MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_011835	CAC	2	6	1084308	1084313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25002	NC_011835	TTC	2	6	1084379	1084384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25003	NC_011835	CCG	2	6	1084412	1084417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25004	NC_011835	CTC	2	6	1084596	1084601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25005	NC_011835	TTC	2	6	1084643	1084648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25006	NC_011835	GCCC	2	8	1084708	1084715	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25007	NC_011835	CGA	2	6	1084764	1084769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25008	NC_011835	GCT	2	6	1084834	1084839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25009	NC_011835	CTG	2	6	1084994	1084999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25010	NC_011835	TGG	2	6	1085078	1085083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25011	NC_011835	CAA	2	6	1085097	1085102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25012	NC_011835	CCCAT	2	10	1085119	1085128	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25013	NC_011835	CCCAC	2	10	1085144	1085153	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
25014	NC_011835	GGAGC	2	10	1085162	1085171	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25015	NC_011835	ACC	2	6	1085182	1085187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25016	NC_011835	CGC	2	6	1085307	1085312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25017	NC_011835	A	6	6	1085348	1085353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25018	NC_011835	TAA	2	6	1085414	1085419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25019	NC_011835	CA	3	6	1085431	1085436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25020	NC_011835	A	6	6	1085436	1085441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25021	NC_011835	CCAT	2	8	1085448	1085455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25022	NC_011835	CAT	2	6	1085510	1085515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25023	NC_011835	GAC	2	6	1085520	1085525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25024	NC_011835	AGT	2	6	1085574	1085579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25025	NC_011835	ACC	3	9	1085605	1085613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25026	NC_011835	AC	3	6	1085614	1085619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25027	NC_011835	GCA	2	6	1085659	1085664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25028	NC_011835	CCCA	2	8	1085688	1085695	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25029	NC_011835	ACCCC	2	10	1085700	1085709	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
25030	NC_011835	CA	3	6	1085714	1085719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25031	NC_011835	CAA	2	6	1085731	1085736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25032	NC_011835	ACA	2	6	1085739	1085744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25033	NC_011835	CCA	2	6	1085745	1085750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25034	NC_011835	ACCA	2	8	1085777	1085784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25035	NC_011835	CA	4	8	1085790	1085797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25036	NC_011835	ACCA	2	8	1085803	1085810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25037	NC_011835	CAC	2	6	1085811	1085816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25038	NC_011835	CAC	2	6	1085829	1085834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25039	NC_011835	CAA	2	6	1085840	1085845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25040	NC_011835	ACAA	2	8	1085920	1085927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25041	NC_011835	ACT	2	6	1085934	1085939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683339
25042	NC_011835	GTA	2	6	1086007	1086012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683339
25043	NC_011835	TCG	2	6	1086053	1086058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683339
25044	NC_011835	TCG	3	9	1086125	1086133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683339
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25046	NC_011835	CAC	2	6	1086163	1086168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683339
25047	NC_011835	CGG	2	6	1086189	1086194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683339
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25049	NC_011835	CGTCGG	2	12	1086243	1086254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219683339
25050	NC_011835	CCT	2	6	1086303	1086308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683339
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25053	NC_011835	CG	3	6	1086406	1086411	0 %	0 %	50 %	50 %	219683339
25054	NC_011835	TTG	2	6	1086413	1086418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683339
25055	NC_011835	TCG	2	6	1086431	1086436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683339
25056	NC_011835	GTC	2	6	1086472	1086477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683339
25057	NC_011835	GTT	2	6	1086547	1086552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683339
25058	NC_011835	TGA	2	6	1086579	1086584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683339
25059	NC_011835	GCTC	2	8	1086597	1086604	0 %	25 %	25 %	50 %	219683339
25060	NC_011835	TGA	2	6	1086639	1086644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683339
25061	NC_011835	TGCC	2	8	1086708	1086715	0 %	25 %	25 %	50 %	219683339
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25063	NC_011835	CG	3	6	1086769	1086774	0 %	0 %	50 %	50 %	219683339
25064	NC_011835	GAA	2	6	1086775	1086780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683339
25065	NC_011835	CGT	2	6	1086825	1086830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683339
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25069	NC_011835	CGA	2	6	1087074	1087079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683339
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25073	NC_011835	CGAA	2	8	1087276	1087283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25074	NC_011835	GCA	2	6	1087289	1087294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25122	NC_011835	GCA	2	6	1089023	1089028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683341
25123	NC_011835	CGT	2	6	1089033	1089038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683341
25124	NC_011835	GTC	2	6	1089048	1089053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683341
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25135	NC_011835	CG	3	6	1089497	1089502	0 %	0 %	50 %	50 %	219683341
25136	NC_011835	CGA	2	6	1089536	1089541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683341
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25182	NC_011835	GCACG	2	10	1092072	1092081	20 %	0 %	40 %	40 %	219683343
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25355	NC_011835	CGC	2	6	1100126	1100131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683349
25356	NC_011835	CGA	2	6	1100213	1100218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683349
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25360	NC_011835	GCG	2	6	1100386	1100391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683349
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25362	NC_011835	ACC	2	6	1100422	1100427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683349
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25367	NC_011835	ACA	2	6	1100658	1100663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25370	NC_011835	CAG	2	6	1100761	1100766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25374	NC_011835	TGG	2	6	1100836	1100841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683350
25375	NC_011835	GAATCT	2	12	1101119	1101130	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219683350
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25385	NC_011835	GCA	2	6	1101678	1101683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683351
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25393	NC_011835	CAT	2	6	1102104	1102109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683352
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25422	NC_011835	GCC	3	9	1103603	1103611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683353
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25432	NC_011835	GCGG	2	8	1104208	1104215	0 %	0 %	75 %	25 %	219683354
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25451	NC_011835	TCG	2	6	1104968	1104973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683354
25452	NC_011835	AGT	2	6	1105041	1105046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683354
25453	NC_011835	GTC	2	6	1105096	1105101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683354
25454	NC_011835	GTA	2	6	1105252	1105257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683354
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25457	NC_011835	GAA	2	6	1105318	1105323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683354
25458	NC_011835	CTG	2	6	1105363	1105368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683354
25459	NC_011835	CTT	2	6	1105369	1105374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683354
25460	NC_011835	TGA	2	6	1105401	1105406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683354
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25462	NC_011835	CATTA	2	10	1105561	1105570	40 %	40 %	0 %	20 %	219683355
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25464	NC_011835	AC	3	6	1105607	1105612	50 %	0 %	0 %	50 %	219683355
25465	NC_011835	CAG	3	9	1105620	1105628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683355
25466	NC_011835	ATC	2	6	1105648	1105653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683355
25467	NC_011835	CACC	2	8	1105656	1105663	25 %	0 %	0 %	75 %	219683355
25468	NC_011835	TCA	2	6	1105751	1105756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683355
25469	NC_011835	TGA	2	6	1105799	1105804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683355
25470	NC_011835	GAT	2	6	1105818	1105823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683355
25471	NC_011835	AGA	2	6	1105835	1105840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683355
25472	NC_011835	CTG	2	6	1105845	1105850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683355
25473	NC_011835	GAT	2	6	1105926	1105931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683355
25474	NC_011835	GCGA	2	8	1106029	1106036	25 %	0 %	50 %	25 %	219683355
25475	NC_011835	GAGC	2	8	1106040	1106047	25 %	0 %	50 %	25 %	219683355
25476	NC_011835	GAC	3	9	1106061	1106069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683355
25477	NC_011835	GCA	2	6	1106096	1106101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683355
25478	NC_011835	AGC	3	9	1106176	1106184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683355
25479	NC_011835	CTT	2	6	1106406	1106411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25480	NC_011835	CG	3	6	1106496	1106501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25481	NC_011835	TTCG	2	8	1106523	1106530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25482	NC_011835	ATGC	2	8	1106576	1106583	25 %	25 %	25 %	25 %	219683356
25483	NC_011835	TCGAT	2	10	1106586	1106595	20 %	40 %	20 %	20 %	219683356
25484	NC_011835	TGC	2	6	1106605	1106610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683356
25485	NC_011835	CG	4	8	1106623	1106630	0 %	0 %	50 %	50 %	219683356
25486	NC_011835	CAC	2	6	1106729	1106734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683356
25487	NC_011835	AC	3	6	1106773	1106778	50 %	0 %	0 %	50 %	219683356
25488	NC_011835	TCACGC	2	12	1106827	1106838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219683356
25489	NC_011835	GCTG	2	8	1106960	1106967	0 %	25 %	50 %	25 %	219683356
25490	NC_011835	CCG	2	6	1106986	1106991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683356
25491	NC_011835	CTA	2	6	1107011	1107016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683356
25492	NC_011835	CG	3	6	1107040	1107045	0 %	0 %	50 %	50 %	219683356
25493	NC_011835	CGA	2	6	1107064	1107069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683356
25494	NC_011835	GCT	2	6	1107125	1107130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683356
25495	NC_011835	GCA	2	6	1107184	1107189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683356
25496	NC_011835	GCC	2	6	1107201	1107206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683356
25497	NC_011835	CGG	2	6	1107257	1107262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683356
25498	NC_011835	TC	3	6	1107285	1107290	0 %	50 %	0 %	50 %	219683356
25499	NC_011835	GAGCA	2	10	1107291	1107300	40 %	0 %	40 %	20 %	219683356
25500	NC_011835	GAC	3	9	1107327	1107335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683356

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