MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_011835	ACG	2	6	1236593	1236598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28503	NC_011835	CGT	2	6	1236600	1236605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28504	NC_011835	GGGC	2	8	1236608	1236615	0 %	0 %	75 %	25 %	219683448
28505	NC_011835	CGA	2	6	1236651	1236656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28506	NC_011835	AGG	2	6	1236746	1236751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683448
28507	NC_011835	GAG	2	6	1236820	1236825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683448
28508	NC_011835	GCC	2	6	1236865	1236870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683448
28509	NC_011835	GAC	2	6	1236916	1236921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28510	NC_011835	GGA	2	6	1236993	1236998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683448
28511	NC_011835	ACATCG	2	12	1237007	1237018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219683448
28512	NC_011835	GCCG	2	8	1237041	1237048	0 %	0 %	50 %	50 %	219683448
28513	NC_011835	GAA	2	6	1237122	1237127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683448
28514	NC_011835	GGC	2	6	1237159	1237164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683448
28515	NC_011835	TGG	2	6	1237178	1237183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683448
28516	NC_011835	CCA	2	6	1237184	1237189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683448
28517	NC_011835	TCG	2	6	1237249	1237254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28518	NC_011835	GCC	2	6	1237372	1237377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683448
28519	NC_011835	CGTCAT	2	12	1237404	1237415	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219683448
28520	NC_011835	GCT	2	6	1237437	1237442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28521	NC_011835	CCA	2	6	1237487	1237492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683448
28522	NC_011835	CGG	2	6	1237509	1237514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683448
28523	NC_011835	CAA	2	6	1237572	1237577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683448
28524	NC_011835	AAGG	2	8	1237585	1237592	50 %	0 %	50 %	0 %	219683448
28525	NC_011835	CGT	2	6	1237644	1237649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28526	NC_011835	GCG	2	6	1237658	1237663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683448
28527	NC_011835	TA	3	6	1237777	1237782	50 %	50 %	0 %	0 %	219683448
28528	NC_011835	GGGC	2	8	1237795	1237802	0 %	0 %	75 %	25 %	219683448
28529	NC_011835	CGA	2	6	1237827	1237832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28530	NC_011835	TCG	2	6	1237859	1237864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683448
28531	NC_011835	GC	3	6	1237913	1237918	0 %	0 %	50 %	50 %	219683448
28532	NC_011835	CCG	2	6	1237935	1237940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683448
28533	NC_011835	ATG	2	6	1237989	1237994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28534	NC_011835	ATGAC	2	10	1238008	1238017	40 %	20 %	20 %	20 %	219683449
28535	NC_011835	TAC	2	6	1238034	1238039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683449
28536	NC_011835	GGA	2	6	1238114	1238119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683449
28537	NC_011835	AAG	2	6	1238145	1238150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683449
28538	NC_011835	CAA	2	6	1238153	1238158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683449
28539	NC_011835	GGA	2	6	1238165	1238170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683449
28540	NC_011835	AAT	2	6	1238187	1238192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219683449
28541	NC_011835	AAG	2	6	1238205	1238210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683449
28542	NC_011835	TAT	2	6	1238226	1238231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28543	NC_011835	GGCG	2	8	1238247	1238254	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28544	NC_011835	TTGTG	2	10	1238281	1238290	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28545	NC_011835	CGT	2	6	1238405	1238410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28546	NC_011835	GTTC	2	8	1238504	1238511	0 %	50 %	25 %	25 %	219683450
28547	NC_011835	TTCA	2	8	1238547	1238554	25 %	50 %	0 %	25 %	219683450
28548	NC_011835	GAA	2	6	1238555	1238560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683450
28549	NC_011835	TGA	2	6	1238579	1238584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683450
28550	NC_011835	CGAC	2	8	1238602	1238609	25 %	0 %	25 %	50 %	219683450
28551	NC_011835	CGA	2	6	1238636	1238641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28552	NC_011835	AGC	2	6	1238665	1238670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28553	NC_011835	ATG	2	6	1238677	1238682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683450
28554	NC_011835	CGG	2	6	1238698	1238703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683450
28555	NC_011835	GGCT	2	8	1238720	1238727	0 %	25 %	50 %	25 %	219683450
28556	NC_011835	TCG	2	6	1238758	1238763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28557	NC_011835	ATG	2	6	1238796	1238801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683450
28558	NC_011835	TGG	2	6	1238821	1238826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683450
28559	NC_011835	AGG	2	6	1238839	1238844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683450
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28562	NC_011835	GT	3	6	1238911	1238916	0 %	50 %	50 %	0 %	219683450
28563	NC_011835	GAA	2	6	1238930	1238935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683450
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28566	NC_011835	CAT	2	6	1238999	1239004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683450
28567	NC_011835	CGT	2	6	1239015	1239020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28568	NC_011835	AGC	2	6	1239058	1239063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28569	NC_011835	GAG	2	6	1239135	1239140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683450
28570	NC_011835	ACG	2	6	1239142	1239147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28571	NC_011835	GAA	2	6	1239164	1239169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683450
28572	NC_011835	TCA	2	6	1239172	1239177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683450
28573	NC_011835	GC	3	6	1239207	1239212	0 %	0 %	50 %	50 %	219683450
28574	NC_011835	CG	3	6	1239224	1239229	0 %	0 %	50 %	50 %	219683450
28575	NC_011835	TTC	2	6	1239318	1239323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683450
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28577	NC_011835	ATC	2	6	1239384	1239389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683450
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28582	NC_011835	ACGCTC	2	12	1239549	1239560	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219683450
28583	NC_011835	GGGACC	2	12	1239569	1239580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219683450
28584	NC_011835	CGAAC	2	10	1239581	1239590	40 %	0 %	20 %	40 %	219683450
28585	NC_011835	TGC	2	6	1239729	1239734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683450
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28587	NC_011835	TTC	2	6	1239768	1239773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683450
28588	NC_011835	GCT	2	6	1239800	1239805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28589	NC_011835	CGG	2	6	1239818	1239823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683450
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28592	NC_011835	CATG	2	8	1239989	1239996	25 %	25 %	25 %	25 %	219683450
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28597	NC_011835	ACG	3	9	1240246	1240254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683450
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28599	NC_011835	ACG	2	6	1240513	1240518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28600	NC_011835	TCG	2	6	1240597	1240602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28601	NC_011835	TGC	2	6	1240654	1240659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28602	NC_011835	CAG	2	6	1240764	1240769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683450
28603	NC_011835	GGGGC	2	10	1240848	1240857	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28604	NC_011835	GCCCC	2	10	1240864	1240873	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
28605	NC_011835	CAC	2	6	1240949	1240954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683451
28606	NC_011835	GTC	2	6	1240973	1240978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683451
28607	NC_011835	TGG	2	6	1241239	1241244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683451
28608	NC_011835	GGC	2	6	1241286	1241291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683451
28609	NC_011835	GCG	2	6	1241305	1241310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683451
28610	NC_011835	ATG	2	6	1241316	1241321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683451
28611	NC_011835	GGC	2	6	1241351	1241356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683451
28612	NC_011835	CGA	2	6	1241429	1241434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683451
28613	NC_011835	GAG	2	6	1241472	1241477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683451
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28615	NC_011835	AGG	2	6	1241541	1241546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683451
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28847	NC_011835	CAT	2	6	1251725	1251730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683459
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28962	NC_011835	ATG	2	6	1257305	1257310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683464
28963	NC_011835	TCC	2	6	1257379	1257384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683464
28964	NC_011835	GCA	2	6	1257485	1257490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683464
28965	NC_011835	GGC	2	6	1257491	1257496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683464
28966	NC_011835	GC	3	6	1257543	1257548	0 %	0 %	50 %	50 %	219683464
28967	NC_011835	CGTGC	2	10	1257562	1257571	0 %	20 %	40 %	40 %	219683464
28968	NC_011835	TGCG	2	8	1257599	1257606	0 %	25 %	50 %	25 %	219683464
28969	NC_011835	CGT	2	6	1257607	1257612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683464
28970	NC_011835	GGT	2	6	1257624	1257629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683464
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28972	NC_011835	GC	4	8	1257650	1257657	0 %	0 %	50 %	50 %	219683464
28973	NC_011835	TCG	2	6	1257763	1257768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683464
28974	NC_011835	GCA	2	6	1257776	1257781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683464
28975	NC_011835	GT	3	6	1257817	1257822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28976	NC_011835	TCT	2	6	1257859	1257864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28977	NC_011835	GTG	2	6	1257904	1257909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683465
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28984	NC_011835	GCT	2	6	1258182	1258187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683465
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28992	NC_011835	CCA	2	6	1258559	1258564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683465
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28999	NC_011835	CCT	2	6	1258793	1258798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683465
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