MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010581	ACA	2	6	633345	633350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_010581	GGA	2	6	633440	633445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677565
13003	NC_010581	ACC	2	6	633469	633474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677565
13004	NC_010581	CTGG	2	8	633477	633484	0 %	25 %	50 %	25 %	182677565
13005	NC_010581	CGC	2	6	633587	633592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677565
13006	NC_010581	GAC	2	6	633627	633632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677565
13007	NC_010581	GCC	2	6	633675	633680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677565
13008	NC_010581	ATG	2	6	633718	633723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677565
13009	NC_010581	AAT	2	6	633803	633808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677565
13010	NC_010581	TGG	2	6	633838	633843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677565
13011	NC_010581	GCC	2	6	633849	633854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677565
13012	NC_010581	CGG	2	6	633881	633886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677565
13013	NC_010581	GGC	2	6	633924	633929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677565
13014	NC_010581	AAT	2	6	633964	633969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677565
13015	NC_010581	AGGGC	2	10	633976	633985	20 %	0 %	60 %	20 %	182677565
13016	NC_010581	CCA	2	6	633987	633992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677565
13017	NC_010581	CCG	2	6	634048	634053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677566
13018	NC_010581	ATG	2	6	634100	634105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677566
13019	NC_010581	TGA	2	6	634138	634143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677566
13020	NC_010581	CGAT	2	8	634278	634285	25 %	25 %	25 %	25 %	182677566
13021	NC_010581	CGCGG	2	10	634409	634418	0 %	0 %	60 %	40 %	182677566
13022	NC_010581	TGC	2	6	634480	634485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677566
13023	NC_010581	GAC	2	6	634574	634579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677566
13024	NC_010581	GAT	2	6	634586	634591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677566
13025	NC_010581	GCG	2	6	634598	634603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677566
13026	NC_010581	GGCGG	2	10	634703	634712	0 %	0 %	80 %	20 %	182677566
13027	NC_010581	CAT	2	6	634773	634778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_010581	CGG	2	6	634779	634784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_010581	TC	3	6	634817	634822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13030	NC_010581	CAGC	2	8	634863	634870	25 %	0 %	25 %	50 %	182677567
13031	NC_010581	TGC	2	6	635049	635054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677567
13032	NC_010581	GA	3	6	635061	635066	50 %	0 %	50 %	0 %	182677567
13033	NC_010581	GCG	2	6	635158	635163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677567
13034	NC_010581	CG	3	6	635208	635213	0 %	0 %	50 %	50 %	182677567
13035	NC_010581	GATC	2	8	635239	635246	25 %	25 %	25 %	25 %	182677567
13036	NC_010581	GCGT	2	8	635268	635275	0 %	25 %	50 %	25 %	182677567
13037	NC_010581	GAAAG	2	10	635464	635473	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_010581	GACG	2	8	635484	635491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13039	NC_010581	GA	3	6	635527	635532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_010581	AGC	2	6	635569	635574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_010581	G	6	6	635578	635583	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_010581	CGC	2	6	635614	635619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_010581	TTCTTG	2	12	635700	635711	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13044	NC_010581	CCGG	2	8	635719	635726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_010581	TA	3	6	635733	635738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_010581	GATG	2	8	635766	635773	25 %	25 %	50 %	0 %	182677568
13047	NC_010581	ACC	2	6	635794	635799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677568
13048	NC_010581	CGA	2	6	635823	635828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677568
13049	NC_010581	GCGA	2	8	635995	636002	25 %	0 %	50 %	25 %	182677568
13050	NC_010581	TGG	3	9	636028	636036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677568
13051	NC_010581	CGGC	2	8	636051	636058	0 %	0 %	50 %	50 %	182677568
13052	NC_010581	CGAT	2	8	636059	636066	25 %	25 %	25 %	25 %	182677568
13053	NC_010581	CCA	2	6	636089	636094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677568
13054	NC_010581	GTC	2	6	636097	636102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677568
13055	NC_010581	GGC	2	6	636103	636108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677568
13056	NC_010581	GATC	2	8	636219	636226	25 %	25 %	25 %	25 %	182677568
13057	NC_010581	CGG	2	6	636258	636263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677568
13058	NC_010581	GGC	2	6	636271	636276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677568
13059	NC_010581	TGC	2	6	636284	636289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677568
13060	NC_010581	GGC	2	6	636294	636299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677568
13061	NC_010581	TCCCG	2	10	636305	636314	0 %	20 %	20 %	60 %	182677568
13062	NC_010581	CGC	2	6	636321	636326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677568
13063	NC_010581	GGCA	2	8	636385	636392	25 %	0 %	50 %	25 %	182677568
13064	NC_010581	GGC	2	6	636480	636485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677568
13065	NC_010581	CCA	2	6	636603	636608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677568
13066	NC_010581	TCG	2	6	636620	636625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677568
13067	NC_010581	ATT	2	6	636671	636676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677568
13068	NC_010581	GCC	2	6	636685	636690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677568
13069	NC_010581	CGG	2	6	636696	636701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677568
13070	NC_010581	CGT	2	6	636744	636749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677568
13071	NC_010581	TTCC	2	8	636750	636757	0 %	50 %	0 %	50 %	182677568
13072	NC_010581	CCG	2	6	636779	636784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677568
13073	NC_010581	CG	3	6	636788	636793	0 %	0 %	50 %	50 %	182677568
13074	NC_010581	TCG	2	6	636836	636841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677568
13075	NC_010581	CG	3	6	636905	636910	0 %	0 %	50 %	50 %	182677568
13076	NC_010581	CCG	2	6	636946	636951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677568
13077	NC_010581	AGA	2	6	636981	636986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677568
13078	NC_010581	CG	3	6	637032	637037	0 %	0 %	50 %	50 %	182677569
13079	NC_010581	GCG	2	6	637117	637122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677569
13080	NC_010581	TGC	2	6	637132	637137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677569
13081	NC_010581	GTG	2	6	637156	637161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677569
13082	NC_010581	GC	3	6	637167	637172	0 %	0 %	50 %	50 %	182677569
13083	NC_010581	GCG	2	6	637192	637197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677569
13084	NC_010581	CGG	2	6	637317	637322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677569
13085	NC_010581	TGC	2	6	637345	637350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677569
13086	NC_010581	GCC	2	6	637357	637362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677569
13087	NC_010581	T	6	6	637502	637507	0 %	100 %	0 %	0 %	182677569
13088	NC_010581	GGAA	2	8	637639	637646	50 %	0 %	50 %	0 %	182677569
13089	NC_010581	G	6	6	637649	637654	0 %	0 %	100 %	0 %	182677569
13090	NC_010581	CG	3	6	637659	637664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13091	NC_010581	CGA	2	6	637729	637734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677570
13092	NC_010581	GGC	2	6	637736	637741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677570
13093	NC_010581	TCA	2	6	637782	637787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677570
13094	NC_010581	GGC	2	6	637822	637827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677570
13095	NC_010581	GAC	2	6	637828	637833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677570
13096	NC_010581	CTG	2	6	637877	637882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677570
13097	NC_010581	TGC	2	6	637954	637959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677570
13098	NC_010581	CGC	2	6	638062	638067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677570
13099	NC_010581	TGC	2	6	638076	638081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677570
13100	NC_010581	ATG	2	6	638111	638116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677570
13101	NC_010581	TCG	2	6	638229	638234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677570
13102	NC_010581	TCA	2	6	638241	638246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677570
13103	NC_010581	CCT	3	9	638299	638307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677570
13104	NC_010581	CT	4	8	638326	638333	0 %	50 %	0 %	50 %	182677570
13105	NC_010581	GAG	2	6	638399	638404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677570
13106	NC_010581	GGA	2	6	638426	638431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677570
13107	NC_010581	GTC	2	6	638603	638608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677570
13108	NC_010581	CTG	2	6	638771	638776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677570
13109	NC_010581	CTT	2	6	638777	638782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677570
13110	NC_010581	CTT	2	6	638787	638792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677570
13111	NC_010581	GC	3	6	638829	638834	0 %	0 %	50 %	50 %	182677570
13112	NC_010581	TAT	2	6	638855	638860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677570
13113	NC_010581	GTG	2	6	638884	638889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677570
13114	NC_010581	TCG	2	6	638909	638914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677570
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13116	NC_010581	CCT	2	6	639119	639124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677571
13117	NC_010581	CG	3	6	639133	639138	0 %	0 %	50 %	50 %	182677571
13118	NC_010581	GCC	2	6	639153	639158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677571
13119	NC_010581	GCC	2	6	639211	639216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677571
13120	NC_010581	TGGT	2	8	639307	639314	0 %	50 %	50 %	0 %	182677571
13121	NC_010581	CGC	2	6	639383	639388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677571
13122	NC_010581	TCA	2	6	639418	639423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677571
13123	NC_010581	AGC	2	6	639437	639442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677571
13124	NC_010581	TCC	2	6	639487	639492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677571
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13128	NC_010581	CAC	2	6	639747	639752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677571
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13130	NC_010581	GGC	2	6	639811	639816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677571
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13132	NC_010581	GC	4	8	639877	639884	0 %	0 %	50 %	50 %	182677571
13133	NC_010581	CTG	2	6	639927	639932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677571
13134	NC_010581	CTG	3	9	639948	639956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677571
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13136	NC_010581	GTC	2	6	640009	640014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677571
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13149	NC_010581	CCT	2	6	640321	640326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677571
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13153	NC_010581	CCAT	2	8	640459	640466	25 %	25 %	0 %	50 %	182677571
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13158	NC_010581	GCT	2	6	640679	640684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677571
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13177	NC_010581	CGT	2	6	641962	641967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677573
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13220	NC_010581	TGA	2	6	643808	643813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13229	NC_010581	TGA	2	6	644219	644224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677575
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13241	NC_010581	CGG	2	6	644619	644624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677575
13242	NC_010581	TCA	2	6	644671	644676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677576
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13250	NC_010581	GGCAA	2	10	645049	645058	40 %	0 %	40 %	20 %	182677576
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13263	NC_010581	CAGC	2	8	645627	645634	25 %	0 %	25 %	50 %	182677577
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13362	NC_010581	GAT	2	6	649986	649991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677580
13363	NC_010581	CCGAG	2	10	650019	650028	20 %	0 %	40 %	40 %	182677580
13364	NC_010581	ATC	2	6	650105	650110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677580
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13368	NC_010581	GGA	2	6	650216	650221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677580
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13377	NC_010581	GCC	3	9	650753	650761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677581
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13381	NC_010581	GCCA	2	8	650924	650931	25 %	0 %	25 %	50 %	182677581
13382	NC_010581	GAT	2	6	651016	651021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677581
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13385	NC_010581	CG	3	6	651362	651367	0 %	0 %	50 %	50 %	182677582
13386	NC_010581	TGAG	2	8	651373	651380	25 %	25 %	50 %	0 %	182677582
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13481	NC_010581	CAT	2	6	655989	655994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677583
13482	NC_010581	CAGG	2	8	656174	656181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13483	NC_010581	CTTT	2	8	656198	656205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13484	NC_010581	GATC	2	8	656333	656340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13485	NC_010581	CCG	2	6	656418	656423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13486	NC_010581	CGG	2	6	656465	656470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13487	NC_010581	CAGG	2	8	656522	656529	25 %	0 %	50 %	25 %	182677584
13488	NC_010581	TGGT	2	8	656689	656696	0 %	50 %	50 %	0 %	182677584
13489	NC_010581	GAAG	2	8	656697	656704	50 %	0 %	50 %	0 %	182677584
13490	NC_010581	AGG	2	6	656767	656772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677584
13491	NC_010581	TCA	2	6	656906	656911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677584
13492	NC_010581	TGA	2	6	656930	656935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677584
13493	NC_010581	CGC	2	6	656979	656984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677584
13494	NC_010581	CTGC	2	8	657020	657027	0 %	25 %	25 %	50 %	182677584
13495	NC_010581	CGAGA	2	10	657051	657060	40 %	0 %	40 %	20 %	182677584
13496	NC_010581	GGC	2	6	657087	657092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677584
13497	NC_010581	ATC	2	6	657124	657129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677584
13498	NC_010581	CAT	2	6	657144	657149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677584
13499	NC_010581	CGG	2	6	657163	657168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677584
13500	NC_010581	CGA	2	6	657176	657181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677584

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