MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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66002	NC_010581	GAA	2	6	3262117	3262122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182679771
66003	NC_010581	CCG	2	6	3262139	3262144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679771
66004	NC_010581	TCC	2	6	3262181	3262186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679771
66005	NC_010581	CA	3	6	3262194	3262199	50 %	0 %	0 %	50 %	182679771
66006	NC_010581	CAA	2	6	3262287	3262292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182679771
66007	NC_010581	T	6	6	3262294	3262299	0 %	100 %	0 %	0 %	182679771
66008	NC_010581	CGAT	2	8	3262314	3262321	25 %	25 %	25 %	25 %	182679771
66009	NC_010581	GC	3	6	3262374	3262379	0 %	0 %	50 %	50 %	182679771
66010	NC_010581	GACA	2	8	3262382	3262389	50 %	0 %	25 %	25 %	182679771
66011	NC_010581	GCA	2	6	3262422	3262427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679771
66012	NC_010581	CG	3	6	3262462	3262467	0 %	0 %	50 %	50 %	182679771
66013	NC_010581	TGC	2	6	3262487	3262492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679771
66014	NC_010581	TGA	2	6	3262602	3262607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679771
66015	NC_010581	ATG	2	6	3262700	3262705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679771
66016	NC_010581	GCG	2	6	3262779	3262784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679771
66017	NC_010581	GCG	2	6	3262786	3262791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679771
66018	NC_010581	TCG	2	6	3262863	3262868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679771
66019	NC_010581	AATC	2	8	3262878	3262885	50 %	25 %	0 %	25 %	182679771
66020	NC_010581	ATG	2	6	3262937	3262942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679771
66021	NC_010581	CCA	2	6	3262968	3262973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679771
66022	NC_010581	CGG	2	6	3263061	3263066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679771
66023	NC_010581	GCC	2	6	3263075	3263080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679771
66024	NC_010581	TCC	2	6	3263087	3263092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679771
66025	NC_010581	GA	3	6	3263160	3263165	50 %	0 %	50 %	0 %	182679771
66026	NC_010581	TGC	2	6	3263285	3263290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679771
66027	NC_010581	TTC	2	6	3263325	3263330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66028	NC_010581	CTT	3	9	3263396	3263404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66029	NC_010581	CGA	2	6	3263423	3263428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66030	NC_010581	TTG	2	6	3263446	3263451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66031	NC_010581	TCG	2	6	3263469	3263474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66032	NC_010581	GTA	2	6	3263606	3263611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679772
66033	NC_010581	ACG	2	6	3263640	3263645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679772
66034	NC_010581	GTT	2	6	3263789	3263794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182679772
66035	NC_010581	TGC	2	6	3263827	3263832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679772
66036	NC_010581	TCAGGC	2	12	3263836	3263847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182679772
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66038	NC_010581	GCT	2	6	3263881	3263886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679772
66039	NC_010581	CCAC	2	8	3263916	3263923	25 %	0 %	0 %	75 %	182679772
66040	NC_010581	ACG	2	6	3263967	3263972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679772
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66042	NC_010581	CAGC	2	8	3264047	3264054	25 %	0 %	25 %	50 %	182679772
66043	NC_010581	GCA	2	6	3264067	3264072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679772
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66046	NC_010581	GAA	2	6	3264218	3264223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182679772
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66048	NC_010581	CAT	2	6	3264442	3264447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679772
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66051	NC_010581	CGC	2	6	3264577	3264582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679772
66052	NC_010581	CGGGA	2	10	3264692	3264701	20 %	0 %	60 %	20 %	182679772
66053	NC_010581	GGC	2	6	3264729	3264734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679772
66054	NC_010581	TGC	2	6	3264752	3264757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679772
66055	NC_010581	GT	3	6	3264827	3264832	0 %	50 %	50 %	0 %	182679772
66056	NC_010581	CATACT	2	12	3264839	3264850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679772
66057	NC_010581	CCCT	2	8	3264856	3264863	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66058	NC_010581	ATGCCA	3	18	3264871	3264888	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66059	NC_010581	TCT	2	6	3264891	3264896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66060	NC_010581	GAATCA	2	12	3265015	3265026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	182679773
66061	NC_010581	ACTC	2	8	3265057	3265064	25 %	25 %	0 %	50 %	182679773
66062	NC_010581	CTT	2	6	3265376	3265381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679773
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66066	NC_010581	GTG	2	6	3265506	3265511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679773
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66071	NC_010581	CAA	2	6	3265846	3265851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182679773
66072	NC_010581	ATTC	2	8	3265883	3265890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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66074	NC_010581	T	6	6	3265909	3265914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66075	NC_010581	AGCGAT	2	12	3265979	3265990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	182679774
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66084	NC_010581	ATGC	2	8	3266349	3266356	25 %	25 %	25 %	25 %	182679774
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66088	NC_010581	CGA	2	6	3266498	3266503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679774
66089	NC_010581	GC	3	6	3266505	3266510	0 %	0 %	50 %	50 %	182679774
66090	NC_010581	CGG	2	6	3266553	3266558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679774
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66093	NC_010581	GCC	2	6	3266718	3266723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679774
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66098	NC_010581	GGAA	2	8	3267034	3267041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66099	NC_010581	TCG	2	6	3267083	3267088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679775
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66101	NC_010581	GATGAC	2	12	3267219	3267230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	182679775
66102	NC_010581	CAG	2	6	3267342	3267347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679775
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66105	NC_010581	GA	3	6	3267382	3267387	50 %	0 %	50 %	0 %	182679775
66106	NC_010581	CG	3	6	3267447	3267452	0 %	0 %	50 %	50 %	182679775
66107	NC_010581	AGC	2	6	3267479	3267484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679775
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66110	NC_010581	AC	3	6	3267608	3267613	50 %	0 %	0 %	50 %	182679775
66111	NC_010581	ATG	3	9	3267643	3267651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679775
66112	NC_010581	ATG	2	6	3267805	3267810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679775
66113	NC_010581	TTCT	2	8	3267837	3267844	0 %	75 %	0 %	25 %	182679775
66114	NC_010581	TGAGG	2	10	3267852	3267861	20 %	20 %	60 %	0 %	182679775
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66469	NC_010581	ACG	2	6	3285991	3285996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679790
66470	NC_010581	CGG	2	6	3286131	3286136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679790
66471	NC_010581	GAT	2	6	3286161	3286166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679790
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66473	NC_010581	GCA	2	6	3286298	3286303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679790
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66480	NC_010581	CACG	2	8	3286598	3286605	25 %	0 %	25 %	50 %	182679790
66481	NC_010581	TGA	2	6	3286715	3286720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679790
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66498	NC_010581	CTT	2	6	3287531	3287536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679790
66499	NC_010581	CAT	2	6	3287573	3287578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679790
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