MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl27

Total Repeats: 706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011265	AAC	2	6	21	26	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288912
2	NC_011265	A	7	7	51	57	100 %	0 %	0 %	0 %	203288912
3	NC_011265	CAA	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288912
4	NC_011265	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288912
5	NC_011265	TTA	2	6	89	94	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288912
6	NC_011265	ATA	3	9	131	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
7	NC_011265	GTAA	2	8	151	158	50 %	25 %	25 %	0 %	203288912
8	NC_011265	GAAT	2	8	198	205	50 %	25 %	25 %	0 %	203288912
9	NC_011265	GCT	3	9	304	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288912
10	NC_011265	AATT	2	8	314	321	50 %	50 %	0 %	0 %	203288912
11	NC_011265	AAG	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288912
12	NC_011265	A	6	6	382	387	100 %	0 %	0 %	0 %	203288912
13	NC_011265	TGA	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288912
14	NC_011265	TATT	2	8	429	436	25 %	75 %	0 %	0 %	203288912
15	NC_011265	ATA	2	6	440	445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
16	NC_011265	GTAG	2	8	508	515	25 %	25 %	50 %	0 %	203288912
17	NC_011265	ATA	2	6	521	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
18	NC_011265	TTG	2	6	527	532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288912
19	NC_011265	CAA	2	6	536	541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288912
20	NC_011265	TGGT	2	8	546	553	0 %	50 %	50 %	0 %	203288912
21	NC_011265	ATT	2	6	608	613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288912
22	NC_011265	T	6	6	651	656	0 %	100 %	0 %	0 %	203288912
23	NC_011265	T	8	8	736	743	0 %	100 %	0 %	0 %	203288912
24	NC_011265	TGA	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288912
25	NC_011265	AG	3	6	774	779	50 %	0 %	50 %	0 %	203288912
26	NC_011265	AAT	2	6	781	786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
27	NC_011265	AGA	2	6	897	902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288912
28	NC_011265	ATT	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288912
29	NC_011265	AATTA	2	10	962	971	60 %	40 %	0 %	0 %	203288912
30	NC_011265	TTAAA	2	10	1004	1013	60 %	40 %	0 %	0 %	203288912
31	NC_011265	A	6	6	1087	1092	100 %	0 %	0 %	0 %	203288912
32	NC_011265	AT	3	6	1154	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	203288912
33	NC_011265	ATA	2	6	1193	1198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288912
34	NC_011265	ATT	3	9	1289	1297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288912
35	NC_011265	TCG	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288912
36	NC_011265	GAT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011265	TAA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011265	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011265	GT	3	6	1430	1435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011265	ATT	2	6	1465	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011265	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011265	ACA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011265	ATG	3	9	1573	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011265	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288913
45	NC_011265	TAG	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288913
46	NC_011265	TAA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288913
47	NC_011265	GA	3	6	1725	1730	50 %	0 %	50 %	0 %	203288913
48	NC_011265	T	6	6	1741	1746	0 %	100 %	0 %	0 %	203288913
49	NC_011265	TAT	2	6	1754	1759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288913
50	NC_011265	GTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288913
51	NC_011265	TAT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288913
52	NC_011265	ATT	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288913
53	NC_011265	CAT	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288913
54	NC_011265	TTCCTG	2	12	1949	1960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288913
55	NC_011265	TCC	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288913
56	NC_011265	AGG	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011265	AT	3	6	2045	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	203288914
58	NC_011265	ACA	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288914
59	NC_011265	ATA	2	6	2068	2073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288914
60	NC_011265	TTA	2	6	2079	2084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288914
61	NC_011265	GTT	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288914
62	NC_011265	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288914
63	NC_011265	ATT	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288914
64	NC_011265	AAT	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288914
65	NC_011265	CAA	2	6	2368	2373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288914
66	NC_011265	ATA	2	6	2374	2379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288914
67	NC_011265	TAT	2	6	2476	2481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011265	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011265	TAT	2	6	2494	2499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011265	T	8	8	2516	2523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011265	T	6	6	2531	2536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011265	TGT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011265	A	8	8	2624	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011265	CTT	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011265	TAT	2	6	2670	2675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011265	ATT	2	6	2698	2703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
77	NC_011265	AATA	2	8	2846	2853	75 %	25 %	0 %	0 %	203288915
78	NC_011265	AT	3	6	2863	2868	50 %	50 %	0 %	0 %	203288915
79	NC_011265	TATT	2	8	2938	2945	25 %	75 %	0 %	0 %	203288915
80	NC_011265	TAT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
81	NC_011265	T	6	6	2971	2976	0 %	100 %	0 %	0 %	203288915
82	NC_011265	TTA	2	6	3064	3069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
83	NC_011265	T	6	6	3099	3104	0 %	100 %	0 %	0 %	203288915
84	NC_011265	ATT	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
85	NC_011265	GTTT	2	8	3146	3153	0 %	75 %	25 %	0 %	203288915
86	NC_011265	TTA	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288915
87	NC_011265	TCA	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288915
88	NC_011265	ATCT	2	8	3245	3252	25 %	50 %	0 %	25 %	203288915
89	NC_011265	TAAA	2	8	3302	3309	75 %	25 %	0 %	0 %	203288915
90	NC_011265	TAA	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288915
91	NC_011265	CTT	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288915
92	NC_011265	TC	3	6	3542	3547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011265	ATTT	2	8	3577	3584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011265	GCA	2	6	3612	3617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011265	TTCT	2	8	3676	3683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011265	GA	3	6	3717	3722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011265	T	7	7	3734	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011265	T	7	7	3791	3797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011265	TACTTT	2	12	3813	3824	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011265	CTTT	2	8	3843	3850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011265	GCT	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288916
102	NC_011265	CTA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288916
103	NC_011265	T	8	8	3992	3999	0 %	100 %	0 %	0 %	203288916
104	NC_011265	CTT	2	6	4117	4122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288916
105	NC_011265	A	6	6	4125	4130	100 %	0 %	0 %	0 %	203288916
106	NC_011265	T	6	6	4139	4144	0 %	100 %	0 %	0 %	203288916
107	NC_011265	TC	3	6	4164	4169	0 %	50 %	0 %	50 %	203288916
108	NC_011265	TTC	2	6	4175	4180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288916
109	NC_011265	T	8	8	4186	4193	0 %	100 %	0 %	0 %	203288916
110	NC_011265	TTG	2	6	4202	4207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288916
111	NC_011265	TTA	2	6	4251	4256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288916
112	NC_011265	ACT	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288916
113	NC_011265	TAA	2	6	4283	4288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288916
114	NC_011265	AT	3	6	4358	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011265	ATT	2	6	4368	4373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011265	TATT	2	8	4379	4386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011265	AATT	2	8	4433	4440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011265	GAA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
119	NC_011265	ATGT	2	8	4571	4578	25 %	50 %	25 %	0 %	203288917
120	NC_011265	AATAA	2	10	4636	4645	80 %	20 %	0 %	0 %	203288917
121	NC_011265	ACT	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288917
122	NC_011265	T	6	6	4779	4784	0 %	100 %	0 %	0 %	203288917
123	NC_011265	AGA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
124	NC_011265	GA	5	10	4828	4837	50 %	0 %	50 %	0 %	203288917
125	NC_011265	TAG	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288917
126	NC_011265	AAG	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
127	NC_011265	AGA	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
128	NC_011265	GTTAT	2	10	4935	4944	20 %	60 %	20 %	0 %	203288917
129	NC_011265	GAA	2	6	4953	4958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288917
130	NC_011265	GGA	2	6	4999	5004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288917
131	NC_011265	AT	3	6	5016	5021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011265	AGT	3	9	5024	5032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011265	A	8	8	5133	5140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011265	TAAA	2	8	5144	5151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011265	A	6	6	5149	5154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011265	GAA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288918
137	NC_011265	AGG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288918
138	NC_011265	AAT	2	6	5302	5307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288918
139	NC_011265	TGG	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288918
140	NC_011265	CTG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288918
141	NC_011265	TTAT	2	8	5507	5514	25 %	75 %	0 %	0 %	203288918
142	NC_011265	CAA	2	6	5525	5530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288918
143	NC_011265	AAG	2	6	5552	5557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288918
144	NC_011265	ATC	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288918
145	NC_011265	ATT	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288918
146	NC_011265	AT	3	6	5659	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	203288918
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174	NC_011265	T	6	6	6981	6986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011265	TAT	2	6	6998	7003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011265	T	6	6	7003	7008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_011265	T	6	6	7038	7043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_011265	CTAT	2	8	7605	7612	25 %	50 %	0 %	25 %	203288920
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259	NC_011265	TTG	2	6	10325	10330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288923
260	NC_011265	AAT	2	6	10343	10348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288923
261	NC_011265	GAG	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_011265	GAA	2	6	10381	10386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288924
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265	NC_011265	GAA	2	6	10471	10476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288924
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267	NC_011265	AAT	2	6	10552	10557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288924
268	NC_011265	CAA	2	6	10571	10576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288924
269	NC_011265	ATT	2	6	10607	10612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288924
270	NC_011265	TGT	2	6	10650	10655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288924
271	NC_011265	TAA	3	9	10692	10700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288924
272	NC_011265	ATCAA	2	10	10856	10865	60 %	20 %	0 %	20 %	203288924
273	NC_011265	AGA	2	6	10866	10871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288924
274	NC_011265	A	6	6	10901	10906	100 %	0 %	0 %	0 %	203288924
275	NC_011265	ATT	2	6	10952	10957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288924
276	NC_011265	TTG	2	6	11006	11011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288924
277	NC_011265	ATC	2	6	11040	11045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288924
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279	NC_011265	A	6	6	11136	11141	100 %	0 %	0 %	0 %	203288924
280	NC_011265	ATT	3	9	11146	11154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288924
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282	NC_011265	AGA	2	6	11294	11299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288924
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288	NC_011265	GAT	2	6	11593	11598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288925
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402	NC_011265	GT	3	6	16489	16494	0 %	50 %	50 %	0 %	203288933
403	NC_011265	TTCA	2	8	16569	16576	25 %	50 %	0 %	25 %	203288933
404	NC_011265	TAC	2	6	16610	16615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288933
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407	NC_011265	AAT	2	6	16707	16712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288933
408	NC_011265	TTAG	2	8	16719	16726	25 %	50 %	25 %	0 %	203288933
409	NC_011265	ACT	2	6	16739	16744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288933
410	NC_011265	ACA	2	6	16808	16813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288933
411	NC_011265	TAAC	2	8	16816	16823	50 %	25 %	0 %	25 %	203288933
412	NC_011265	AAAG	2	8	16830	16837	75 %	0 %	25 %	0 %	203288933
413	NC_011265	TGA	2	6	16925	16930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288933
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419	NC_011265	TA	3	6	17240	17245	50 %	50 %	0 %	0 %	203288934
420	NC_011265	TA	3	6	17257	17262	50 %	50 %	0 %	0 %	203288934
421	NC_011265	ACTA	2	8	17280	17287	50 %	25 %	0 %	25 %	203288934
422	NC_011265	A	6	6	17353	17358	100 %	0 %	0 %	0 %	203288934
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429	NC_011265	A	6	6	17645	17650	100 %	0 %	0 %	0 %	203288934
430	NC_011265	AAG	2	6	17717	17722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288934
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436	NC_011265	A	7	7	17813	17819	100 %	0 %	0 %	0 %	203288934
437	NC_011265	ACA	2	6	17863	17868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288934
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439	NC_011265	TCT	2	6	17931	17936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288934
440	NC_011265	CAA	2	6	17950	17955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288934
441	NC_011265	AT	3	6	17992	17997	50 %	50 %	0 %	0 %	203288934
442	NC_011265	AGTT	2	8	18045	18052	25 %	50 %	25 %	0 %	203288934
443	NC_011265	GAT	2	6	18151	18156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288934
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449	NC_011265	ATG	2	6	18458	18463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288935
450	NC_011265	ATT	2	6	18467	18472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288935
451	NC_011265	TA	3	6	18490	18495	50 %	50 %	0 %	0 %	203288935
452	NC_011265	TGA	2	6	18534	18539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288935
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454	NC_011265	A	6	6	18555	18560	100 %	0 %	0 %	0 %	203288935
455	NC_011265	ATA	2	6	18578	18583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288935
456	NC_011265	AGA	2	6	18606	18611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288935
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458	NC_011265	TAT	2	6	18737	18742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_011265	TTA	2	6	18751	18756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_011265	GAA	2	6	18851	18856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288936
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493	NC_011265	A	6	6	20235	20240	100 %	0 %	0 %	0 %	203288938
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499	NC_011265	A	6	6	20485	20490	100 %	0 %	0 %	0 %	203288938
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