MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_009445	TCGCC	2	10	1144135	1144144	0 %	20 %	20 %	60 %	146338178
30003	NC_009445	CGC	2	6	1144264	1144269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338178
30004	NC_009445	ACG	2	6	1144333	1144338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338178
30005	NC_009445	TGC	2	6	1144339	1144344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338178
30006	NC_009445	CGC	2	6	1144388	1144393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338178
30007	NC_009445	CGA	2	6	1144415	1144420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338178
30008	NC_009445	GGC	2	6	1144421	1144426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338178
30009	NC_009445	TCGA	2	8	1144449	1144456	25 %	25 %	25 %	25 %	146338178
30010	NC_009445	CGG	2	6	1144457	1144462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338178
30011	NC_009445	AAC	2	6	1144477	1144482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146338178
30012	NC_009445	TC	3	6	1144483	1144488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30013	NC_009445	CAC	2	6	1144715	1144720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338179
30014	NC_009445	GCC	2	6	1144737	1144742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338179
30015	NC_009445	CAC	2	6	1144748	1144753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338179
30016	NC_009445	ACC	2	6	1144836	1144841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338179
30017	NC_009445	GCT	2	6	1144856	1144861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338179
30018	NC_009445	GC	3	6	1144867	1144872	0 %	0 %	50 %	50 %	146338179
30019	NC_009445	TCG	2	6	1144921	1144926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338179
30020	NC_009445	CGC	2	6	1144966	1144971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30021	NC_009445	GCC	3	9	1144982	1144990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30022	NC_009445	GCG	2	6	1144998	1145003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338180
30023	NC_009445	CG	3	6	1145002	1145007	0 %	0 %	50 %	50 %	146338180
30024	NC_009445	GAC	3	9	1145020	1145028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338180
30025	NC_009445	CGG	2	6	1145043	1145048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338180
30026	NC_009445	CGA	2	6	1145127	1145132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338180
30027	NC_009445	AT	3	6	1145146	1145151	50 %	50 %	0 %	0 %	146338180
30028	NC_009445	TTG	2	6	1145191	1145196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146338180
30029	NC_009445	AGAT	2	8	1145206	1145213	50 %	25 %	25 %	0 %	146338180
30030	NC_009445	CG	3	6	1145214	1145219	0 %	0 %	50 %	50 %	146338180
30031	NC_009445	ACC	2	6	1145241	1145246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338180
30032	NC_009445	CGG	2	6	1145288	1145293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338180
30033	NC_009445	CCT	2	6	1145357	1145362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146338180
30034	NC_009445	GTA	2	6	1145409	1145414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338180
30035	NC_009445	CGA	3	9	1145435	1145443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338180
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30037	NC_009445	CG	3	6	1145546	1145551	0 %	0 %	50 %	50 %	146338180
30038	NC_009445	CAA	3	9	1145604	1145612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146338180
30039	NC_009445	CAGC	2	8	1145618	1145625	25 %	0 %	25 %	50 %	146338180
30040	NC_009445	CG	3	6	1145667	1145672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30041	NC_009445	TCG	2	6	1145736	1145741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30042	NC_009445	GGA	2	6	1145787	1145792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30043	NC_009445	GCT	2	6	1145869	1145874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338181
30044	NC_009445	CCG	2	6	1145943	1145948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338181
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30046	NC_009445	CGC	3	9	1145993	1146001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338181
30047	NC_009445	GC	3	6	1146018	1146023	0 %	0 %	50 %	50 %	146338181
30048	NC_009445	CG	3	6	1146068	1146073	0 %	0 %	50 %	50 %	146338181
30049	NC_009445	ATG	2	6	1146102	1146107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338181
30050	NC_009445	GC	3	6	1146127	1146132	0 %	0 %	50 %	50 %	146338181
30051	NC_009445	AGC	2	6	1146144	1146149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338181
30052	NC_009445	AGC	2	6	1146165	1146170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338181
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30054	NC_009445	CTG	2	6	1146374	1146379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338181
30055	NC_009445	CAGCAC	2	12	1146380	1146391	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146338181
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30062	NC_009445	GAT	2	6	1146644	1146649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338181
30063	NC_009445	GC	3	6	1146689	1146694	0 %	0 %	50 %	50 %	146338181
30064	NC_009445	GTC	2	6	1146770	1146775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338181
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30102	NC_009445	CGAG	2	8	1148079	1148086	25 %	0 %	50 %	25 %	146338182
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30105	NC_009445	TTGA	2	8	1148224	1148231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30106	NC_009445	CGC	2	6	1148316	1148321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338183
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30112	NC_009445	CCGG	3	12	1148477	1148488	0 %	0 %	50 %	50 %	146338183
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30116	NC_009445	ACT	2	6	1148635	1148640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338183
30117	NC_009445	GAC	3	9	1148684	1148692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338183
30118	NC_009445	GC	3	6	1148768	1148773	0 %	0 %	50 %	50 %	146338183
30119	NC_009445	GAG	3	9	1148784	1148792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146338183
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30123	NC_009445	TCG	2	6	1149170	1149175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30124	NC_009445	TC	3	6	1149178	1149183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30125	NC_009445	CTG	2	6	1149239	1149244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338184
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30131	NC_009445	TCT	3	9	1149547	1149555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338184
30132	NC_009445	TCG	2	6	1149558	1149563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338184
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30135	NC_009445	ATC	2	6	1149623	1149628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338184
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30145	NC_009445	GCC	2	6	1149902	1149907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338184
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30147	NC_009445	GCT	3	9	1149949	1149957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338184
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30150	NC_009445	CGA	2	6	1150075	1150080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338184
30151	NC_009445	GATGGC	2	12	1150100	1150111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146338184
30152	NC_009445	TCG	2	6	1150135	1150140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30153	NC_009445	CGG	2	6	1150141	1150146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30154	NC_009445	CG	3	6	1150218	1150223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30155	NC_009445	TGA	2	6	1150302	1150307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338185
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30181	NC_009445	CTACG	2	10	1151125	1151134	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30182	NC_009445	CTCA	2	8	1151179	1151186	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30183	NC_009445	ATC	2	6	1151207	1151212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30188	NC_009445	CTG	2	6	1151568	1151573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338186
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30202	NC_009445	ATC	2	6	1152369	1152374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338186
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30206	NC_009445	CACG	2	8	1152484	1152491	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30207	NC_009445	AAAC	2	8	1152495	1152502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30208	NC_009445	CGG	2	6	1152565	1152570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338187
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30218	NC_009445	ATC	2	6	1152920	1152925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338187
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30221	NC_009445	CGA	2	6	1152951	1152956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338187
30222	NC_009445	GAC	2	6	1153093	1153098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338187
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30225	NC_009445	CAT	2	6	1153213	1153218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338187
30226	NC_009445	TCG	2	6	1153260	1153265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30227	NC_009445	CGC	2	6	1153273	1153278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30228	NC_009445	GGC	2	6	1153328	1153333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30229	NC_009445	GGC	2	6	1153389	1153394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338188
30230	NC_009445	CG	5	10	1153437	1153446	0 %	0 %	50 %	50 %	146338188
30231	NC_009445	CGT	2	6	1153457	1153462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338188
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30233	NC_009445	CGC	2	6	1153490	1153495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338188
30234	NC_009445	GCA	3	9	1153543	1153551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338188
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30337	NC_009445	CATT	2	8	1157359	1157366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30338	NC_009445	TCG	2	6	1157482	1157487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338191
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30342	NC_009445	CGACG	2	10	1157609	1157618	20 %	0 %	40 %	40 %	146338191
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30348	NC_009445	CG	4	8	1157738	1157745	0 %	0 %	50 %	50 %	146338191
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30457	NC_009445	TTA	2	6	1162295	1162300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30458	NC_009445	T	7	7	1162387	1162393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30459	NC_009445	CAC	2	6	1162403	1162408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30460	NC_009445	ATGA	2	8	1162419	1162426	50 %	25 %	25 %	0 %	146338195
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30469	NC_009445	ACG	2	6	1162868	1162873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338195
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30498	NC_009445	CGAG	2	8	1164026	1164033	25 %	0 %	50 %	25 %	146338195
30499	NC_009445	GC	3	6	1164048	1164053	0 %	0 %	50 %	50 %	146338195
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