MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 84501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_010581	CGA	2	6	2616200	2616205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679242
53002	NC_010581	A	6	6	2616240	2616245	100 %	0 %	0 %	0 %	182679242
53003	NC_010581	GCG	3	9	2616355	2616363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679242
53004	NC_010581	CGG	2	6	2616365	2616370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679242
53005	NC_010581	GAAA	2	8	2616384	2616391	75 %	0 %	25 %	0 %	182679242
53006	NC_010581	GAC	2	6	2616468	2616473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679242
53007	NC_010581	CGG	2	6	2616474	2616479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679242
53008	NC_010581	CAG	2	6	2616510	2616515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679242
53009	NC_010581	CG	3	6	2616538	2616543	0 %	0 %	50 %	50 %	182679242
53010	NC_010581	GAAAA	2	10	2616553	2616562	80 %	0 %	20 %	0 %	182679242
53011	NC_010581	AGGC	2	8	2616570	2616577	25 %	0 %	50 %	25 %	182679242
53012	NC_010581	CGG	2	6	2616635	2616640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679242
53013	NC_010581	AAG	2	6	2616691	2616696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53014	NC_010581	GCAGG	2	10	2616723	2616732	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53015	NC_010581	TTCGC	2	10	2616762	2616771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53016	NC_010581	TCA	2	6	2616784	2616789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53017	NC_010581	GCT	2	6	2616815	2616820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53018	NC_010581	TA	3	6	2616875	2616880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53019	NC_010581	CAG	2	6	2616923	2616928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53020	NC_010581	ATTT	2	8	2616937	2616944	25 %	75 %	0 %	0 %	182679243
53021	NC_010581	TCG	2	6	2616980	2616985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679243
53022	NC_010581	GAG	2	6	2617044	2617049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182679243
53023	NC_010581	CGA	2	6	2617097	2617102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679243
53024	NC_010581	CG	3	6	2617163	2617168	0 %	0 %	50 %	50 %	182679243
53025	NC_010581	ATTC	2	8	2617391	2617398	25 %	50 %	0 %	25 %	182679243
53026	NC_010581	CCG	2	6	2617410	2617415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679243
53027	NC_010581	ATCC	2	8	2617452	2617459	25 %	25 %	0 %	50 %	182679243
53028	NC_010581	CGG	2	6	2617469	2617474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679243
53029	NC_010581	CGG	2	6	2617523	2617528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679243
53030	NC_010581	GGC	3	9	2617575	2617583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679243
53031	NC_010581	GCC	2	6	2617612	2617617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679243
53032	NC_010581	GGTGCC	2	12	2617654	2617665	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	182679243
53033	NC_010581	CG	3	6	2617825	2617830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53034	NC_010581	ATT	2	6	2617837	2617842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53035	NC_010581	GGT	2	6	2617857	2617862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53036	NC_010581	G	6	6	2617950	2617955	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53037	NC_010581	CTT	2	6	2618035	2618040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53038	NC_010581	GC	3	6	2618117	2618122	0 %	0 %	50 %	50 %	182679244
53039	NC_010581	CGG	2	6	2618216	2618221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679244
53040	NC_010581	CTC	2	6	2618249	2618254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679244
53041	NC_010581	CGCCTC	2	12	2618315	2618326	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	182679244
53042	NC_010581	CAGA	2	8	2618372	2618379	50 %	0 %	25 %	25 %	182679244
53043	NC_010581	CA	3	6	2618464	2618469	50 %	0 %	0 %	50 %	182679244
53044	NC_010581	TAT	2	6	2618498	2618503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182679244
53045	NC_010581	TGA	2	6	2618596	2618601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53046	NC_010581	A	6	6	2618645	2618650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53047	NC_010581	GACG	2	8	2618666	2618673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53048	NC_010581	TCG	2	6	2618799	2618804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53049	NC_010581	CTT	2	6	2618842	2618847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53050	NC_010581	CTTC	2	8	2618849	2618856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53051	NC_010581	TC	3	6	2618895	2618900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53052	NC_010581	TGAG	2	8	2618967	2618974	25 %	25 %	50 %	0 %	182679245
53053	NC_010581	TCT	2	6	2618986	2618991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679245
53054	NC_010581	TCT	2	6	2618994	2618999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679245
53055	NC_010581	TGC	2	6	2619009	2619014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679245
53056	NC_010581	AGA	2	6	2619015	2619020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182679245
53057	NC_010581	TGC	2	6	2619104	2619109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679245
53058	NC_010581	CGA	2	6	2619112	2619117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679245
53059	NC_010581	GGCAG	2	10	2619191	2619200	20 %	0 %	60 %	20 %	182679245
53060	NC_010581	CA	3	6	2619223	2619228	50 %	0 %	0 %	50 %	182679245
53061	NC_010581	TTG	2	6	2619257	2619262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182679245
53062	NC_010581	ATC	2	6	2619324	2619329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679245
53063	NC_010581	ATA	2	6	2619362	2619367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182679245
53064	NC_010581	TCTT	2	8	2619449	2619456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53065	NC_010581	ACG	2	6	2619577	2619582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53066	NC_010581	TTG	3	9	2619646	2619654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53067	NC_010581	GCA	2	6	2619768	2619773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53068	NC_010581	ATGAC	2	10	2619803	2619812	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53069	NC_010581	CTC	2	6	2619963	2619968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53070	NC_010581	TTA	2	6	2620072	2620077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53071	NC_010581	TCAC	2	8	2620097	2620104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53072	NC_010581	CCAAGA	2	12	2620115	2620126	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53073	NC_010581	T	7	7	2620139	2620145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_010581	CGT	2	6	2620356	2620361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679246
53075	NC_010581	GAT	2	6	2620428	2620433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679246
53076	NC_010581	TACAT	2	10	2620442	2620451	40 %	40 %	0 %	20 %	182679246
53077	NC_010581	TGAT	2	8	2620452	2620459	25 %	50 %	25 %	0 %	182679246
53078	NC_010581	GAT	2	6	2620476	2620481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53079	NC_010581	CCG	2	6	2620583	2620588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679247
53080	NC_010581	ATC	2	6	2620644	2620649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679247
53081	NC_010581	GC	3	6	2620817	2620822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53082	NC_010581	GCC	2	6	2620893	2620898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679248
53083	NC_010581	GATC	2	8	2620971	2620978	25 %	25 %	25 %	25 %	182679248
53084	NC_010581	ATC	2	6	2621044	2621049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679248
53085	NC_010581	TGA	2	6	2621097	2621102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679248
53086	NC_010581	CG	3	6	2621194	2621199	0 %	0 %	50 %	50 %	182679248
53087	NC_010581	TCC	2	6	2621228	2621233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679248
53088	NC_010581	AAG	2	6	2621329	2621334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182679248
53089	NC_010581	CGG	2	6	2621361	2621366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679248
53090	NC_010581	ATC	2	6	2621377	2621382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679248
53091	NC_010581	GATC	2	8	2621386	2621393	25 %	25 %	25 %	25 %	182679248
53092	NC_010581	TC	3	6	2621484	2621489	0 %	50 %	0 %	50 %	182679248
53093	NC_010581	ACG	2	6	2621507	2621512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679248
53094	NC_010581	GA	3	6	2621597	2621602	50 %	0 %	50 %	0 %	182679248
53095	NC_010581	GCCC	2	8	2621613	2621620	0 %	0 %	25 %	75 %	182679248
53096	NC_010581	GGCC	2	8	2621652	2621659	0 %	0 %	50 %	50 %	182679248
53097	NC_010581	ACG	2	6	2621728	2621733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679248
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53099	NC_010581	CGAT	2	8	2621864	2621871	25 %	25 %	25 %	25 %	182679248
53100	NC_010581	ACG	2	6	2621935	2621940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679248
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53102	NC_010581	GAT	2	6	2621956	2621961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679248
53103	NC_010581	GAGC	2	8	2622042	2622049	25 %	0 %	50 %	25 %	182679248
53104	NC_010581	A	6	6	2622051	2622056	100 %	0 %	0 %	0 %	182679248
53105	NC_010581	GTT	2	6	2622136	2622141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53106	NC_010581	TCG	2	6	2622268	2622273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53107	NC_010581	AGG	2	6	2622281	2622286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53108	NC_010581	AAG	2	6	2622306	2622311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53109	NC_010581	AAG	2	6	2622412	2622417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53110	NC_010581	GAT	2	6	2622521	2622526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53111	NC_010581	GCC	2	6	2622568	2622573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53112	NC_010581	CTT	2	6	2622593	2622598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53113	NC_010581	GTT	2	6	2622609	2622614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53114	NC_010581	GAC	2	6	2622634	2622639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53115	NC_010581	CGT	2	6	2622741	2622746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53116	NC_010581	CGG	2	6	2622840	2622845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53117	NC_010581	GCC	2	6	2623024	2623029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53118	NC_010581	GCC	2	6	2623066	2623071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53119	NC_010581	TTG	2	6	2623198	2623203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53120	NC_010581	GCCT	2	8	2623277	2623284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53121	NC_010581	TGG	2	6	2623351	2623356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53122	NC_010581	GCAT	2	8	2623424	2623431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53123	NC_010581	GAA	2	6	2623440	2623445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53124	NC_010581	GCCA	2	8	2623457	2623464	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53125	NC_010581	GCA	3	9	2623479	2623487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53130	NC_010581	GCC	2	6	2623602	2623607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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53133	NC_010581	CGG	2	6	2623939	2623944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53223	NC_010581	CGG	2	6	2628773	2628778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53225	NC_010581	CCTTT	2	10	2628827	2628836	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53226	NC_010581	GGCG	2	8	2628852	2628859	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53227	NC_010581	A	6	6	2628907	2628912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53229	NC_010581	A	6	6	2629001	2629006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53230	NC_010581	ACC	2	6	2629073	2629078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679253
53231	NC_010581	GC	3	6	2629121	2629126	0 %	0 %	50 %	50 %	182679253
53232	NC_010581	GATC	2	8	2629141	2629148	25 %	25 %	25 %	25 %	182679253
53233	NC_010581	CGG	2	6	2629184	2629189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679253
53234	NC_010581	TCG	2	6	2629273	2629278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679253
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53236	NC_010581	CCCG	2	8	2629404	2629411	0 %	0 %	25 %	75 %	182679253
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53242	NC_010581	CCA	2	6	2629747	2629752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679253
53243	NC_010581	GCCGC	2	10	2629753	2629762	0 %	0 %	40 %	60 %	182679253
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53429	NC_010581	GCCTC	2	10	2638407	2638416	0 %	20 %	20 %	60 %	182679263
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53463	NC_010581	CGG	2	6	2639432	2639437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679263
53464	NC_010581	CG	3	6	2639446	2639451	0 %	0 %	50 %	50 %	182679263
53465	NC_010581	CAC	2	6	2639483	2639488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679263
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53470	NC_010581	AAAC	2	8	2639669	2639676	75 %	0 %	0 %	25 %	182679263
53471	NC_010581	GC	3	6	2639738	2639743	0 %	0 %	50 %	50 %	182679263
53472	NC_010581	AGC	2	6	2639761	2639766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679263
53473	NC_010581	GAA	2	6	2639838	2639843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182679263
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53475	NC_010581	TC	3	6	2639886	2639891	0 %	50 %	0 %	50 %	182679264
53476	NC_010581	GCG	2	6	2639982	2639987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679264
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53480	NC_010581	GC	3	6	2640096	2640101	0 %	0 %	50 %	50 %	182679264
53481	NC_010581	CAT	2	6	2640121	2640126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679264
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53485	NC_010581	TCTGG	2	10	2640393	2640402	0 %	40 %	40 %	20 %	182679264
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53491	NC_010581	GGTT	2	8	2640658	2640665	0 %	50 %	50 %	0 %	182679264
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53494	NC_010581	CGG	2	6	2640769	2640774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679264
53495	NC_010581	GCGT	2	8	2640792	2640799	0 %	25 %	50 %	25 %	182679264
53496	NC_010581	CGC	2	6	2640980	2640985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679264
53497	NC_010581	AGC	2	6	2641005	2641010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53498	NC_010581	GCG	2	6	2641050	2641055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679265
53499	NC_010581	CAT	2	6	2641108	2641113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679265
53500	NC_010581	GC	3	6	2641140	2641145	0 %	0 %	50 %	50 %	182679265

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