MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_010581	CATGAA	2	12	2693488	2693499	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	182679307
54502	NC_010581	GCC	2	6	2693589	2693594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679307
54503	NC_010581	CT	3	6	2693595	2693600	0 %	50 %	0 %	50 %	182679307
54504	NC_010581	AT	3	6	2693616	2693621	50 %	50 %	0 %	0 %	182679307
54505	NC_010581	TTC	2	6	2693659	2693664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679307
54506	NC_010581	GCC	2	6	2693714	2693719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679307
54507	NC_010581	CCTG	2	8	2693767	2693774	0 %	25 %	25 %	50 %	182679307
54508	NC_010581	CTT	2	6	2693880	2693885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679307
54509	NC_010581	GC	3	6	2693887	2693892	0 %	0 %	50 %	50 %	182679307
54510	NC_010581	GAA	2	6	2693998	2694003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182679308
54511	NC_010581	AGA	2	6	2694047	2694052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182679308
54512	NC_010581	CAC	2	6	2694074	2694079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679308
54513	NC_010581	TC	3	6	2694107	2694112	0 %	50 %	0 %	50 %	182679308
54514	NC_010581	ATC	2	6	2694233	2694238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54515	NC_010581	TGCC	2	8	2694275	2694282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54516	NC_010581	TCTGC	2	10	2694348	2694357	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54517	NC_010581	GGA	2	6	2694507	2694512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54518	NC_010581	CGCCTC	2	12	2694571	2694582	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54519	NC_010581	CGTC	2	8	2694636	2694643	0 %	25 %	25 %	50 %	182679309
54520	NC_010581	CCAG	2	8	2694675	2694682	25 %	0 %	25 %	50 %	182679309
54521	NC_010581	T	6	6	2694696	2694701	0 %	100 %	0 %	0 %	182679309
54522	NC_010581	CT	3	6	2694749	2694754	0 %	50 %	0 %	50 %	182679309
54523	NC_010581	ATGA	2	8	2694770	2694777	50 %	25 %	25 %	0 %	182679309
54524	NC_010581	GTC	2	6	2694832	2694837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679309
54525	NC_010581	CGG	2	6	2694844	2694849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679309
54526	NC_010581	GC	3	6	2694947	2694952	0 %	0 %	50 %	50 %	182679309
54527	NC_010581	TCG	2	6	2694956	2694961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679309
54528	NC_010581	TGA	2	6	2695029	2695034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679309
54529	NC_010581	CCG	2	6	2695053	2695058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679309
54530	NC_010581	TCG	2	6	2695059	2695064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679309
54531	NC_010581	GC	4	8	2695117	2695124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54532	NC_010581	CGT	2	6	2695168	2695173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54533	NC_010581	CAA	2	6	2695269	2695274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54534	NC_010581	TCC	2	6	2695288	2695293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54535	NC_010581	GATC	2	8	2695354	2695361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54536	NC_010581	ATT	2	6	2695367	2695372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54537	NC_010581	GAT	2	6	2695427	2695432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679310
54538	NC_010581	CGC	2	6	2695477	2695482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679310
54539	NC_010581	GGAT	2	8	2695555	2695562	25 %	25 %	50 %	0 %	182679310
54540	NC_010581	CG	3	6	2695615	2695620	0 %	0 %	50 %	50 %	182679310
54541	NC_010581	CTT	2	6	2695660	2695665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679310
54542	NC_010581	GATC	2	8	2695675	2695682	25 %	25 %	25 %	25 %	182679310
54543	NC_010581	CGC	2	6	2695703	2695708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679310
54544	NC_010581	GGCGC	2	10	2695739	2695748	0 %	0 %	60 %	40 %	182679310
54545	NC_010581	CCGC	2	8	2695758	2695765	0 %	0 %	25 %	75 %	182679310
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54548	NC_010581	GC	4	8	2695955	2695962	0 %	0 %	50 %	50 %	182679310
54549	NC_010581	GATC	2	8	2696007	2696014	25 %	25 %	25 %	25 %	182679310
54550	NC_010581	AGCG	2	8	2696067	2696074	25 %	0 %	50 %	25 %	182679311
54551	NC_010581	AAT	2	6	2696149	2696154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182679311
54552	NC_010581	TCG	2	6	2696168	2696173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679311
54553	NC_010581	CGG	2	6	2696183	2696188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679311
54554	NC_010581	GGC	2	6	2696191	2696196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679311
54555	NC_010581	CCTG	2	8	2696262	2696269	0 %	25 %	25 %	50 %	182679311
54556	NC_010581	CAG	2	6	2696527	2696532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679311
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54558	NC_010581	GC	3	6	2696601	2696606	0 %	0 %	50 %	50 %	182679311
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54569	NC_010581	CTTT	2	8	2697218	2697225	0 %	75 %	0 %	25 %	182679312
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54572	NC_010581	ATA	2	6	2697394	2697399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182679312
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54575	NC_010581	CG	3	6	2697435	2697440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54576	NC_010581	AAGC	2	8	2697528	2697535	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54577	NC_010581	AG	3	6	2697569	2697574	50 %	0 %	50 %	0 %	182679313
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54584	NC_010581	GCC	3	9	2698055	2698063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679314
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54587	NC_010581	CGG	2	6	2698102	2698107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679314
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54591	NC_010581	GC	3	6	2698291	2698296	0 %	0 %	50 %	50 %	182679314
54592	NC_010581	CG	3	6	2698362	2698367	0 %	0 %	50 %	50 %	182679314
54593	NC_010581	AGC	2	6	2698373	2698378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679314
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54603	NC_010581	A	6	6	2698914	2698919	100 %	0 %	0 %	0 %	182679314
54604	NC_010581	TGG	2	6	2699002	2699007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679314
54605	NC_010581	GGC	2	6	2699057	2699062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679314
54606	NC_010581	C	6	6	2699071	2699076	0 %	0 %	0 %	100 %	182679314
54607	NC_010581	CTG	2	6	2699084	2699089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679314
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54614	NC_010581	CGC	2	6	2699361	2699366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679315
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54618	NC_010581	CGA	2	6	2699432	2699437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679315
54619	NC_010581	ATC	2	6	2699541	2699546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679315
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54731	NC_010581	ATTG	2	8	2705825	2705832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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54746	NC_010581	GCT	2	6	2706594	2706599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54843	NC_010581	CGCC	2	8	2711648	2711655	0 %	0 %	25 %	75 %	182679326
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54853	NC_010581	GGC	3	9	2712220	2712228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679327
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54982	NC_010581	CG	3	6	2718603	2718608	0 %	0 %	50 %	50 %	182679334
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