MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND02

Total Repeats: 1260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010578	C	7	7	26682	26688	0 %	0 %	0 %	100 %	182676803
502	NC_010578	GCTT	2	8	26707	26714	0 %	50 %	25 %	25 %	182676803
503	NC_010578	GCC	2	6	26745	26750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676803
504	NC_010578	CCA	2	6	26828	26833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676803
505	NC_010578	CGT	2	6	26877	26882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676803
506	NC_010578	GCA	2	6	26927	26932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
507	NC_010578	CAG	2	6	27042	27047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
508	NC_010578	TTG	2	6	27136	27141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676803
509	NC_010578	CGA	2	6	27146	27151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
510	NC_010578	CGAT	2	8	27193	27200	25 %	25 %	25 %	25 %	182676803
511	NC_010578	CAT	2	6	27227	27232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676803
512	NC_010578	GCA	2	6	27260	27265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
513	NC_010578	GCA	2	6	27347	27352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
514	NC_010578	TCGGC	2	10	27356	27365	0 %	20 %	40 %	40 %	182676803
515	NC_010578	AGCG	2	8	27384	27391	25 %	0 %	50 %	25 %	182676803
516	NC_010578	TCG	2	6	27399	27404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676803
517	NC_010578	CGA	2	6	27482	27487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
518	NC_010578	TCG	2	6	27488	27493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676803
519	NC_010578	CGA	2	6	27563	27568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
520	NC_010578	CTG	2	6	27695	27700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676803
521	NC_010578	TGT	2	6	27939	27944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010578	CAT	2	6	27947	27952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010578	TCT	2	6	27961	27966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676804
524	NC_010578	TTG	2	6	27986	27991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676804
525	NC_010578	TTC	2	6	27999	28004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676804
526	NC_010578	AT	3	6	28043	28048	50 %	50 %	0 %	0 %	182676804
527	NC_010578	GCC	2	6	28078	28083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676804
528	NC_010578	ATC	3	9	28119	28127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676804
529	NC_010578	CAG	2	6	28131	28136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676804
530	NC_010578	AG	3	6	28340	28345	50 %	0 %	50 %	0 %	182676804
531	NC_010578	CGAA	2	8	28358	28365	50 %	0 %	25 %	25 %	182676804
532	NC_010578	CAC	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676804
533	NC_010578	TGA	2	6	28382	28387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676804
534	NC_010578	TGA	2	6	28415	28420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676804
535	NC_010578	CGC	2	6	28478	28483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676804
536	NC_010578	TGC	2	6	28500	28505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676804
537	NC_010578	AATG	2	8	28548	28555	50 %	25 %	25 %	0 %	182676804
538	NC_010578	GCG	2	6	28810	28815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676804
539	NC_010578	TCA	2	6	28831	28836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676804
540	NC_010578	CTT	2	6	28878	28883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676804
541	NC_010578	TCA	3	9	28919	28927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676804
542	NC_010578	AGGATC	2	12	28980	28991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	182676804
543	NC_010578	AGCG	2	8	29005	29012	25 %	0 %	50 %	25 %	182676804
544	NC_010578	AGA	2	6	29026	29031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676804
545	NC_010578	A	6	6	29086	29091	100 %	0 %	0 %	0 %	182676804
546	NC_010578	TGA	2	6	29186	29191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676804
547	NC_010578	GAGC	2	8	29258	29265	25 %	0 %	50 %	25 %	182676804
548	NC_010578	TGG	2	6	29279	29284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676804
549	NC_010578	CAAAGG	2	12	29315	29326	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	182676804
550	NC_010578	AATG	2	8	29420	29427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010578	ATG	2	6	29456	29461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010578	GAT	2	6	29543	29548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676805
553	NC_010578	TCC	2	6	29559	29564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676805
554	NC_010578	GAGC	2	8	29583	29590	25 %	0 %	50 %	25 %	182676805
555	NC_010578	CCGC	2	8	29615	29622	0 %	0 %	25 %	75 %	182676805
556	NC_010578	CCT	2	6	29695	29700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676805
557	NC_010578	GGC	2	6	29898	29903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676805
558	NC_010578	CAT	2	6	29947	29952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676805
559	NC_010578	GCA	2	6	29977	29982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676805
560	NC_010578	CGG	2	6	30001	30006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676805
561	NC_010578	ACG	2	6	30033	30038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676805
562	NC_010578	AGC	2	6	30045	30050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676805
563	NC_010578	TTC	2	6	30101	30106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676805
564	NC_010578	GCG	2	6	30242	30247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676805
565	NC_010578	GAG	2	6	30347	30352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676805
566	NC_010578	TCTG	2	8	30363	30370	0 %	50 %	25 %	25 %	182676805
567	NC_010578	G	7	7	30408	30414	0 %	0 %	100 %	0 %	182676805
568	NC_010578	GAG	2	6	30527	30532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676805
569	NC_010578	CGA	2	6	30607	30612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676805
570	NC_010578	TGA	2	6	30814	30819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676805
571	NC_010578	AGG	2	6	30820	30825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676805
572	NC_010578	CGC	2	6	30826	30831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676805
573	NC_010578	TCATGG	2	12	30988	30999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182676805
574	NC_010578	GCA	2	6	31000	31005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676805
575	NC_010578	GGCA	2	8	31008	31015	25 %	0 %	50 %	25 %	182676805
576	NC_010578	GGCT	2	8	31022	31029	0 %	25 %	50 %	25 %	182676805
577	NC_010578	TTG	2	6	31180	31185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676805
578	NC_010578	TG	3	6	31187	31192	0 %	50 %	50 %	0 %	182676805
579	NC_010578	TGG	2	6	31229	31234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676805
580	NC_010578	CACGGC	2	12	31259	31270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182676805
581	NC_010578	CTC	2	6	31280	31285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676805
582	NC_010578	GCT	2	6	31287	31292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676805
583	NC_010578	AC	3	6	31303	31308	50 %	0 %	0 %	50 %	182676805
584	NC_010578	GCT	2	6	31339	31344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676805
585	NC_010578	CAA	2	6	31381	31386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010578	TTCA	2	8	31394	31401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_010578	TCT	2	6	31411	31416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676806
588	NC_010578	GCTG	2	8	31430	31437	0 %	25 %	50 %	25 %	182676806
589	NC_010578	CAGGC	2	10	31439	31448	20 %	0 %	40 %	40 %	182676806
590	NC_010578	ATC	3	9	31583	31591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676806
591	NC_010578	GCC	2	6	31660	31665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676806
592	NC_010578	GCA	2	6	31696	31701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676806
593	NC_010578	TGA	2	6	31732	31737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676806
594	NC_010578	GT	3	6	31772	31777	0 %	50 %	50 %	0 %	182676806
595	NC_010578	TGA	2	6	31900	31905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676806
596	NC_010578	ATA	2	6	31932	31937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676806
597	NC_010578	GTG	2	6	32014	32019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676806
598	NC_010578	GAG	2	6	32034	32039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676806
599	NC_010578	CGT	2	6	32111	32116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676806
600	NC_010578	GCC	2	6	32136	32141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676806
601	NC_010578	CGG	2	6	32149	32154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676806
602	NC_010578	ATC	2	6	32195	32200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676806
603	NC_010578	CTGAA	2	10	32364	32373	40 %	20 %	20 %	20 %	182676806
604	NC_010578	GAA	2	6	32390	32395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676806
605	NC_010578	CGT	2	6	32406	32411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676806
606	NC_010578	TC	3	6	32449	32454	0 %	50 %	0 %	50 %	182676806
607	NC_010578	CTTC	2	8	32482	32489	0 %	50 %	0 %	50 %	182676806
608	NC_010578	GGGT	2	8	32563	32570	0 %	25 %	75 %	0 %	182676806
609	NC_010578	TAT	2	6	32629	32634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010578	AT	3	6	32648	32653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010578	AT	3	6	32668	32673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010578	AT	3	6	32690	32695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010578	ATT	2	6	32703	32708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_010578	A	6	6	32722	32727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010578	AAT	2	6	32754	32759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010578	GCC	2	6	32768	32773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_010578	GCA	2	6	32793	32798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010578	TCT	2	6	32843	32848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010578	CAGGC	5	25	32871	32895	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
620	NC_010578	TG	3	6	32915	32920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010578	GTC	2	6	32968	32973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_010578	TGT	2	6	32984	32989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010578	CGA	2	6	32999	33004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010578	TCG	2	6	33031	33036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_010578	CATG	2	8	33056	33063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_010578	GCT	2	6	33128	33133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010578	TCT	2	6	33192	33197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676807
628	NC_010578	CAGGC	2	10	33220	33229	20 %	0 %	40 %	40 %	182676807
629	NC_010578	ATC	3	9	33364	33372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676807
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