MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 1

Total Repeats: 111947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010681	CGC	2	6	150	155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010681	GCT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010681	TTG	2	6	236	241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010681	GC	3	6	245	250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010681	CCG	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010681	CAG	2	6	353	358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
7	NC_010681	ACGTG	2	10	360	369	20 %	20 %	40 %	20 %	187922036
8	NC_010681	CGC	2	6	400	405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
9	NC_010681	CGC	2	6	424	429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
10	NC_010681	GGC	2	6	620	625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
11	NC_010681	GCG	2	6	674	679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
12	NC_010681	CG	4	8	685	692	0 %	0 %	50 %	50 %	187922036
13	NC_010681	AAC	2	6	713	718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922036
14	NC_010681	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
15	NC_010681	CG	4	8	772	779	0 %	0 %	50 %	50 %	187922036
16	NC_010681	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
17	NC_010681	CGAA	2	8	828	835	50 %	0 %	25 %	25 %	187922036
18	NC_010681	GCC	2	6	842	847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
19	NC_010681	CGC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
20	NC_010681	AACGGC	2	12	884	895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
21	NC_010681	CGC	2	6	985	990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
22	NC_010681	GGC	2	6	1046	1051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
23	NC_010681	GC	3	6	1116	1121	0 %	0 %	50 %	50 %	187922036
24	NC_010681	GTG	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922036
25	NC_010681	CGA	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
26	NC_010681	CTA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922036
27	NC_010681	CTCG	2	8	1213	1220	0 %	25 %	25 %	50 %	187922036
28	NC_010681	CTG	3	9	1223	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
29	NC_010681	CGA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
30	NC_010681	CA	3	6	1267	1272	50 %	0 %	0 %	50 %	187922036
31	NC_010681	AGA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
32	NC_010681	TTC	2	6	1280	1285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922036
33	NC_010681	CGA	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
34	NC_010681	GCC	2	6	1417	1422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
35	NC_010681	TGAA	2	8	1482	1489	50 %	25 %	25 %	0 %	187922036
36	NC_010681	TTC	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922036
37	NC_010681	CGTG	2	8	1528	1535	0 %	25 %	50 %	25 %	187922036
38	NC_010681	AAG	2	6	1611	1616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
39	NC_010681	CTG	2	6	1628	1633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
40	NC_010681	AGA	2	6	1671	1676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
41	NC_010681	GAA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
42	NC_010681	CG	3	6	1741	1746	0 %	0 %	50 %	50 %	187922036
43	NC_010681	AGA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
44	NC_010681	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
45	NC_010681	ACCAC	2	10	1830	1839	40 %	0 %	0 %	60 %	187922036
46	NC_010681	TGC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
47	NC_010681	CGA	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
48	NC_010681	GCA	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
49	NC_010681	GTCT	2	8	1940	1947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010681	A	6	6	1950	1955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010681	CGG	2	6	2033	2038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010681	CGG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010681	GC	3	6	2098	2103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010681	GC	3	6	2124	2129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010681	CCT	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922037
56	NC_010681	TCG	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
57	NC_010681	CGC	2	6	2226	2231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
58	NC_010681	CAC	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922037
59	NC_010681	GCG	2	6	2344	2349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922037
60	NC_010681	CTC	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922037
61	NC_010681	GC	3	6	2396	2401	0 %	0 %	50 %	50 %	187922037
62	NC_010681	TCACGC	2	12	2419	2430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187922037
63	NC_010681	CGC	2	6	2489	2494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
64	NC_010681	CAG	2	6	2601	2606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
65	NC_010681	TGC	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
66	NC_010681	TGG	3	9	2638	2646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922037
67	NC_010681	ACGG	2	8	2673	2680	25 %	0 %	50 %	25 %	187922037
68	NC_010681	CTG	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
69	NC_010681	CGA	2	6	2789	2794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
70	NC_010681	TGG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922037
71	NC_010681	GAA	2	6	2940	2945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922037
72	NC_010681	CGC	2	6	2966	2971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
73	NC_010681	GAA	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922037
74	NC_010681	ACG	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
75	NC_010681	ACG	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
76	NC_010681	CGT	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
77	NC_010681	AC	3	6	3279	3284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010681	AGC	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010681	GCA	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010681	A	6	6	3366	3371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010681	ACA	2	6	3403	3408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922038
82	NC_010681	CGA	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
83	NC_010681	GAC	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
84	NC_010681	AGCGC	2	10	3670	3679	20 %	0 %	40 %	40 %	187922038
85	NC_010681	TGA	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
86	NC_010681	CGG	2	6	3710	3715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
87	NC_010681	CGG	2	6	3746	3751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
88	NC_010681	GGCGTG	2	12	3759	3770	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	187922038
89	NC_010681	CGTG	2	8	3772	3779	0 %	25 %	50 %	25 %	187922038
90	NC_010681	CGC	2	6	3813	3818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922038
91	NC_010681	AAG	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
92	NC_010681	CGA	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
93	NC_010681	GACC	2	8	4058	4065	25 %	0 %	25 %	50 %	187922038
94	NC_010681	GAA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
95	NC_010681	GCG	2	6	4102	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
96	NC_010681	TGC	2	6	4147	4152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
97	NC_010681	GCG	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
98	NC_010681	GGCGTG	2	12	4188	4199	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	187922038
99	NC_010681	GTGCT	2	10	4239	4248	0 %	40 %	40 %	20 %	187922038
100	NC_010681	AAC	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922038
101	NC_010681	CG	3	6	4312	4317	0 %	0 %	50 %	50 %	187922038
102	NC_010681	GAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
103	NC_010681	CGA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
104	NC_010681	CGTG	2	8	4402	4409	0 %	25 %	50 %	25 %	187922038
105	NC_010681	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	187922038
106	NC_010681	GTC	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
107	NC_010681	GC	4	8	4478	4485	0 %	0 %	50 %	50 %	187922038
108	NC_010681	ATT	2	6	4551	4556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187922038
109	NC_010681	GCA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
110	NC_010681	GCG	2	6	4575	4580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
111	NC_010681	CG	5	10	4579	4588	0 %	0 %	50 %	50 %	187922038
112	NC_010681	TCG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
113	NC_010681	GCT	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
114	NC_010681	TTC	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922038
115	NC_010681	CAT	4	12	4919	4930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
116	NC_010681	TGT	2	6	4969	4974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922038
117	NC_010681	TTC	2	6	4980	4985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922038
118	NC_010681	GAT	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
119	NC_010681	TATATC	2	12	5019	5030	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187922038
120	NC_010681	GCC	2	6	5036	5041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922038
121	NC_010681	GTT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922038
122	NC_010681	CAT	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
123	NC_010681	GAAGC	2	10	5334	5343	40 %	0 %	40 %	20 %	187922038
124	NC_010681	GAT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
125	NC_010681	ACG	2	6	5379	5384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
126	NC_010681	CAT	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
127	NC_010681	AGA	2	6	5446	5451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
128	NC_010681	CTG	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
129	NC_010681	GCTG	2	8	5609	5616	0 %	25 %	50 %	25 %	187922038
130	NC_010681	AGC	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
131	NC_010681	CGT	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
132	NC_010681	GAT	2	6	5778	5783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
133	NC_010681	GCGG	2	8	5822	5829	0 %	0 %	75 %	25 %	187922038
134	NC_010681	GCT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010681	T	6	6	5919	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	187922039
136	NC_010681	TTG	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922039
137	NC_010681	AGC	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922039
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139	NC_010681	CAT	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922039
140	NC_010681	CGG	2	6	6086	6091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922039
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143	NC_010681	CGA	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922039
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145	NC_010681	ACCG	2	8	6333	6340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010681	CG	5	10	6377	6386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010681	GCT	2	6	6509	6514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010681	GC	5	10	6546	6555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010681	GTC	2	6	6569	6574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010681	GTA	2	6	6699	6704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010681	CCAC	2	8	6711	6718	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_010681	CG	3	6	6736	6741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010681	ACAG	2	8	6821	6828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010681	ATC	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_010681	TTC	2	6	7215	7220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_010681	TC	3	6	7316	7321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_010681	CCA	2	6	7350	7355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_010681	ATC	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_010681	TAT	2	6	7443	7448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010681	TGC	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_010681	TTA	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010681	TCCA	2	8	7649	7656	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_010681	CGC	2	6	7759	7764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922040
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178	NC_010681	GGGT	2	8	8618	8625	0 %	25 %	75 %	0 %	187922040
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239	NC_010681	GC	4	8	11513	11520	0 %	0 %	50 %	50 %	187922042
240	NC_010681	GTA	2	6	11522	11527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922042
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243	NC_010681	GC	3	6	11618	11623	0 %	0 %	50 %	50 %	187922042
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246	NC_010681	CGA	2	6	11856	11861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922042
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248	NC_010681	ACT	2	6	11895	11900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922042
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250	NC_010681	AGGA	2	8	11977	11984	50 %	0 %	50 %	0 %	187922042
251	NC_010681	TGA	2	6	12053	12058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922042
252	NC_010681	CCA	2	6	12094	12099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922042
253	NC_010681	TGC	2	6	12101	12106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922042
254	NC_010681	GC	3	6	12195	12200	0 %	0 %	50 %	50 %	187922042
255	NC_010681	AAC	2	6	12274	12279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922042
256	NC_010681	CGC	2	6	12314	12319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922042
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258	NC_010681	CTA	2	6	12411	12416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922042
259	NC_010681	CGA	2	6	12417	12422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922042
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262	NC_010681	CGA	2	6	12543	12548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922042
263	NC_010681	CAT	2	6	12549	12554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922042
264	NC_010681	GC	3	6	12580	12585	0 %	0 %	50 %	50 %	187922042
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266	NC_010681	ACA	2	6	12662	12667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922042
267	NC_010681	CGA	2	6	12735	12740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922042
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269	NC_010681	TGC	2	6	12767	12772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922042
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271	NC_010681	GATG	2	8	12960	12967	25 %	25 %	50 %	0 %	187922042
272	NC_010681	GGC	2	6	12996	13001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922042
273	NC_010681	CGC	2	6	13019	13024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922042
274	NC_010681	CTA	2	6	13083	13088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922042
275	NC_010681	CT	3	6	13096	13101	0 %	50 %	0 %	50 %	187922042
276	NC_010681	GACC	2	8	13116	13123	25 %	0 %	25 %	50 %	187922042
277	NC_010681	CGC	2	6	13136	13141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922042
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280	NC_010681	ATTC	2	8	13251	13258	25 %	50 %	0 %	25 %	187922042
281	NC_010681	GC	3	6	13275	13280	0 %	0 %	50 %	50 %	187922042
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284	NC_010681	CTT	2	6	13483	13488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922042
285	NC_010681	AGGACA	2	12	13559	13570	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187922042
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297	NC_010681	GTG	2	6	14055	14060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922042
298	NC_010681	GAA	2	6	14186	14191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922042
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394	NC_010681	ATT	2	6	18728	18733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187922046
395	NC_010681	TCC	2	6	18871	18876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922046
396	NC_010681	AGC	2	6	18891	18896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922046
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400	NC_010681	A	8	8	19065	19072	100 %	0 %	0 %	0 %	187922047
401	NC_010681	GGC	2	6	19111	19116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922047
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404	NC_010681	CAGT	2	8	19216	19223	25 %	25 %	25 %	25 %	187922047
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492	NC_010681	GGTCA	2	10	24092	24101	20 %	20 %	40 %	20 %	187922049
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498	NC_010681	CTC	2	6	24621	24626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922050
499	NC_010681	CGG	2	6	24635	24640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922050
500	NC_010681	A	6	6	24658	24663	100 %	0 %	0 %	0 %	187922050

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