MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 52906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46503	NC_010816	TCG	2	6	2091009	2091014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440614
46504	NC_010816	CCA	2	6	2091097	2091102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440614
46505	NC_010816	GGT	2	6	2091113	2091118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440614
46506	NC_010816	TCGG	2	8	2091207	2091214	0 %	25 %	50 %	25 %	189440614
46507	NC_010816	TGG	2	6	2091229	2091234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440614
46508	NC_010816	TTG	2	6	2091235	2091240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440614
46509	NC_010816	CGG	2	6	2091286	2091291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440614
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46514	NC_010816	TGC	2	6	2091486	2091491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440614
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46532	NC_010816	TGTGT	2	10	2092184	2092193	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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46619	NC_010816	CGA	2	6	2096100	2096105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440617
46620	NC_010816	TCT	2	6	2096121	2096126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440617
46621	NC_010816	GGCCG	2	10	2096128	2096137	0 %	0 %	60 %	40 %	189440617
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46730	NC_010816	GCG	2	6	2101249	2101254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440620
46731	NC_010816	TACC	2	8	2101267	2101274	25 %	25 %	0 %	50 %	189440620
46732	NC_010816	GCT	2	6	2101276	2101281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440620
46733	NC_010816	TATACG	2	12	2101439	2101450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189440620
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46735	NC_010816	CCA	2	6	2101573	2101578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440620
46736	NC_010816	TGA	2	6	2101611	2101616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440620
46737	NC_010816	CGC	2	6	2101639	2101644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440620
46738	NC_010816	GC	3	6	2101653	2101658	0 %	0 %	50 %	50 %	189440620
46739	NC_010816	CGA	3	9	2101705	2101713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440620
46740	NC_010816	GC	3	6	2101883	2101888	0 %	0 %	50 %	50 %	189440621
46741	NC_010816	GAT	2	6	2101889	2101894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440621
46742	NC_010816	GAT	2	6	2102043	2102048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440621
46743	NC_010816	CAC	2	6	2102058	2102063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440621
46744	NC_010816	GCC	2	6	2102094	2102099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440621
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46746	NC_010816	GAT	2	6	2102109	2102114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440621
46747	NC_010816	CAG	2	6	2102124	2102129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440621
46748	NC_010816	GCC	2	6	2102146	2102151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440621
46749	NC_010816	TTC	2	6	2102287	2102292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440621
46750	NC_010816	CGC	2	6	2102294	2102299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440621
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46753	NC_010816	GTC	2	6	2102409	2102414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440621
46754	NC_010816	GGT	2	6	2102420	2102425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440621
46755	NC_010816	CCA	2	6	2102450	2102455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440621
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46757	NC_010816	GAT	2	6	2102553	2102558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440621
46758	NC_010816	CGC	2	6	2102615	2102620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440621
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46762	NC_010816	CGG	2	6	2102755	2102760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440621
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46764	NC_010816	GCG	3	9	2102847	2102855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440621
46765	NC_010816	GC	4	8	2102858	2102865	0 %	0 %	50 %	50 %	189440621
46766	NC_010816	CGATGA	2	12	2102870	2102881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189440621
46767	NC_010816	CAC	3	9	2102892	2102900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440621
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46769	NC_010816	ATTCA	2	10	2103194	2103203	40 %	40 %	0 %	20 %	189440622
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46771	NC_010816	GCG	2	6	2103246	2103251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440622
46772	NC_010816	TCG	2	6	2103264	2103269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440622
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46774	NC_010816	CGT	2	6	2103296	2103301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440622
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46790	NC_010816	GAGCAC	2	12	2104076	2104087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440622
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46801	NC_010816	GGC	2	6	2104430	2104435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440622
46802	NC_010816	CTGA	2	8	2104519	2104526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46803	NC_010816	GA	3	6	2104529	2104534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46804	NC_010816	CAG	2	6	2104546	2104551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46805	NC_010816	GACC	2	8	2104562	2104569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46806	NC_010816	TCCC	2	8	2104589	2104596	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46807	NC_010816	CTTTTT	2	12	2104752	2104763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46808	NC_010816	TCT	2	6	2104774	2104779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46809	NC_010816	AT	3	6	2104800	2104805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46810	NC_010816	GCA	2	6	2104890	2104895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46811	NC_010816	CAA	2	6	2104934	2104939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46812	NC_010816	GCAC	2	8	2105043	2105050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46813	NC_010816	TGG	2	6	2105190	2105195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46814	NC_010816	TTG	2	6	2105220	2105225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46815	NC_010816	AATGA	2	10	2105291	2105300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46816	NC_010816	CG	3	6	2105356	2105361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46817	NC_010816	TCA	2	6	2105416	2105421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46818	NC_010816	TGA	2	6	2105430	2105435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46819	NC_010816	AGGA	2	8	2105443	2105450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46820	NC_010816	CAA	2	6	2105470	2105475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440624
46821	NC_010816	GCT	2	6	2105486	2105491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440624
46822	NC_010816	AGC	2	6	2105503	2105508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440624
46823	NC_010816	GCG	2	6	2105532	2105537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440624
46824	NC_010816	CCA	2	6	2105691	2105696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440624
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46828	NC_010816	ACTT	2	8	2105936	2105943	25 %	50 %	0 %	25 %	189440624
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46831	NC_010816	CAT	2	6	2106043	2106048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440624
46832	NC_010816	TGA	2	6	2106061	2106066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440624
46833	NC_010816	ATG	4	12	2106071	2106082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440624
46834	NC_010816	CAG	2	6	2106185	2106190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440624
46835	NC_010816	ACA	2	6	2106198	2106203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440624
46836	NC_010816	GCC	2	6	2106206	2106211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
46837	NC_010816	TCCA	2	8	2106248	2106255	25 %	25 %	0 %	50 %	189440624
46838	NC_010816	GCC	2	6	2106281	2106286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
46839	NC_010816	CCG	2	6	2106315	2106320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
46840	NC_010816	CTGGTG	2	12	2106327	2106338	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189440624
46841	NC_010816	TGG	2	6	2106397	2106402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440624
46842	NC_010816	TGA	2	6	2106481	2106486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440624
46843	NC_010816	GCC	2	6	2106512	2106517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
46844	NC_010816	ACC	2	6	2106518	2106523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440624
46845	NC_010816	ACT	2	6	2106555	2106560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440624
46846	NC_010816	ACA	2	6	2106603	2106608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440624
46847	NC_010816	CCG	2	6	2106666	2106671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
46848	NC_010816	AGA	2	6	2106723	2106728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440624
46849	NC_010816	GAA	2	6	2106745	2106750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440624
46850	NC_010816	GCCG	2	8	2106812	2106819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46851	NC_010816	TGC	2	6	2106900	2106905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46852	NC_010816	TAT	2	6	2106962	2106967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440625
46853	NC_010816	ACT	2	6	2106978	2106983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440625
46854	NC_010816	GCC	3	9	2107011	2107019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440625
46855	NC_010816	CAT	2	6	2107118	2107123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440625
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46857	NC_010816	CGG	2	6	2107178	2107183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440625
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46859	NC_010816	CGC	2	6	2107310	2107315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440625
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46861	NC_010816	CGT	2	6	2107406	2107411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440625
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46967	NC_010816	CCA	2	6	2112039	2112044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440628
46968	NC_010816	ATC	2	6	2112062	2112067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440628
46969	NC_010816	CAT	2	6	2112079	2112084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440628
46970	NC_010816	GCA	2	6	2112231	2112236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440628
46971	NC_010816	CG	4	8	2112241	2112248	0 %	0 %	50 %	50 %	189440628
46972	NC_010816	CTG	2	6	2112257	2112262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440628
46973	NC_010816	ACT	2	6	2112315	2112320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440628
46974	NC_010816	CCA	2	6	2112342	2112347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440628
46975	NC_010816	GCACCC	2	12	2112372	2112383	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	189440628
46976	NC_010816	CAT	2	6	2112445	2112450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440628
46977	NC_010816	ATG	2	6	2112496	2112501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46978	NC_010816	CTTGAC	2	12	2112579	2112590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189440629
46979	NC_010816	ACGCA	2	10	2112593	2112602	40 %	0 %	20 %	40 %	189440629
46980	NC_010816	CGG	2	6	2112673	2112678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440629
46981	NC_010816	TTG	2	6	2112706	2112711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440629
46982	NC_010816	CGC	2	6	2112761	2112766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440629
46983	NC_010816	CGC	3	9	2112773	2112781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440629
46984	NC_010816	CCG	2	6	2112787	2112792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440629
46985	NC_010816	GGA	2	6	2112806	2112811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440629
46986	NC_010816	CAT	2	6	2112833	2112838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440629
46987	NC_010816	CGA	2	6	2112869	2112874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440629
46988	NC_010816	TCG	2	6	2112886	2112891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440629
46989	NC_010816	GGC	2	6	2112903	2112908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440629
46990	NC_010816	GCC	2	6	2112912	2112917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440629
46991	NC_010816	ACT	2	6	2112934	2112939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440629
46992	NC_010816	CAA	2	6	2112947	2112952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440629
46993	NC_010816	GAA	2	6	2113049	2113054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440629
46994	NC_010816	GGC	3	9	2113055	2113063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440629
46995	NC_010816	CGG	2	6	2113079	2113084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440629
46996	NC_010816	CGG	2	6	2113169	2113174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440629
46997	NC_010816	CGC	2	6	2113331	2113336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440629
46998	NC_010816	CGG	2	6	2113349	2113354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440629
46999	NC_010816	GCG	3	9	2113384	2113392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440629
47000	NC_010816	CTG	2	6	2113395	2113400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440629

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