MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella petrii DSM 12804 chromosome

Total Repeats: 138861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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138502	NC_010170	GCGCC	2	10	5274837	5274846	0 %	0 %	40 %	60 %	163859322
138503	NC_010170	CAC	2	6	5274876	5274881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163859322
138504	NC_010170	GCC	2	6	5274888	5274893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163859322
138505	NC_010170	GGC	2	6	5274915	5274920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859322
138506	NC_010170	GCG	2	6	5275032	5275037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138507	NC_010170	ATG	2	6	5275072	5275077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163859323
138508	NC_010170	TGGC	2	8	5275100	5275107	0 %	25 %	50 %	25 %	163859323
138509	NC_010170	GCC	2	6	5275138	5275143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163859323
138510	NC_010170	GC	3	6	5275156	5275161	0 %	0 %	50 %	50 %	163859323
138511	NC_010170	TGG	3	9	5275166	5275174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163859323
138512	NC_010170	GC	3	6	5275266	5275271	0 %	0 %	50 %	50 %	163859323
138513	NC_010170	GCAGCC	2	12	5275284	5275295	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163859323
138514	NC_010170	CGG	2	6	5275385	5275390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859323
138515	NC_010170	GTG	2	6	5275396	5275401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163859323
138516	NC_010170	ACC	2	6	5275510	5275515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163859323
138517	NC_010170	GCT	2	6	5275530	5275535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163859323
138518	NC_010170	ACC	3	9	5275606	5275614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163859323
138519	NC_010170	GCG	2	6	5275625	5275630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859323
138520	NC_010170	TGG	2	6	5275637	5275642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163859323
138521	NC_010170	TCGTG	2	10	5275661	5275670	0 %	40 %	40 %	20 %	163859323
138522	NC_010170	GCG	2	6	5275676	5275681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859323
138523	NC_010170	ACT	2	6	5275709	5275714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163859323
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138525	NC_010170	TATC	2	8	5275743	5275750	25 %	50 %	0 %	25 %	163859323
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138527	NC_010170	CTG	2	6	5275786	5275791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163859323
138528	NC_010170	TCC	2	6	5275818	5275823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163859323
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138530	NC_010170	GAA	2	6	5275870	5275875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163859323
138531	NC_010170	AGA	2	6	5275949	5275954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163859323
138532	NC_010170	GCG	2	6	5276033	5276038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859323
138533	NC_010170	GGC	2	6	5276046	5276051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859323
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138537	NC_010170	TGGC	2	8	5276333	5276340	0 %	25 %	50 %	25 %	163859323
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138540	NC_010170	GCT	2	6	5276382	5276387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163859323
138541	NC_010170	GGCG	2	8	5276406	5276413	0 %	0 %	75 %	25 %	163859323
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138543	NC_010170	GC	3	6	5276499	5276504	0 %	0 %	50 %	50 %	163859323
138544	NC_010170	GCT	2	6	5276508	5276513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163859323
138545	NC_010170	GCA	2	6	5276514	5276519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163859323
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138550	NC_010170	GCT	2	6	5276703	5276708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163859324
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138552	NC_010170	TGG	2	6	5276858	5276863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163859324
138553	NC_010170	TGC	2	6	5276993	5276998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163859324
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138557	NC_010170	GCTGG	2	10	5277150	5277159	0 %	20 %	60 %	20 %	163859324
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138560	NC_010170	CG	3	6	5277311	5277316	0 %	0 %	50 %	50 %	163859324
138561	NC_010170	CG	5	10	5277345	5277354	0 %	0 %	50 %	50 %	163859324
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138570	NC_010170	GAC	2	6	5277653	5277658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163859324
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138593	NC_010170	GGCGC	2	10	5278212	5278221	0 %	0 %	60 %	40 %	163859325
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138595	NC_010170	GCTGG	2	10	5278268	5278277	0 %	20 %	60 %	20 %	163859325
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138605	NC_010170	CG	3	6	5278659	5278664	0 %	0 %	50 %	50 %	163859326
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138615	NC_010170	GC	3	6	5279056	5279061	0 %	0 %	50 %	50 %	163859326
138616	NC_010170	GGC	2	6	5279081	5279086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859326
138617	NC_010170	GCCATT	2	12	5279102	5279113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163859326
138618	NC_010170	GCT	2	6	5279116	5279121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163859326
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138842	NC_010170	GC	4	8	5287163	5287170	0 %	0 %	50 %	50 %	163859334
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138845	NC_010170	GCG	2	6	5287236	5287241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859334
138846	NC_010170	GGC	2	6	5287354	5287359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859334
138847	NC_010170	GCT	2	6	5287375	5287380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163859334
138848	NC_010170	GCG	2	6	5287385	5287390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163859334
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138857	NC_010170	GGGC	2	8	5287768	5287775	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138858	NC_010170	GACA	2	8	5287802	5287809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138859	NC_010170	CAT	2	6	5287825	5287830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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138861	NC_010170	ACCC	2	8	5287906	5287913	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.