MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 chromosome 2

Total Repeats: 79215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_010552	TCC	2	6	441513	441518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172062543
12002	NC_010552	CAT	2	6	441521	441526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172062543
12003	NC_010552	T	6	6	441671	441676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_010552	AATGC	2	10	441721	441730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12005	NC_010552	CG	3	6	441764	441769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12006	NC_010552	CCT	2	6	441779	441784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12007	NC_010552	T	6	6	441823	441828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_010552	T	6	6	441869	441874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_010552	TCGTT	2	10	441899	441908	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12010	NC_010552	T	6	6	441907	441912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_010552	ACG	2	6	441924	441929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12012	NC_010552	CAG	2	6	441962	441967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062544
12013	NC_010552	CGA	2	6	442045	442050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062544
12014	NC_010552	CAG	2	6	442088	442093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062544
12015	NC_010552	CGT	2	6	442181	442186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062544
12016	NC_010552	GAT	2	6	442196	442201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172062544
12017	NC_010552	CAT	2	6	442205	442210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172062544
12018	NC_010552	GATC	2	8	442231	442238	25 %	25 %	25 %	25 %	172062544
12019	NC_010552	GCG	2	6	442242	442247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062544
12020	NC_010552	GAT	2	6	442256	442261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172062544
12021	NC_010552	GCCG	2	8	442321	442328	0 %	0 %	50 %	50 %	172062544
12022	NC_010552	GAT	2	6	442370	442375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172062544
12023	NC_010552	GTC	2	6	442484	442489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_010552	CATCGT	2	12	442539	442550	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	172062545
12025	NC_010552	CGT	2	6	442634	442639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062545
12026	NC_010552	TCG	2	6	442712	442717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062545
12027	NC_010552	TGT	2	6	442739	442744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172062545
12028	NC_010552	CGCGG	2	10	442764	442773	0 %	0 %	60 %	40 %	172062545
12029	NC_010552	GCC	2	6	442831	442836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062545
12030	NC_010552	CCGG	2	8	442878	442885	0 %	0 %	50 %	50 %	172062545
12031	NC_010552	TGG	2	6	442886	442891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172062545
12032	NC_010552	GCGA	2	8	442929	442936	25 %	0 %	50 %	25 %	172062545
12033	NC_010552	GCG	2	6	442945	442950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062545
12034	NC_010552	GC	4	8	443031	443038	0 %	0 %	50 %	50 %	172062545
12035	NC_010552	CGT	2	6	443109	443114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12036	NC_010552	GCT	2	6	443123	443128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_010552	GCAG	2	8	443135	443142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12038	NC_010552	ATC	2	6	443163	443168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12039	NC_010552	GCG	2	6	443175	443180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12040	NC_010552	CGA	2	6	443232	443237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_010552	CGGC	2	8	443243	443250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12042	NC_010552	CGG	2	6	443257	443262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12043	NC_010552	GC	3	6	443344	443349	0 %	0 %	50 %	50 %	172062546
12044	NC_010552	GCCG	2	8	443369	443376	0 %	0 %	50 %	50 %	172062546
12045	NC_010552	GGC	2	6	443424	443429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062546
12046	NC_010552	CTG	2	6	443492	443497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062546
12047	NC_010552	GCC	2	6	443500	443505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062546
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12049	NC_010552	CGGC	2	8	443565	443572	0 %	0 %	50 %	50 %	172062546
12050	NC_010552	GC	3	6	443583	443588	0 %	0 %	50 %	50 %	172062546
12051	NC_010552	GCT	2	6	443629	443634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062546
12052	NC_010552	CGGC	2	8	443637	443644	0 %	0 %	50 %	50 %	172062546
12053	NC_010552	GC	3	6	443646	443651	0 %	0 %	50 %	50 %	172062546
12054	NC_010552	GCT	2	6	443659	443664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062546
12055	NC_010552	TGC	2	6	443700	443705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062546
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12057	NC_010552	GC	3	6	443736	443741	0 %	0 %	50 %	50 %	172062546
12058	NC_010552	TCA	2	6	443748	443753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172062546
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12062	NC_010552	CGG	2	6	443827	443832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062546
12063	NC_010552	TCG	2	6	443847	443852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062546
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12074	NC_010552	GCCG	2	8	444022	444029	0 %	0 %	50 %	50 %	172062546
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12089	NC_010552	GCG	2	6	444548	444553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062546
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12094	NC_010552	CG	3	6	444688	444693	0 %	0 %	50 %	50 %	172062547
12095	NC_010552	CGT	2	6	444717	444722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062547
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12107	NC_010552	GC	4	8	445160	445167	0 %	0 %	50 %	50 %	172062547
12108	NC_010552	GTCG	2	8	445180	445187	0 %	25 %	50 %	25 %	172062547
12109	NC_010552	GCG	2	6	445220	445225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_010552	TCG	2	6	445255	445260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_010552	GAT	2	6	445263	445268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12112	NC_010552	GCGCG	4	20	445380	445399	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12113	NC_010552	A	7	7	445402	445408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12114	NC_010552	CG	3	6	445424	445429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12115	NC_010552	ATG	2	6	445467	445472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_010552	CGA	2	6	445486	445491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12117	NC_010552	ACG	2	6	445492	445497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12118	NC_010552	GCG	2	6	445510	445515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12119	NC_010552	CGATAC	2	12	445520	445531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12120	NC_010552	TCG	2	6	445582	445587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062548
12121	NC_010552	ACG	2	6	445588	445593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062548
12122	NC_010552	TCGC	2	8	445611	445618	0 %	25 %	25 %	50 %	172062548
12123	NC_010552	TCGG	2	8	445632	445639	0 %	25 %	50 %	25 %	172062548
12124	NC_010552	GCC	2	6	445665	445670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062548
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12126	NC_010552	GC	3	6	445770	445775	0 %	0 %	50 %	50 %	172062548
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12131	NC_010552	GCA	2	6	445925	445930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062548
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12228	NC_010552	ATCG	2	8	448715	448722	25 %	25 %	25 %	25 %	172062551
12229	NC_010552	CG	3	6	448748	448753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12230	NC_010552	ACG	2	6	448758	448763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062552
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12232	NC_010552	CGG	2	6	448777	448782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062552
12233	NC_010552	GC	3	6	448791	448796	0 %	0 %	50 %	50 %	172062552
12234	NC_010552	CGT	2	6	448852	448857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062552
12235	NC_010552	CGT	2	6	448882	448887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062552
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12238	NC_010552	CGA	3	9	448947	448955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062552
12239	NC_010552	GTC	2	6	448960	448965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062552
12240	NC_010552	GCACGC	2	12	448980	448991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	172062552
12241	NC_010552	CGG	2	6	449007	449012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062552
12242	NC_010552	CG	3	6	449055	449060	0 %	0 %	50 %	50 %	172062552
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12244	NC_010552	CGC	2	6	449085	449090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062552
12245	NC_010552	GCAGCG	2	12	449106	449117	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	172062552
12246	NC_010552	GAA	2	6	449147	449152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12247	NC_010552	GCG	2	6	449161	449166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12248	NC_010552	CCGCGC	2	12	449225	449236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062553
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12297	NC_010552	CTT	2	6	450659	450664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12344	NC_010552	CG	3	6	452439	452444	0 %	0 %	50 %	50 %	172062555
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12352	NC_010552	CGG	2	6	452632	452637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062555
12353	NC_010552	CCG	2	6	452646	452651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062555
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12356	NC_010552	CG	3	6	452742	452747	0 %	0 %	50 %	50 %	172062555
12357	NC_010552	CGT	3	9	452767	452775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062555
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12359	NC_010552	GTC	2	6	452811	452816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12360	NC_010552	AGGTGA	2	12	452822	452833	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12361	NC_010552	GCG	2	6	452856	452861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12362	NC_010552	CAG	2	6	452878	452883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062556
12363	NC_010552	GTCGA	2	10	452909	452918	20 %	20 %	40 %	20 %	172062556
12364	NC_010552	TCT	2	6	452931	452936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172062556
12365	NC_010552	CGC	2	6	453009	453014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062556
12366	NC_010552	CGA	3	9	453024	453032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062556
12367	NC_010552	CGA	2	6	453051	453056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062556
12368	NC_010552	GCT	3	9	453064	453072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062556
12369	NC_010552	GC	3	6	453106	453111	0 %	0 %	50 %	50 %	172062556
12370	NC_010552	GTC	2	6	453178	453183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062556
12371	NC_010552	CGC	2	6	453202	453207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062556
12372	NC_010552	GATC	2	8	453225	453232	25 %	25 %	25 %	25 %	172062556
12373	NC_010552	CAC	2	6	453235	453240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172062556
12374	NC_010552	GGCC	2	8	453246	453253	0 %	0 %	50 %	50 %	172062556
12375	NC_010552	CG	3	6	453274	453279	0 %	0 %	50 %	50 %	172062556
12376	NC_010552	CGG	2	6	453287	453292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062556
12377	NC_010552	CG	3	6	453328	453333	0 %	0 %	50 %	50 %	172062556
12378	NC_010552	CTG	2	6	453343	453348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062556
12379	NC_010552	GTC	2	6	453367	453372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062556
12380	NC_010552	CAT	2	6	453373	453378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172062556
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12383	NC_010552	GC	3	6	453524	453529	0 %	0 %	50 %	50 %	172062557
12384	NC_010552	CGT	2	6	453557	453562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12385	NC_010552	GCCGAA	2	12	453570	453581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12386	NC_010552	GCC	2	6	453636	453641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062557
12387	NC_010552	TTCG	2	8	453675	453682	0 %	50 %	25 %	25 %	172062557
12388	NC_010552	GCA	2	6	453695	453700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12389	NC_010552	GAA	2	6	453705	453710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172062557
12390	NC_010552	CAGGTT	2	12	453738	453749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	172062557
12391	NC_010552	CAG	2	6	453762	453767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062557
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12393	NC_010552	GCG	2	6	453827	453832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062557
12394	NC_010552	GCG	2	6	453848	453853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062557
12395	NC_010552	CGT	2	6	453857	453862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12396	NC_010552	TCG	2	6	453865	453870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12397	NC_010552	GATC	2	8	453872	453879	25 %	25 %	25 %	25 %	172062557
12398	NC_010552	GC	3	6	453920	453925	0 %	0 %	50 %	50 %	172062557
12399	NC_010552	GCTC	2	8	453938	453945	0 %	25 %	25 %	50 %	172062557
12400	NC_010552	CGG	2	6	453965	453970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062557
12401	NC_010552	TCG	2	6	453979	453984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12402	NC_010552	CGT	2	6	454032	454037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12403	NC_010552	CTTGAA	2	12	454065	454076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	172062557
12404	NC_010552	CGC	2	6	454148	454153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062557
12405	NC_010552	GTC	2	6	454179	454184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12406	NC_010552	GC	4	8	454289	454296	0 %	0 %	50 %	50 %	172062557
12407	NC_010552	GGC	2	6	454391	454396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062557
12408	NC_010552	GCA	2	6	454406	454411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062557
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12412	NC_010552	TGA	2	6	454472	454477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172062557
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12415	NC_010552	TCG	3	9	454658	454666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062557
12416	NC_010552	AAAT	2	8	454768	454775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12417	NC_010552	ATG	2	6	454783	454788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12418	NC_010552	ATC	2	6	454811	454816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172062558
12419	NC_010552	TCG	2	6	454850	454855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062558
12420	NC_010552	GCCG	2	8	454902	454909	0 %	0 %	50 %	50 %	172062558
12421	NC_010552	GGC	2	6	454925	454930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062558
12422	NC_010552	CGA	2	6	454944	454949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062558
12423	NC_010552	TCG	2	6	455015	455020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062558
12424	NC_010552	GCTGTC	2	12	455100	455111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062558
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12433	NC_010552	GCG	2	6	455353	455358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062558
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12443	NC_010552	TCG	2	6	455693	455698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062558
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12446	NC_010552	TCG	2	6	455754	455759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12448	NC_010552	TCG	2	6	455818	455823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12449	NC_010552	CCG	2	6	455854	455859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062559
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12451	NC_010552	GCA	3	9	455876	455884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062559
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12453	NC_010552	GAT	2	6	455932	455937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172062559
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12456	NC_010552	GC	3	6	456017	456022	0 %	0 %	50 %	50 %	172062559
12457	NC_010552	CGA	2	6	456031	456036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062559
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12465	NC_010552	ATCG	2	8	456254	456261	25 %	25 %	25 %	25 %	172062559
12466	NC_010552	GCC	2	6	456285	456290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062559
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12471	NC_010552	AGT	2	6	456391	456396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172062559
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12473	NC_010552	GCT	2	6	456418	456423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062559
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12475	NC_010552	TCGC	2	8	456486	456493	0 %	25 %	25 %	50 %	172062559
12476	NC_010552	GCGCG	2	10	456518	456527	0 %	0 %	60 %	40 %	172062559
12477	NC_010552	CGT	3	9	456556	456564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062559
12478	NC_010552	AGCG	2	8	456567	456574	25 %	0 %	50 %	25 %	172062559
12479	NC_010552	CCG	2	6	456579	456584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062559
12480	NC_010552	CG	3	6	456583	456588	0 %	0 %	50 %	50 %	172062559
12481	NC_010552	GC	3	6	456590	456595	0 %	0 %	50 %	50 %	172062559
12482	NC_010552	CTT	2	6	456599	456604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172062559
12483	NC_010552	TCG	2	6	456630	456635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172062559
12484	NC_010552	GGC	2	6	456637	456642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062559
12485	NC_010552	CG	3	6	456733	456738	0 %	0 %	50 %	50 %	172062559
12486	NC_010552	TGG	2	6	456795	456800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172062559
12487	NC_010552	GAA	2	6	456834	456839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12488	NC_010552	AAATC	2	10	456897	456906	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12489	NC_010552	A	6	6	456910	456915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12490	NC_010552	GGAT	2	8	456934	456941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12491	NC_010552	TCG	2	6	456960	456965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12492	NC_010552	CG	3	6	456964	456969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12493	NC_010552	GCG	2	6	456978	456983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062560
12494	NC_010552	GGC	2	6	457013	457018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062560
12495	NC_010552	CGCGCT	2	12	457042	457053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	172062560
12496	NC_010552	GCG	2	6	457061	457066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062560
12497	NC_010552	GCC	2	6	457083	457088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172062560
12498	NC_010552	AGC	3	9	457089	457097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172062560
12499	NC_010552	GCG	2	6	457098	457103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062560
12500	NC_010552	GGC	2	6	457109	457114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172062560

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