MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_011835	CAC	2	6	1258815	1258820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683465
29002	NC_011835	GCA	2	6	1258841	1258846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683465
29003	NC_011835	ACG	2	6	1259011	1259016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683465
29004	NC_011835	CATGC	2	10	1259022	1259031	20 %	20 %	20 %	40 %	219683465
29005	NC_011835	GCA	2	6	1259042	1259047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683465
29006	NC_011835	GCA	2	6	1259054	1259059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683465
29007	NC_011835	GCA	2	6	1259072	1259077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683465
29008	NC_011835	GGC	2	6	1259163	1259168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683465
29009	NC_011835	GAA	2	6	1259185	1259190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683465
29010	NC_011835	CT	3	6	1259283	1259288	0 %	50 %	0 %	50 %	219683465
29011	NC_011835	GAT	2	6	1259319	1259324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683465
29012	NC_011835	GAA	2	6	1259328	1259333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683465
29013	NC_011835	GA	3	6	1259345	1259350	50 %	0 %	50 %	0 %	219683465
29014	NC_011835	CCA	2	6	1259387	1259392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683465
29015	NC_011835	ATG	2	6	1259441	1259446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683466
29016	NC_011835	GGTG	2	8	1259459	1259466	0 %	25 %	75 %	0 %	219683466
29017	NC_011835	TGACGG	2	12	1259467	1259478	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219683466
29018	NC_011835	CGA	2	6	1259550	1259555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683466
29019	NC_011835	GCA	2	6	1259571	1259576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683466
29020	NC_011835	CCT	2	6	1259584	1259589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683466
29021	NC_011835	ATG	2	6	1259602	1259607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683466
29022	NC_011835	CGA	2	6	1259629	1259634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683466
29023	NC_011835	GAT	2	6	1259663	1259668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683466
29024	NC_011835	ATG	2	6	1259717	1259722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683466
29025	NC_011835	TGT	2	6	1259875	1259880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29026	NC_011835	CCT	2	6	1260341	1260346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683467
29027	NC_011835	ACG	2	6	1260403	1260408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683467
29028	NC_011835	TCGT	2	8	1260457	1260464	0 %	50 %	25 %	25 %	219683467
29029	NC_011835	TGTCC	2	10	1260467	1260476	0 %	40 %	20 %	40 %	219683467
29030	NC_011835	GGA	2	6	1260501	1260506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683467
29031	NC_011835	CGA	2	6	1260542	1260547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683467
29032	NC_011835	GC	3	6	1260548	1260553	0 %	0 %	50 %	50 %	219683467
29033	NC_011835	CTG	2	6	1260729	1260734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683467
29034	NC_011835	GGT	2	6	1260765	1260770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683467
29035	NC_011835	GGC	2	6	1260867	1260872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683467
29036	NC_011835	GAGC	2	8	1260876	1260883	25 %	0 %	50 %	25 %	219683467
29037	NC_011835	AT	3	6	1260928	1260933	50 %	50 %	0 %	0 %	219683467
29038	NC_011835	AT	3	6	1260989	1260994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29039	NC_011835	CCA	2	6	1261059	1261064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29040	NC_011835	TGTGC	2	10	1261179	1261188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29041	NC_011835	CTG	2	6	1261201	1261206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29042	NC_011835	ACG	2	6	1261234	1261239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29043	NC_011835	CA	3	6	1261289	1261294	50 %	0 %	0 %	50 %	219683468
29044	NC_011835	GAC	2	6	1261381	1261386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29045	NC_011835	TGC	2	6	1261546	1261551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29046	NC_011835	GCC	2	6	1261604	1261609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683468
29047	NC_011835	CTG	2	6	1261637	1261642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29048	NC_011835	CAC	3	9	1261669	1261677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683468
29049	NC_011835	TCG	2	6	1261680	1261685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29050	NC_011835	GAG	2	6	1261709	1261714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683468
29051	NC_011835	ACA	2	6	1261725	1261730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683468
29052	NC_011835	ACA	2	6	1261836	1261841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683468
29053	NC_011835	CGCCA	2	10	1261846	1261855	20 %	0 %	20 %	60 %	219683468
29054	NC_011835	CAC	2	6	1261930	1261935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683468
29055	NC_011835	TCG	2	6	1261950	1261955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29056	NC_011835	CG	3	6	1262081	1262086	0 %	0 %	50 %	50 %	219683468
29057	NC_011835	CTG	2	6	1262090	1262095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29058	NC_011835	CTG	3	9	1262135	1262143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29059	NC_011835	AGTCG	2	10	1262230	1262239	20 %	20 %	40 %	20 %	219683468
29060	NC_011835	CATC	2	8	1262246	1262253	25 %	25 %	0 %	50 %	219683468
29061	NC_011835	GGC	2	6	1262336	1262341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683468
29062	NC_011835	GCT	2	6	1262386	1262391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29063	NC_011835	ACG	2	6	1262438	1262443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29064	NC_011835	GGA	2	6	1262470	1262475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683468
29065	NC_011835	CGA	2	6	1262527	1262532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29066	NC_011835	CAT	2	6	1262533	1262538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683468
29067	NC_011835	CGA	2	6	1262539	1262544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683468
29068	NC_011835	GC	3	6	1262569	1262574	0 %	0 %	50 %	50 %	219683468
29069	NC_011835	GCC	2	6	1262684	1262689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29070	NC_011835	ATG	2	6	1262733	1262738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29071	NC_011835	TTG	2	6	1262817	1262822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29072	NC_011835	TGA	2	6	1262862	1262867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
29073	NC_011835	CTC	2	6	1262890	1262895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683469
29074	NC_011835	GCACG	2	10	1262899	1262908	20 %	0 %	40 %	40 %	219683469
29075	NC_011835	ATG	2	6	1262925	1262930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
29076	NC_011835	GTT	2	6	1262934	1262939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683469
29077	NC_011835	TAG	2	6	1262967	1262972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
29078	NC_011835	ATC	2	6	1263020	1263025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683469
29079	NC_011835	TCA	2	6	1263057	1263062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683469
29080	NC_011835	TGGC	2	8	1263066	1263073	0 %	25 %	50 %	25 %	219683469
29081	NC_011835	GAT	2	6	1263304	1263309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
29082	NC_011835	GCA	2	6	1263335	1263340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
29083	NC_011835	CGA	2	6	1263382	1263387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
29084	NC_011835	GAC	2	6	1263419	1263424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
29085	NC_011835	GGT	2	6	1263448	1263453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683469
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29087	NC_011835	TGG	2	6	1263510	1263515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683469
29088	NC_011835	GGTGA	2	10	1263518	1263527	20 %	20 %	60 %	0 %	219683469
29089	NC_011835	CCG	2	6	1263529	1263534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683469
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29091	NC_011835	CGT	2	6	1263564	1263569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683469
29092	NC_011835	CGA	2	6	1263601	1263606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
29093	NC_011835	CCGAT	2	10	1263651	1263660	20 %	20 %	20 %	40 %	219683469
29094	NC_011835	CAT	2	6	1263661	1263666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683469
29095	NC_011835	TAC	2	6	1263680	1263685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683469
29096	NC_011835	C	6	6	1263714	1263719	0 %	0 %	0 %	100 %	219683469
29097	NC_011835	CGT	2	6	1263766	1263771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683469
29098	NC_011835	GAC	2	6	1263793	1263798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683469
29099	NC_011835	GAT	2	6	1263808	1263813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
29100	NC_011835	CCG	2	6	1263867	1263872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683469
29101	NC_011835	ATG	2	6	1263932	1263937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
29102	NC_011835	TGA	2	6	1264147	1264152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
29103	NC_011835	CAA	2	6	1264213	1264218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683469
29104	NC_011835	GCAA	2	8	1264241	1264248	50 %	0 %	25 %	25 %	219683469
29105	NC_011835	GAT	2	6	1264253	1264258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683469
29106	NC_011835	GGA	2	6	1264294	1264299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683469
29107	NC_011835	AGG	2	6	1264362	1264367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683469
29108	NC_011835	CTC	2	6	1264510	1264515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683470
29109	NC_011835	CTG	2	6	1264531	1264536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683470
29110	NC_011835	TTC	2	6	1264579	1264584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683470
29111	NC_011835	CAT	2	6	1264611	1264616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683470
29112	NC_011835	CTC	2	6	1264618	1264623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683470
29113	NC_011835	GCTG	2	8	1264664	1264671	0 %	25 %	50 %	25 %	219683470
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29115	NC_011835	GTT	2	6	1264749	1264754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683470
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29211	NC_011835	GGCT	2	8	1268755	1268762	0 %	25 %	50 %	25 %	219683472
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29216	NC_011835	GCTC	2	8	1268855	1268862	0 %	25 %	25 %	50 %	219683472
29217	NC_011835	CGC	2	6	1268900	1268905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683472
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29219	NC_011835	GGT	2	6	1269055	1269060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683473
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29222	NC_011835	TCGCGT	2	12	1269213	1269224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683473
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29227	NC_011835	GAT	2	6	1269353	1269358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683473
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29462	NC_011835	CGA	2	6	1279502	1279507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683481
29463	NC_011835	ATG	2	6	1279568	1279573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683481
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29493	NC_011835	GC	3	6	1280762	1280767	0 %	0 %	50 %	50 %	219683482
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29498	NC_011835	ATTT	2	8	1280941	1280948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29499	NC_011835	ATGA	2	8	1281130	1281137	50 %	25 %	25 %	0 %	219683483
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