MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_011835	AGC	2	6	1171011	1171016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683399
27003	NC_011835	GAA	2	6	1171030	1171035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683399
27004	NC_011835	AAG	2	6	1171058	1171063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683399
27005	NC_011835	GTGGA	2	10	1171086	1171095	20 %	20 %	60 %	0 %	219683399
27006	NC_011835	AAC	2	6	1171202	1171207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683399
27007	NC_011835	AGCACC	2	12	1171317	1171328	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219683399
27008	NC_011835	CG	4	8	1171333	1171340	0 %	0 %	50 %	50 %	219683399
27009	NC_011835	GCG	3	9	1171394	1171402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683399
27010	NC_011835	ACG	2	6	1171440	1171445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683399
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27012	NC_011835	TGA	2	6	1171467	1171472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683399
27013	NC_011835	CAC	2	6	1171525	1171530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683399
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27015	NC_011835	CAC	2	6	1171573	1171578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683399
27016	NC_011835	GC	4	8	1171602	1171609	0 %	0 %	50 %	50 %	219683399
27017	NC_011835	GCG	2	6	1171619	1171624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683399
27018	NC_011835	GAG	2	6	1171673	1171678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683399
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27021	NC_011835	GCCG	2	8	1171894	1171901	0 %	0 %	50 %	50 %	219683399
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27025	NC_011835	CGG	2	6	1172212	1172217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27026	NC_011835	CTG	2	6	1172226	1172231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683400
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27039	NC_011835	ACC	2	6	1172614	1172619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27040	NC_011835	TGT	2	6	1172635	1172640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27042	NC_011835	TTA	2	6	1172666	1172671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27044	NC_011835	CGA	2	6	1172733	1172738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683401
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27062	NC_011835	AACG	2	8	1173334	1173341	50 %	0 %	25 %	25 %	219683401
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27116	NC_011835	CGA	2	6	1175378	1175383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683403
27117	NC_011835	TGC	2	6	1175398	1175403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683403
27118	NC_011835	GCG	2	6	1175410	1175415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683403
27119	NC_011835	TCGA	2	8	1175421	1175428	25 %	25 %	25 %	25 %	219683403
27120	NC_011835	CTG	3	9	1175445	1175453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683403
27121	NC_011835	AGC	2	6	1175467	1175472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683403
27122	NC_011835	CGTA	2	8	1175528	1175535	25 %	25 %	25 %	25 %	219683403
27123	NC_011835	CGA	2	6	1175648	1175653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683403
27124	NC_011835	CGA	2	6	1175664	1175669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683403
27125	NC_011835	CG	3	6	1175713	1175718	0 %	0 %	50 %	50 %	219683403
27126	NC_011835	CGC	2	6	1175743	1175748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683403
27127	NC_011835	GCA	2	6	1175765	1175770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683403
27128	NC_011835	TCG	2	6	1175776	1175781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683403
27129	NC_011835	GTG	2	6	1175916	1175921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683403
27130	NC_011835	TCACCG	2	12	1175992	1176003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219683403
27131	NC_011835	CCG	2	6	1176052	1176057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683403
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27144	NC_011835	CGG	3	9	1176685	1176693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683404
27145	NC_011835	CGG	2	6	1176721	1176726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683404
27146	NC_011835	GGT	2	6	1176731	1176736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683404
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27150	NC_011835	GC	4	8	1176887	1176894	0 %	0 %	50 %	50 %	219683405
27151	NC_011835	CGC	2	6	1176954	1176959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683405
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27165	NC_011835	AACA	2	8	1177765	1177772	75 %	0 %	0 %	25 %	219683405
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27173	NC_011835	CCT	2	6	1177977	1177982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27174	NC_011835	ACA	2	6	1178003	1178008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27193	NC_011835	TGC	2	6	1178998	1179003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683406
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27196	NC_011835	GACC	2	8	1179080	1179087	25 %	0 %	25 %	50 %	219683406
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27198	NC_011835	AGG	2	6	1179119	1179124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27199	NC_011835	CGA	2	6	1179220	1179225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683407
27200	NC_011835	ATAC	2	8	1179267	1179274	50 %	25 %	0 %	25 %	219683407
27201	NC_011835	CG	3	6	1179323	1179328	0 %	0 %	50 %	50 %	219683407
27202	NC_011835	TGC	2	6	1179334	1179339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683407
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27218	NC_011835	CAACG	2	10	1180224	1180233	40 %	0 %	20 %	40 %	219683407
27219	NC_011835	CCCA	2	8	1180257	1180264	25 %	0 %	0 %	75 %	219683407
27220	NC_011835	GCTC	2	8	1180355	1180362	0 %	25 %	25 %	50 %	219683407
27221	NC_011835	AGG	2	6	1180386	1180391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683407
27222	NC_011835	ATG	2	6	1180480	1180485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27223	NC_011835	CAT	2	6	1180503	1180508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27224	NC_011835	CCA	2	6	1180535	1180540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27225	NC_011835	GGT	2	6	1180569	1180574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27226	NC_011835	TCG	2	6	1180646	1180651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27227	NC_011835	CAC	2	6	1180659	1180664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27228	NC_011835	TCA	2	6	1180715	1180720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27229	NC_011835	CCG	2	6	1180769	1180774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27230	NC_011835	GGA	2	6	1180839	1180844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683408
27231	NC_011835	CGT	2	6	1180886	1180891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683408
27232	NC_011835	TCC	2	6	1180897	1180902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683408
27233	NC_011835	GCG	2	6	1180924	1180929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683408
27234	NC_011835	ATCGCC	2	12	1180981	1180992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219683408
27235	NC_011835	CGA	2	6	1181010	1181015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683408
27236	NC_011835	ACGG	2	8	1181027	1181034	25 %	0 %	50 %	25 %	219683408
27237	NC_011835	GAT	2	6	1181049	1181054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683408
27238	NC_011835	CAG	2	6	1181185	1181190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683408
27239	NC_011835	TGT	2	6	1181197	1181202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683408
27240	NC_011835	GGC	2	6	1181262	1181267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683408
27241	NC_011835	TGGTC	2	10	1181418	1181427	0 %	40 %	40 %	20 %	219683408
27242	NC_011835	TGA	2	6	1181477	1181482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683408
27243	NC_011835	TGG	2	6	1181509	1181514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683408
27244	NC_011835	GGCGT	2	10	1181605	1181614	0 %	20 %	60 %	20 %	219683408
27245	NC_011835	GC	3	6	1181756	1181761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27246	NC_011835	CG	3	6	1181764	1181769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27247	NC_011835	GCG	2	6	1181810	1181815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27248	NC_011835	GAG	2	6	1181818	1181823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27249	NC_011835	CGC	2	6	1181843	1181848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683409
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27251	NC_011835	CGT	2	6	1182028	1182033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683409
27252	NC_011835	GAC	2	6	1182098	1182103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683409
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27254	NC_011835	ACATCG	2	12	1182162	1182173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219683409
27255	NC_011835	CAC	2	6	1182266	1182271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683409
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27259	NC_011835	CGC	2	6	1182376	1182381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683409
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27263	NC_011835	TCG	2	6	1182520	1182525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683409
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27267	NC_011835	GTC	2	6	1182605	1182610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683409
27268	NC_011835	GAC	2	6	1182629	1182634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683409
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27274	NC_011835	CCT	2	6	1183048	1183053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27275	NC_011835	GAAC	2	8	1183107	1183114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27276	NC_011835	GCA	2	6	1183126	1183131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683410
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27279	NC_011835	CG	3	6	1183251	1183256	0 %	0 %	50 %	50 %	219683410
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27295	NC_011835	TCA	2	6	1183848	1183853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683410
27296	NC_011835	TCCG	2	8	1183912	1183919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27297	NC_011835	CGGT	2	8	1184033	1184040	0 %	25 %	50 %	25 %	219683411
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27316	NC_011835	AAC	2	6	1184800	1184805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27317	NC_011835	ATG	2	6	1184877	1184882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683412
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27320	NC_011835	TAT	2	6	1184988	1184993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219683412
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27323	NC_011835	CGT	2	6	1185110	1185115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683412
27324	NC_011835	GA	3	6	1185139	1185144	50 %	0 %	50 %	0 %	219683412
27325	NC_011835	CGG	2	6	1185224	1185229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683412
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27327	NC_011835	AC	4	8	1185350	1185357	50 %	0 %	0 %	50 %	219683412
27328	NC_011835	AGGTGA	2	12	1185358	1185369	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219683412
27329	NC_011835	CAA	2	6	1185455	1185460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683412
27330	NC_011835	CAC	2	6	1185485	1185490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683412
27331	NC_011835	GCT	2	6	1185575	1185580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683412
27332	NC_011835	TATGGC	2	12	1185600	1185611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219683412
27333	NC_011835	GCT	2	6	1185638	1185643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683412
27334	NC_011835	GC	3	6	1185644	1185649	0 %	0 %	50 %	50 %	219683412
27335	NC_011835	CGG	2	6	1185700	1185705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683412
27336	NC_011835	CGA	2	6	1185713	1185718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683412
27337	NC_011835	CGC	2	6	1185725	1185730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683412
27338	NC_011835	GC	3	6	1185800	1185805	0 %	0 %	50 %	50 %	219683412
27339	NC_011835	CAT	2	6	1185893	1185898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683412
27340	NC_011835	GGA	3	9	1185920	1185928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683412
27341	NC_011835	CAG	2	6	1185933	1185938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683412
27342	NC_011835	TCG	2	6	1185969	1185974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683412
27343	NC_011835	CGC	2	6	1185994	1185999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683412
27344	NC_011835	GAG	2	6	1186095	1186100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219683412
27345	NC_011835	TGA	2	6	1186135	1186140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683412
27346	NC_011835	GAA	2	6	1186157	1186162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683412
27347	NC_011835	ATG	2	6	1186237	1186242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683412
27348	NC_011835	GC	3	6	1186367	1186372	0 %	0 %	50 %	50 %	219683413
27349	NC_011835	TCG	2	6	1186385	1186390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683413
27350	NC_011835	GTG	2	6	1186451	1186456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683413
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27452	NC_011835	TTC	2	6	1191767	1191772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683416
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27467	NC_011835	CGT	2	6	1192093	1192098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683417
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27491	NC_011835	TCC	2	6	1192904	1192909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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27493	NC_011835	GCC	2	6	1192935	1192940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27494	NC_011835	GAG	2	6	1193001	1193006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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