MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010581	GCA	2	6	484806	484811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_010581	GGA	2	6	484844	484849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_010581	C	6	6	484937	484942	0 %	0 %	0 %	100 %	182677427
10004	NC_010581	CCG	2	6	484949	484954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677427
10005	NC_010581	CGC	2	6	484957	484962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677427
10006	NC_010581	TGC	2	6	484999	485004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677427
10007	NC_010581	GCCG	2	8	485088	485095	0 %	0 %	50 %	50 %	182677427
10008	NC_010581	TCC	2	6	485119	485124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677427
10009	NC_010581	TC	3	6	485147	485152	0 %	50 %	0 %	50 %	182677427
10010	NC_010581	GAT	2	6	485157	485162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677427
10011	NC_010581	CTG	2	6	485194	485199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677427
10012	NC_010581	ACG	2	6	485326	485331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677427
10013	NC_010581	GCC	2	6	485430	485435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677427
10014	NC_010581	TGC	2	6	485453	485458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677427
10015	NC_010581	CT	3	6	485494	485499	0 %	50 %	0 %	50 %	182677427
10016	NC_010581	CGA	2	6	485531	485536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677427
10017	NC_010581	CG	3	6	485631	485636	0 %	0 %	50 %	50 %	182677427
10018	NC_010581	A	6	6	485642	485647	100 %	0 %	0 %	0 %	182677427
10019	NC_010581	AG	3	6	485669	485674	50 %	0 %	50 %	0 %	182677427
10020	NC_010581	G	7	7	485679	485685	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_010581	CT	3	6	485686	485691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_010581	CCG	2	6	485867	485872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677428
10023	NC_010581	GAA	2	6	485907	485912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677428
10024	NC_010581	CCA	3	9	485929	485937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677428
10025	NC_010581	AG	3	6	485961	485966	50 %	0 %	50 %	0 %	182677428
10026	NC_010581	TCCGCC	2	12	485986	485997	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	182677428
10027	NC_010581	CGG	2	6	486005	486010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677428
10028	NC_010581	CGA	2	6	486011	486016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677428
10029	NC_010581	CGG	2	6	486069	486074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677428
10030	NC_010581	GC	3	6	486093	486098	0 %	0 %	50 %	50 %	182677428
10031	NC_010581	CGG	2	6	486155	486160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677428
10032	NC_010581	CGGC	2	8	486168	486175	0 %	0 %	50 %	50 %	182677428
10033	NC_010581	TGCA	2	8	486183	486190	25 %	25 %	25 %	25 %	182677428
10034	NC_010581	CAG	3	9	486222	486230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677428
10035	NC_010581	ATC	2	6	486327	486332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677428
10036	NC_010581	GCG	2	6	486374	486379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677428
10037	NC_010581	CAGG	2	8	486425	486432	25 %	0 %	50 %	25 %	182677428
10038	NC_010581	TTG	2	6	486444	486449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677428
10039	NC_010581	TCG	2	6	486512	486517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677428
10040	NC_010581	GCC	2	6	486529	486534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677428
10041	NC_010581	TGC	2	6	486669	486674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_010581	GGC	2	6	486686	486691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_010581	T	6	6	486735	486740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_010581	GAT	2	6	486757	486762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_010581	GACT	2	8	486815	486822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10046	NC_010581	ATG	2	6	486863	486868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_010581	AGTGG	2	10	486922	486931	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_010581	GTCC	2	8	487062	487069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_010581	TCGCT	2	10	487111	487120	0 %	40 %	20 %	40 %	182677429
10050	NC_010581	TCT	2	6	487206	487211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677429
10051	NC_010581	GCCG	2	8	487242	487249	0 %	0 %	50 %	50 %	182677429
10052	NC_010581	CG	3	6	487259	487264	0 %	0 %	50 %	50 %	182677429
10053	NC_010581	GCG	2	6	487312	487317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677429
10054	NC_010581	CGA	2	6	487333	487338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677429
10055	NC_010581	CG	3	6	487363	487368	0 %	0 %	50 %	50 %	182677429
10056	NC_010581	CAT	2	6	487408	487413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677429
10057	NC_010581	AGA	2	6	487416	487421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677429
10058	NC_010581	GC	3	6	487442	487447	0 %	0 %	50 %	50 %	182677429
10059	NC_010581	CGC	2	6	487461	487466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677429
10060	NC_010581	GGTC	2	8	487615	487622	0 %	25 %	50 %	25 %	182677429
10061	NC_010581	G	6	6	487650	487655	0 %	0 %	100 %	0 %	182677429
10062	NC_010581	CGA	2	6	487683	487688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677429
10063	NC_010581	CGT	3	9	487702	487710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677429
10064	NC_010581	GCT	2	6	487834	487839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677429
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10066	NC_010581	GC	3	6	487930	487935	0 %	0 %	50 %	50 %	182677429
10067	NC_010581	CGC	2	6	487963	487968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677429
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10069	NC_010581	GCC	2	6	488029	488034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677430
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10071	NC_010581	CGG	2	6	488076	488081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677430
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10075	NC_010581	GCA	2	6	488487	488492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677430
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10088	NC_010581	ACGG	2	8	488818	488825	25 %	0 %	50 %	25 %	182677430
10089	NC_010581	GGC	2	6	488839	488844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677430
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10102	NC_010581	ATT	2	6	489422	489427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_010581	T	6	6	489443	489448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_010581	GAC	2	6	489528	489533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10106	NC_010581	ATC	2	6	489638	489643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_010581	TCG	2	6	489680	489685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_010581	CG	3	6	489684	489689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_010581	CTT	2	6	489725	489730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_010581	GCC	2	6	489734	489739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_010581	TTG	2	6	489805	489810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_010581	CATG	2	8	489818	489825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_010581	TCT	2	6	489851	489856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_010581	TGA	2	6	489890	489895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_010581	GAA	2	6	489950	489955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_010581	GGAA	2	8	490041	490048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_010581	GTTTC	2	10	490141	490150	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10118	NC_010581	ACC	2	6	490162	490167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10119	NC_010581	TCC	2	6	490324	490329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677431
10120	NC_010581	CATTT	2	10	490368	490377	20 %	60 %	0 %	20 %	182677431
10121	NC_010581	CAA	2	6	490391	490396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677431
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10123	NC_010581	GAT	2	6	490629	490634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677431
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10125	NC_010581	GGA	2	6	490703	490708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677431
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10244	NC_010581	GAT	2	6	497155	497160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677437
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10346	NC_010581	A	6	6	502424	502429	100 %	0 %	0 %	0 %	182677442
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10349	NC_010581	ATG	2	6	502529	502534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10350	NC_010581	GGAGC	2	10	502542	502551	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10351	NC_010581	GC	3	6	502627	502632	0 %	0 %	50 %	50 %	182677443
10352	NC_010581	CCG	2	6	502639	502644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677443
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10355	NC_010581	CCA	2	6	502799	502804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677443
10356	NC_010581	AAGC	2	8	502814	502821	50 %	0 %	25 %	25 %	182677443
10357	NC_010581	ATGGCG	2	12	502938	502949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	182677443
10358	NC_010581	GCAG	2	8	502972	502979	25 %	0 %	50 %	25 %	182677443
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10360	NC_010581	GAT	2	6	503054	503059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677443
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10362	NC_010581	CG	3	6	503131	503136	0 %	0 %	50 %	50 %	182677443
10363	NC_010581	A	6	6	503140	503145	100 %	0 %	0 %	0 %	182677443
10364	NC_010581	ATC	2	6	503186	503191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677443
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10366	NC_010581	GCC	2	6	503261	503266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677443
10367	NC_010581	CGAT	2	8	503308	503315	25 %	25 %	25 %	25 %	182677443
10368	NC_010581	GCG	2	6	503325	503330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677443
10369	NC_010581	TGG	2	6	503356	503361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677443
10370	NC_010581	GTC	2	6	503477	503482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677443
10371	NC_010581	GCG	2	6	503505	503510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677443
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10379	NC_010581	GCGAT	2	10	503884	503893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10380	NC_010581	CG	3	6	504143	504148	0 %	0 %	50 %	50 %	182677444
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10387	NC_010581	GC	3	6	504414	504419	0 %	0 %	50 %	50 %	182677444
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10487	NC_010581	GCG	2	6	509022	509027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677448
10488	NC_010581	AAG	2	6	509043	509048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677448
10489	NC_010581	GC	4	8	509063	509070	0 %	0 %	50 %	50 %	182677448
10490	NC_010581	ATC	2	6	509085	509090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677448
10491	NC_010581	CG	3	6	509091	509096	0 %	0 %	50 %	50 %	182677448
10492	NC_010581	GAA	2	6	509103	509108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677448
10493	NC_010581	GGCG	2	8	509117	509124	0 %	0 %	75 %	25 %	182677448
10494	NC_010581	ATC	2	6	509140	509145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677448
10495	NC_010581	GC	3	6	509158	509163	0 %	0 %	50 %	50 %	182677448
10496	NC_010581	GTG	2	6	509230	509235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677448
10497	NC_010581	CAAGG	2	10	509334	509343	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10498	NC_010581	TGA	2	6	509366	509371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_010581	GTT	2	6	509412	509417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677449
10500	NC_010581	CGA	2	6	509469	509474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677449

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