MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl41

Total Repeats: 1289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011251	TAA	2	6	22	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
2	NC_011251	T	6	6	38	43	0 %	100 %	0 %	0 %	203288702
3	NC_011251	TCC	2	6	130	135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288702
4	NC_011251	AATTT	2	10	136	145	40 %	60 %	0 %	0 %	203288702
5	NC_011251	TTC	2	6	158	163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288702
6	NC_011251	CAA	2	6	190	195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
7	NC_011251	TTTTA	2	10	227	236	20 %	80 %	0 %	0 %	203288702
8	NC_011251	CT	3	6	244	249	0 %	50 %	0 %	50 %	203288702
9	NC_011251	CTA	3	9	268	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
10	NC_011251	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
11	NC_011251	T	6	6	332	337	0 %	100 %	0 %	0 %	203288702
12	NC_011251	TTCT	2	8	361	368	0 %	75 %	0 %	25 %	203288702
13	NC_011251	AGA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288702
14	NC_011251	AAT	2	6	393	398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
15	NC_011251	TAT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
16	NC_011251	CAT	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
17	NC_011251	TAT	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
18	NC_011251	TCC	2	6	495	500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288702
19	NC_011251	CAT	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
20	NC_011251	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
21	NC_011251	T	7	7	614	620	0 %	100 %	0 %	0 %	203288702
22	NC_011251	AAC	2	6	635	640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
23	NC_011251	TCT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288702
24	NC_011251	TCA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
25	NC_011251	ATT	2	6	671	676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
26	NC_011251	ACA	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
27	NC_011251	ATT	2	6	692	697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
28	NC_011251	ACA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
29	NC_011251	A	6	6	711	716	100 %	0 %	0 %	0 %	203288702
30	NC_011251	TAT	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
31	NC_011251	AAT	2	6	741	746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
32	NC_011251	TAA	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
33	NC_011251	TAAA	2	8	790	797	75 %	25 %	0 %	0 %	203288702
34	NC_011251	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	203288702
35	NC_011251	CTT	2	6	819	824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011251	TAA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011251	ATT	2	6	860	865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011251	TAA	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011251	TA	3	6	875	880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011251	TTTA	2	8	885	892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011251	T	6	6	901	906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011251	T	8	8	921	928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011251	TTA	2	6	954	959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011251	A	6	6	974	979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011251	T	7	7	1002	1008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011251	AAAT	2	8	1064	1071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011251	GT	3	6	1116	1121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011251	TAAATG	2	12	1122	1133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011251	TAT	2	6	1156	1161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011251	TAT	2	6	1200	1205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011251	A	6	6	1218	1223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011251	A	6	6	1237	1242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011251	TATT	2	8	1253	1260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011251	ACTG	2	8	1288	1295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011251	CAG	2	6	1323	1328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011251	TTC	2	6	1413	1418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011251	TTA	2	6	1553	1558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011251	CTG	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011251	CTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011251	AGT	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011251	GTA	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011251	TAA	3	9	1762	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011251	A	8	8	1769	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011251	AGG	2	6	1779	1784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011251	AGA	2	6	1785	1790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011251	AATG	2	8	1792	1799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011251	GAA	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011251	GGAA	2	8	1830	1837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011251	GAG	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011251	GGAAG	2	10	1848	1857	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011251	TGA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011251	ATG	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011251	A	7	7	1992	1998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011251	CAAAAA	2	12	2000	2011	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011251	AATG	2	8	2015	2022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011251	TGAA	2	8	2030	2037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011251	TACA	2	8	2104	2111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011251	TAT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011251	ATG	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011251	TCTT	2	8	2188	2195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011251	T	6	6	2251	2256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011251	AAC	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011251	TAAA	2	8	2278	2285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011251	ATTTT	2	10	2306	2315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011251	TTA	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011251	ATTT	2	8	2334	2341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011251	TTTA	2	8	2347	2354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011251	TCCAC	2	10	2361	2370	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_011251	AT	3	6	2380	2385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011251	ATTA	2	8	2398	2405	50 %	50 %	0 %	0 %	203288703
91	NC_011251	TTG	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288703
92	NC_011251	TC	3	6	2437	2442	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
93	NC_011251	TTAT	2	8	2451	2458	25 %	75 %	0 %	0 %	203288703
94	NC_011251	CTTA	2	8	2516	2523	25 %	50 %	0 %	25 %	203288703
95	NC_011251	CTA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
96	NC_011251	GCT	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288703
97	NC_011251	TCTT	2	8	2643	2650	0 %	75 %	0 %	25 %	203288703
98	NC_011251	T	6	6	2669	2674	0 %	100 %	0 %	0 %	203288703
99	NC_011251	AGCAAT	2	12	2690	2701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288703
100	NC_011251	GCA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288703
101	NC_011251	TGC	2	6	2717	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288703
102	NC_011251	TAT	2	6	2737	2742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
103	NC_011251	AT	3	6	2782	2787	50 %	50 %	0 %	0 %	203288703
104	NC_011251	ACTG	2	8	2795	2802	25 %	25 %	25 %	25 %	203288703
105	NC_011251	GCC	2	6	2826	2831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	203288703
106	NC_011251	TCA	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
107	NC_011251	CTT	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
108	NC_011251	T	8	8	2885	2892	0 %	100 %	0 %	0 %	203288703
109	NC_011251	ATT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
110	NC_011251	CTT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
111	NC_011251	TC	3	6	2929	2934	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
112	NC_011251	AGC	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288703
113	NC_011251	CTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
114	NC_011251	TACCT	2	10	3113	3122	20 %	40 %	0 %	40 %	203288703
115	NC_011251	TC	4	8	3169	3176	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
116	NC_011251	CTTC	2	8	3178	3185	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
117	NC_011251	CCA	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288703
118	NC_011251	CAT	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
119	NC_011251	CAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
120	NC_011251	TAT	2	6	3386	3391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
121	NC_011251	T	6	6	3413	3418	0 %	100 %	0 %	0 %	203288703
122	NC_011251	TTC	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
123	NC_011251	CCT	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011251	TTA	2	6	3453	3458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011251	T	8	8	3459	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011251	T	6	6	3472	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011251	TTTA	2	8	3484	3491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011251	CAAA	2	8	3497	3504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011251	A	6	6	3502	3507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011251	ACG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011251	ATT	2	6	3534	3539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011251	ACA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011251	TAAA	2	8	3562	3569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011251	A	6	6	3567	3572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011251	TAA	2	6	3609	3614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011251	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011251	ATTA	2	8	3649	3656	50 %	50 %	0 %	0 %	203288704
138	NC_011251	TC	3	6	3688	3693	0 %	50 %	0 %	50 %	203288704
139	NC_011251	TTAT	2	8	3702	3709	25 %	75 %	0 %	0 %	203288704
140	NC_011251	CTA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288704
141	NC_011251	ATA	2	6	3803	3808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288704
142	NC_011251	ATC	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288704
143	NC_011251	CTG	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288704
144	NC_011251	T	7	7	3890	3896	0 %	100 %	0 %	0 %	203288704
145	NC_011251	TTC	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288704
146	NC_011251	T	6	6	3917	3922	0 %	100 %	0 %	0 %	203288704
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288	NC_011251	A	6	6	8599	8604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_011251	C	6	6	8664	8669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
292	NC_011251	TTA	2	6	8732	8737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011251	TTAC	2	8	8740	8747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
294	NC_011251	AT	3	6	8754	8759	50 %	50 %	0 %	0 %	203288706
295	NC_011251	TAA	2	6	8785	8790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288706
296	NC_011251	CTGT	2	8	8799	8806	0 %	50 %	25 %	25 %	203288706
297	NC_011251	TAT	2	6	8824	8829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288706
298	NC_011251	TAA	2	6	8854	8859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288706
299	NC_011251	TTTA	2	8	8860	8867	25 %	75 %	0 %	0 %	203288706
300	NC_011251	TACTCC	2	12	8875	8886	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203288706
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332	NC_011251	AATA	2	8	10153	10160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_011251	ATT	2	6	10172	10177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_011251	A	7	7	10188	10194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_011251	A	6	6	10206	10211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_011251	A	9	9	10217	10225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_011251	TAGA	2	8	10240	10247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_011251	GAAG	2	8	13524	13531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
424	NC_011251	AAAG	2	8	13571	13578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
425	NC_011251	A	6	6	13647	13652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_011251	TCT	2	6	13701	13706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_011251	ATT	2	6	14885	14890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_011251	A	7	7	14959	14965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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