MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 52906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010816	CGG	2	6	136618	136623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438978
3002	NC_010816	TGC	2	6	136631	136636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438978
3003	NC_010816	GGA	2	6	136763	136768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438978
3004	NC_010816	AGCTTG	2	12	136777	136788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189438978
3005	NC_010816	CCG	2	6	136793	136798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438978
3006	NC_010816	CGA	2	6	136805	136810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438978
3007	NC_010816	ATG	2	6	136826	136831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438978
3008	NC_010816	CGC	2	6	136922	136927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438979
3009	NC_010816	CGC	2	6	136934	136939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438979
3010	NC_010816	TGG	2	6	136944	136949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438979
3011	NC_010816	CCGGTG	2	12	136952	136963	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189438979
3012	NC_010816	GC	3	6	136971	136976	0 %	0 %	50 %	50 %	189438979
3013	NC_010816	GCA	2	6	137032	137037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438979
3014	NC_010816	CCG	3	9	137052	137060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438979
3015	NC_010816	CGA	2	6	137242	137247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438979
3016	NC_010816	GCC	2	6	137270	137275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438979
3017	NC_010816	TGG	2	6	137370	137375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438979
3018	NC_010816	GAAG	2	8	137386	137393	50 %	0 %	50 %	0 %	189438979
3019	NC_010816	TCA	2	6	137454	137459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438979
3020	NC_010816	GGCC	2	8	137527	137534	0 %	0 %	50 %	50 %	189438979
3021	NC_010816	CCTG	2	8	137559	137566	0 %	25 %	25 %	50 %	189438979
3022	NC_010816	TC	4	8	137615	137622	0 %	50 %	0 %	50 %	189438979
3023	NC_010816	CGC	2	6	137625	137630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438979
3024	NC_010816	CAT	2	6	137698	137703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438979
3025	NC_010816	CCG	2	6	137754	137759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438979
3026	NC_010816	TCA	2	6	137889	137894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438979
3027	NC_010816	TCA	2	6	137904	137909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438979
3028	NC_010816	TCG	2	6	137931	137936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438979
3029	NC_010816	GCT	2	6	137941	137946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438979
3030	NC_010816	CGC	2	6	137965	137970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438979
3031	NC_010816	AAG	3	9	138111	138119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010816	CACC	2	8	138157	138164	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3033	NC_010816	CGA	2	6	138283	138288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438980
3034	NC_010816	GTG	2	6	138500	138505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438980
3035	NC_010816	CGGC	2	8	138573	138580	0 %	0 %	50 %	50 %	189438980
3036	NC_010816	ACC	2	6	138617	138622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438980
3037	NC_010816	TTG	2	6	138861	138866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438980
3038	NC_010816	CGAA	2	8	138870	138877	50 %	0 %	25 %	25 %	189438980
3039	NC_010816	GT	3	6	138900	138905	0 %	50 %	50 %	0 %	189438980
3040	NC_010816	CGC	2	6	138964	138969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438980
3041	NC_010816	TGA	2	6	139011	139016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438980
3042	NC_010816	GTGC	2	8	139034	139041	0 %	25 %	50 %	25 %	189438980
3043	NC_010816	TGC	2	6	139113	139118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438980
3044	NC_010816	CCG	2	6	139200	139205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438980
3045	NC_010816	CAAT	2	8	139250	139257	50 %	25 %	0 %	25 %	189438980
3046	NC_010816	AT	3	6	139298	139303	50 %	50 %	0 %	0 %	189438980
3047	NC_010816	GGT	2	6	139324	139329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438980
3048	NC_010816	CTG	3	9	139331	139339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438980
3049	NC_010816	CATC	2	8	139344	139351	25 %	25 %	0 %	50 %	189438980
3050	NC_010816	TGG	2	6	139362	139367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438980
3051	NC_010816	CGG	2	6	139386	139391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438980
3052	NC_010816	GGC	2	6	139401	139406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438980
3053	NC_010816	GA	3	6	139407	139412	50 %	0 %	50 %	0 %	189438980
3054	NC_010816	GCT	2	6	139492	139497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438980
3055	NC_010816	CAC	2	6	139510	139515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438980
3056	NC_010816	TCT	2	6	139533	139538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438980
3057	NC_010816	GTG	2	6	139643	139648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438980
3058	NC_010816	TCCG	2	8	139706	139713	0 %	25 %	25 %	50 %	189438980
3059	NC_010816	TCG	2	6	139735	139740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438980
3060	NC_010816	CTGG	2	8	139813	139820	0 %	25 %	50 %	25 %	189438980
3061	NC_010816	TTTA	2	8	139871	139878	25 %	75 %	0 %	0 %	189438980
3062	NC_010816	ACT	2	6	139882	139887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438980
3063	NC_010816	GAGAT	2	10	139923	139932	40 %	20 %	40 %	0 %	189438981
3064	NC_010816	GGTGT	2	10	139952	139961	0 %	40 %	60 %	0 %	189438981
3065	NC_010816	ATC	2	6	139994	139999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438981
3066	NC_010816	CGCT	2	8	140123	140130	0 %	25 %	25 %	50 %	189438981
3067	NC_010816	CGC	2	6	140158	140163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438981
3068	NC_010816	CGG	2	6	140181	140186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438981
3069	NC_010816	GCG	2	6	140192	140197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438981
3070	NC_010816	GCC	2	6	140204	140209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438981
3071	NC_010816	GCT	2	6	140278	140283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438981
3072	NC_010816	GC	3	6	140353	140358	0 %	0 %	50 %	50 %	189438981
3073	NC_010816	CTTGGC	2	12	140359	140370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438981
3074	NC_010816	CGC	2	6	140379	140384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438981
3075	NC_010816	CGG	2	6	140443	140448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438981
3076	NC_010816	GC	3	6	140480	140485	0 %	0 %	50 %	50 %	189438981
3077	NC_010816	GTTG	2	8	140581	140588	0 %	50 %	50 %	0 %	189438981
3078	NC_010816	G	6	6	140595	140600	0 %	0 %	100 %	0 %	189438981
3079	NC_010816	TTCG	2	8	140622	140629	0 %	50 %	25 %	25 %	189438981
3080	NC_010816	CGT	2	6	140678	140683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438982
3081	NC_010816	AGC	2	6	140795	140800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438982
3082	NC_010816	GCC	2	6	140830	140835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438982
3083	NC_010816	GGT	2	6	140841	140846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438982
3084	NC_010816	ATC	2	6	140971	140976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438982
3085	NC_010816	CGT	2	6	140980	140985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438982
3086	NC_010816	GTGCGC	2	12	141010	141021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189438982
3087	NC_010816	CGA	2	6	141060	141065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438982
3088	NC_010816	GCC	2	6	141073	141078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438982
3089	NC_010816	GAG	2	6	141079	141084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438982
3090	NC_010816	AAC	2	6	141094	141099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438982
3091	NC_010816	TGG	2	6	141132	141137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438982
3092	NC_010816	GCC	2	6	141163	141168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438982
3093	NC_010816	TCGC	2	8	141170	141177	0 %	25 %	25 %	50 %	189438982
3094	NC_010816	GAT	2	6	141222	141227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438982
3095	NC_010816	GCC	2	6	141322	141327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438982
3096	NC_010816	GGC	2	6	141427	141432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438982
3097	NC_010816	GTTC	2	8	141460	141467	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_010816	CGC	2	6	141469	141474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_010816	GGCCGA	2	12	141477	141488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_010816	ATG	2	6	141506	141511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_010816	AGGCGA	2	12	141617	141628	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3102	NC_010816	AGA	2	6	141644	141649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_010816	CT	3	6	141733	141738	0 %	50 %	0 %	50 %	189438983
3104	NC_010816	A	6	6	141751	141756	100 %	0 %	0 %	0 %	189438983
3105	NC_010816	CACATG	2	12	141780	141791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189438983
3106	NC_010816	GGT	2	6	141828	141833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438983
3107	NC_010816	CG	3	6	141873	141878	0 %	0 %	50 %	50 %	189438983
3108	NC_010816	GAA	2	6	141907	141912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438983
3109	NC_010816	CCG	3	9	141923	141931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438983
3110	NC_010816	GCC	2	6	141954	141959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438983
3111	NC_010816	CCGC	2	8	142026	142033	0 %	0 %	25 %	75 %	189438983
3112	NC_010816	GCC	2	6	142063	142068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438983
3113	NC_010816	CCA	2	6	142106	142111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438983
3114	NC_010816	GAT	2	6	142164	142169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438983
3115	NC_010816	CAA	2	6	142192	142197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438983
3116	NC_010816	CAT	2	6	142224	142229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438983
3117	NC_010816	GCA	2	6	142366	142371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438983
3118	NC_010816	ACCG	2	8	142438	142445	25 %	0 %	25 %	50 %	189438983
3119	NC_010816	AAC	2	6	142521	142526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438983
3120	NC_010816	ATC	2	6	142551	142556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438983
3121	NC_010816	CA	3	6	142563	142568	50 %	0 %	0 %	50 %	189438983
3122	NC_010816	CAT	2	6	142619	142624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438983
3123	NC_010816	AAG	2	6	142673	142678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438983
3124	NC_010816	CAAA	2	8	142718	142725	75 %	0 %	0 %	25 %	189438983
3125	NC_010816	CAA	2	6	142821	142826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438983
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3127	NC_010816	CAT	2	6	142844	142849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438983
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3155	NC_010816	GCC	2	6	144318	144323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3243	NC_010816	ATG	2	6	148042	148047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438987
3244	NC_010816	GAA	2	6	148131	148136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438987
3245	NC_010816	ACC	2	6	148139	148144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438987
3246	NC_010816	AGA	2	6	148160	148165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438987
3247	NC_010816	AGGA	2	8	148196	148203	50 %	0 %	50 %	0 %	189438987
3248	NC_010816	TTC	2	6	148204	148209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438987
3249	NC_010816	ATC	2	6	148237	148242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_010816	TAC	2	6	148250	148255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_010816	TTGG	2	8	148256	148263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_010816	GGC	2	6	148291	148296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_010816	GTT	2	6	148312	148317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_010816	GTA	2	6	148320	148325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_010816	ATT	2	6	148326	148331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_010816	CGG	2	6	148512	148517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438988
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3258	NC_010816	CGT	2	6	148547	148552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438988
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3263	NC_010816	GTT	2	6	148827	148832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438988
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3272	NC_010816	CTCGCT	2	12	149166	149177	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	189438988
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3321	NC_010816	TGA	3	9	151430	151438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3322	NC_010816	AGT	2	6	151507	151512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3333	NC_010816	CAC	2	6	151969	151974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3334	NC_010816	CAG	2	6	151998	152003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3354	NC_010816	CA	3	6	152830	152835	50 %	0 %	0 %	50 %	189438992
3355	NC_010816	GCA	2	6	152836	152841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438992
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3357	NC_010816	CGG	2	6	152898	152903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438992
3358	NC_010816	ACAGC	2	10	152989	152998	40 %	0 %	20 %	40 %	189438992
3359	NC_010816	GCC	2	6	153032	153037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438992
3360	NC_010816	CAG	3	9	153041	153049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438992
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3362	NC_010816	CGA	2	6	153088	153093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438992
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3488	NC_010816	TGT	2	6	158229	158234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3489	NC_010816	A	6	6	158256	158261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_010816	TCA	2	6	158277	158282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3491	NC_010816	ACT	2	6	158295	158300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438996
3492	NC_010816	CGG	2	6	158331	158336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438996
3493	NC_010816	CG	3	6	158413	158418	0 %	0 %	50 %	50 %	189438996
3494	NC_010816	CAG	2	6	158425	158430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438996
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3497	NC_010816	AGC	2	6	158499	158504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438996
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3499	NC_010816	GCC	2	6	158536	158541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438996
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