MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl37

Total Repeats: 1181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011258	TTGATA	2	12	161	172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011258	TAA	2	6	192	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011258	AAC	2	6	218	223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011258	ATA	2	6	232	237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011258	GCA	2	6	259	264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011258	TGA	2	6	297	302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011258	TAA	2	6	338	343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011258	ATG	3	9	365	373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011258	A	6	6	421	426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011258	AGA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011258	A	7	7	568	574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011258	A	6	6	600	605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011258	GAA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011258	ACA	2	6	659	664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011258	TTAA	2	8	677	684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011258	GAT	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011258	ACT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011258	A	6	6	724	729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011258	TTA	2	6	777	782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011258	AGT	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011258	AAT	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011258	ATAA	2	8	840	847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011258	AT	3	6	848	853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011258	AG	3	6	880	885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011258	TAT	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011258	TAAA	2	8	945	952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011258	ATT	2	6	960	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011258	ATA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011258	AT	4	8	997	1004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011258	TAT	3	9	1002	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011258	ATA	3	9	1011	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011258	ATT	2	6	1020	1025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011258	ATA	2	6	1045	1050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011258	AAGG	2	8	1056	1063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011258	A	6	6	1078	1083	100 %	0 %	0 %	0 %	203288417
36	NC_011258	T	7	7	1084	1090	0 %	100 %	0 %	0 %	203288417
37	NC_011258	TATTT	2	10	1102	1111	20 %	80 %	0 %	0 %	203288417
38	NC_011258	TAA	2	6	1113	1118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288417
39	NC_011258	AAG	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288417
40	NC_011258	TGG	2	6	1165	1170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288417
41	NC_011258	AATT	2	8	1224	1231	50 %	50 %	0 %	0 %	203288417
42	NC_011258	AGA	3	9	1258	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288417
43	NC_011258	TGA	2	6	1267	1272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288417
44	NC_011258	A	7	7	1290	1296	100 %	0 %	0 %	0 %	203288417
45	NC_011258	TAA	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288417
46	NC_011258	CAA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288417
47	NC_011258	AAC	2	6	1451	1456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288417
48	NC_011258	CTG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288417
49	NC_011258	AAC	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288417
50	NC_011258	GAATG	2	10	1517	1526	40 %	20 %	40 %	0 %	203288417
51	NC_011258	AAT	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288417
52	NC_011258	GAAT	2	8	1611	1618	50 %	25 %	25 %	0 %	203288417
53	NC_011258	AAT	2	6	1645	1650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288417
54	NC_011258	TGA	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288417
55	NC_011258	TAATT	2	10	1681	1690	40 %	60 %	0 %	0 %	203288417
56	NC_011258	ATT	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288417
57	NC_011258	AAAAT	2	10	1866	1875	80 %	20 %	0 %	0 %	203288417
58	NC_011258	TGA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288417
59	NC_011258	GAT	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288417
60	NC_011258	TAAAA	2	10	1926	1935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011258	AG	3	6	1960	1965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011258	T	6	6	1974	1979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011258	CT	3	6	1980	1985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011258	AT	3	6	2051	2056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011258	TA	3	6	2062	2067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011258	T	7	7	2075	2081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011258	ATA	2	6	2100	2105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011258	TA	3	6	2114	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011258	TTA	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011258	TATAT	2	10	2147	2156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011258	ACAA	2	8	2206	2213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011258	TCA	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011258	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011258	ATT	2	6	2329	2334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288418
75	NC_011258	CAG	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288418
76	NC_011258	CATA	2	8	2407	2414	50 %	25 %	0 %	25 %	203288418
77	NC_011258	TCA	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288418
78	NC_011258	CAA	2	6	2504	2509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288418
79	NC_011258	TCTTT	2	10	2538	2547	0 %	80 %	0 %	20 %	203288418
80	NC_011258	AT	3	6	2573	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	203288418
81	NC_011258	TTA	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288418
82	NC_011258	TCT	2	6	2589	2594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288418
83	NC_011258	TA	3	6	2635	2640	50 %	50 %	0 %	0 %	203288418
84	NC_011258	ATT	2	6	2645	2650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288418
85	NC_011258	A	6	6	2654	2659	100 %	0 %	0 %	0 %	203288418
86	NC_011258	AAT	2	6	2670	2675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288418
87	NC_011258	TTA	2	6	2676	2681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288418
88	NC_011258	T	6	6	2708	2713	0 %	100 %	0 %	0 %	203288418
89	NC_011258	GTT	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288418
90	NC_011258	GTT	2	6	2736	2741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288418
91	NC_011258	CAT	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288418
92	NC_011258	TCA	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288418
93	NC_011258	ATA	2	6	2807	2812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288418
94	NC_011258	ATT	2	6	2828	2833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288418
95	NC_011258	TGG	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288418
96	NC_011258	AATA	2	8	2851	2858	75 %	25 %	0 %	0 %	203288418
97	NC_011258	T	7	7	2879	2885	0 %	100 %	0 %	0 %	203288418
98	NC_011258	AAT	2	6	2894	2899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288418
99	NC_011258	ATC	2	6	2903	2908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288418
100	NC_011258	T	6	6	2947	2952	0 %	100 %	0 %	0 %	203288418
101	NC_011258	T	6	6	2997	3002	0 %	100 %	0 %	0 %	203288418
102	NC_011258	TGG	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288418
103	NC_011258	GAC	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288418
104	NC_011258	ATT	2	6	3183	3188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288418
105	NC_011258	T	6	6	3192	3197	0 %	100 %	0 %	0 %	203288418
106	NC_011258	T	8	8	3211	3218	0 %	100 %	0 %	0 %	203288418
107	NC_011258	T	7	7	3232	3238	0 %	100 %	0 %	0 %	203288418
108	NC_011258	TAA	2	6	3286	3291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288418
109	NC_011258	AAAT	2	8	3293	3300	75 %	25 %	0 %	0 %	203288418
110	NC_011258	AATT	2	8	3304	3311	50 %	50 %	0 %	0 %	203288418
111	NC_011258	TC	3	6	3318	3323	0 %	50 %	0 %	50 %	203288418
112	NC_011258	AT	3	6	3324	3329	50 %	50 %	0 %	0 %	203288418
113	NC_011258	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011258	ACA	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011258	ATA	2	6	3368	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011258	ATATTA	2	12	3384	3395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011258	AT	3	6	3401	3406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011258	T	6	6	3435	3440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011258	A	6	6	3450	3455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011258	ATT	2	6	3471	3476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011258	TAT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011258	TAA	3	9	3516	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011258	CAT	2	6	3552	3557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011258	ATA	2	6	3558	3563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011258	ATT	2	6	3566	3571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011258	TAA	2	6	3611	3616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011258	TAT	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011258	T	7	7	3628	3634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011258	TAATT	2	10	3642	3651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011258	TAG	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011258	TAA	2	6	3674	3679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011258	A	8	8	3682	3689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011258	AT	4	8	3701	3708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011258	CAT	3	9	3740	3748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011258	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011258	TAGT	2	8	3808	3815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011258	AAGT	2	8	3837	3844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011258	T	6	6	3883	3888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011258	ATT	2	6	3894	3899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011258	GAT	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011258	T	6	6	3940	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011258	TA	3	6	3986	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011258	TTC	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011258	TGG	2	6	4074	4079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011258	TGAT	2	8	4104	4111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011258	TTTTG	2	10	4135	4144	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011258	A	6	6	4203	4208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_011258	A	7	7	9109	9115	100 %	0 %	0 %	0 %	203288421
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432	NC_011258	ATTAT	2	10	13676	13685	40 %	60 %	0 %	0 %	203288424
433	NC_011258	CTT	2	6	13698	13703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288424
434	NC_011258	CAA	2	6	13722	13727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288424
435	NC_011258	ACA	2	6	13754	13759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288424
436	NC_011258	AGC	2	6	13771	13776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288424
437	NC_011258	TAT	2	6	13807	13812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288424
438	NC_011258	TCCT	2	8	13846	13853	0 %	50 %	0 %	50 %	203288424
439	NC_011258	CTTA	2	8	13858	13865	25 %	50 %	0 %	25 %	203288424
440	NC_011258	TC	4	8	13890	13897	0 %	50 %	0 %	50 %	203288424
441	NC_011258	TCT	2	6	13929	13934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288424
442	NC_011258	TC	3	6	13941	13946	0 %	50 %	0 %	50 %	203288424
443	NC_011258	CTTC	2	8	13950	13957	0 %	50 %	0 %	50 %	203288424
444	NC_011258	CTT	2	6	13999	14004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288424
445	NC_011258	CAC	2	6	14146	14151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288424
446	NC_011258	CAT	4	12	14152	14163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288424
447	NC_011258	ATTCT	2	10	14184	14193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
448	NC_011258	CTTC	2	8	14206	14213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
449	NC_011258	TCT	2	6	14217	14222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_011258	ACA	2	6	14249	14254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_011258	AAC	2	6	14255	14260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_011258	CTAT	2	8	14271	14278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
453	NC_011258	CAG	2	6	14309	14314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_011258	TG	3	6	14329	14334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_011258	A	6	6	14336	14341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_011258	TTAAAT	2	12	14413	14424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_011258	AGTA	2	8	14515	14522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
458	NC_011258	ATCA	2	8	14526	14533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
459	NC_011258	GTA	2	6	14603	14608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_011258	TGAA	2	8	14614	14621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
461	NC_011258	ATA	2	6	14625	14630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_011258	AAATA	2	10	14646	14655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011258	T	7	7	14656	14662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_011258	A	7	7	14672	14678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_011258	TTATT	3	15	14732	14746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_011258	T	7	7	14745	14751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_011258	TAGCAT	2	12	14817	14828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288425
468	NC_011258	CCT	2	6	14841	14846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288425
469	NC_011258	CTG	2	6	14925	14930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288425
470	NC_011258	AGC	2	6	14962	14967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288425
471	NC_011258	CCT	2	6	15020	15025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288425
472	NC_011258	T	6	6	15040	15045	0 %	100 %	0 %	0 %	203288425
473	NC_011258	CAG	2	6	15057	15062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288425
474	NC_011258	CAG	2	6	15066	15071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288425
475	NC_011258	AAC	2	6	15091	15096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288425
476	NC_011258	GCT	2	6	15170	15175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288425
477	NC_011258	CTT	2	6	15178	15183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288425
478	NC_011258	TCACCA	2	12	15233	15244	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	203288425
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484	NC_011258	CCA	2	6	15455	15460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288425
485	NC_011258	TTATC	2	10	15462	15471	20 %	60 %	0 %	20 %	203288425
486	NC_011258	TTCTT	2	10	15527	15536	0 %	80 %	0 %	20 %	203288425
487	NC_011258	TTCAT	2	10	15539	15548	20 %	60 %	0 %	20 %	203288425
488	NC_011258	TTA	2	6	15557	15562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288425
489	NC_011258	CTT	2	6	15625	15630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288425
490	NC_011258	TTAC	2	8	15701	15708	25 %	50 %	0 %	25 %	203288425
491	NC_011258	TTC	2	6	15734	15739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288425
492	NC_011258	CAT	2	6	15775	15780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288425
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494	NC_011258	T	7	7	15823	15829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_011258	T	6	6	15843	15848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_011258	TTA	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_011258	AGCA	2	8	15869	15876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_011258	A	6	6	15879	15884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_011258	AAAT	2	8	15892	15899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011258	CAT	2	6	15944	15949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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