MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_010581	GCT	2	6	2838435	2838440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679436
57502	NC_010581	ATC	2	6	2838474	2838479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679436
57503	NC_010581	GTT	2	6	2838488	2838493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182679436
57504	NC_010581	CGGCGC	2	12	2838653	2838664	0 %	0 %	50 %	50 %	182679436
57505	NC_010581	ATTG	2	8	2838692	2838699	25 %	50 %	25 %	0 %	182679436
57506	NC_010581	CGG	2	6	2838728	2838733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679436
57507	NC_010581	GGT	2	6	2838743	2838748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679436
57508	NC_010581	CATCGG	2	12	2838818	2838829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182679436
57509	NC_010581	GA	3	6	2838883	2838888	50 %	0 %	50 %	0 %	182679436
57510	NC_010581	TGG	2	6	2838889	2838894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679436
57511	NC_010581	TTC	2	6	2838924	2838929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679436
57512	NC_010581	CAG	2	6	2838947	2838952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679436
57513	NC_010581	GCC	2	6	2838990	2838995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679436
57514	NC_010581	TCC	2	6	2839000	2839005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679436
57515	NC_010581	ATG	2	6	2839057	2839062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679436
57516	NC_010581	AGG	2	6	2839081	2839086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182679436
57517	NC_010581	GCTG	2	8	2839089	2839096	0 %	25 %	50 %	25 %	182679436
57518	NC_010581	GCG	2	6	2839168	2839173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679436
57519	NC_010581	GAT	3	9	2839181	2839189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679436
57520	NC_010581	TAT	2	6	2839191	2839196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182679436
57521	NC_010581	TCG	2	6	2839303	2839308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679436
57522	NC_010581	GGCGCC	2	12	2839318	2839329	0 %	0 %	50 %	50 %	182679436
57523	NC_010581	TCA	2	6	2839357	2839362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679436
57524	NC_010581	GTC	2	6	2839428	2839433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679436
57525	NC_010581	TCT	2	6	2839436	2839441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679436
57526	NC_010581	ATG	2	6	2839449	2839454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679436
57527	NC_010581	CCG	2	6	2839462	2839467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679436
57528	NC_010581	GGCT	2	8	2839482	2839489	0 %	25 %	50 %	25 %	182679436
57529	NC_010581	GCTCG	2	10	2839490	2839499	0 %	20 %	40 %	40 %	182679436
57530	NC_010581	CCT	2	6	2839568	2839573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679436
57531	NC_010581	CGT	2	6	2839595	2839600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679436
57532	NC_010581	TTC	2	6	2839674	2839679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679436
57533	NC_010581	GCC	2	6	2839779	2839784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679436
57534	NC_010581	GGT	2	6	2839838	2839843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679436
57535	NC_010581	ATG	2	6	2839906	2839911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57536	NC_010581	GGATCA	2	12	2839918	2839929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57537	NC_010581	CAGT	2	8	2839944	2839951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57538	NC_010581	GAT	2	6	2839990	2839995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57539	NC_010581	TGT	2	6	2840022	2840027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57540	NC_010581	GGT	2	6	2840057	2840062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679437
57541	NC_010581	CCA	2	6	2840247	2840252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679437
57542	NC_010581	CCAA	2	8	2840267	2840274	50 %	0 %	0 %	50 %	182679437
57543	NC_010581	TCG	2	6	2840386	2840391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679437
57544	NC_010581	GCAA	2	8	2840437	2840444	50 %	0 %	25 %	25 %	182679437
57545	NC_010581	CAG	2	6	2840466	2840471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679437
57546	NC_010581	TCA	2	6	2840495	2840500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679437
57547	NC_010581	CATC	3	12	2840556	2840567	25 %	25 %	0 %	50 %	182679437
57548	NC_010581	GCA	2	6	2840644	2840649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679437
57549	NC_010581	CGG	2	6	2840752	2840757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679437
57550	NC_010581	GCC	2	6	2840791	2840796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679437
57551	NC_010581	TCG	2	6	2840815	2840820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679437
57552	NC_010581	CAT	2	6	2840892	2840897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679437
57553	NC_010581	CG	3	6	2840904	2840909	0 %	0 %	50 %	50 %	182679438
57554	NC_010581	CAGC	2	8	2840992	2840999	25 %	0 %	25 %	50 %	182679438
57555	NC_010581	CCA	2	6	2841046	2841051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679438
57556	NC_010581	GCA	2	6	2841198	2841203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679438
57557	NC_010581	CG	3	6	2841216	2841221	0 %	0 %	50 %	50 %	182679438
57558	NC_010581	CCG	2	6	2841292	2841297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679438
57559	NC_010581	GGCC	2	8	2841376	2841383	0 %	0 %	50 %	50 %	182679438
57560	NC_010581	TAC	2	6	2841448	2841453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679438
57561	NC_010581	GC	3	6	2841557	2841562	0 %	0 %	50 %	50 %	182679438
57562	NC_010581	CCG	3	9	2841660	2841668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679438
57563	NC_010581	A	6	6	2841703	2841708	100 %	0 %	0 %	0 %	182679438
57564	NC_010581	TCGGCA	2	12	2841714	2841725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182679438
57565	NC_010581	TCT	2	6	2841770	2841775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679438
57566	NC_010581	AGC	2	6	2841798	2841803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679438
57567	NC_010581	CCCG	2	8	2841820	2841827	0 %	0 %	25 %	75 %	182679438
57568	NC_010581	CAC	2	6	2841941	2841946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679438
57569	NC_010581	GGCTC	2	10	2841993	2842002	0 %	20 %	40 %	40 %	182679438
57570	NC_010581	GAT	2	6	2842079	2842084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679438
57571	NC_010581	TTG	2	6	2842134	2842139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182679439
57572	NC_010581	CCTG	2	8	2842186	2842193	0 %	25 %	25 %	50 %	182679439
57573	NC_010581	TCC	2	6	2842290	2842295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679439
57574	NC_010581	ACG	2	6	2842332	2842337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679439
57575	NC_010581	TTC	2	6	2842347	2842352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679439
57576	NC_010581	TCA	2	6	2842398	2842403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679439
57577	NC_010581	GTG	2	6	2842452	2842457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679439
57578	NC_010581	CATC	2	8	2842459	2842466	25 %	25 %	0 %	50 %	182679439
57579	NC_010581	CG	3	6	2842564	2842569	0 %	0 %	50 %	50 %	182679439
57580	NC_010581	CCTTT	2	10	2842621	2842630	0 %	60 %	0 %	40 %	182679439
57581	NC_010581	T	6	6	2842628	2842633	0 %	100 %	0 %	0 %	182679439
57582	NC_010581	GGC	2	6	2842796	2842801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679439
57583	NC_010581	ATG	2	6	2842821	2842826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679439
57584	NC_010581	CACC	2	8	2842918	2842925	25 %	0 %	0 %	75 %	182679439
57585	NC_010581	GCA	2	6	2842954	2842959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679439
57586	NC_010581	GTC	2	6	2842973	2842978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679439
57587	NC_010581	GGC	2	6	2843033	2843038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679439
57588	NC_010581	GCT	2	6	2843046	2843051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679439
57589	NC_010581	TCC	2	6	2843073	2843078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57590	NC_010581	TGC	2	6	2843122	2843127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57591	NC_010581	GCA	2	6	2843186	2843191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57592	NC_010581	AATC	2	8	2843215	2843222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57593	NC_010581	GCT	2	6	2843242	2843247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679440
57594	NC_010581	CCA	2	6	2843276	2843281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679440
57595	NC_010581	CAGG	2	8	2843311	2843318	25 %	0 %	50 %	25 %	182679440
57596	NC_010581	TGG	2	6	2843491	2843496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679440
57597	NC_010581	GTC	2	6	2843526	2843531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679440
57598	NC_010581	GCT	2	6	2843562	2843567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679441
57599	NC_010581	GC	3	6	2843582	2843587	0 %	0 %	50 %	50 %	182679441
57600	NC_010581	TTCC	2	8	2843606	2843613	0 %	50 %	0 %	50 %	182679441
57601	NC_010581	TGC	2	6	2843628	2843633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679441
57602	NC_010581	CGT	2	6	2843659	2843664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679441
57603	NC_010581	CCA	2	6	2843761	2843766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679441
57604	NC_010581	GTCC	2	8	2843767	2843774	0 %	25 %	25 %	50 %	182679441
57605	NC_010581	GGC	2	6	2843825	2843830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679441
57606	NC_010581	AG	3	6	2843931	2843936	50 %	0 %	50 %	0 %	182679441
57607	NC_010581	ATG	2	6	2843963	2843968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679441
57608	NC_010581	CAT	2	6	2844185	2844190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679441
57609	NC_010581	CGG	2	6	2844238	2844243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679441
57610	NC_010581	ATAAAG	2	12	2844290	2844301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	182679441
57611	NC_010581	CGG	2	6	2844395	2844400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679441
57612	NC_010581	CCG	2	6	2844424	2844429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679441
57613	NC_010581	AAG	2	6	2844456	2844461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182679441
57614	NC_010581	CGG	2	6	2844497	2844502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679441
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57616	NC_010581	GCG	2	6	2844538	2844543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679441
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57728	NC_010581	CTTG	2	8	2850873	2850880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57729	NC_010581	CG	3	6	2850903	2850908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57730	NC_010581	CGATC	2	10	2850972	2850981	20 %	20 %	20 %	40 %	182679449
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57971	NC_010581	CGT	2	6	2862642	2862647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679459
57972	NC_010581	GCT	2	6	2862651	2862656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679459
57973	NC_010581	GTC	2	6	2862663	2862668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679459
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57999	NC_010581	CGT	2	6	2863431	2863436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679459
58000	NC_010581	CG	3	6	2863474	2863479	0 %	0 %	50 %	50 %	182679459

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