MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus subsp. cytotoxis NVH 391-98 plasmid pBC9801

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009673	TTCTTT	2	12	27	38	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152973843
2	NC_009673	TCT	2	6	92	97	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973843
3	NC_009673	T	6	6	107	112	0 %	100 %	0 %	0 %	152973843
4	NC_009673	TCAA	2	8	121	128	50 %	25 %	0 %	25 %	152973843
5	NC_009673	TTC	2	6	141	146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973843
6	NC_009673	A	6	6	201	206	100 %	0 %	0 %	0 %	152973843
7	NC_009673	TCTTTT	2	12	223	234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152973843
8	NC_009673	AAAAT	2	10	249	258	80 %	20 %	0 %	0 %	152973843
9	NC_009673	TAA	2	6	273	278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973843
10	NC_009673	CAT	2	6	305	310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
11	NC_009673	TAT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973843
12	NC_009673	GAC	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973843
13	NC_009673	ACC	2	6	414	419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973843
14	NC_009673	AGT	2	6	420	425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973843
15	NC_009673	T	7	7	425	431	0 %	100 %	0 %	0 %	152973843
16	NC_009673	AAGA	2	8	447	454	75 %	0 %	25 %	0 %	152973843
17	NC_009673	CAATA	2	10	489	498	60 %	20 %	0 %	20 %	152973843
18	NC_009673	T	6	6	501	506	0 %	100 %	0 %	0 %	152973843
19	NC_009673	CAT	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
20	NC_009673	CAA	2	6	530	535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973843
21	NC_009673	CATT	2	8	575	582	25 %	50 %	0 %	25 %	152973843
22	NC_009673	AACT	2	8	690	697	50 %	25 %	0 %	25 %	152973843
23	NC_009673	CTT	2	6	702	707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973843
24	NC_009673	TGA	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973843
25	NC_009673	TAG	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973843
26	NC_009673	AT	3	6	754	759	50 %	50 %	0 %	0 %	152973843
27	NC_009673	CAT	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
28	NC_009673	CAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973843
29	NC_009673	ATC	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
30	NC_009673	T	6	6	876	881	0 %	100 %	0 %	0 %	152973843
31	NC_009673	CAT	2	6	1016	1021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
32	NC_009673	TAAA	2	8	1031	1038	75 %	25 %	0 %	0 %	152973843
33	NC_009673	TCA	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973843
34	NC_009673	TAA	2	6	1073	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973843
35	NC_009673	TCC	2	6	1079	1084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973843
36	NC_009673	A	6	6	1239	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009673	CTA	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009673	ATTT	2	8	1260	1267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009673	ATTTTC	2	12	1281	1292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009673	TTC	2	6	1361	1366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973844
41	NC_009673	GTG	2	6	1369	1374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973844
42	NC_009673	TGATAT	2	12	1403	1414	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	152973844
43	NC_009673	ATA	2	6	1428	1433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973844
44	NC_009673	TAA	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973844
45	NC_009673	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	152973844
46	NC_009673	T	6	6	1584	1589	0 %	100 %	0 %	0 %	152973844
47	NC_009673	TCT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973844
48	NC_009673	T	7	7	1616	1622	0 %	100 %	0 %	0 %	152973844
49	NC_009673	CT	3	6	1651	1656	0 %	50 %	0 %	50 %	152973844
50	NC_009673	ACTC	2	8	1690	1697	25 %	25 %	0 %	50 %	152973845
51	NC_009673	T	6	6	1837	1842	0 %	100 %	0 %	0 %	152973845
52	NC_009673	TC	3	6	1944	1949	0 %	50 %	0 %	50 %	152973846
53	NC_009673	TAAA	2	8	1978	1985	75 %	25 %	0 %	0 %	152973846
54	NC_009673	TTA	2	6	2040	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973846
55	NC_009673	ATC	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973846
56	NC_009673	TTC	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973846
57	NC_009673	AAT	2	6	2129	2134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973846
58	NC_009673	TAA	2	6	2141	2146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973846
59	NC_009673	A	6	6	2181	2186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009673	TATTAA	2	12	2203	2214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009673	AAGA	2	8	2221	2228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009673	TCT	2	6	2266	2271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973847
63	NC_009673	A	6	6	2288	2293	100 %	0 %	0 %	0 %	152973847
64	NC_009673	TGTAAA	2	12	2402	2413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	152973847
65	NC_009673	TTTTCT	2	12	2422	2433	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	152973847
66	NC_009673	ATC	2	6	2442	2447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973847
67	NC_009673	CCT	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009673	ATT	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009673	T	7	7	2520	2526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009673	A	6	6	2527	2532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009673	TATTT	2	10	2533	2542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009673	CTA	2	6	2550	2555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009673	CAA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009673	A	6	6	2621	2626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009673	TAA	2	6	2628	2633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009673	A	7	7	2699	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009673	A	6	6	2718	2723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009673	TCA	2	6	2725	2730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009673	TAG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009673	AAC	3	9	2813	2821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009673	ACA	2	6	2876	2881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009673	ATA	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009673	ATT	2	6	2929	2934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009673	CAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009673	CAAA	2	8	2984	2991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009673	ATA	2	6	2994	2999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009673	AAT	2	6	3029	3034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009673	TATC	2	8	3085	3092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009673	A	6	6	3108	3113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009673	ATC	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009673	TTA	2	6	3156	3161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009673	TA	3	6	3217	3222	50 %	50 %	0 %	0 %	152973848
93	NC_009673	CT	3	6	3320	3325	0 %	50 %	0 %	50 %	152973848
94	NC_009673	T	6	6	3443	3448	0 %	100 %	0 %	0 %	152973848
95	NC_009673	AGAAGT	2	12	3457	3468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	152973848
96	NC_009673	T	6	6	3488	3493	0 %	100 %	0 %	0 %	152973848
97	NC_009673	TAAA	2	8	3499	3506	75 %	25 %	0 %	0 %	152973848
98	NC_009673	TCAC	2	8	3530	3537	25 %	25 %	0 %	50 %	152973848
99	NC_009673	GGT	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973848
100	NC_009673	TCA	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
101	NC_009673	TAGA	2	8	3636	3643	50 %	25 %	25 %	0 %	152973848
102	NC_009673	GAA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973848
103	NC_009673	CAA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973848
104	NC_009673	TTC	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973848
105	NC_009673	CTT	2	6	3760	3765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973848
106	NC_009673	ATC	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
107	NC_009673	TAACT	2	10	3823	3832	40 %	40 %	0 %	20 %	152973848
108	NC_009673	AGG	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973848
109	NC_009673	T	7	7	3882	3888	0 %	100 %	0 %	0 %	152973848
110	NC_009673	TCA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
111	NC_009673	CAT	3	9	3939	3947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
112	NC_009673	ATC	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
113	NC_009673	ACA	2	6	3998	4003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973848
114	NC_009673	CAAT	2	8	4032	4039	50 %	25 %	0 %	25 %	152973848
115	NC_009673	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973848
116	NC_009673	CAT	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
117	NC_009673	CTTT	2	8	4233	4240	0 %	75 %	0 %	25 %	152973848
118	NC_009673	CTT	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973848
119	NC_009673	T	6	6	4253	4258	0 %	100 %	0 %	0 %	152973848
120	NC_009673	T	7	7	4263	4269	0 %	100 %	0 %	0 %	152973848
121	NC_009673	CAT	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
122	NC_009673	ACA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973848
123	NC_009673	GTC	2	6	4402	4407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973848
124	NC_009673	CTA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973848
125	NC_009673	T	8	8	4475	4482	0 %	100 %	0 %	0 %	152973848
126	NC_009673	AT	3	6	4484	4489	50 %	50 %	0 %	0 %	152973848
127	NC_009673	AAAGA	2	10	4549	4558	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009673	ACA	2	6	4570	4575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009673	A	7	7	4618	4624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009673	A	6	6	4648	4653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009673	GGA	2	6	4678	4683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009673	A	6	6	4795	4800	100 %	0 %	0 %	0 %	152973849
133	NC_009673	T	6	6	4802	4807	0 %	100 %	0 %	0 %	152973849
134	NC_009673	A	7	7	4815	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	152973849
135	NC_009673	T	6	6	4823	4828	0 %	100 %	0 %	0 %	152973849
136	NC_009673	GAT	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009673	TTC	2	6	4982	4987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973850
138	NC_009673	TCT	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973850
139	NC_009673	ATC	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973850
140	NC_009673	A	6	6	5072	5077	100 %	0 %	0 %	0 %	152973850
141	NC_009673	TAC	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973850
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.