MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_009445	CGG	2	6	958304	958309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338007
25003	NC_009445	TGC	2	6	958318	958323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338007
25004	NC_009445	ACC	2	6	958333	958338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338007
25005	NC_009445	CGA	2	6	958471	958476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338007
25006	NC_009445	GAC	2	6	958494	958499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338007
25007	NC_009445	CGG	2	6	958514	958519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338007
25008	NC_009445	GGC	2	6	958542	958547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338007
25009	NC_009445	CGATCT	2	12	958595	958606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146338007
25010	NC_009445	GATC	2	8	958625	958632	25 %	25 %	25 %	25 %	146338007
25011	NC_009445	TCG	2	6	958660	958665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338007
25012	NC_009445	CAA	2	6	958682	958687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146338007
25013	NC_009445	TCA	2	6	958702	958707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338007
25014	NC_009445	ACG	2	6	958771	958776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338007
25015	NC_009445	GCA	2	6	958803	958808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25016	NC_009445	CGCCGG	2	12	958870	958881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25017	NC_009445	GGT	2	6	958925	958930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146338008
25018	NC_009445	CG	3	6	958932	958937	0 %	0 %	50 %	50 %	146338008
25019	NC_009445	CG	5	10	958950	958959	0 %	0 %	50 %	50 %	146338008
25020	NC_009445	TGT	2	6	958967	958972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146338008
25021	NC_009445	TCG	2	6	958976	958981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338008
25022	NC_009445	TCG	2	6	959096	959101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338008
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25028	NC_009445	GTT	2	6	959310	959315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146338008
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25032	NC_009445	GCT	2	6	959481	959486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338008
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25072	NC_009445	GC	3	6	961224	961229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25073	NC_009445	GAC	2	6	961267	961272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25103	NC_009445	GCTG	2	8	962428	962435	0 %	25 %	50 %	25 %	146338009
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25117	NC_009445	TGC	2	6	963314	963319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25118	NC_009445	CGG	2	6	963335	963340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338010
25119	NC_009445	ACG	2	6	963410	963415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25120	NC_009445	GTC	2	6	963435	963440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25121	NC_009445	CGT	2	6	963456	963461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25122	NC_009445	ATG	2	6	963548	963553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338010
25123	NC_009445	GC	3	6	963554	963559	0 %	0 %	50 %	50 %	146338010
25124	NC_009445	GTG	2	6	963577	963582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146338010
25125	NC_009445	CGC	2	6	963614	963619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338010
25126	NC_009445	GC	3	6	963676	963681	0 %	0 %	50 %	50 %	146338010
25127	NC_009445	CGA	2	6	963687	963692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25128	NC_009445	GCG	2	6	963841	963846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338010
25129	NC_009445	CGC	2	6	963896	963901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338010
25130	NC_009445	GC	3	6	963946	963951	0 %	0 %	50 %	50 %	146338010
25131	NC_009445	GAT	2	6	963969	963974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338010
25132	NC_009445	CTG	2	6	963976	963981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25133	NC_009445	GC	3	6	964000	964005	0 %	0 %	50 %	50 %	146338010
25134	NC_009445	CTG	2	6	964015	964020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25135	NC_009445	GGCGCC	2	12	964044	964055	0 %	0 %	50 %	50 %	146338010
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25138	NC_009445	CG	3	6	964136	964141	0 %	0 %	50 %	50 %	146338010
25139	NC_009445	GCC	2	6	964180	964185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338010
25140	NC_009445	ATCG	2	8	964195	964202	25 %	25 %	25 %	25 %	146338010
25141	NC_009445	CTG	2	6	964222	964227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25142	NC_009445	GCC	2	6	964315	964320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338010
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25145	NC_009445	GCA	2	6	964437	964442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25146	NC_009445	CCA	2	6	964553	964558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338010
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25148	NC_009445	TTC	2	6	964585	964590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146338010
25149	NC_009445	GTC	2	6	964611	964616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25150	NC_009445	GCC	2	6	964623	964628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338010
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25154	NC_009445	CCG	2	6	964706	964711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338010
25155	NC_009445	CGC	2	6	964758	964763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338010
25156	NC_009445	ACG	2	6	964781	964786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338010
25157	NC_009445	CG	4	8	964793	964800	0 %	0 %	50 %	50 %	146338010
25158	NC_009445	GTG	2	6	964822	964827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146338010
25159	NC_009445	TCC	2	6	964886	964891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25160	NC_009445	TCG	2	6	964894	964899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25161	NC_009445	CCAT	2	8	964921	964928	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25162	NC_009445	GGA	2	6	964940	964945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25163	NC_009445	GAC	2	6	964979	964984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25164	NC_009445	CT	3	6	965012	965017	0 %	50 %	0 %	50 %	146338011
25165	NC_009445	TGC	2	6	965020	965025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338011
25166	NC_009445	ATC	3	9	965051	965059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338011
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25172	NC_009445	GC	3	6	965284	965289	0 %	0 %	50 %	50 %	146338011
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25177	NC_009445	CGATCG	2	12	965409	965420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146338011
25178	NC_009445	TCA	2	6	965463	965468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338011
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25181	NC_009445	GTCC	2	8	965511	965518	0 %	25 %	25 %	50 %	146338011
25182	NC_009445	CAC	2	6	965578	965583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146338011
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25184	NC_009445	TCG	2	6	965655	965660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338011
25185	NC_009445	TGCG	2	8	965667	965674	0 %	25 %	50 %	25 %	146338011
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25189	NC_009445	GCT	2	6	965857	965862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338011
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25192	NC_009445	GCCG	2	8	966015	966022	0 %	0 %	50 %	50 %	146338012
25193	NC_009445	GC	3	6	966028	966033	0 %	0 %	50 %	50 %	146338012
25194	NC_009445	CTG	3	9	966100	966108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338012
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25200	NC_009445	TCG	2	6	966332	966337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338012
25201	NC_009445	CGG	2	6	966348	966353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338012
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25203	NC_009445	GCGATC	2	12	966418	966429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146338012
25204	NC_009445	GC	3	6	966434	966439	0 %	0 %	50 %	50 %	146338012
25205	NC_009445	TCG	2	6	966545	966550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338012
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25209	NC_009445	TGC	2	6	966669	966674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338012
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25212	NC_009445	TGA	2	6	966791	966796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146338012
25213	NC_009445	CTG	2	6	966823	966828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338012
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25215	NC_009445	ATCGC	2	10	966942	966951	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25216	NC_009445	GTCT	2	8	966973	966980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25217	NC_009445	GCA	3	9	967056	967064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25218	NC_009445	CGG	2	6	967126	967131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338013
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25221	NC_009445	GC	4	8	967200	967207	0 %	0 %	50 %	50 %	146338013
25222	NC_009445	GCGG	2	8	967216	967223	0 %	0 %	75 %	25 %	146338013
25223	NC_009445	TCG	2	6	967269	967274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338013
25224	NC_009445	CGA	2	6	967296	967301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338013
25225	NC_009445	ATC	2	6	967346	967351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338013
25226	NC_009445	GACG	2	8	967355	967362	25 %	0 %	50 %	25 %	146338013
25227	NC_009445	CTCA	2	8	967435	967442	25 %	25 %	0 %	50 %	146338013
25228	NC_009445	GAG	2	6	967460	967465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146338013
25229	NC_009445	GGCGC	2	10	967505	967514	0 %	0 %	60 %	40 %	146338013
25230	NC_009445	GC	3	6	967523	967528	0 %	0 %	50 %	50 %	146338013
25231	NC_009445	GCT	2	6	967531	967536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338013
25232	NC_009445	CGG	2	6	967594	967599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338013
25233	NC_009445	CAGCGC	2	12	967601	967612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146338013
25234	NC_009445	TCGC	2	8	967620	967627	0 %	25 %	25 %	50 %	146338013
25235	NC_009445	GC	3	6	967626	967631	0 %	0 %	50 %	50 %	146338013
25236	NC_009445	CGC	2	6	967641	967646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146338013
25237	NC_009445	CGA	2	6	967660	967665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338013
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25239	NC_009445	TCA	2	6	967776	967781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146338013
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25241	NC_009445	TGCT	2	8	967887	967894	0 %	50 %	25 %	25 %	146338013
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25286	NC_009445	GC	4	8	969826	969833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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25479	NC_009445	CCAG	2	8	976026	976033	25 %	0 %	25 %	50 %	146338021
25480	NC_009445	CAG	2	6	976054	976059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338021
25481	NC_009445	GC	3	6	976113	976118	0 %	0 %	50 %	50 %	146338021
25482	NC_009445	CAG	2	6	976156	976161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146338021
25483	NC_009445	CGG	2	6	976179	976184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146338021
25484	NC_009445	CGT	3	9	976243	976251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146338021
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