MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_010581	GAT	2	6	337081	337086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677292
7004	NC_010581	GCC	2	6	337155	337160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677292
7005	NC_010581	GC	3	6	337166	337171	0 %	0 %	50 %	50 %	182677292
7006	NC_010581	CG	3	6	337180	337185	0 %	0 %	50 %	50 %	182677292
7007	NC_010581	CG	3	6	337236	337241	0 %	0 %	50 %	50 %	182677292
7008	NC_010581	CG	3	6	337281	337286	0 %	0 %	50 %	50 %	182677292
7009	NC_010581	CG	3	6	337344	337349	0 %	0 %	50 %	50 %	182677292
7010	NC_010581	TCT	2	6	337410	337415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677292
7011	NC_010581	GCC	2	6	337564	337569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677292
7012	NC_010581	CGA	2	6	337599	337604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677292
7013	NC_010581	CGG	2	6	337640	337645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677292
7014	NC_010581	GAA	2	6	337699	337704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677292
7015	NC_010581	CGT	2	6	337723	337728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677292
7016	NC_010581	CGA	2	6	337773	337778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677292
7017	NC_010581	T	6	6	337800	337805	0 %	100 %	0 %	0 %	182677292
7018	NC_010581	TCG	2	6	337811	337816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677292
7019	NC_010581	GAC	2	6	337825	337830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677292
7020	NC_010581	CGA	2	6	337854	337859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677292
7021	NC_010581	CCG	2	6	337894	337899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677292
7022	NC_010581	CG	3	6	337956	337961	0 %	0 %	50 %	50 %	182677292
7023	NC_010581	TGA	2	6	338031	338036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677292
7024	NC_010581	GCC	3	9	338065	338073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677292
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7028	NC_010581	CGGCCT	2	12	338370	338381	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	182677292
7029	NC_010581	TGA	2	6	338412	338417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677292
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7031	NC_010581	AAT	2	6	338497	338502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_010581	T	6	6	338536	338541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_010581	ACG	2	6	338671	338676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7035	NC_010581	CAT	2	6	338722	338727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677293
7036	NC_010581	ATC	2	6	338742	338747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677293
7037	NC_010581	TGC	2	6	338787	338792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677293
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7042	NC_010581	CGA	2	6	338974	338979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677293
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7045	NC_010581	TCG	2	6	339160	339165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677293
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7054	NC_010581	CGA	2	6	339475	339480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677293
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7056	NC_010581	A	6	6	339512	339517	100 %	0 %	0 %	0 %	182677293
7057	NC_010581	GC	3	6	339525	339530	0 %	0 %	50 %	50 %	182677293
7058	NC_010581	GCC	2	6	339534	339539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677293
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7087	NC_010581	GCCG	2	8	340939	340946	0 %	0 %	50 %	50 %	182677294
7088	NC_010581	AGG	2	6	340965	340970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677294
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7095	NC_010581	CGG	2	6	341245	341250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7123	NC_010581	CG	3	6	342608	342613	0 %	0 %	50 %	50 %	182677296
7124	NC_010581	GAT	2	6	342616	342621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677296
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7126	NC_010581	CG	3	6	342778	342783	0 %	0 %	50 %	50 %	182677296
7127	NC_010581	CG	3	6	342790	342795	0 %	0 %	50 %	50 %	182677296
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7144	NC_010581	GA	3	6	343905	343910	50 %	0 %	50 %	0 %	182677298
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7247	NC_010581	TGG	2	6	348837	348842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677302
7248	NC_010581	GTC	2	6	348859	348864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677302
7249	NC_010581	CGC	2	6	348917	348922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677302
7250	NC_010581	GAC	2	6	348924	348929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677302
7251	NC_010581	GC	3	6	349011	349016	0 %	0 %	50 %	50 %	182677302
7252	NC_010581	GCA	2	6	349064	349069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677302
7253	NC_010581	TTC	2	6	349074	349079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677302
7254	NC_010581	GAT	2	6	349105	349110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677302
7255	NC_010581	ACG	2	6	349144	349149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677302
7256	NC_010581	GAT	2	6	349210	349215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677302
7257	NC_010581	ATTC	2	8	349246	349253	25 %	50 %	0 %	25 %	182677302
7258	NC_010581	CAC	2	6	349266	349271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677302
7259	NC_010581	GGC	2	6	349327	349332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677302
7260	NC_010581	ATCG	2	8	349336	349343	25 %	25 %	25 %	25 %	182677302
7261	NC_010581	GAC	2	6	349407	349412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677302
7262	NC_010581	ACCT	2	8	349471	349478	25 %	25 %	0 %	50 %	182677302
7263	NC_010581	TTA	2	6	349494	349499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677302
7264	NC_010581	ACG	2	6	349594	349599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677302
7265	NC_010581	GCGA	2	8	349606	349613	25 %	0 %	50 %	25 %	182677302
7266	NC_010581	CGG	2	6	349653	349658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677302
7267	NC_010581	CAA	2	6	349804	349809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677302
7268	NC_010581	GTC	2	6	349810	349815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677302
7269	NC_010581	CACG	2	8	349817	349824	25 %	0 %	25 %	50 %	182677302
7270	NC_010581	GAT	2	6	349861	349866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677302
7271	NC_010581	ATTG	2	8	349873	349880	25 %	50 %	25 %	0 %	182677302
7272	NC_010581	CAT	2	6	349917	349922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677302
7273	NC_010581	TAT	2	6	349954	349959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677302
7274	NC_010581	GCTT	2	8	350025	350032	0 %	50 %	25 %	25 %	182677302
7275	NC_010581	TCG	2	6	350048	350053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677302
7276	NC_010581	GC	3	6	350075	350080	0 %	0 %	50 %	50 %	182677302
7277	NC_010581	CAA	2	6	350091	350096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677302
7278	NC_010581	CGC	2	6	350198	350203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677302
7279	NC_010581	TCA	2	6	350228	350233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677302
7280	NC_010581	CTT	2	6	350312	350317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677302
7281	NC_010581	TTC	2	6	350341	350346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677302
7282	NC_010581	TCA	2	6	350351	350356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677302
7283	NC_010581	CGG	2	6	350465	350470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677302
7284	NC_010581	CCG	2	6	350596	350601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7285	NC_010581	ATCGA	2	10	350727	350736	40 %	20 %	20 %	20 %	182677303
7286	NC_010581	CG	4	8	350761	350768	0 %	0 %	50 %	50 %	182677303
7287	NC_010581	ATC	2	6	350774	350779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677303
7288	NC_010581	GC	3	6	350801	350806	0 %	0 %	50 %	50 %	182677303
7289	NC_010581	GCG	2	6	350811	350816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677303
7290	NC_010581	ATG	2	6	350849	350854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677303
7291	NC_010581	TGC	2	6	350883	350888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677303
7292	NC_010581	CAT	3	9	350917	350925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677303
7293	NC_010581	GCG	3	9	350976	350984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677303
7294	NC_010581	GCC	2	6	350987	350992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677303
7295	NC_010581	TGC	2	6	351002	351007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677303
7296	NC_010581	G	6	6	351055	351060	0 %	0 %	100 %	0 %	182677303
7297	NC_010581	CGT	2	6	351061	351066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677303
7298	NC_010581	TGG	2	6	351137	351142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677303
7299	NC_010581	CGG	2	6	351143	351148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677303
7300	NC_010581	ATC	2	6	351173	351178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677303
7301	NC_010581	GCCT	2	8	351183	351190	0 %	25 %	25 %	50 %	182677303
7302	NC_010581	TCG	2	6	351192	351197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677303
7303	NC_010581	CCGG	2	8	351212	351219	0 %	0 %	50 %	50 %	182677303
7304	NC_010581	CGC	2	6	351411	351416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677303
7305	NC_010581	GCG	2	6	351485	351490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677303
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7308	NC_010581	CTC	2	6	351699	351704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677304
7309	NC_010581	GCGCC	2	10	351779	351788	0 %	0 %	40 %	60 %	182677304
7310	NC_010581	TCC	2	6	351814	351819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677304
7311	NC_010581	CGC	2	6	351827	351832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677304
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7313	NC_010581	GCG	2	6	351968	351973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677304
7314	NC_010581	CTT	2	6	351997	352002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677304
7315	NC_010581	GCC	2	6	352003	352008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677304
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7317	NC_010581	TCG	2	6	352100	352105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677304
7318	NC_010581	CAC	2	6	352122	352127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677304
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7320	NC_010581	CGC	2	6	352157	352162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677304
7321	NC_010581	CGA	2	6	352241	352246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677304
7322	NC_010581	GCC	2	6	352251	352256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677304
7323	NC_010581	TGC	2	6	352262	352267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677304
7324	NC_010581	TGC	2	6	352278	352283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677304
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7326	NC_010581	CCG	2	6	352316	352321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677304
7327	NC_010581	TGA	2	6	352355	352360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677304
7328	NC_010581	CTG	2	6	352624	352629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677304
7329	NC_010581	GTC	2	6	352674	352679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677304
7330	NC_010581	GGA	2	6	352749	352754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677304
7331	NC_010581	TTC	2	6	352891	352896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677305
7332	NC_010581	GC	3	6	352928	352933	0 %	0 %	50 %	50 %	182677305
7333	NC_010581	GC	3	6	353055	353060	0 %	0 %	50 %	50 %	182677305
7334	NC_010581	CGC	2	6	353097	353102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677305
7335	NC_010581	TCGGT	2	10	353133	353142	0 %	40 %	40 %	20 %	182677305
7336	NC_010581	ATC	2	6	353153	353158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677305
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7338	NC_010581	CG	3	6	353317	353322	0 %	0 %	50 %	50 %	182677305
7339	NC_010581	CAT	2	6	353378	353383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677305
7340	NC_010581	CGG	2	6	353445	353450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677305
7341	NC_010581	TCA	2	6	353481	353486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677305
7342	NC_010581	CCG	2	6	353493	353498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677305
7343	NC_010581	CGC	2	6	353524	353529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677305
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7345	NC_010581	CG	3	6	353681	353686	0 %	0 %	50 %	50 %	182677305
7346	NC_010581	CCG	2	6	353689	353694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677305
7347	NC_010581	CAG	2	6	353721	353726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677305
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7350	NC_010581	AGAA	2	8	353906	353913	75 %	0 %	25 %	0 %	182677306
7351	NC_010581	GAGC	2	8	353953	353960	25 %	0 %	50 %	25 %	182677306
7352	NC_010581	AG	3	6	354125	354130	50 %	0 %	50 %	0 %	182677306
7353	NC_010581	CAC	2	6	354139	354144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677306
7354	NC_010581	CGA	2	6	354213	354218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677306
7355	NC_010581	TTC	2	6	354222	354227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677306
7356	NC_010581	CGC	2	6	354242	354247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677306
7357	NC_010581	GATCA	2	10	354307	354316	40 %	20 %	20 %	20 %	182677306
7358	NC_010581	CTG	2	6	354504	354509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677306
7359	NC_010581	CGGT	2	8	354534	354541	0 %	25 %	50 %	25 %	182677306
7360	NC_010581	GC	3	6	354548	354553	0 %	0 %	50 %	50 %	182677306
7361	NC_010581	TTTC	2	8	354557	354564	0 %	75 %	0 %	25 %	182677306
7362	NC_010581	TCC	2	6	354587	354592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677306
7363	NC_010581	GCC	2	6	354644	354649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677306
7364	NC_010581	ACGA	2	8	354676	354683	50 %	0 %	25 %	25 %	182677306
7365	NC_010581	ATC	2	6	354861	354866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677307
7366	NC_010581	GAT	2	6	354884	354889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677307
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7368	NC_010581	CTC	2	6	355091	355096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677307
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7492	NC_010581	TC	3	6	360704	360709	0 %	50 %	0 %	50 %	182677312
7493	NC_010581	ATC	2	6	360718	360723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677312
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7495	NC_010581	GCC	2	6	360786	360791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677312
7496	NC_010581	CAT	2	6	360894	360899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677312
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7499	NC_010581	TTCGG	2	10	361086	361095	0 %	40 %	40 %	20 %	182677312
7500	NC_010581	GGC	2	6	361104	361109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677312

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