MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 4869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009475	TGT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009475	ACA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009475	GC	3	6	82	87	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009475	AAC	2	6	99	104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009475	TC	3	6	149	154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009475	TCGC	3	12	293	304	0 %	25 %	25 %	50 %	148240871
7	NC_009475	CAGC	2	8	325	332	25 %	0 %	25 %	50 %	148240871
8	NC_009475	TC	3	6	336	341	0 %	50 %	0 %	50 %	148240871
9	NC_009475	CTCG	2	8	407	414	0 %	25 %	25 %	50 %	148240871
10	NC_009475	GACC	2	8	424	431	25 %	0 %	25 %	50 %	148240871
11	NC_009475	GC	3	6	488	493	0 %	0 %	50 %	50 %	148240871
12	NC_009475	CGC	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
13	NC_009475	GAC	3	9	605	613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
14	NC_009475	CCTTGC	2	12	635	646	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148240871
15	NC_009475	CT	3	6	742	747	0 %	50 %	0 %	50 %	148240871
16	NC_009475	CCG	2	6	773	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
17	NC_009475	CAC	2	6	861	866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240871
18	NC_009475	GCG	2	6	887	892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240871
19	NC_009475	CGC	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
20	NC_009475	CGA	2	6	950	955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
21	NC_009475	ACG	2	6	958	963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
22	NC_009475	TCG	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240871
23	NC_009475	GC	3	6	1009	1014	0 %	0 %	50 %	50 %	148240871
24	NC_009475	CCAT	2	8	1042	1049	25 %	25 %	0 %	50 %	148240871
25	NC_009475	CGG	2	6	1127	1132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240871
26	NC_009475	TCA	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240871
27	NC_009475	ACG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
28	NC_009475	CCT	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240871
29	NC_009475	GCGCG	2	10	1316	1325	0 %	0 %	60 %	40 %	148240871
30	NC_009475	GGGCG	2	10	1329	1338	0 %	0 %	80 %	20 %	148240871
31	NC_009475	CG	3	6	1347	1352	0 %	0 %	50 %	50 %	148240871
32	NC_009475	CTT	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240871
33	NC_009475	AAG	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240871
34	NC_009475	TCG	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240872
35	NC_009475	GAG	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240872
36	NC_009475	GAT	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240872
37	NC_009475	CGC	2	6	1784	1789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240872
38	NC_009475	CG	3	6	1800	1805	0 %	0 %	50 %	50 %	148240872
39	NC_009475	CG	3	6	1887	1892	0 %	0 %	50 %	50 %	148240872
40	NC_009475	GC	3	6	1912	1917	0 %	0 %	50 %	50 %	148240872
41	NC_009475	TCGA	2	8	1979	1986	25 %	25 %	25 %	25 %	148240872
42	NC_009475	GCG	2	6	2138	2143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240872
43	NC_009475	GCA	2	6	2192	2197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240872
44	NC_009475	CAG	2	6	2202	2207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240872
45	NC_009475	GGC	2	6	2408	2413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240872
46	NC_009475	GAAAA	2	10	2474	2483	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009475	A	6	6	2480	2485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009475	TCG	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009475	ACG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
50	NC_009475	GCG	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
51	NC_009475	TCC	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240873
52	NC_009475	GCACG	2	10	2765	2774	20 %	0 %	40 %	40 %	148240873
53	NC_009475	GAT	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240873
54	NC_009475	ACTC	2	8	2892	2899	25 %	25 %	0 %	50 %	148240873
55	NC_009475	GGCG	2	8	2900	2907	0 %	0 %	75 %	25 %	148240873
56	NC_009475	TGCTG	2	10	2943	2952	0 %	40 %	40 %	20 %	148240873
57	NC_009475	CG	3	6	3003	3008	0 %	0 %	50 %	50 %	148240873
58	NC_009475	CGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
59	NC_009475	GGC	2	6	3093	3098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
60	NC_009475	GAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240873
61	NC_009475	GGAGG	2	10	3212	3221	20 %	0 %	80 %	0 %	148240873
62	NC_009475	CGC	2	6	3252	3257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
63	NC_009475	CG	3	6	3262	3267	0 %	0 %	50 %	50 %	148240873
64	NC_009475	TCG	2	6	3269	3274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
65	NC_009475	CAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
66	NC_009475	GAC	2	6	3343	3348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
67	NC_009475	TCT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240873
68	NC_009475	CA	3	6	3368	3373	50 %	0 %	0 %	50 %	148240873
69	NC_009475	GCG	2	6	3481	3486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
70	NC_009475	TCG	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
71	NC_009475	CGAT	2	8	3634	3641	25 %	25 %	25 %	25 %	148240873
72	NC_009475	GAG	2	6	3667	3672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240873
73	NC_009475	TCG	3	9	3707	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
74	NC_009475	CCG	2	6	3749	3754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
75	NC_009475	AGC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
76	NC_009475	GCT	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240874
77	NC_009475	GA	3	6	3956	3961	50 %	0 %	50 %	0 %	148240874
78	NC_009475	TTC	2	6	4000	4005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240874
79	NC_009475	TGA	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240874
80	NC_009475	GC	3	6	4116	4121	0 %	0 %	50 %	50 %	148240874
81	NC_009475	AGC	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240874
82	NC_009475	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240874
83	NC_009475	TCG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240874
84	NC_009475	ATG	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240874
85	NC_009475	CG	3	6	4368	4373	0 %	0 %	50 %	50 %	148240874
86	NC_009475	CTC	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009475	CAG	2	6	4403	4408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009475	ACCGCG	2	12	4447	4458	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009475	GGC	2	6	4459	4464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009475	TCG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009475	CGA	2	6	4530	4535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009475	GCCGGA	2	12	4567	4578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148240875
93	NC_009475	CGG	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240875
94	NC_009475	GC	3	6	4601	4606	0 %	0 %	50 %	50 %	148240875
95	NC_009475	GGC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240875
96	NC_009475	GCC	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240875
97	NC_009475	CG	3	6	4719	4724	0 %	0 %	50 %	50 %	148240875
98	NC_009475	TTC	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240875
99	NC_009475	TCG	2	6	4845	4850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240876
100	NC_009475	CGC	2	6	4864	4869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
101	NC_009475	GGCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	50 %	25 %	148240876
102	NC_009475	CGA	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240876
103	NC_009475	CGGC	2	8	4987	4994	0 %	0 %	50 %	50 %	148240876
104	NC_009475	CGC	2	6	5041	5046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
105	NC_009475	CCG	2	6	5075	5080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
106	NC_009475	TGC	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009475	CG	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009475	CGG	2	6	5209	5214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009475	GTCG	2	8	5284	5291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009475	TGA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009475	TGC	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009475	GCC	2	6	5508	5513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009475	CGTC	2	8	5626	5633	0 %	25 %	25 %	50 %	148240877
114	NC_009475	TTC	2	6	5641	5646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240877
115	NC_009475	GCCG	2	8	5690	5697	0 %	0 %	50 %	50 %	148240877
116	NC_009475	CATTT	2	10	5703	5712	20 %	60 %	0 %	20 %	148240877
117	NC_009475	CTCAAC	2	12	5866	5877	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148240877
118	NC_009475	GCC	2	6	5962	5967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240877
119	NC_009475	AGA	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240877
120	NC_009475	TCGAAG	2	12	6059	6070	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148240877
121	NC_009475	CCAG	2	8	6122	6129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009475	CCG	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009475	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240878
124	NC_009475	GC	3	6	6207	6212	0 %	0 %	50 %	50 %	148240878
125	NC_009475	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240878
126	NC_009475	GAG	2	6	6310	6315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240878
127	NC_009475	CGT	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240879
128	NC_009475	TCC	2	6	6370	6375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240879
129	NC_009475	GGCG	2	8	6400	6407	0 %	0 %	75 %	25 %	148240879
130	NC_009475	CCTTGA	2	12	6486	6497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148240879
131	NC_009475	GCA	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240879
132	NC_009475	CGA	2	6	6570	6575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240879
133	NC_009475	TCCG	2	8	6766	6773	0 %	25 %	25 %	50 %	148240880
134	NC_009475	CCG	2	6	6949	6954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240880
135	NC_009475	TGCG	2	8	6960	6967	0 %	25 %	50 %	25 %	148240880
136	NC_009475	GCG	2	6	6976	6981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240880
137	NC_009475	CGGTTC	2	12	6991	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240880
138	NC_009475	GCG	2	6	7040	7045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240880
139	NC_009475	GATT	2	8	7138	7145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_009475	GGCT	2	8	11933	11940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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254	NC_009475	GA	3	6	12013	12018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009475	GATTGG	2	12	12071	12082	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148240886
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269	NC_009475	CGC	2	6	12619	12624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_009475	GGCCT	2	10	12633	12642	0 %	20 %	40 %	40 %	148240887
271	NC_009475	CCG	2	6	12651	12656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240887
272	NC_009475	GCC	2	6	12723	12728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240887
273	NC_009475	GCC	2	6	12733	12738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240887
274	NC_009475	GCA	2	6	12932	12937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240887
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277	NC_009475	CAT	2	6	13001	13006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240887
278	NC_009475	CGA	2	6	13115	13120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240887
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281	NC_009475	CGCGG	2	10	13299	13308	0 %	0 %	60 %	40 %	148240887
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283	NC_009475	GTGAG	2	10	13375	13384	20 %	20 %	60 %	0 %	148240887
284	NC_009475	GC	3	6	13494	13499	0 %	0 %	50 %	50 %	148240887
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290	NC_009475	GTTCGC	2	12	13756	13767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_009475	AAC	2	6	13849	13854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240888
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295	NC_009475	GTC	2	6	14064	14069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_009475	CTT	2	6	14153	14158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_009475	GGC	2	6	14159	14164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_009475	CGA	2	6	14170	14175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_009475	TCC	2	6	14221	14226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_009475	TGCG	2	8	14290	14297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
301	NC_009475	CAT	2	6	14299	14304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_009475	CTGC	2	8	14355	14362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
303	NC_009475	ACGT	2	8	14442	14449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
304	NC_009475	TCT	2	6	14518	14523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240889
305	NC_009475	CGT	2	6	14583	14588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240889
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327	NC_009475	CGA	2	6	15440	15445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
328	NC_009475	GTC	2	6	15477	15482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
329	NC_009475	CGA	2	6	15544	15549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
330	NC_009475	A	8	8	15594	15601	100 %	0 %	0 %	0 %	148240891
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372	NC_009475	GC	5	10	17726	17735	0 %	0 %	50 %	50 %	148240893
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376	NC_009475	CAG	2	6	18096	18101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_009475	G	6	6	18214	18219	0 %	0 %	100 %	0 %	148240894
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380	NC_009475	CAGC	2	8	18334	18341	25 %	0 %	25 %	50 %	148240894
381	NC_009475	TA	3	6	18371	18376	50 %	50 %	0 %	0 %	148240894
382	NC_009475	TGG	2	6	18440	18445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240894
383	NC_009475	CGG	2	6	18505	18510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240894
384	NC_009475	TTG	2	6	18755	18760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240895
385	NC_009475	AGC	2	6	18782	18787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240895
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398	NC_009475	CGG	2	6	19381	19386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240896
399	NC_009475	GTGACG	2	12	19410	19421	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148240896
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