MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 2475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010679	TCA	2	6	23844	23849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921892
502	NC_010679	CGT	2	6	23880	23885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921892
503	NC_010679	AGGC	2	8	23933	23940	25 %	0 %	50 %	25 %	187921892
504	NC_010679	GC	3	6	23939	23944	0 %	0 %	50 %	50 %	187921892
505	NC_010679	GCGG	2	8	24017	24024	0 %	0 %	75 %	25 %	187921892
506	NC_010679	CGC	2	6	24027	24032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921892
507	NC_010679	GC	3	6	24054	24059	0 %	0 %	50 %	50 %	187921892
508	NC_010679	CGC	2	6	24077	24082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921892
509	NC_010679	TGTCC	2	10	24105	24114	0 %	40 %	20 %	40 %	187921892
510	NC_010679	CTG	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921892
511	NC_010679	TGAG	2	8	24152	24159	25 %	25 %	50 %	0 %	187921892
512	NC_010679	ACGC	2	8	24203	24210	25 %	0 %	25 %	50 %	187921892
513	NC_010679	CGCC	2	8	24402	24409	0 %	0 %	25 %	75 %	187921893
514	NC_010679	ATC	2	6	24538	24543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921893
515	NC_010679	TATC	2	8	24627	24634	25 %	50 %	0 %	25 %	187921893
516	NC_010679	CCA	2	6	24653	24658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921893
517	NC_010679	TGCA	2	8	24661	24668	25 %	25 %	25 %	25 %	187921893
518	NC_010679	GA	3	6	24675	24680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010679	CGAAT	2	10	24811	24820	40 %	20 %	20 %	20 %	187921894
520	NC_010679	CT	4	8	24837	24844	0 %	50 %	0 %	50 %	187921894
521	NC_010679	TC	4	8	24916	24923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_010679	CAG	2	6	24995	25000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921895
523	NC_010679	TCC	2	6	25043	25048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187921895
524	NC_010679	TCATG	2	10	25125	25134	20 %	40 %	20 %	20 %	187921895
525	NC_010679	TCG	2	6	25164	25169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_010679	GCA	2	6	25202	25207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_010679	AAAATG	2	12	25228	25239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010679	ATC	2	6	25347	25352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_010679	CCA	2	6	25439	25444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_010679	AAG	2	6	25473	25478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_010679	CGG	2	6	25524	25529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_010679	GC	3	6	25551	25556	0 %	0 %	50 %	50 %	187921896
533	NC_010679	TTC	2	6	25563	25568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921896
534	NC_010679	TCT	2	6	25689	25694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921896
535	NC_010679	CGTTGT	2	12	25695	25706	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187921896
536	NC_010679	TCT	2	6	25707	25712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921896
537	NC_010679	GCT	2	6	25716	25721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921896
538	NC_010679	TTCAT	2	10	25729	25738	20 %	60 %	0 %	20 %	187921896
539	NC_010679	CTC	2	6	25768	25773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187921896
540	NC_010679	T	6	6	25779	25784	0 %	100 %	0 %	0 %	187921896
541	NC_010679	TAC	2	6	25869	25874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921896
542	NC_010679	TCG	2	6	25890	25895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921896
543	NC_010679	GC	3	6	25911	25916	0 %	0 %	50 %	50 %	187921896
544	NC_010679	CAT	3	9	25947	25955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921896
545	NC_010679	GAC	2	6	25969	25974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921896
546	NC_010679	GGC	2	6	25995	26000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921896
547	NC_010679	ATGG	2	8	26012	26019	25 %	25 %	50 %	0 %	187921896
548	NC_010679	CGA	2	6	26049	26054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921896
549	NC_010679	AAT	2	6	26163	26168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187921896
550	NC_010679	AAT	2	6	26233	26238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187921896
551	NC_010679	CGCAG	2	10	26246	26255	20 %	0 %	40 %	40 %	187921896
552	NC_010679	CTG	2	6	26269	26274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921896
553	NC_010679	TGGA	2	8	26334	26341	25 %	25 %	50 %	0 %	187921896
554	NC_010679	GCG	2	6	26351	26356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921896
555	NC_010679	CGA	2	6	26370	26375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921896
556	NC_010679	CGA	2	6	26466	26471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921896
557	NC_010679	TGG	2	6	26561	26566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187921896
558	NC_010679	AGCG	2	8	26574	26581	25 %	0 %	50 %	25 %	187921896
559	NC_010679	AAAC	2	8	26635	26642	75 %	0 %	0 %	25 %	187921896
560	NC_010679	GGA	2	6	26643	26648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187921896
561	NC_010679	CGC	2	6	26748	26753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921896
562	NC_010679	GCTG	2	8	26783	26790	0 %	25 %	50 %	25 %	187921896
563	NC_010679	GCCA	2	8	26795	26802	25 %	0 %	25 %	50 %	187921896
564	NC_010679	GAA	2	6	26812	26817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921896
565	NC_010679	CGC	2	6	26859	26864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921896
566	NC_010679	GCC	2	6	26904	26909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921896
567	NC_010679	ACG	2	6	26933	26938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921896
568	NC_010679	CA	3	6	26960	26965	50 %	0 %	0 %	50 %	187921896
569	NC_010679	CAG	2	6	27049	27054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921896
570	NC_010679	GCC	2	6	27074	27079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921896
571	NC_010679	AGA	2	6	27092	27097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921896
572	NC_010679	GCC	2	6	27189	27194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_010679	CA	3	6	27442	27447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_010679	ATG	2	6	27553	27558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921898
575	NC_010679	TCG	2	6	27604	27609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921898
576	NC_010679	GAA	2	6	27653	27658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921898
577	NC_010679	GCC	2	6	27685	27690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921898
578	NC_010679	TCG	2	6	27827	27832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921898
579	NC_010679	CAT	2	6	27840	27845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921898
580	NC_010679	CAT	2	6	27912	27917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187921898
581	NC_010679	GCCG	2	8	27957	27964	0 %	0 %	50 %	50 %	187921898
582	NC_010679	CT	3	6	28219	28224	0 %	50 %	0 %	50 %	187921898
583	NC_010679	CCGG	2	8	28248	28255	0 %	0 %	50 %	50 %	187921898
584	NC_010679	CCGG	2	8	28379	28386	0 %	0 %	50 %	50 %	187921898
585	NC_010679	TGGCT	2	10	28448	28457	0 %	40 %	40 %	20 %	187921898
586	NC_010679	T	6	6	28524	28529	0 %	100 %	0 %	0 %	187921898
587	NC_010679	CGTT	2	8	28543	28550	0 %	50 %	25 %	25 %	187921898
588	NC_010679	CTT	2	6	28554	28559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921898
589	NC_010679	CTT	2	6	28644	28649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187921899
590	NC_010679	ACG	2	6	28669	28674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921899
591	NC_010679	AGC	2	6	28759	28764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921899
592	NC_010679	CTAT	2	8	28890	28897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_010679	TTG	2	6	28916	28921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010679	GCA	2	6	28932	28937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010679	AAG	2	6	28986	28991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010679	ACT	2	6	29017	29022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010679	GGC	2	6	29025	29030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010679	CG	3	6	29170	29175	0 %	0 %	50 %	50 %	187921900
599	NC_010679	CGC	2	6	29192	29197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
600	NC_010679	CATC	2	8	29216	29223	25 %	25 %	0 %	50 %	187921900
601	NC_010679	TGC	2	6	29224	29229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921900
602	NC_010679	CCG	2	6	29263	29268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
603	NC_010679	CCG	2	6	29312	29317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
604	NC_010679	AGCG	2	8	29373	29380	25 %	0 %	50 %	25 %	187921900
605	NC_010679	GTA	2	6	29436	29441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921900
606	NC_010679	CGA	2	6	29583	29588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921900
607	NC_010679	GCGAG	2	10	29624	29633	20 %	0 %	60 %	20 %	187921900
608	NC_010679	GT	3	6	29658	29663	0 %	50 %	50 %	0 %	187921900
609	NC_010679	ACGA	2	8	29677	29684	50 %	0 %	25 %	25 %	187921900
610	NC_010679	CGT	3	9	29691	29699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921900
611	NC_010679	GCC	2	6	29769	29774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
612	NC_010679	CGA	2	6	29780	29785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921900
613	NC_010679	GCGTCA	2	12	29810	29821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187921900
614	NC_010679	GCCGA	2	10	29851	29860	20 %	0 %	40 %	40 %	187921900
615	NC_010679	CAC	2	6	29931	29936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921900
616	NC_010679	GCC	2	6	30027	30032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
617	NC_010679	GCC	2	6	30063	30068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
618	NC_010679	ACC	3	9	30069	30077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187921900
619	NC_010679	GCC	2	6	30078	30083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
620	NC_010679	CGC	2	6	30132	30137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187921900
621	NC_010679	TGA	2	6	30181	30186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010679	ATG	2	6	30359	30364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921901
623	NC_010679	GCA	2	6	30452	30457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921901
624	NC_010679	CGG	2	6	30484	30489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921901
625	NC_010679	CGCT	2	8	30534	30541	0 %	25 %	25 %	50 %	187921901
626	NC_010679	GTT	2	6	30545	30550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187921901
627	NC_010679	GGCC	2	8	30580	30587	0 %	0 %	50 %	50 %	187921901
628	NC_010679	CGG	2	6	30594	30599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187921901
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