MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_010581	CTG	2	6	388000	388005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_010581	GCAG	2	8	388055	388062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8003	NC_010581	GCAT	2	8	388200	388207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8004	NC_010581	GCA	2	6	388229	388234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_010581	TG	3	6	388274	388279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_010581	AT	3	6	388347	388352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_010581	AGGG	2	8	388368	388375	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_010581	TTC	3	9	388476	388484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677341
8009	NC_010581	GAT	2	6	388593	388598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677341
8010	NC_010581	TTCAG	2	10	388600	388609	20 %	40 %	20 %	20 %	182677341
8011	NC_010581	GCC	2	6	388620	388625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677341
8012	NC_010581	GAT	2	6	388631	388636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677341
8013	NC_010581	GTC	2	6	388660	388665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677341
8014	NC_010581	T	6	6	388745	388750	0 %	100 %	0 %	0 %	182677341
8015	NC_010581	ATG	2	6	388780	388785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677341
8016	NC_010581	CGC	2	6	388810	388815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677341
8017	NC_010581	CCA	2	6	388835	388840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677341
8018	NC_010581	ATC	2	6	388872	388877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677341
8019	NC_010581	GAT	2	6	389019	389024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677341
8020	NC_010581	GATC	2	8	389048	389055	25 %	25 %	25 %	25 %	182677341
8021	NC_010581	GTC	2	6	389136	389141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677341
8022	NC_010581	TCAA	2	8	389143	389150	50 %	25 %	0 %	25 %	182677341
8023	NC_010581	GCG	2	6	389240	389245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_010581	CAT	2	6	389266	389271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_010581	TGCG	2	8	389339	389346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8026	NC_010581	TCT	2	6	389390	389395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_010581	TGA	2	6	389413	389418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_010581	GAAT	2	8	389464	389471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_010581	GCG	2	6	389557	389562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_010581	CGT	2	6	389574	389579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_010581	CGT	3	9	389647	389655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677342
8032	NC_010581	TCG	3	9	389700	389708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677342
8033	NC_010581	TGA	2	6	389812	389817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677342
8034	NC_010581	TGGAC	2	10	389836	389845	20 %	20 %	40 %	20 %	182677342
8035	NC_010581	CGC	2	6	389867	389872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677342
8036	NC_010581	GCCG	2	8	390002	390009	0 %	0 %	50 %	50 %	182677342
8037	NC_010581	CGA	2	6	390037	390042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677342
8038	NC_010581	ACC	2	6	390053	390058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677342
8039	NC_010581	CCGC	2	8	390157	390164	0 %	0 %	25 %	75 %	182677342
8040	NC_010581	CGG	2	6	390175	390180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677342
8041	NC_010581	CGC	2	6	390224	390229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677342
8042	NC_010581	CTT	2	6	390290	390295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677342
8043	NC_010581	GCG	2	6	390395	390400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_010581	GAA	2	6	390417	390422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_010581	AAGG	2	8	390431	390438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_010581	GA	3	6	390446	390451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_010581	CCG	2	6	390488	390493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677343
8048	NC_010581	TCG	2	6	390501	390506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677343
8049	NC_010581	TTG	2	6	390522	390527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677343
8050	NC_010581	GC	3	6	390549	390554	0 %	0 %	50 %	50 %	182677343
8051	NC_010581	TC	3	6	390629	390634	0 %	50 %	0 %	50 %	182677343
8052	NC_010581	GGC	2	6	390656	390661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677343
8053	NC_010581	AAT	2	6	390676	390681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677343
8054	NC_010581	TCA	2	6	390721	390726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677343
8055	NC_010581	T	6	6	390778	390783	0 %	100 %	0 %	0 %	182677343
8056	NC_010581	ATG	2	6	390803	390808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677343
8057	NC_010581	GCC	2	6	390833	390838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677343
8058	NC_010581	TCT	2	6	390907	390912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677343
8059	NC_010581	AGG	2	6	390924	390929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677343
8060	NC_010581	GC	3	6	390958	390963	0 %	0 %	50 %	50 %	182677343
8061	NC_010581	CGA	2	6	390985	390990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677343
8062	NC_010581	ATT	2	6	391004	391009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677343
8063	NC_010581	GGAT	2	8	391065	391072	25 %	25 %	50 %	0 %	182677343
8064	NC_010581	AAT	2	6	391135	391140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677343
8065	NC_010581	GATC	2	8	391144	391151	25 %	25 %	25 %	25 %	182677343
8066	NC_010581	GTC	2	6	391157	391162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_010581	CGCAT	2	10	391165	391174	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8068	NC_010581	GC	3	6	391177	391182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_010581	AC	3	6	391223	391228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_010581	AAG	2	6	391272	391277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_010581	CGG	3	9	391327	391335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677344
8072	NC_010581	GGGC	2	8	391336	391343	0 %	0 %	75 %	25 %	182677344
8073	NC_010581	GA	3	6	391349	391354	50 %	0 %	50 %	0 %	182677344
8074	NC_010581	CGG	2	6	391384	391389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677344
8075	NC_010581	ATC	2	6	391481	391486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677344
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8078	NC_010581	CG	3	6	391519	391524	0 %	0 %	50 %	50 %	182677344
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8080	NC_010581	TCG	2	6	391614	391619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677344
8081	NC_010581	CCTTCC	2	12	391641	391652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677344
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8084	NC_010581	TCT	2	6	391828	391833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677344
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8089	NC_010581	AT	3	6	392121	392126	50 %	50 %	0 %	0 %	182677344
8090	NC_010581	GCG	2	6	392153	392158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677344
8091	NC_010581	ATC	2	6	392199	392204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677344
8092	NC_010581	TTG	2	6	392347	392352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_010581	GAAT	2	8	392513	392520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_010581	GTTCG	2	10	392531	392540	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8095	NC_010581	AAG	2	6	392555	392560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_010581	CAA	2	6	392562	392567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_010581	ATG	2	6	392582	392587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_010581	TGT	2	6	392618	392623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_010581	A	6	6	392693	392698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_010581	GAA	2	6	392699	392704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_010581	AAT	2	6	392705	392710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_010581	CAC	2	6	392826	392831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_010581	GTC	2	6	392866	392871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_010581	TCC	2	6	392927	392932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8105	NC_010581	GTGA	2	8	393020	393027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_010581	ACT	2	6	393028	393033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677345
8107	NC_010581	GAG	2	6	393053	393058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677345
8108	NC_010581	GCC	2	6	393060	393065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677345
8109	NC_010581	CGG	2	6	393070	393075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677345
8110	NC_010581	GCG	2	6	393135	393140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677345
8111	NC_010581	GCCG	2	8	393151	393158	0 %	0 %	50 %	50 %	182677345
8112	NC_010581	GGCA	2	8	393304	393311	25 %	0 %	50 %	25 %	182677345
8113	NC_010581	TCT	2	6	393390	393395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677345
8114	NC_010581	ACC	2	6	393399	393404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677345
8115	NC_010581	TC	3	6	393410	393415	0 %	50 %	0 %	50 %	182677345
8116	NC_010581	GGC	2	6	393430	393435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677345
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8118	NC_010581	GC	3	6	393464	393469	0 %	0 %	50 %	50 %	182677345
8119	NC_010581	GC	3	6	393539	393544	0 %	0 %	50 %	50 %	182677345
8120	NC_010581	CGA	2	6	393577	393582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677345
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8123	NC_010581	GGCC	2	8	393703	393710	0 %	0 %	50 %	50 %	182677345
8124	NC_010581	CAC	2	6	393719	393724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677345
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8250	NC_010581	AT	3	6	399481	399486	50 %	50 %	0 %	0 %	182677349
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8497	NC_010581	GCC	2	6	412614	412619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677360
8498	NC_010581	GC	4	8	412656	412663	0 %	0 %	50 %	50 %	182677360
8499	NC_010581	GAATCC	2	12	412677	412688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182677360
8500	NC_010581	CGT	3	9	412883	412891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677360

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