MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40004	NC_009445	CGA	2	6	1535939	1535944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338517
40005	NC_009445	GC	3	6	1535952	1535957	0 %	0 %	50 %	50 %	146338517
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40116	NC_009445	A	7	7	1539784	1539790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40121	NC_009445	CAC	2	6	1539890	1539895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40122	NC_009445	GCT	2	6	1539901	1539906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40123	NC_009445	TTG	2	6	1539929	1539934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40124	NC_009445	CGC	2	6	1539950	1539955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40125	NC_009445	G	7	7	1539960	1539966	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40126	NC_009445	GAC	2	6	1539968	1539973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40127	NC_009445	GCG	2	6	1540011	1540016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338519
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40130	NC_009445	CTG	2	6	1540067	1540072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338519
40131	NC_009445	GGC	2	6	1540073	1540078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338519
40132	NC_009445	CTG	3	9	1540097	1540105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338519
40133	NC_009445	GGC	2	6	1540106	1540111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338519
40134	NC_009445	CCTGCT	2	12	1540123	1540134	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146338519
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40209	NC_009445	TGGAT	2	10	1541742	1541751	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40210	NC_009445	TTGC	2	8	1541776	1541783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40211	NC_009445	AGC	2	6	1541803	1541808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40212	NC_009445	GGC	3	9	1541811	1541819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40213	NC_009445	GCG	2	6	1541852	1541857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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40215	NC_009445	AAAC	2	8	1541901	1541908	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40216	NC_009445	GCC	2	6	1541922	1541927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40217	NC_009445	GCG	2	6	1541940	1541945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40218	NC_009445	CGG	2	6	1541960	1541965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40219	NC_009445	GAT	2	6	1541986	1541991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40220	NC_009445	TAT	2	6	1541998	1542003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40221	NC_009445	CAT	2	6	1542006	1542011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40222	NC_009445	AGC	2	6	1542068	1542073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40223	NC_009445	CGT	2	6	1542114	1542119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40224	NC_009445	GCG	2	6	1542140	1542145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338520
40225	NC_009445	TTG	2	6	1542293	1542298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146338520
40226	NC_009445	GCC	2	6	1542405	1542410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338520
40227	NC_009445	GCC	2	6	1542451	1542456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338520
40228	NC_009445	CGGCAT	2	12	1542487	1542498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40229	NC_009445	CGA	2	6	1542537	1542542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40230	NC_009445	GGC	2	6	1542544	1542549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338520
40231	NC_009445	GGC	2	6	1542554	1542559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338520
40232	NC_009445	GCA	2	6	1542579	1542584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40233	NC_009445	GGC	2	6	1542617	1542622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338520
40234	NC_009445	CGGCG	2	10	1542643	1542652	0 %	0 %	60 %	40 %	146338520
40235	NC_009445	ACAGCG	2	12	1542681	1542692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40236	NC_009445	TCG	2	6	1542702	1542707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40237	NC_009445	CGA	2	6	1542708	1542713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40238	NC_009445	CGG	2	6	1542727	1542732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338520
40239	NC_009445	TCG	2	6	1542752	1542757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40240	NC_009445	GC	3	6	1542828	1542833	0 %	0 %	50 %	50 %	146338520
40241	NC_009445	ACG	2	6	1542842	1542847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40242	NC_009445	AGC	2	6	1542933	1542938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40243	NC_009445	GC	3	6	1542937	1542942	0 %	0 %	50 %	50 %	146338520
40244	NC_009445	GCCTTC	2	12	1542968	1542979	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146338520
40245	NC_009445	GCG	2	6	1543010	1543015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338520
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40250	NC_009445	GTA	2	6	1543210	1543215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338520
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40253	NC_009445	CTG	2	6	1543345	1543350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338520
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40260	NC_009445	TCG	2	6	1543529	1543534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40261	NC_009445	CTT	2	6	1543585	1543590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338520
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40263	NC_009445	TGACGG	2	12	1543629	1543640	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146338520
40264	NC_009445	GTT	2	6	1543646	1543651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146338520
40265	NC_009445	TCT	2	6	1543653	1543658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338520
40266	NC_009445	GAG	2	6	1543693	1543698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146338520
40267	NC_009445	CGA	2	6	1543704	1543709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338520
40268	NC_009445	GCTTC	2	10	1543743	1543752	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40269	NC_009445	CAC	2	6	1543776	1543781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338521
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40276	NC_009445	AATG	2	8	1544032	1544039	50 %	25 %	25 %	0 %	146338521
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40284	NC_009445	CGACA	2	10	1544219	1544228	40 %	0 %	20 %	40 %	146338521
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40300	NC_009445	CGG	2	6	1544820	1544825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338522
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40302	NC_009445	TCG	2	6	1544846	1544851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338522
40303	NC_009445	CG	3	6	1544850	1544855	0 %	0 %	50 %	50 %	146338522
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40305	NC_009445	GC	3	6	1544895	1544900	0 %	0 %	50 %	50 %	146338522
40306	NC_009445	TCG	2	6	1544939	1544944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338522
40307	NC_009445	GCT	2	6	1544955	1544960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338522
40308	NC_009445	CGCT	2	8	1544993	1545000	0 %	25 %	25 %	50 %	146338522
40309	NC_009445	GCCTG	2	10	1545092	1545101	0 %	20 %	40 %	40 %	146338522
40310	NC_009445	CAG	2	6	1545112	1545117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338522
40311	NC_009445	CGA	2	6	1545246	1545251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338522
40312	NC_009445	CG	3	6	1545264	1545269	0 %	0 %	50 %	50 %	146338522
40313	NC_009445	GCC	2	6	1545283	1545288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338522
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40315	NC_009445	CG	4	8	1545420	1545427	0 %	0 %	50 %	50 %	146338522
40316	NC_009445	GCA	3	9	1545465	1545473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338522
40317	NC_009445	CGA	2	6	1545531	1545536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338522
40318	NC_009445	GCT	2	6	1545574	1545579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338522
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40322	NC_009445	GCA	2	6	1545732	1545737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338522
40323	NC_009445	CCA	2	6	1545774	1545779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40324	NC_009445	A	6	6	1545796	1545801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40325	NC_009445	TCC	2	6	1545807	1545812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40326	NC_009445	CGC	2	6	1545847	1545852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40327	NC_009445	TCGCT	2	10	1545872	1545881	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40328	NC_009445	GGA	2	6	1545891	1545896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40329	NC_009445	GCG	2	6	1545919	1545924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40330	NC_009445	AGG	2	6	1545925	1545930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40331	NC_009445	GC	3	6	1545948	1545953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40332	NC_009445	CGT	2	6	1546073	1546078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338523
40333	NC_009445	CGAAGC	2	12	1546088	1546099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338523
40334	NC_009445	GCC	2	6	1546126	1546131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338523
40335	NC_009445	AGG	2	6	1546136	1546141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146338523
40336	NC_009445	CGG	2	6	1546145	1546150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338523
40337	NC_009445	CTTC	2	8	1546214	1546221	0 %	50 %	0 %	50 %	146338523
40338	NC_009445	CGGC	2	8	1546296	1546303	0 %	0 %	50 %	50 %	146338523
40339	NC_009445	ACG	2	6	1546309	1546314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338523
40340	NC_009445	CTC	2	6	1546434	1546439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146338523
40341	NC_009445	CGGC	2	8	1546454	1546461	0 %	0 %	50 %	50 %	146338523
40342	NC_009445	GAA	2	6	1546476	1546481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146338523
40343	NC_009445	CGT	2	6	1546488	1546493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338523
40344	NC_009445	TCA	2	6	1546502	1546507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338523
40345	NC_009445	CTT	2	6	1546539	1546544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338523
40346	NC_009445	CGA	2	6	1546559	1546564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338523
40347	NC_009445	GA	3	6	1546573	1546578	50 %	0 %	50 %	0 %	146338523
40348	NC_009445	GTG	2	6	1546612	1546617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146338523
40349	NC_009445	CAG	2	6	1546623	1546628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338523
40350	NC_009445	ATC	2	6	1546630	1546635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338523
40351	NC_009445	TCT	2	6	1546667	1546672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338523
40352	NC_009445	GAC	2	6	1546680	1546685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338523
40353	NC_009445	CGT	2	6	1546725	1546730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338523
40354	NC_009445	CGC	2	6	1546781	1546786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338523
40355	NC_009445	GCA	2	6	1546835	1546840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338523
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40462	NC_009445	GC	4	8	1550926	1550933	0 %	0 %	50 %	50 %	146338527
40463	NC_009445	GCCGGG	2	12	1550980	1550991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338527
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40469	NC_009445	GCG	2	6	1551234	1551239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338527
40470	NC_009445	GCC	2	6	1551298	1551303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338527
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40473	NC_009445	ATG	2	6	1551350	1551355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338527
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