MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 chromosome

Total Repeats: 43353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011835	CCA	2	6	722242	722247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17002	NC_011835	CCT	2	6	722263	722268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17003	NC_011835	TGA	2	6	722284	722289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_011835	TTC	2	6	722298	722303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17005	NC_011835	GCT	2	6	722326	722331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_011835	CCT	2	6	722338	722343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17007	NC_011835	ATC	2	6	722391	722396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_011835	TCG	2	6	722401	722406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17009	NC_011835	CCG	2	6	722454	722459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17010	NC_011835	CTT	2	6	722539	722544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_011835	GC	3	6	722581	722586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17012	NC_011835	GATCG	2	10	722617	722626	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17013	NC_011835	CG	3	6	722634	722639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17014	NC_011835	TTC	2	6	722657	722662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17015	NC_011835	CTG	2	6	722668	722673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_011835	GAG	2	6	722681	722686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_011835	CTG	2	6	722692	722697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_011835	CTT	2	6	722704	722709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17019	NC_011835	AT	3	6	722711	722716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_011835	ACGC	2	8	722727	722734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17021	NC_011835	GCG	2	6	722773	722778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17022	NC_011835	CCA	2	6	722790	722795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17023	NC_011835	CAT	2	6	722803	722808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17024	NC_011835	TCGC	2	8	722882	722889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17025	NC_011835	TCG	2	6	722895	722900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17026	NC_011835	CGC	3	9	723021	723029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17027	NC_011835	TGA	2	6	723042	723047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_011835	TTC	4	12	723086	723097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17029	NC_011835	TCTAT	2	10	723106	723115	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17030	NC_011835	GAC	2	6	723190	723195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_011835	CGG	2	6	723246	723251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683053
17032	NC_011835	GAT	2	6	723272	723277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683053
17033	NC_011835	CG	3	6	723346	723351	0 %	0 %	50 %	50 %	219683053
17034	NC_011835	CGA	2	6	723358	723363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683053
17035	NC_011835	TCC	2	6	723375	723380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683053
17036	NC_011835	TCC	2	6	723411	723416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683053
17037	NC_011835	GCGAG	2	10	723433	723442	20 %	0 %	60 %	20 %	219683053
17038	NC_011835	CAG	2	6	723446	723451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683053
17039	NC_011835	GC	3	6	723513	723518	0 %	0 %	50 %	50 %	219683053
17040	NC_011835	GCA	2	6	723538	723543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683053
17041	NC_011835	CAC	2	6	723605	723610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683053
17042	NC_011835	CCA	2	6	723622	723627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683053
17043	NC_011835	GCC	2	6	723653	723658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683053
17044	NC_011835	CGC	2	6	723694	723699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683053
17045	NC_011835	GTAT	2	8	723702	723709	25 %	50 %	25 %	0 %	219683053
17046	NC_011835	AGC	2	6	723714	723719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683053
17047	NC_011835	CCT	2	6	723763	723768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683053
17048	NC_011835	CTC	2	6	723830	723835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683053
17049	NC_011835	CG	3	6	723859	723864	0 %	0 %	50 %	50 %	219683053
17050	NC_011835	CTC	2	6	723869	723874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219683053
17051	NC_011835	AAC	2	6	723888	723893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219683053
17052	NC_011835	CAG	2	6	723902	723907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683053
17053	NC_011835	TCGC	2	8	723917	723924	0 %	25 %	25 %	50 %	219683053
17054	NC_011835	GCCG	2	8	723938	723945	0 %	0 %	50 %	50 %	219683053
17055	NC_011835	CGG	2	6	723979	723984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683053
17056	NC_011835	TCC	2	6	724000	724005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17057	NC_011835	TATC	2	8	724011	724018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17058	NC_011835	GC	4	8	724096	724103	0 %	0 %	50 %	50 %	219683054
17059	NC_011835	ACG	2	6	724108	724113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683054
17060	NC_011835	TCT	2	6	724171	724176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683054
17061	NC_011835	GCA	2	6	724189	724194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683054
17062	NC_011835	TGC	2	6	724197	724202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683054
17063	NC_011835	GTG	2	6	724238	724243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683054
17064	NC_011835	CAG	2	6	724244	724249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683054
17065	NC_011835	CCG	2	6	724288	724293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17066	NC_011835	CGC	2	6	724294	724299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17067	NC_011835	CGC	2	6	724310	724315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17068	NC_011835	GC	4	8	724345	724352	0 %	0 %	50 %	50 %	219683054
17069	NC_011835	GCG	2	6	724362	724367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683054
17070	NC_011835	CAG	2	6	724376	724381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683054
17071	NC_011835	CG	3	6	724410	724415	0 %	0 %	50 %	50 %	219683054
17072	NC_011835	CCA	2	6	724426	724431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683054
17073	NC_011835	CGC	3	9	724489	724497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17074	NC_011835	CGC	2	6	724506	724511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17075	NC_011835	TCG	2	6	724554	724559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683054
17076	NC_011835	ACC	2	6	724584	724589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219683054
17077	NC_011835	GCC	2	6	724596	724601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17078	NC_011835	CGG	2	6	724681	724686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683054
17079	NC_011835	CGA	2	6	724702	724707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219683054
17080	NC_011835	GC	4	8	724812	724819	0 %	0 %	50 %	50 %	219683054
17081	NC_011835	CG	3	6	724864	724869	0 %	0 %	50 %	50 %	219683054
17082	NC_011835	CCG	2	6	724872	724877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17083	NC_011835	GCAC	2	8	724887	724894	25 %	0 %	25 %	50 %	219683054
17084	NC_011835	TCGCC	2	10	724909	724918	0 %	20 %	20 %	60 %	219683054
17085	NC_011835	CGC	2	6	724948	724953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17086	NC_011835	ATC	2	6	725015	725020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683054
17087	NC_011835	GAA	2	6	725093	725098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683054
17088	NC_011835	TCG	2	6	725133	725138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683054
17089	NC_011835	GCC	2	6	725165	725170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683054
17090	NC_011835	ACC	2	6	725257	725262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17091	NC_011835	C	6	6	725261	725266	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17092	NC_011835	AATGC	2	10	725271	725280	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17093	NC_011835	CGC	2	6	725289	725294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683055
17094	NC_011835	CG	3	6	725314	725319	0 %	0 %	50 %	50 %	219683055
17095	NC_011835	GGT	2	6	725326	725331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219683055
17096	NC_011835	ATC	2	6	725385	725390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219683055
17097	NC_011835	GAA	2	6	725492	725497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683055
17098	NC_011835	GCC	3	9	725508	725516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683055
17099	NC_011835	TTG	2	6	725523	725528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683055
17100	NC_011835	AGGT	2	8	725535	725542	25 %	25 %	50 %	0 %	219683055
17101	NC_011835	CTG	2	6	725579	725584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683055
17102	NC_011835	GCC	2	6	725621	725626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683055
17103	NC_011835	GCG	2	6	725644	725649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683055
17104	NC_011835	GTT	2	6	725708	725713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219683055
17105	NC_011835	CTG	2	6	725714	725719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683055
17106	NC_011835	CGC	2	6	725722	725727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219683055
17107	NC_011835	GT	3	6	725794	725799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17108	NC_011835	CCGC	2	8	725891	725898	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17109	NC_011835	AGC	2	6	725914	725919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17110	NC_011835	CGG	2	6	725978	725983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17111	NC_011835	GC	3	6	725992	725997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17112	NC_011835	CGT	2	6	726169	726174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683056
17113	NC_011835	GC	3	6	726199	726204	0 %	0 %	50 %	50 %	219683056
17114	NC_011835	CTT	2	6	726240	726245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219683056
17115	NC_011835	GTTGCA	2	12	726247	726258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219683056
17116	NC_011835	CG	3	6	726283	726288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17117	NC_011835	ATCG	2	8	726314	726321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17118	NC_011835	TCG	2	6	726371	726376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683057
17119	NC_011835	CGG	2	6	726420	726425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683057
17120	NC_011835	CGG	2	6	726438	726443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683057
17121	NC_011835	CGT	2	6	726444	726449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219683057
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17123	NC_011835	GGC	2	6	726475	726480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683057
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17483	NC_011835	TGAA	2	8	742572	742579	50 %	25 %	25 %	0 %	219683070
17484	NC_011835	GAACC	2	10	742590	742599	40 %	0 %	20 %	40 %	219683070
17485	NC_011835	CGG	2	6	742639	742644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683070
17486	NC_011835	AGA	2	6	742647	742652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219683070
17487	NC_011835	CGG	2	6	742911	742916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219683070
17488	NC_011835	TGA	2	6	742920	742925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219683070
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