MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM100

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010008	TCA	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161353807
2	NC_010008	ATA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161353807
3	NC_010008	A	6	6	172	177	100 %	0 %	0 %	0 %	161353807
4	NC_010008	TTG	2	6	214	219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010008	TAT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010008	CAA	2	6	263	268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010008	A	6	6	267	272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010008	GGA	2	6	282	287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010008	AATG	2	8	295	302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010008	AAC	2	6	322	327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010008	GGA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010008	ACAAA	2	10	448	457	80 %	0 %	0 %	20 %	294672671
13	NC_010008	GCT	2	6	479	484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672671
14	NC_010008	GGAA	2	8	486	493	50 %	0 %	50 %	0 %	294672671
15	NC_010008	A	7	7	541	547	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
16	NC_010008	ATT	2	6	549	554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672671
17	NC_010008	AAAT	2	8	615	622	75 %	25 %	0 %	0 %	294672671
18	NC_010008	ACA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
19	NC_010008	A	6	6	693	698	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
20	NC_010008	TCT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672671
21	NC_010008	ACA	2	6	763	768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
22	NC_010008	GT	3	6	771	776	0 %	50 %	50 %	0 %	294672671
23	NC_010008	ACA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
24	NC_010008	TAAA	2	8	798	805	75 %	25 %	0 %	0 %	294672671
25	NC_010008	A	6	6	803	808	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
26	NC_010008	A	6	6	834	839	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
27	NC_010008	TAG	3	9	841	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
28	NC_010008	TGA	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
29	NC_010008	ATA	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
30	NC_010008	CGA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672671
31	NC_010008	CAAA	2	8	1007	1014	75 %	0 %	0 %	25 %	294672671
32	NC_010008	GTA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
33	NC_010008	ACAA	2	8	1066	1073	75 %	0 %	0 %	25 %	294672671
34	NC_010008	ATG	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
35	NC_010008	AGA	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672671
36	NC_010008	AAT	2	6	1109	1114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
37	NC_010008	A	6	6	1134	1139	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
38	NC_010008	TAA	2	6	1190	1195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
39	NC_010008	GAA	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353809
40	NC_010008	AACG	2	8	1251	1258	50 %	0 %	25 %	25 %	161353809
41	NC_010008	AAC	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353809
42	NC_010008	T	6	6	1382	1387	0 %	100 %	0 %	0 %	161353809
43	NC_010008	A	6	6	1440	1445	100 %	0 %	0 %	0 %	161353809
44	NC_010008	AGAACA	2	12	1505	1516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	161353809
45	NC_010008	C	6	6	1527	1532	0 %	0 %	0 %	100 %	161353809
46	NC_010008	GGA	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353809
47	NC_010008	GAAC	2	8	1625	1632	50 %	0 %	25 %	25 %	161353809
48	NC_010008	A	8	8	1676	1683	100 %	0 %	0 %	0 %	161353809
49	NC_010008	GCT	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161353809
50	NC_010008	GTAA	2	8	1704	1711	50 %	25 %	25 %	0 %	161353809
51	NC_010008	A	9	9	1710	1718	100 %	0 %	0 %	0 %	161353809
52	NC_010008	TGG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161353809
53	NC_010008	T	7	7	1743	1749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010008	TAT	2	6	1802	1807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010008	CAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010008	ATA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010008	AGA	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010008	A	6	6	1856	1861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010008	T	7	7	1882	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010008	TA	3	6	1898	1903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010008	ATA	2	6	1908	1913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010008	TA	3	6	1932	1937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010008	GATA	2	8	2000	2007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010008	GTAA	2	8	2019	2026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010008	TAT	2	6	2032	2037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010008	GCT	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010008	T	7	7	2047	2053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010008	TGTTT	2	10	2058	2067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010008	ATG	2	6	2070	2075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010008	CGG	2	6	2087	2092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010008	TTG	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010008	GCTT	2	8	2179	2186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010008	T	6	6	2185	2190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010008	AATA	2	8	2230	2237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010008	A	6	6	2265	2270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010008	ATAA	2	8	2274	2281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010008	TTA	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010008	TG	3	6	2375	2380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010008	TAA	2	6	2399	2404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161353810
80	NC_010008	T	6	6	2459	2464	0 %	100 %	0 %	0 %	161353810
81	NC_010008	TCT	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353810
82	NC_010008	GA	3	6	2562	2567	50 %	0 %	50 %	0 %	161353810
83	NC_010008	T	6	6	2571	2576	0 %	100 %	0 %	0 %	161353810
84	NC_010008	CCTA	2	8	2719	2726	25 %	25 %	0 %	50 %	161353810
85	NC_010008	ATC	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010008	TCA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
87	NC_010008	ATC	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
88	NC_010008	CTT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672672
89	NC_010008	CTT	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672672
90	NC_010008	GAT	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672672
91	NC_010008	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672672
92	NC_010008	TACTC	2	10	3056	3065	20 %	40 %	0 %	40 %	294672672
93	NC_010008	TGT	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672672
94	NC_010008	GAA	2	6	3100	3105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672672
95	NC_010008	GGT	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672672
96	NC_010008	CTA	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
97	NC_010008	CAT	2	6	3311	3316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010008	ATA	2	6	3322	3327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010008	A	6	6	3339	3344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010008	C	6	6	3366	3371	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_010008	AT	3	6	3402	3407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010008	A	6	6	3420	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010008	A	7	7	3428	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010008	TTAA	2	8	3452	3459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010008	T	7	7	3485	3491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010008	GTT	2	6	3526	3531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010008	CAA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010008	CTT	2	6	3572	3577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010008	T	6	6	3606	3611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010008	GTG	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010008	ATG	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010008	AAAAG	2	10	3749	3758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010008	GAA	2	6	3806	3811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010008	GAT	2	6	3835	3840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010008	A	6	6	3850	3855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010008	T	7	7	3885	3891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010008	AGAA	2	8	3920	3927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010008	AT	3	6	3928	3933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010008	CTTT	2	8	3989	3996	0 %	75 %	0 %	25 %	294672673
120	NC_010008	CAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672673
121	NC_010008	CTGG	2	8	4076	4083	0 %	25 %	50 %	25 %	294672673
122	NC_010008	GTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672673
123	NC_010008	TTC	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672673
124	NC_010008	T	7	7	4195	4201	0 %	100 %	0 %	0 %	294672673
125	NC_010008	CCT	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010008	A	7	7	4247	4253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010008	ATTT	2	8	4348	4355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010008	GAG	3	9	4471	4479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353813
129	NC_010008	AAG	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353813
130	NC_010008	CAA	2	6	4615	4620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353813
131	NC_010008	A	6	6	4636	4641	100 %	0 %	0 %	0 %	161353813
132	NC_010008	AAG	2	6	4661	4666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353813
133	NC_010008	CAA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353813
134	NC_010008	CCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353813
135	NC_010008	CAC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353813
136	NC_010008	A	6	6	4751	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	161353813
137	NC_010008	A	6	6	4759	4764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010008	CAG	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010008	A	6	6	4878	4883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010008	GCCTA	2	10	4912	4921	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010008	GAA	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010008	T	8	8	4991	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010008	A	6	6	5000	5005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010008	T	7	7	5014	5020	0 %	100 %	0 %	0 %	294672674
145	NC_010008	ATT	3	9	5025	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672674
146	NC_010008	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
147	NC_010008	CAT	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672674
148	NC_010008	GGGA	2	8	5154	5161	25 %	0 %	75 %	0 %	294672674
149	NC_010008	ACA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672674
150	NC_010008	ATG	2	6	5229	5234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
151	NC_010008	GAT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
152	NC_010008	T	7	7	5294	5300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010008	TCT	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010008	ATAA	2	8	5381	5388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.