MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010581	GCC	2	6	608801	608806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677544
12502	NC_010581	GTCG	2	8	608930	608937	0 %	25 %	50 %	25 %	182677544
12503	NC_010581	GGA	2	6	608942	608947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677544
12504	NC_010581	GATA	2	8	608972	608979	50 %	25 %	25 %	0 %	182677544
12505	NC_010581	GCG	2	6	609054	609059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677544
12506	NC_010581	GCT	3	9	609064	609072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677544
12507	NC_010581	TGA	2	6	609076	609081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677544
12508	NC_010581	TGA	2	6	609086	609091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677544
12509	NC_010581	TTG	2	6	609119	609124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677544
12510	NC_010581	ACG	2	6	609171	609176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677544
12511	NC_010581	CT	3	6	609207	609212	0 %	50 %	0 %	50 %	182677544
12512	NC_010581	AGC	2	6	609259	609264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677544
12513	NC_010581	GCC	2	6	609435	609440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12514	NC_010581	CCA	2	6	609468	609473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_010581	ATT	2	6	609474	609479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_010581	TA	3	6	609490	609495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_010581	GAA	2	6	609528	609533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_010581	AGA	2	6	609591	609596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_010581	CTG	2	6	609615	609620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_010581	AAG	2	6	609669	609674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_010581	ATC	2	6	609703	609708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_010581	GCAT	2	8	609764	609771	25 %	25 %	25 %	25 %	182677545
12523	NC_010581	CATC	2	8	609894	609901	25 %	25 %	0 %	50 %	182677545
12524	NC_010581	CAT	2	6	609987	609992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677545
12525	NC_010581	GC	3	6	610077	610082	0 %	0 %	50 %	50 %	182677545
12526	NC_010581	TCG	2	6	610091	610096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677545
12527	NC_010581	GCAG	2	8	610172	610179	25 %	0 %	50 %	25 %	182677545
12528	NC_010581	CGG	2	6	610290	610295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677545
12529	NC_010581	AAAC	2	8	610306	610313	75 %	0 %	0 %	25 %	182677545
12530	NC_010581	CTT	2	6	610317	610322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677545
12531	NC_010581	CG	3	6	610333	610338	0 %	0 %	50 %	50 %	182677545
12532	NC_010581	CGT	2	6	610351	610356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677545
12533	NC_010581	CGC	2	6	610383	610388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677545
12534	NC_010581	CGA	2	6	610452	610457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677545
12535	NC_010581	AT	3	6	610491	610496	50 %	50 %	0 %	0 %	182677545
12536	NC_010581	GCC	2	6	610516	610521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677545
12537	NC_010581	AGG	2	6	610648	610653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677546
12538	NC_010581	GAA	2	6	610685	610690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677546
12539	NC_010581	ATC	2	6	610723	610728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677546
12540	NC_010581	CCG	2	6	610748	610753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677546
12541	NC_010581	GCC	2	6	610987	610992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677546
12542	NC_010581	CAGA	2	8	611008	611015	50 %	0 %	25 %	25 %	182677546
12543	NC_010581	TGA	2	6	611072	611077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677546
12544	NC_010581	CG	3	6	611159	611164	0 %	0 %	50 %	50 %	182677546
12545	NC_010581	CCG	2	6	611215	611220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677546
12546	NC_010581	GGC	2	6	611242	611247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677546
12547	NC_010581	AAG	2	6	611295	611300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677546
12548	NC_010581	GC	3	6	611325	611330	0 %	0 %	50 %	50 %	182677546
12549	NC_010581	GAA	2	6	611333	611338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677546
12550	NC_010581	GCG	2	6	611365	611370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677546
12551	NC_010581	AGA	2	6	611406	611411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677547
12552	NC_010581	CGATCA	2	12	611461	611472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182677547
12553	NC_010581	ATG	2	6	611478	611483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677547
12554	NC_010581	GCCA	2	8	611571	611578	25 %	0 %	25 %	50 %	182677547
12555	NC_010581	A	6	6	611608	611613	100 %	0 %	0 %	0 %	182677547
12556	NC_010581	GCG	2	6	611625	611630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677547
12557	NC_010581	GGC	2	6	611750	611755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677547
12558	NC_010581	AGAA	2	8	611850	611857	75 %	0 %	25 %	0 %	182677547
12559	NC_010581	CGC	2	6	611942	611947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677547
12560	NC_010581	ACC	2	6	612156	612161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677547
12561	NC_010581	CGGAA	2	10	612165	612174	40 %	0 %	40 %	20 %	182677547
12562	NC_010581	TTTC	2	8	612178	612185	0 %	75 %	0 %	25 %	182677547
12563	NC_010581	CAT	2	6	612384	612389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677548
12564	NC_010581	AAT	2	6	612399	612404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677548
12565	NC_010581	AACC	2	8	612452	612459	50 %	0 %	0 %	50 %	182677548
12566	NC_010581	TTG	2	6	612513	612518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677548
12567	NC_010581	GTC	2	6	612538	612543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677548
12568	NC_010581	G	6	6	612549	612554	0 %	0 %	100 %	0 %	182677548
12569	NC_010581	GGT	2	6	612648	612653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677548
12570	NC_010581	GC	3	6	612700	612705	0 %	0 %	50 %	50 %	182677548
12571	NC_010581	ATC	2	6	612775	612780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677548
12572	NC_010581	TGG	2	6	612786	612791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677548
12573	NC_010581	GCT	2	6	612881	612886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677548
12574	NC_010581	TGA	2	6	612906	612911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677548
12575	NC_010581	GCC	2	6	612941	612946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677548
12576	NC_010581	AGAT	2	8	613052	613059	50 %	25 %	25 %	0 %	182677548
12577	NC_010581	GC	3	6	613064	613069	0 %	0 %	50 %	50 %	182677548
12578	NC_010581	GGC	2	6	613078	613083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677548
12579	NC_010581	GCT	2	6	613155	613160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677548
12580	NC_010581	GAA	2	6	613201	613206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677548
12581	NC_010581	TTC	3	9	613243	613251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677548
12582	NC_010581	GAA	2	6	613269	613274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677548
12583	NC_010581	CGG	2	6	613353	613358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677548
12584	NC_010581	A	6	6	613372	613377	100 %	0 %	0 %	0 %	182677548
12585	NC_010581	GAA	2	6	613401	613406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677548
12586	NC_010581	CCT	2	6	613421	613426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677548
12587	NC_010581	TCG	2	6	613444	613449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677548
12588	NC_010581	GCG	2	6	613465	613470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_010581	GCGG	2	8	613500	613507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12590	NC_010581	ATC	2	6	613712	613717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677549
12591	NC_010581	ATC	2	6	613721	613726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677549
12592	NC_010581	CCGA	2	8	613773	613780	25 %	0 %	25 %	50 %	182677549
12593	NC_010581	CCAGCG	2	12	613781	613792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182677549
12594	NC_010581	TGA	2	6	613834	613839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677549
12595	NC_010581	GAT	2	6	613892	613897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677549
12596	NC_010581	GAGC	2	8	613898	613905	25 %	0 %	50 %	25 %	182677549
12597	NC_010581	ATGCAC	2	12	613922	613933	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182677549
12598	NC_010581	GCC	2	6	614009	614014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677549
12599	NC_010581	TTC	2	6	614093	614098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677549
12600	NC_010581	CAC	2	6	614147	614152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677549
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12602	NC_010581	CGC	2	6	614227	614232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677549
12603	NC_010581	GC	4	8	614231	614238	0 %	0 %	50 %	50 %	182677549
12604	NC_010581	TG	3	6	614259	614264	0 %	50 %	50 %	0 %	182677549
12605	NC_010581	GAA	2	6	614360	614365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677549
12606	NC_010581	GCG	2	6	614400	614405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677549
12607	NC_010581	TGA	2	6	614426	614431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677549
12608	NC_010581	GCC	2	6	614465	614470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677549
12609	NC_010581	ATG	2	6	614474	614479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677549
12610	NC_010581	ATC	2	6	614640	614645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_010581	GAA	2	6	614668	614673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_010581	CA	3	6	614700	614705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12613	NC_010581	ATT	2	6	614710	614715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_010581	ATC	2	6	614750	614755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677550
12615	NC_010581	GCG	2	6	614756	614761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677550
12616	NC_010581	TGGT	2	8	614797	614804	0 %	50 %	50 %	0 %	182677550
12617	NC_010581	ATC	2	6	614966	614971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677550
12618	NC_010581	GC	3	6	615036	615041	0 %	0 %	50 %	50 %	182677550
12619	NC_010581	GCTTT	2	10	615087	615096	0 %	60 %	20 %	20 %	182677550
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