MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34003	NC_009445	GTC	2	6	1296917	1296922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34004	NC_009445	CGGC	2	8	1296958	1296965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34005	NC_009445	GA	3	6	1297010	1297015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_009445	CCT	2	6	1297027	1297032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146338316
34007	NC_009445	GTT	2	6	1297121	1297126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146338316
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34009	NC_009445	CGG	2	6	1297240	1297245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338316
34010	NC_009445	GC	3	6	1297270	1297275	0 %	0 %	50 %	50 %	146338316
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34017	NC_009445	TCC	2	6	1297440	1297445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146338316
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34043	NC_009445	CGG	2	6	1298350	1298355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338316
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34049	NC_009445	GC	3	6	1298505	1298510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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34113	NC_009445	GATC	2	8	1301391	1301398	25 %	25 %	25 %	25 %	146338318
34114	NC_009445	CAT	2	6	1301436	1301441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338318
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34117	NC_009445	GGA	2	6	1301514	1301519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146338318
34118	NC_009445	GGC	2	6	1301549	1301554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338319
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34202	NC_009445	GATCTT	2	12	1304923	1304934	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	146338321
34203	NC_009445	AGC	2	6	1304942	1304947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338321
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34212	NC_009445	GCGG	2	8	1305279	1305286	0 %	0 %	75 %	25 %	146338322
34213	NC_009445	ACG	2	6	1305386	1305391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338322
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34217	NC_009445	GTA	2	6	1305511	1305516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338322
34218	NC_009445	AGCGC	2	10	1305528	1305537	20 %	0 %	40 %	40 %	146338322
34219	NC_009445	CG	3	6	1305564	1305569	0 %	0 %	50 %	50 %	146338322
34220	NC_009445	GAC	2	6	1305601	1305606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338322
34221	NC_009445	ATC	2	6	1305617	1305622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338322
34222	NC_009445	GCC	2	6	1305625	1305630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338322
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34224	NC_009445	GCC	2	6	1305718	1305723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338322
34225	NC_009445	GC	3	6	1305729	1305734	0 %	0 %	50 %	50 %	146338322
34226	NC_009445	TGT	2	6	1305756	1305761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146338322
34227	NC_009445	GGT	2	6	1305871	1305876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146338322
34228	NC_009445	TCG	2	6	1305884	1305889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338322
34229	NC_009445	TCT	3	9	1305897	1305905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338322
34230	NC_009445	CTTG	2	8	1305942	1305949	0 %	50 %	25 %	25 %	146338322
34231	NC_009445	GCG	2	6	1305978	1305983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338322
34232	NC_009445	GTC	2	6	1306018	1306023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338322
34233	NC_009445	GCA	2	6	1306025	1306030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338322
34234	NC_009445	CAT	2	6	1306045	1306050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338322
34235	NC_009445	GCG	2	6	1306081	1306086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338322
34236	NC_009445	TTGT	2	8	1306160	1306167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34237	NC_009445	CAA	2	6	1306172	1306177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34238	NC_009445	CT	3	6	1306238	1306243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34239	NC_009445	CGT	2	6	1306247	1306252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34240	NC_009445	TCG	3	9	1306280	1306288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34241	NC_009445	GC	4	8	1306364	1306371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34242	NC_009445	CGG	2	6	1306415	1306420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34243	NC_009445	TCAGC	2	10	1306440	1306449	20 %	20 %	20 %	40 %	146338323
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34246	NC_009445	GCCG	2	8	1306536	1306543	0 %	0 %	50 %	50 %	146338323
34247	NC_009445	TCG	2	6	1306552	1306557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338323
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34250	NC_009445	TCG	2	6	1306765	1306770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34254	NC_009445	GTCG	2	8	1307044	1307051	0 %	25 %	50 %	25 %	146338324
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34257	NC_009445	CGG	3	9	1307192	1307200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338324
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34261	NC_009445	TGC	2	6	1307269	1307274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338324
34262	NC_009445	GAT	2	6	1307324	1307329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338324
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34264	NC_009445	GCA	2	6	1307396	1307401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338324
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34346	NC_009445	ATCT	2	8	1310383	1310390	25 %	50 %	0 %	25 %	146338327
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34350	NC_009445	ATC	2	6	1310482	1310487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338327
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34455	NC_009445	GGA	2	6	1314349	1314354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34463	NC_009445	CGTTG	2	10	1314824	1314833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34464	NC_009445	GTT	2	6	1314866	1314871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34465	NC_009445	ATGC	2	8	1314954	1314961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34466	NC_009445	GC	4	8	1315025	1315032	0 %	0 %	50 %	50 %	146338330
34467	NC_009445	CGC	2	6	1315085	1315090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338330
34468	NC_009445	TTC	2	6	1315119	1315124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338330
34469	NC_009445	TCG	2	6	1315155	1315160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338330
34470	NC_009445	CTCG	2	8	1315196	1315203	0 %	25 %	25 %	50 %	146338330
34471	NC_009445	CCA	2	6	1315369	1315374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338330
34472	NC_009445	GCT	2	6	1315376	1315381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338330
34473	NC_009445	CGG	2	6	1315387	1315392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338330
34474	NC_009445	CG	3	6	1315434	1315439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34475	NC_009445	CTGT	2	8	1315661	1315668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34476	NC_009445	AGG	2	6	1315674	1315679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34477	NC_009445	GGT	2	6	1315682	1315687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34478	NC_009445	CCCA	2	8	1315693	1315700	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34479	NC_009445	GCTA	2	8	1315755	1315762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34480	NC_009445	GGC	2	6	1315797	1315802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34481	NC_009445	A	6	6	1315815	1315820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34482	NC_009445	GGC	2	6	1315861	1315866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34483	NC_009445	TGC	2	6	1316064	1316069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34484	NC_009445	TGA	2	6	1316162	1316167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34485	NC_009445	AG	3	6	1316232	1316237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34486	NC_009445	CG	3	6	1316269	1316274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34487	NC_009445	GGCGT	2	10	1316281	1316290	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34488	NC_009445	CGG	2	6	1316296	1316301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34489	NC_009445	AGCCG	2	10	1316374	1316383	20 %	0 %	40 %	40 %	146338331
34490	NC_009445	CGGC	2	8	1316421	1316428	0 %	0 %	50 %	50 %	146338331
34491	NC_009445	GGAT	2	8	1316431	1316438	25 %	25 %	50 %	0 %	146338331
34492	NC_009445	CGGCG	2	10	1316578	1316587	0 %	0 %	60 %	40 %	146338331
34493	NC_009445	GC	4	8	1316623	1316630	0 %	0 %	50 %	50 %	146338331
34494	NC_009445	ACC	2	6	1316648	1316653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338331
34495	NC_009445	GCC	2	6	1316655	1316660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338331
34496	NC_009445	TTC	2	6	1316679	1316684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338331
34497	NC_009445	CGT	2	6	1316701	1316706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338331
34498	NC_009445	CCT	2	6	1316725	1316730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146338331
34499	NC_009445	CT	3	6	1316756	1316761	0 %	50 %	0 %	50 %	146338331
34500	NC_009445	GCT	2	6	1316771	1316776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338331

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