MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl42

Total Repeats: 1296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011254	TTC	2	6	9	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011254	CTC	2	6	39	44	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011254	ATC	3	9	77	85	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011254	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011254	CT	3	6	111	116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011254	CT	4	8	120	127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011254	ATTT	2	8	128	135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011254	CT	3	6	136	141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011254	CCT	2	6	184	189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011254	T	7	7	197	203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011254	A	7	7	231	237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011254	TA	3	6	245	250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011254	ATT	2	6	255	260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011254	TAAT	2	8	283	290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011254	TTATA	2	10	296	305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011254	ATT	2	6	347	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011254	AT	3	6	373	378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011254	CTA	2	6	398	403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011254	TC	3	6	409	414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011254	T	8	8	506	513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011254	TTTA	2	8	545	552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011254	A	6	6	599	604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011254	TAC	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011254	TAT	2	6	654	659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011254	ATTT	2	8	671	678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011254	AT	3	6	716	721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011254	TA	3	6	756	761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011254	ACA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011254	TTTA	2	8	799	806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011254	T	6	6	816	821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011254	ATT	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288731
32	NC_011254	TTG	2	6	835	840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288731
33	NC_011254	TCT	2	6	872	877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288731
34	NC_011254	CCT	2	6	906	911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288731
35	NC_011254	ATT	2	6	944	949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288731
36	NC_011254	TGC	2	6	979	984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288731
37	NC_011254	AGC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
38	NC_011254	T	6	6	1087	1092	0 %	100 %	0 %	0 %	203288731
39	NC_011254	CAT	2	6	1095	1100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
40	NC_011254	TCTT	2	8	1127	1134	0 %	75 %	0 %	25 %	203288731
41	NC_011254	AGC	3	9	1135	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
42	NC_011254	CAG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
43	NC_011254	CAG	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
44	NC_011254	AT	3	6	1221	1226	50 %	50 %	0 %	0 %	203288731
45	NC_011254	TGC	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288731
46	NC_011254	CAG	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
47	NC_011254	T	6	6	1324	1329	0 %	100 %	0 %	0 %	203288731
48	NC_011254	GTAGCA	2	12	1349	1360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203288731
49	NC_011254	ACA	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288731
50	NC_011254	CAG	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
51	NC_011254	AGC	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
52	NC_011254	CAG	3	9	1458	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
53	NC_011254	GCA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
54	NC_011254	ATC	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
55	NC_011254	CTT	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288731
56	NC_011254	CTTC	2	8	1623	1630	0 %	50 %	0 %	50 %	203288731
57	NC_011254	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288731
58	NC_011254	CAT	3	9	1813	1821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
59	NC_011254	CAT	4	12	1825	1836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
60	NC_011254	ACT	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
61	NC_011254	T	6	6	1867	1872	0 %	100 %	0 %	0 %	203288731
62	NC_011254	ATTC	2	8	1879	1886	25 %	50 %	0 %	25 %	203288731
63	NC_011254	CCT	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011254	T	6	6	1901	1906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011254	T	7	7	1908	1914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011254	A	6	6	1938	1943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011254	TCA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011254	TA	3	6	1978	1983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011254	A	7	7	1997	2003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011254	ATT	2	6	2031	2036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011254	TAAT	2	8	2041	2048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011254	AT	3	6	2053	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011254	TAA	2	6	2128	2133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011254	TTA	2	6	2135	2140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011254	CTTA	2	8	2200	2207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011254	CTA	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011254	CCT	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011254	T	6	6	2353	2358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011254	CTG	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011254	TAT	2	6	2421	2426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011254	TCT	2	6	2438	2443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011254	AT	3	6	2466	2471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011254	GCT	4	12	2498	2509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011254	AGT	3	9	2542	2550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011254	AAC	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011254	T	6	6	2569	2574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011254	ATC	2	6	2578	2583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011254	CCCT	2	8	2610	2617	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_011254	AGC	2	6	2749	2754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011254	CTT	2	6	2755	2760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011254	CTT	2	6	2766	2771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011254	CTTA	2	8	2776	2783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011254	ATT	3	9	3081	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011254	TAC	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011254	TCT	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011254	CCTTC	2	10	3113	3122	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_011254	CTC	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011254	TTTC	2	8	3134	3141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011254	TTC	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011254	CATT	2	8	3181	3188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011254	TTC	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011254	CCT	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011254	CAAA	3	12	3233	3244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011254	AAAT	2	8	3245	3252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011254	ACA	2	6	3257	3262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011254	GAAT	2	8	3265	3272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011254	CA	3	6	3321	3326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011254	TTATT	2	10	3410	3419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011254	ATT	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
110	NC_011254	ACT	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
111	NC_011254	CTT	2	6	3510	3515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
112	NC_011254	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
113	NC_011254	AT	3	6	3564	3569	50 %	50 %	0 %	0 %	203288732
114	NC_011254	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288732
115	NC_011254	AGC	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288732
116	NC_011254	ACC	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
117	NC_011254	TCGC	2	8	3666	3673	0 %	25 %	25 %	50 %	203288732
118	NC_011254	CAC	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
119	NC_011254	CTT	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
120	NC_011254	AT	3	6	3777	3782	50 %	50 %	0 %	0 %	203288732
121	NC_011254	CTC	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288732
122	NC_011254	TGC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288732
123	NC_011254	CTTT	2	8	3828	3835	0 %	75 %	0 %	25 %	203288732
124	NC_011254	CAT	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
125	NC_011254	CAG	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288732
126	NC_011254	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288732
127	NC_011254	TCTCCA	2	12	3890	3901	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203288732
128	NC_011254	TTA	2	6	3935	3940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
129	NC_011254	CTA	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
130	NC_011254	TAT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
131	NC_011254	TTCTT	2	10	4184	4193	0 %	80 %	0 %	20 %	203288732
132	NC_011254	CAA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288732
133	NC_011254	TTA	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
134	NC_011254	CTT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
135	NC_011254	CTT	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
136	NC_011254	TCCT	2	8	4396	4403	0 %	50 %	0 %	50 %	203288732
137	NC_011254	ACCATC	2	12	4433	4444	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	203288732
138	NC_011254	ACC	3	9	4445	4453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
139	NC_011254	T	8	8	4458	4465	0 %	100 %	0 %	0 %	203288732
140	NC_011254	A	6	6	4490	4495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011254	TA	3	6	4503	4508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011254	ATA	2	6	4515	4520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011254	A	7	7	4529	4535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011254	ATT	2	6	4574	4579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011254	AT	3	6	4594	4599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011254	AT	3	6	4614	4619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011254	TAAT	2	8	4638	4645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_011254	ATT	3	9	9562	9570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288735
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291	NC_011254	CT	3	6	9623	9628	0 %	50 %	0 %	50 %	203288735
292	NC_011254	TAC	2	6	9741	9746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288735
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295	NC_011254	TTC	2	6	9823	9828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288735
296	NC_011254	ATT	2	6	9832	9837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288735
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304	NC_011254	TAT	2	6	10106	10111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_011254	ATC	2	6	13618	13623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_011254	ATT	2	6	13641	13646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_011254	AAT	2	6	13757	13762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_011254	CA	3	6	13805	13810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
415	NC_011254	AAT	2	6	13880	13885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_011254	TAAAA	2	10	13927	13936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_011254	ATA	2	6	13966	13971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_011254	A	6	6	14001	14006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_011254	TAAA	2	8	14052	14059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_011254	A	7	7	14076	14082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_011254	TAA	2	6	14083	14088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_011254	AGT	2	6	14128	14133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_011254	TCTTT	2	10	14142	14151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
424	NC_011254	TAT	2	6	14199	14204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_011254	ATA	2	6	14240	14245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_011254	A	6	6	14245	14250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_011254	TGA	2	6	14254	14259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_011254	TTA	2	6	14260	14265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_011254	AT	4	8	14287	14294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_011254	TA	3	6	14333	14338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_011254	A	6	6	14371	14376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_011254	TAT	2	6	14383	14388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_011254	TAA	2	6	14410	14415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_011254	T	6	6	14416	14421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_011254	TAC	2	6	14423	14428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_011254	TGA	2	6	14492	14497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
437	NC_011254	ATTAT	2	10	14512	14521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_011254	TAA	2	6	14539	14544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_011254	A	9	9	14549	14557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_011254	CAG	2	6	14598	14603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_011254	ATT	2	6	14650	14655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_011254	ATTT	2	8	14694	14701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_011254	ACT	2	6	14709	14714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_011254	TTAT	2	8	14841	14848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_011254	TAT	2	6	14932	14937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_011254	TAT	2	6	14953	14958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_011254	AAC	2	6	15179	15184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_011254	CTA	2	6	15187	15192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_011254	TAA	2	6	15256	15261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_011254	TATCCA	2	12	15306	15317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_011254	TCTAT	2	10	15378	15387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
454	NC_011254	TTG	2	6	15397	15402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_011254	TGT	2	6	15409	15414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_011254	ATT	3	9	15439	15447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_011254	TAT	2	6	15467	15472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_011254	TA	3	6	15478	15483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_011254	TTA	2	6	15489	15494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_011254	AT	3	6	15506	15511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_011254	A	7	7	15516	15522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_011254	TTAA	2	8	15590	15597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011254	ATA	2	6	15643	15648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_011254	ACT	2	6	15651	15656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_011254	AAT	2	6	15660	15665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_011254	CAA	2	6	15714	15719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_011254	AT	3	6	15720	15725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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