MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010581	GCCC	2	8	535510	535517	0 %	0 %	25 %	75 %	182677470
11002	NC_010581	CAT	2	6	535546	535551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677470
11003	NC_010581	ACA	2	6	535560	535565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677470
11004	NC_010581	GGT	2	6	535568	535573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677470
11005	NC_010581	GTC	2	6	535582	535587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677470
11006	NC_010581	GAA	2	6	535733	535738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677470
11007	NC_010581	GTGG	2	8	535753	535760	0 %	25 %	75 %	0 %	182677470
11008	NC_010581	CTT	2	6	535768	535773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677470
11009	NC_010581	GCCA	2	8	535811	535818	25 %	0 %	25 %	50 %	182677470
11010	NC_010581	CGA	2	6	535822	535827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677470
11011	NC_010581	TCG	2	6	535935	535940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677470
11012	NC_010581	ACG	2	6	536025	536030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677470
11013	NC_010581	CAC	2	6	536041	536046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677470
11014	NC_010581	GAC	2	6	536078	536083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677470
11015	NC_010581	TCG	2	6	536109	536114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677470
11016	NC_010581	TGGT	2	8	536133	536140	0 %	50 %	50 %	0 %	182677470
11017	NC_010581	ATG	2	6	536232	536237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677470
11018	NC_010581	TCGC	2	8	536250	536257	0 %	25 %	25 %	50 %	182677470
11019	NC_010581	CTC	2	6	536329	536334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11020	NC_010581	GAG	2	6	536342	536347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_010581	A	7	7	536378	536384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_010581	AAG	3	9	536476	536484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677471
11023	NC_010581	TTA	2	6	536688	536693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677471
11024	NC_010581	TTC	2	6	536739	536744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677471
11025	NC_010581	AAC	2	6	536782	536787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677471
11026	NC_010581	GAT	2	6	536832	536837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677471
11027	NC_010581	CGA	2	6	536846	536851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677471
11028	NC_010581	CGA	2	6	536874	536879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677471
11029	NC_010581	TCA	2	6	536891	536896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677471
11030	NC_010581	GCTC	2	8	536915	536922	0 %	25 %	25 %	50 %	182677471
11031	NC_010581	ATG	2	6	536933	536938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677471
11032	NC_010581	TCG	2	6	536963	536968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677471
11033	NC_010581	GGC	2	6	537025	537030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677471
11034	NC_010581	CGAA	2	8	537065	537072	50 %	0 %	25 %	25 %	182677471
11035	NC_010581	CGG	2	6	537087	537092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677471
11036	NC_010581	CGGT	2	8	537107	537114	0 %	25 %	50 %	25 %	182677471
11037	NC_010581	ATG	2	6	537145	537150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677471
11038	NC_010581	CAT	2	6	537165	537170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677471
11039	NC_010581	GGC	2	6	537229	537234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677471
11040	NC_010581	ACC	2	6	537235	537240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677471
11041	NC_010581	CGA	2	6	537243	537248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677471
11042	NC_010581	GAA	2	6	537328	537333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677471
11043	NC_010581	ATC	2	6	537359	537364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677471
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11045	NC_010581	TC	3	6	537404	537409	0 %	50 %	0 %	50 %	182677471
11046	NC_010581	GTC	2	6	537455	537460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677471
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11051	NC_010581	TCTGG	2	10	537867	537876	0 %	40 %	40 %	20 %	182677471
11052	NC_010581	CAT	2	6	537948	537953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677471
11053	NC_010581	AGT	2	6	538061	538066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_010581	ATG	2	6	538095	538100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_010581	GAG	2	6	538240	538245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_010581	GAAAAG	2	12	538324	538335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677472
11057	NC_010581	TGG	2	6	538365	538370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677472
11058	NC_010581	GCGG	2	8	538375	538382	0 %	0 %	75 %	25 %	182677472
11059	NC_010581	TCG	2	6	538495	538500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677472
11060	NC_010581	ATC	2	6	538597	538602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677472
11061	NC_010581	CCG	2	6	538615	538620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677472
11062	NC_010581	CGA	2	6	538662	538667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677472
11063	NC_010581	GGC	2	6	538686	538691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677472
11064	NC_010581	A	6	6	538696	538701	100 %	0 %	0 %	0 %	182677472
11065	NC_010581	GAA	2	6	538749	538754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677472
11066	NC_010581	TGCT	2	8	538784	538791	0 %	50 %	25 %	25 %	182677472
11067	NC_010581	ACG	2	6	538822	538827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677472
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11071	NC_010581	CGA	2	6	538979	538984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677472
11072	NC_010581	GATC	2	8	539118	539125	25 %	25 %	25 %	25 %	182677472
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11074	NC_010581	GAA	2	6	539176	539181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677472
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11090	NC_010581	GGA	2	6	539712	539717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677472
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11093	NC_010581	AAT	2	6	539791	539796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677472
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11100	NC_010581	GCT	2	6	540025	540030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677472
11101	NC_010581	GCC	2	6	540040	540045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677472
11102	NC_010581	GCG	2	6	540074	540079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677472
11103	NC_010581	GAG	2	6	540088	540093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677472
11104	NC_010581	TGA	2	6	540139	540144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677472
11105	NC_010581	A	6	6	540175	540180	100 %	0 %	0 %	0 %	182677473
11106	NC_010581	AGCC	2	8	540208	540215	25 %	0 %	25 %	50 %	182677473
11107	NC_010581	CGG	2	6	540219	540224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677473
11108	NC_010581	ATGCC	2	10	540251	540260	20 %	20 %	20 %	40 %	182677473
11109	NC_010581	CCT	2	6	540287	540292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677473
11110	NC_010581	CGG	2	6	540375	540380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677473
11111	NC_010581	AACA	2	8	540418	540425	75 %	0 %	0 %	25 %	182677473
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11114	NC_010581	CCTG	2	8	540756	540763	0 %	25 %	25 %	50 %	182677473
11115	NC_010581	GGT	2	6	540820	540825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677473
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11244	NC_010581	CCT	2	6	547798	547803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677483
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11356	NC_010581	A	7	7	553323	553329	100 %	0 %	0 %	0 %	182677490
11357	NC_010581	CGC	2	6	553337	553342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677490
11358	NC_010581	GC	3	6	553448	553453	0 %	0 %	50 %	50 %	182677490
11359	NC_010581	TCT	2	6	553614	553619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11360	NC_010581	TTC	2	6	553674	553679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677491
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11483	NC_010581	AAG	2	6	558965	558970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11484	NC_010581	CCT	2	6	558981	558986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11485	NC_010581	GAT	2	6	558994	558999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11486	NC_010581	CAC	2	6	559025	559030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11487	NC_010581	TGA	2	6	559058	559063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11488	NC_010581	TACTT	2	10	559064	559073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11489	NC_010581	ATC	2	6	559276	559281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677499
11490	NC_010581	ATC	2	6	559297	559302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677499
11491	NC_010581	CGC	2	6	559308	559313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677499
11492	NC_010581	GA	4	8	559435	559442	50 %	0 %	50 %	0 %	182677499
11493	NC_010581	GTGC	2	8	559470	559477	0 %	25 %	50 %	25 %	182677499
11494	NC_010581	TG	3	6	559614	559619	0 %	50 %	50 %	0 %	182677499
11495	NC_010581	TTG	2	6	559702	559707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677499
11496	NC_010581	CA	3	6	559748	559753	50 %	0 %	0 %	50 %	182677499
11497	NC_010581	ATC	2	6	559873	559878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677499
11498	NC_010581	CGC	2	6	559895	559900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677499
11499	NC_010581	CAC	2	6	559952	559957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677499
11500	NC_010581	CCG	2	6	559990	559995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677499

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