MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 52906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010816	TGCG	2	8	22079	22086	0 %	25 %	50 %	25 %	189438880
502	NC_010816	CG	3	6	22085	22090	0 %	0 %	50 %	50 %	189438880
503	NC_010816	CACC	2	8	22109	22116	25 %	0 %	0 %	75 %	189438880
504	NC_010816	CGA	2	6	22224	22229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438880
505	NC_010816	GCC	2	6	22261	22266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438880
506	NC_010816	CGT	2	6	22274	22279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438880
507	NC_010816	CG	3	6	22330	22335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_010816	GAG	2	6	22343	22348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010816	CAT	2	6	22383	22388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438881
510	NC_010816	GGTTG	2	10	22437	22446	0 %	40 %	60 %	0 %	189438881
511	NC_010816	GTGGC	2	10	22465	22474	0 %	20 %	60 %	20 %	189438881
512	NC_010816	GTC	2	6	22512	22517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438881
513	NC_010816	ACG	2	6	22522	22527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
514	NC_010816	GCCC	2	8	22536	22543	0 %	0 %	25 %	75 %	189438881
515	NC_010816	TGCGCC	2	12	22582	22593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189438881
516	NC_010816	GCC	2	6	22774	22779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438881
517	NC_010816	GCA	2	6	22787	22792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
518	NC_010816	GCC	2	6	22824	22829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438881
519	NC_010816	GTG	2	6	22914	22919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438881
520	NC_010816	CTC	2	6	22971	22976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438881
521	NC_010816	AGC	2	6	22978	22983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
522	NC_010816	TAC	2	6	23010	23015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438881
523	NC_010816	GCT	2	6	23026	23031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438881
524	NC_010816	TGA	2	6	23036	23041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438881
525	NC_010816	CGC	2	6	23141	23146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438881
526	NC_010816	CCG	2	6	23158	23163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438881
527	NC_010816	GCTGCC	2	12	23177	23188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189438881
528	NC_010816	TGG	2	6	23260	23265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438881
529	NC_010816	GCC	2	6	23346	23351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438881
530	NC_010816	CGC	2	6	23353	23358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438881
531	NC_010816	GTC	2	6	23359	23364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438881
532	NC_010816	GAG	2	6	23478	23483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438881
533	NC_010816	TCT	2	6	23530	23535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438881
534	NC_010816	CGC	2	6	23537	23542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438881
535	NC_010816	GCT	3	9	23564	23572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438881
536	NC_010816	CGTG	2	8	23579	23586	0 %	25 %	50 %	25 %	189438881
537	NC_010816	CTG	2	6	23610	23615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438881
538	NC_010816	GAA	2	6	23621	23626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438881
539	NC_010816	CGA	2	6	23672	23677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
540	NC_010816	GAT	2	6	23682	23687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438881
541	NC_010816	CAC	2	6	23727	23732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438881
542	NC_010816	GAG	2	6	23826	23831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438881
543	NC_010816	GCG	2	6	23836	23841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438881
544	NC_010816	CGTA	2	8	23846	23853	25 %	25 %	25 %	25 %	189438881
545	NC_010816	CGA	2	6	23861	23866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
546	NC_010816	CGA	2	6	23915	23920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
547	NC_010816	CGG	3	9	24056	24064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438881
548	NC_010816	CGA	2	6	24101	24106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
549	NC_010816	GC	3	6	24110	24115	0 %	0 %	50 %	50 %	189438881
550	NC_010816	CGA	2	6	24146	24151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438881
551	NC_010816	CGG	2	6	24223	24228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_010816	GAG	2	6	24254	24259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010816	TAG	2	6	24274	24279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010816	AAT	2	6	24297	24302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010816	CTT	2	6	24463	24468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_010816	AAC	2	6	24481	24486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010816	TTC	2	6	24552	24557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_010816	GCC	2	6	24579	24584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_010816	GAG	2	6	24608	24613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010816	TGT	2	6	24639	24644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438882
561	NC_010816	TGT	2	6	24652	24657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438882
562	NC_010816	CCT	2	6	24674	24679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438882
563	NC_010816	GC	3	6	24692	24697	0 %	0 %	50 %	50 %	189438882
564	NC_010816	GTT	2	6	24799	24804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438882
565	NC_010816	TGA	2	6	24915	24920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438882
566	NC_010816	CAT	2	6	24925	24930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438882
567	NC_010816	GCC	2	6	25101	25106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438882
568	NC_010816	TGA	2	6	25186	25191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438882
569	NC_010816	CAGC	2	8	25198	25205	25 %	0 %	25 %	50 %	189438882
570	NC_010816	ATGC	2	8	25262	25269	25 %	25 %	25 %	25 %	189438882
571	NC_010816	CTG	2	6	25296	25301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438882
572	NC_010816	CTC	2	6	25359	25364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438882
573	NC_010816	CGC	2	6	25417	25422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438882
574	NC_010816	CAG	2	6	25481	25486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438882
575	NC_010816	GTT	2	6	25544	25549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438882
576	NC_010816	GCG	2	6	25652	25657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_010816	GTC	2	6	25720	25725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010816	CA	3	6	25825	25830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_010816	GCCA	2	8	25844	25851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_010816	GCA	2	6	25875	25880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_010816	CAG	2	6	25912	25917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010816	ACA	2	6	25923	25928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_010816	GCA	2	6	25947	25952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_010816	CCA	2	6	25962	25967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_010816	GCA	2	6	25969	25974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010816	CAG	2	6	25988	25993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010816	GCC	2	6	26041	26046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_010816	TG	3	6	26089	26094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_010816	TCC	2	6	26132	26137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_010816	CAG	2	6	26165	26170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_010816	CAAG	2	8	26201	26208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
592	NC_010816	TGG	2	6	26345	26350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438883
593	NC_010816	CAA	2	6	26526	26531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438883
594	NC_010816	TCA	2	6	26561	26566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438883
595	NC_010816	AAG	2	6	26584	26589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438883
596	NC_010816	CGG	2	6	26670	26675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438883
597	NC_010816	CAG	3	9	26677	26685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438883
598	NC_010816	CG	3	6	26701	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	189438883
599	NC_010816	CGA	2	6	26736	26741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438883
600	NC_010816	GAT	2	6	26820	26825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438883
601	NC_010816	CG	3	6	26850	26855	0 %	0 %	50 %	50 %	189438883
602	NC_010816	GCC	2	6	26860	26865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438883
603	NC_010816	CGA	2	6	26916	26921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438883
604	NC_010816	TTC	2	6	26923	26928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438883
605	NC_010816	GACC	2	8	26940	26947	25 %	0 %	25 %	50 %	189438883
606	NC_010816	CGC	2	6	27061	27066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438884
607	NC_010816	CGC	2	6	27070	27075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438884
608	NC_010816	GCG	2	6	27105	27110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438884
609	NC_010816	AAG	2	6	27170	27175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438884
610	NC_010816	GACGTG	2	12	27197	27208	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189438884
611	NC_010816	ATC	2	6	27251	27256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438884
612	NC_010816	GGAA	2	8	27258	27265	50 %	0 %	50 %	0 %	189438884
613	NC_010816	AGC	2	6	27276	27281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438884
614	NC_010816	CGA	2	6	27340	27345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438884
615	NC_010816	AAG	2	6	27350	27355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438884
616	NC_010816	GAC	2	6	27413	27418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438884
617	NC_010816	CCG	2	6	27483	27488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438884
618	NC_010816	ACC	2	6	27590	27595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438884
619	NC_010816	GAC	2	6	27596	27601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438884
620	NC_010816	ATC	2	6	27602	27607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438884
621	NC_010816	GGCC	2	8	27610	27617	0 %	0 %	50 %	50 %	189438884
622	NC_010816	CG	3	6	27630	27635	0 %	0 %	50 %	50 %	189438884
623	NC_010816	GGT	2	6	27646	27651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438884
624	NC_010816	TAC	2	6	27674	27679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438884
625	NC_010816	AAG	2	6	27692	27697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438884
626	NC_010816	CCA	2	6	27714	27719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438884
627	NC_010816	CAA	2	6	27724	27729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438884
628	NC_010816	AGGAG	2	10	27841	27850	40 %	0 %	60 %	0 %	189438884
629	NC_010816	TGA	2	6	27854	27859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438884
630	NC_010816	CAT	3	9	28053	28061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438885
631	NC_010816	CAC	2	6	28119	28124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438885
632	NC_010816	CTT	2	6	28128	28133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438885
633	NC_010816	CGG	2	6	28166	28171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438885
634	NC_010816	AGGCCG	2	12	28223	28234	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189438885
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637	NC_010816	TGA	2	6	28394	28399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438885
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639	NC_010816	ATC	2	6	28429	28434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438885
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641	NC_010816	CAC	2	6	28494	28499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438885
642	NC_010816	CAA	2	6	28509	28514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438885
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645	NC_010816	CCG	2	6	28674	28679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
646	NC_010816	CAGCT	2	10	28692	28701	20 %	20 %	20 %	40 %	189438886
647	NC_010816	CCG	2	6	28717	28722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
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650	NC_010816	GTG	2	6	28806	28811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
651	NC_010816	CTG	2	6	28839	28844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
652	NC_010816	CCG	2	6	28870	28875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
653	NC_010816	TCG	2	6	28879	28884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
654	NC_010816	TGC	3	9	28906	28914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
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656	NC_010816	GTTCGC	2	12	28937	28948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
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658	NC_010816	GGT	2	6	29009	29014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
659	NC_010816	GGC	2	6	29052	29057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438886
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661	NC_010816	TGC	2	6	29140	29145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438886
662	NC_010816	GCC	2	6	29148	29153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438886
663	NC_010816	GTG	2	6	29169	29174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438886
664	NC_010816	ATC	2	6	29199	29204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438886
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702	NC_010816	AAG	2	6	31357	31362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
703	NC_010816	A	6	6	31375	31380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
704	NC_010816	GAG	2	6	31502	31507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438888
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712	NC_010816	T	7	7	31845	31851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
713	NC_010816	TGCA	2	8	31866	31873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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720	NC_010816	GTG	2	6	32052	32057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438889
721	NC_010816	ATG	2	6	32061	32066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438889
722	NC_010816	GAT	2	6	32090	32095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438889
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742	NC_010816	GCC	2	6	33188	33193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438891
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752	NC_010816	GCT	2	6	33896	33901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438891
753	NC_010816	CG	3	6	33912	33917	0 %	0 %	50 %	50 %	189438891
754	NC_010816	TCC	2	6	33919	33924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189438891
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