MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 4831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	AAT	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011247	ATTTT	2	10	20	29	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011247	T	7	7	42	48	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011247	ATA	2	6	73	78	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011247	TCA	2	6	83	88	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011247	GTT	2	6	111	116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011247	TGT	2	6	146	151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011247	TTA	2	6	195	200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011247	T	6	6	206	211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011247	GCTAT	2	10	215	224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011247	TTA	2	6	240	245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011247	ATT	2	6	341	346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011247	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011247	T	7	7	360	366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011247	TTA	2	6	414	419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011247	ATT	3	9	442	450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011247	T	7	7	469	475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011247	TTC	2	6	508	513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011247	T	6	6	529	534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011247	ATTTAT	2	12	537	548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011247	ATT	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011247	TA	3	6	562	567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011247	T	6	6	569	574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011247	TAT	2	6	609	614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011247	T	6	6	666	671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011247	TCA	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011247	TAA	2	6	722	727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011247	TTTTTG	2	12	733	744	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011247	AAT	2	6	771	776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011247	T	6	6	787	792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011247	TCT	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011247	CAT	2	6	840	845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011247	TAA	2	6	915	920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011247	GTC	2	6	927	932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011247	TAAA	2	8	946	953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011247	TGT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011247	TTG	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011247	TCT	2	6	1061	1066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011247	ATC	2	6	1072	1077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011247	TC	3	6	1124	1129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011247	CTA	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011247	T	9	9	1146	1154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011247	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011247	CTT	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011247	T	6	6	1240	1245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011247	TTGC	2	8	1261	1268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011247	AGT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011247	AAAT	2	8	1302	1309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011247	ACTA	2	8	1359	1366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011247	TTA	2	6	1371	1376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011247	TATTT	2	10	1444	1453	20 %	80 %	0 %	0 %	203288507
52	NC_011247	AT	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
53	NC_011247	CATA	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	203288507
54	NC_011247	T	7	7	1531	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	203288507
55	NC_011247	AT	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
56	NC_011247	ATC	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288507
57	NC_011247	AAT	2	6	1630	1635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
58	NC_011247	TCA	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288507
59	NC_011247	AT	3	6	1660	1665	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
60	NC_011247	ATC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288507
61	NC_011247	TTG	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288507
62	NC_011247	AT	3	6	1726	1731	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
63	NC_011247	ATA	2	6	1777	1782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
64	NC_011247	T	6	6	1783	1788	0 %	100 %	0 %	0 %	203288507
65	NC_011247	TAA	2	6	1790	1795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
66	NC_011247	CTT	2	6	1804	1809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288507
67	NC_011247	TAG	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288507
68	NC_011247	CAAAT	2	10	2000	2009	60 %	20 %	0 %	20 %	203288507
69	NC_011247	ATT	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288507
70	NC_011247	TAA	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
71	NC_011247	CTT	2	6	2134	2139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288507
72	NC_011247	TTG	3	9	2150	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288507
73	NC_011247	TTG	2	6	2162	2167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288507
74	NC_011247	TTTTG	2	10	2172	2181	0 %	80 %	20 %	0 %	203288507
75	NC_011247	TTC	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288507
76	NC_011247	TTCTT	3	15	2194	2208	0 %	80 %	0 %	20 %	203288507
77	NC_011247	TCT	2	6	2217	2222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288507
78	NC_011247	AGTT	2	8	2252	2259	25 %	50 %	25 %	0 %	203288507
79	NC_011247	T	6	6	2335	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	203288507
80	NC_011247	TCAC	2	8	2355	2362	25 %	25 %	0 %	50 %	203288507
81	NC_011247	T	6	6	2373	2378	0 %	100 %	0 %	0 %	203288507
82	NC_011247	TC	3	6	2407	2412	0 %	50 %	0 %	50 %	203288507
83	NC_011247	CT	3	6	2437	2442	0 %	50 %	0 %	50 %	203288507
84	NC_011247	ATA	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288507
85	NC_011247	TATC	2	8	2541	2548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011247	ATT	3	9	2553	2561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011247	A	6	6	2619	2624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011247	AT	3	6	2699	2704	50 %	50 %	0 %	0 %	203288508
89	NC_011247	ATTT	2	8	2731	2738	25 %	75 %	0 %	0 %	203288508
90	NC_011247	TTCA	2	8	2779	2786	25 %	50 %	0 %	25 %	203288508
91	NC_011247	AAT	2	6	2787	2792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
92	NC_011247	T	6	6	2832	2837	0 %	100 %	0 %	0 %	203288508
93	NC_011247	ATA	3	9	2914	2922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
94	NC_011247	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288508
95	NC_011247	T	6	6	2981	2986	0 %	100 %	0 %	0 %	203288508
96	NC_011247	AATG	2	8	2987	2994	50 %	25 %	25 %	0 %	203288508
97	NC_011247	AGTA	2	8	3041	3048	50 %	25 %	25 %	0 %	203288508
98	NC_011247	TCT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
99	NC_011247	ATT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288508
100	NC_011247	ATC	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288508
101	NC_011247	TCT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
102	NC_011247	ATC	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288508
103	NC_011247	TA	3	6	3209	3214	50 %	50 %	0 %	0 %	203288508
104	NC_011247	TAA	2	6	3217	3222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
105	NC_011247	TAA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
106	NC_011247	TTCTC	2	10	3284	3293	0 %	60 %	0 %	40 %	203288508
107	NC_011247	TTG	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288508
108	NC_011247	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288508
109	NC_011247	TCT	2	6	3404	3409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
110	NC_011247	CTT	3	9	3417	3425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
111	NC_011247	TTCTGC	2	12	3448	3459	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288508
112	NC_011247	TAT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288508
113	NC_011247	CTC	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288508
114	NC_011247	TTC	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288508
115	NC_011247	TAA	2	6	3603	3608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
116	NC_011247	ATA	2	6	3626	3631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288508
117	NC_011247	TTA	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011247	A	7	7	3666	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011247	TCA	2	6	3679	3684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011247	AAT	2	6	3711	3716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011247	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288509
122	NC_011247	GTC	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288509
123	NC_011247	T	6	6	3861	3866	0 %	100 %	0 %	0 %	203288509
124	NC_011247	TCT	2	6	3869	3874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288509
125	NC_011247	CTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288509
126	NC_011247	T	6	6	3918	3923	0 %	100 %	0 %	0 %	203288509
127	NC_011247	CT	3	6	3931	3936	0 %	50 %	0 %	50 %	203288509
128	NC_011247	TTC	2	6	3946	3951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288509
129	NC_011247	TTA	2	6	4017	4022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288509
130	NC_011247	TAATA	2	10	4027	4036	60 %	40 %	0 %	0 %	203288509
131	NC_011247	ATTA	2	8	4101	4108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011247	ATC	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011247	TAA	2	6	4177	4182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011247	AATA	2	8	4199	4206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011247	GAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011247	ATTTAT	2	12	4236	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011247	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011247	TAAT	2	8	4262	4269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011247	TAG	2	6	4284	4289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288510
140	NC_011247	CTT	2	6	4304	4309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288510
141	NC_011247	T	7	7	4312	4318	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
142	NC_011247	ATC	2	6	4334	4339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
143	NC_011247	CTT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288510
144	NC_011247	CAT	2	6	4432	4437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
145	NC_011247	TAA	2	6	4562	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288510
146	NC_011247	ATA	2	6	4586	4591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288510
147	NC_011247	TA	3	6	4622	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	203288510
148	NC_011247	T	9	9	4630	4638	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
149	NC_011247	TCA	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
150	NC_011247	GAT	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288510
151	NC_011247	ATC	2	6	4733	4738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
152	NC_011247	TTCT	2	8	4763	4770	0 %	75 %	0 %	25 %	203288510
153	NC_011247	CAA	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288510
154	NC_011247	TAT	2	6	4913	4918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288510
155	NC_011247	A	6	6	4920	4925	100 %	0 %	0 %	0 %	203288510
156	NC_011247	AAT	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288510
157	NC_011247	T	9	9	4983	4991	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
158	NC_011247	TTTCTT	2	12	5038	5049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203288510
159	NC_011247	TCT	2	6	5061	5066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288510
160	NC_011247	CAT	2	6	5128	5133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
161	NC_011247	ATC	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288510
162	NC_011247	AGA	2	6	5150	5155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288510
163	NC_011247	CAG	2	6	5173	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288510
164	NC_011247	AGC	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288510
165	NC_011247	AGC	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288510
166	NC_011247	AGGAGC	2	12	5210	5221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	203288510
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168	NC_011247	T	6	6	5285	5290	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
169	NC_011247	CTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288510
170	NC_011247	T	8	8	5343	5350	0 %	100 %	0 %	0 %	203288510
171	NC_011247	TTA	2	6	5377	5382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288510
172	NC_011247	TAT	2	6	5440	5445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011247	TCA	2	6	5459	5464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_011247	A	6	6	5486	5491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011247	TA	3	6	5502	5507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011247	ATA	3	9	5515	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011247	A	6	6	5526	5531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_011247	TA	5	10	5532	5541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011247	TAA	2	6	5572	5577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_011247	TTAT	2	8	5578	5585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_011247	AATA	2	8	5594	5601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011247	ATTTAT	2	12	5631	5642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_011247	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011247	TAAT	2	8	5657	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_011247	CAT	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288511
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188	NC_011247	TTG	2	6	5840	5845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288511
189	NC_011247	CTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288511
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201	NC_011247	CTT	3	9	6187	6195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288511
202	NC_011247	CAT	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288511
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217	NC_011247	TCA	2	6	6782	6787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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219	NC_011247	TA	3	6	6825	6830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_011247	ATA	3	9	6838	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_011247	A	8	8	6849	6856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_011247	TA	4	8	6857	6864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_011247	TAA	2	6	6893	6898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_011247	AATA	2	8	6915	6922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_011247	AAGA	2	8	6926	6933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
226	NC_011247	TTAA	2	8	6970	6977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_011247	TA	3	6	7296	7301	50 %	50 %	0 %	0 %	203288512
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259	NC_011247	TAA	2	6	8116	8121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_011247	TA	4	8	8123	8130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_011247	AATA	2	8	8138	8145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_011247	ATT	2	6	8195	8200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_011247	AATT	2	8	8213	8220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_011247	TA	3	6	8519	8524	50 %	50 %	0 %	0 %	203288513
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278	NC_011247	TAT	2	6	8788	8793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288513
279	NC_011247	ACA	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288513
280	NC_011247	AAT	2	6	8831	8836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288513
281	NC_011247	TACTCC	2	12	8839	8850	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203288513
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283	NC_011247	CAT	2	6	8875	8880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288513
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412	NC_011247	TA	3	6	13086	13091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_011247	TAA	2	6	13100	13105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_011247	TA	4	8	13107	13114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_011247	TAT	2	6	13166	13171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_011247	GT	3	6	13287	13292	0 %	50 %	50 %	0 %	203288517
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454	NC_011247	TAA	2	6	14303	14308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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