MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_010581	CGT	2	6	2863533	2863538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679459
58002	NC_010581	CAC	2	6	2863560	2863565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679459
58003	NC_010581	CCG	2	6	2863574	2863579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679459
58004	NC_010581	GCG	2	6	2863595	2863600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679459
58005	NC_010581	GCC	2	6	2863624	2863629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679459
58006	NC_010581	TGG	2	6	2863745	2863750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679459
58007	NC_010581	GC	3	6	2863836	2863841	0 %	0 %	50 %	50 %	182679459
58008	NC_010581	TC	3	6	2863916	2863921	0 %	50 %	0 %	50 %	182679459
58009	NC_010581	CGC	2	6	2863929	2863934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679459
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58011	NC_010581	ATC	2	6	2863988	2863993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679459
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58013	NC_010581	GCC	2	6	2864035	2864040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679459
58014	NC_010581	ATCGC	2	10	2864078	2864087	20 %	20 %	20 %	40 %	182679459
58015	NC_010581	CAT	2	6	2864089	2864094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679459
58016	NC_010581	CGA	2	6	2864136	2864141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679459
58017	NC_010581	GCG	2	6	2864216	2864221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58018	NC_010581	CGC	2	6	2864251	2864256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58019	NC_010581	CAG	2	6	2864267	2864272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58020	NC_010581	GCC	2	6	2864312	2864317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58021	NC_010581	AAG	3	9	2864360	2864368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58022	NC_010581	CAA	2	6	2864398	2864403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58023	NC_010581	CGC	2	6	2864425	2864430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58024	NC_010581	TCA	2	6	2864436	2864441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58025	NC_010581	ATC	2	6	2864474	2864479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58026	NC_010581	CGT	2	6	2864485	2864490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58027	NC_010581	AGG	2	6	2864520	2864525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58028	NC_010581	CTCGA	2	10	2864543	2864552	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58029	NC_010581	GC	3	6	2864576	2864581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58030	NC_010581	GA	3	6	2864595	2864600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58031	NC_010581	CCG	2	6	2864613	2864618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58032	NC_010581	CGG	2	6	2864670	2864675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58033	NC_010581	GC	3	6	2864717	2864722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58034	NC_010581	ATCC	2	8	2864733	2864740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58035	NC_010581	ACC	2	6	2864752	2864757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58036	NC_010581	TGG	2	6	2864819	2864824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58037	NC_010581	CGGGC	2	10	2864828	2864837	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58038	NC_010581	CGT	2	6	2864844	2864849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58039	NC_010581	CGC	2	6	2864921	2864926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58040	NC_010581	AAG	2	6	2864941	2864946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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58042	NC_010581	GCC	2	6	2864965	2864970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58043	NC_010581	CAT	2	6	2864976	2864981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58045	NC_010581	TCG	2	6	2865029	2865034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58046	NC_010581	GGT	2	6	2865048	2865053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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58051	NC_010581	ATG	2	6	2865235	2865240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58052	NC_010581	CGG	2	6	2865257	2865262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58053	NC_010581	GCC	2	6	2865334	2865339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58054	NC_010581	ACG	2	6	2865386	2865391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58055	NC_010581	CGG	2	6	2865408	2865413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58056	NC_010581	GC	3	6	2865446	2865451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58057	NC_010581	CCTCG	2	10	2865459	2865468	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58058	NC_010581	CCGCG	2	10	2865483	2865492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58059	NC_010581	GCT	2	6	2865499	2865504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58061	NC_010581	CG	3	6	2865565	2865570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58062	NC_010581	GC	3	6	2865599	2865604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58063	NC_010581	GCA	2	6	2865633	2865638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58064	NC_010581	CGC	2	6	2865699	2865704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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58071	NC_010581	TGC	2	6	2865996	2866001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58072	NC_010581	TGCG	2	8	2866012	2866019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58073	NC_010581	TCG	2	6	2866097	2866102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58074	NC_010581	ACG	2	6	2866124	2866129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58079	NC_010581	AGG	2	6	2866253	2866258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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58081	NC_010581	CCGC	2	8	2866464	2866471	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58082	NC_010581	CG	3	6	2866472	2866477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58083	NC_010581	TCG	2	6	2866526	2866531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58090	NC_010581	TCT	2	6	2866787	2866792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58091	NC_010581	T	6	6	2866849	2866854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58092	NC_010581	GTG	2	6	2866858	2866863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58093	NC_010581	GCG	2	6	2866909	2866914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58094	NC_010581	ACC	2	6	2866932	2866937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58095	NC_010581	ATC	2	6	2866958	2866963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58100	NC_010581	TCG	2	6	2867254	2867259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679460
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58102	NC_010581	TAAAGC	2	12	2867332	2867343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	182679460
58103	NC_010581	CA	3	6	2867395	2867400	50 %	0 %	0 %	50 %	182679460
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58105	NC_010581	TCA	2	6	2867446	2867451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679460
58106	NC_010581	CCTGG	2	10	2867474	2867483	0 %	20 %	40 %	40 %	182679460
58107	NC_010581	TCA	2	6	2867522	2867527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58108	NC_010581	ATC	3	9	2867555	2867563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58109	NC_010581	GCC	2	6	2867586	2867591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58110	NC_010581	CTGC	2	8	2867647	2867654	0 %	25 %	25 %	50 %	182679461
58111	NC_010581	GAC	2	6	2867655	2867660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679461
58112	NC_010581	GC	3	6	2867703	2867708	0 %	0 %	50 %	50 %	182679461
58113	NC_010581	CGA	2	6	2867756	2867761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679461
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58118	NC_010581	AGGT	2	8	2867941	2867948	25 %	25 %	50 %	0 %	182679461
58119	NC_010581	GAAG	2	8	2868025	2868032	50 %	0 %	50 %	0 %	182679461
58120	NC_010581	CCA	2	6	2868038	2868043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679461
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58123	NC_010581	GCA	2	6	2868105	2868110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679461
58124	NC_010581	CGG	2	6	2868201	2868206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679461
58125	NC_010581	CAC	2	6	2868210	2868215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679461
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58200	NC_010581	TTAT	2	8	2872319	2872326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58220	NC_010581	ATT	2	6	2873448	2873453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58228	NC_010581	AGA	2	6	2873745	2873750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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58232	NC_010581	TG	3	6	2873917	2873922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58233	NC_010581	CAGC	2	8	2873975	2873982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58234	NC_010581	CGT	2	6	2873996	2874001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58235	NC_010581	TCG	2	6	2874012	2874017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58236	NC_010581	GC	3	6	2874037	2874042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58237	NC_010581	CG	3	6	2874079	2874084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58238	NC_010581	TTCC	2	8	2874104	2874111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58239	NC_010581	GC	3	6	2874218	2874223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58240	NC_010581	AGACAT	2	12	2874247	2874258	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58241	NC_010581	GCG	2	6	2874260	2874265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58242	NC_010581	CG	3	6	2874324	2874329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58243	NC_010581	TCG	2	6	2874331	2874336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58244	NC_010581	GCCG	2	8	2874395	2874402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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58246	NC_010581	CGC	2	6	2874453	2874458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58247	NC_010581	CGA	2	6	2874479	2874484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58248	NC_010581	CCG	2	6	2874505	2874510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58249	NC_010581	CG	3	6	2874520	2874525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58250	NC_010581	ACC	2	6	2874597	2874602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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58252	NC_010581	GC	4	8	2874689	2874696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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58255	NC_010581	CGC	2	6	2874826	2874831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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