MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009445	TGC	2	6	573258	573263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15002	NC_009445	TCA	2	6	573270	573275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337690
15003	NC_009445	GGC	2	6	573277	573282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337690
15004	NC_009445	CTG	2	6	573314	573319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15005	NC_009445	CGG	2	6	573334	573339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337690
15006	NC_009445	CGC	2	6	573340	573345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337690
15007	NC_009445	CTG	3	9	573389	573397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15008	NC_009445	CTG	2	6	573401	573406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15009	NC_009445	CTT	2	6	573418	573423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337690
15010	NC_009445	CGG	2	6	573424	573429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337690
15011	NC_009445	GC	3	6	573448	573453	0 %	0 %	50 %	50 %	146337690
15012	NC_009445	CG	3	6	573458	573463	0 %	0 %	50 %	50 %	146337690
15013	NC_009445	GTC	2	6	573464	573469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15014	NC_009445	TCCCG	2	10	573481	573490	0 %	20 %	20 %	60 %	146337690
15015	NC_009445	GCC	2	6	573529	573534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337690
15016	NC_009445	GAG	2	6	573539	573544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337690
15017	NC_009445	CCGG	2	8	573545	573552	0 %	0 %	50 %	50 %	146337690
15018	NC_009445	GGC	2	6	573598	573603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337690
15019	NC_009445	TCG	2	6	573612	573617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15020	NC_009445	TGCCG	2	10	573631	573640	0 %	20 %	40 %	40 %	146337690
15021	NC_009445	TGC	2	6	573666	573671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15022	NC_009445	CTC	2	6	573687	573692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337690
15023	NC_009445	TGCC	2	8	573693	573700	0 %	25 %	25 %	50 %	146337690
15024	NC_009445	GAC	2	6	573709	573714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15025	NC_009445	GGAT	2	8	573716	573723	25 %	25 %	50 %	0 %	146337690
15026	NC_009445	AGG	2	6	573735	573740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337690
15027	NC_009445	CCCGAG	2	12	573764	573775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337690
15028	NC_009445	TCC	2	6	573790	573795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337690
15029	NC_009445	GGCG	2	8	573858	573865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15030	NC_009445	GAT	2	6	573873	573878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337691
15031	NC_009445	CG	4	8	573897	573904	0 %	0 %	50 %	50 %	146337691
15032	NC_009445	CGC	2	6	573921	573926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337691
15033	NC_009445	GCC	2	6	573949	573954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337691
15034	NC_009445	GC	3	6	573955	573960	0 %	0 %	50 %	50 %	146337691
15035	NC_009445	CG	3	6	574030	574035	0 %	0 %	50 %	50 %	146337691
15036	NC_009445	GCA	2	6	574076	574081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337691
15037	NC_009445	G	6	6	574094	574099	0 %	0 %	100 %	0 %	146337691
15038	NC_009445	CTGATC	2	12	574122	574133	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146337691
15039	NC_009445	CAC	2	6	574151	574156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15040	NC_009445	GC	3	6	574162	574167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15041	NC_009445	TGCCG	2	10	574221	574230	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15042	NC_009445	ACGC	2	8	574276	574283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15043	NC_009445	TCCGCT	2	12	574339	574350	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15044	NC_009445	GC	4	8	574351	574358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15045	NC_009445	GGC	2	6	574367	574372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_009445	GAT	2	6	574452	574457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337692
15047	NC_009445	CCTC	2	8	574463	574470	0 %	25 %	0 %	75 %	146337692
15048	NC_009445	GCC	2	6	574477	574482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337692
15049	NC_009445	GCGA	2	8	574498	574505	25 %	0 %	50 %	25 %	146337692
15050	NC_009445	GCC	2	6	574654	574659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337692
15051	NC_009445	GC	3	6	574703	574708	0 %	0 %	50 %	50 %	146337692
15052	NC_009445	GAG	2	6	574723	574728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337692
15053	NC_009445	GGC	2	6	574757	574762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337692
15054	NC_009445	AAC	2	6	574792	574797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337692
15055	NC_009445	CG	4	8	574806	574813	0 %	0 %	50 %	50 %	146337692
15056	NC_009445	AGC	2	6	574817	574822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15057	NC_009445	CCT	2	6	574875	574880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337692
15058	NC_009445	ATC	2	6	574955	574960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337692
15059	NC_009445	ACG	2	6	574973	574978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15060	NC_009445	GTG	2	6	575005	575010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337692
15061	NC_009445	GCG	3	9	575045	575053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337692
15062	NC_009445	CAA	2	6	575076	575081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337692
15063	NC_009445	GAC	2	6	575113	575118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15064	NC_009445	CGC	2	6	575145	575150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337692
15065	NC_009445	CGA	2	6	575157	575162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15066	NC_009445	CGA	2	6	575201	575206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15067	NC_009445	CGGT	2	8	575236	575243	0 %	25 %	50 %	25 %	146337692
15068	NC_009445	GAG	2	6	575245	575250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337692
15069	NC_009445	GTTC	2	8	575303	575310	0 %	50 %	25 %	25 %	146337692
15070	NC_009445	GGC	2	6	575318	575323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337692
15071	NC_009445	CGA	2	6	575370	575375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15072	NC_009445	GGT	2	6	575424	575429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337692
15073	NC_009445	ACG	2	6	575446	575451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15074	NC_009445	GAC	2	6	575485	575490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15075	NC_009445	CTG	2	6	575500	575505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15076	NC_009445	CGT	2	6	575514	575519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15077	NC_009445	TCG	2	6	575552	575557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15078	NC_009445	ATC	2	6	575558	575563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337692
15079	NC_009445	ACC	2	6	575638	575643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337692
15080	NC_009445	TGG	2	6	575656	575661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337692
15081	NC_009445	TCGA	2	8	575665	575672	25 %	25 %	25 %	25 %	146337692
15082	NC_009445	GAT	2	6	575676	575681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337692
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15084	NC_009445	TCG	2	6	575714	575719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15085	NC_009445	CGA	2	6	575751	575756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15086	NC_009445	CGA	2	6	575808	575813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15087	NC_009445	CGA	2	6	575913	575918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15088	NC_009445	TGG	2	6	575939	575944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337692
15089	NC_009445	GAT	2	6	575992	575997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337692
15090	NC_009445	GTCG	2	8	576000	576007	0 %	25 %	50 %	25 %	146337692
15091	NC_009445	GCT	2	6	576009	576014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337692
15092	NC_009445	GCCTC	2	10	576056	576065	0 %	20 %	20 %	60 %	146337692
15093	NC_009445	CGG	2	6	576107	576112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337692
15094	NC_009445	GAGCT	2	10	576114	576123	20 %	20 %	40 %	20 %	146337692
15095	NC_009445	GCC	2	6	576124	576129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15096	NC_009445	CTG	2	6	576161	576166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337693
15097	NC_009445	CTT	2	6	576173	576178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337693
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15099	NC_009445	TCG	2	6	576234	576239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337693
15100	NC_009445	TGT	2	6	576241	576246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337693
15101	NC_009445	GCG	3	9	576255	576263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337693
15102	NC_009445	GCC	2	6	576273	576278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337693
15103	NC_009445	TCC	2	6	576282	576287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337693
15104	NC_009445	CG	3	6	576291	576296	0 %	0 %	50 %	50 %	146337693
15105	NC_009445	CTG	2	6	576329	576334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337693
15106	NC_009445	GCG	2	6	576350	576355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337693
15107	NC_009445	CTC	2	6	576362	576367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337693
15108	NC_009445	GCG	2	6	576370	576375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337693
15109	NC_009445	TCGA	2	8	576444	576451	25 %	25 %	25 %	25 %	146337693
15110	NC_009445	ACC	2	6	576471	576476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337693
15111	NC_009445	GTC	2	6	576522	576527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337693
15112	NC_009445	GCA	2	6	576529	576534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337693
15113	NC_009445	GGCC	2	8	576541	576548	0 %	0 %	50 %	50 %	146337693
15114	NC_009445	GAT	2	6	576566	576571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337693
15115	NC_009445	GTC	2	6	576596	576601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337693
15116	NC_009445	TCC	2	6	576630	576635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337693
15117	NC_009445	GCC	2	6	576700	576705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337693
15118	NC_009445	GTG	2	6	576726	576731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337693
15119	NC_009445	CA	3	6	576758	576763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15120	NC_009445	GCAAT	2	10	576816	576825	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15121	NC_009445	CGAG	2	8	576840	576847	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15122	NC_009445	CAG	2	6	576883	576888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_009445	TGC	2	6	576945	576950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_009445	ACG	2	6	576973	576978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15125	NC_009445	CGGC	2	8	577031	577038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15126	NC_009445	TTTCA	2	10	577063	577072	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15127	NC_009445	TCAAGA	2	12	577108	577119	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15128	NC_009445	GTC	2	6	577148	577153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337694
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15131	NC_009445	TCA	2	6	577290	577295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337694
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15137	NC_009445	GCTC	2	8	577539	577546	0 %	25 %	25 %	50 %	146337694
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15145	NC_009445	CGGC	2	8	577860	577867	0 %	0 %	50 %	50 %	146337694
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15159	NC_009445	TGC	2	6	578489	578494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15161	NC_009445	GTC	2	6	578548	578553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15164	NC_009445	CG	3	6	578616	578621	0 %	0 %	50 %	50 %	146337695
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15169	NC_009445	CAA	2	6	578824	578829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337695
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15239	NC_009445	CAT	2	6	581369	581374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337697
15240	NC_009445	CG	3	6	581447	581452	0 %	0 %	50 %	50 %	146337697
15241	NC_009445	CGG	2	6	581507	581512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337697
15242	NC_009445	CGA	2	6	581513	581518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337697
15243	NC_009445	CCGA	2	8	581544	581551	25 %	0 %	25 %	50 %	146337697
15244	NC_009445	CGA	3	9	581549	581557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337697
15245	NC_009445	CTCG	2	8	581564	581571	0 %	25 %	25 %	50 %	146337697
15246	NC_009445	CGG	2	6	581674	581679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337697
15247	NC_009445	CG	5	10	581730	581739	0 %	0 %	50 %	50 %	146337697
15248	NC_009445	ATC	2	6	581748	581753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337697
15249	NC_009445	CCGCAG	2	12	581780	581791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337697
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15251	NC_009445	CAC	2	6	581879	581884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337697
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15253	NC_009445	CGG	2	6	581953	581958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337697
15254	NC_009445	CTG	2	6	581997	582002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337697
15255	NC_009445	GGC	2	6	582014	582019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337697
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15273	NC_009445	CGG	2	6	582690	582695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337698
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15277	NC_009445	CGT	3	9	582760	582768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337698
15278	NC_009445	CCCTCG	2	12	582776	582787	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	146337698
15279	NC_009445	GCG	2	6	582807	582812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337698
15280	NC_009445	TAG	2	6	582821	582826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337698
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15286	NC_009445	GAT	2	6	582994	582999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15287	NC_009445	CGG	2	6	583002	583007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15288	NC_009445	GAG	2	6	583009	583014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15289	NC_009445	CCT	2	6	583079	583084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337699
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15312	NC_009445	GA	3	6	583871	583876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15313	NC_009445	GGC	2	6	583901	583906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15314	NC_009445	CGT	2	6	583910	583915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15316	NC_009445	GATC	2	8	584015	584022	25 %	25 %	25 %	25 %	146337700
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15340	NC_009445	CGA	2	6	584808	584813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15341	NC_009445	AG	3	6	584822	584827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15342	NC_009445	A	7	7	584842	584848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15343	NC_009445	ATC	2	6	584878	584883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15344	NC_009445	TGA	2	6	584892	584897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15345	NC_009445	CTCG	2	8	584919	584926	0 %	25 %	25 %	50 %	146337701
15346	NC_009445	CGG	2	6	584971	584976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337701
15347	NC_009445	GCC	2	6	585013	585018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337701
15348	NC_009445	CTGCGG	2	12	585033	585044	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146337701
15349	NC_009445	TGA	2	6	585050	585055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337701
15350	NC_009445	CGC	2	6	585074	585079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337701
15351	NC_009445	CG	3	6	585185	585190	0 %	0 %	50 %	50 %	146337701
15352	NC_009445	CT	3	6	585210	585215	0 %	50 %	0 %	50 %	146337701
15353	NC_009445	CG	3	6	585230	585235	0 %	0 %	50 %	50 %	146337701
15354	NC_009445	GCT	3	9	585272	585280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337701
15355	NC_009445	GCT	2	6	585296	585301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337701
15356	NC_009445	CGC	2	6	585308	585313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337701
15357	NC_009445	CAT	3	9	585407	585415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337701
15358	NC_009445	TCG	2	6	585421	585426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337701
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15481	NC_009445	GCA	2	6	589889	589894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337704
15482	NC_009445	CGG	2	6	589937	589942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337704
15483	NC_009445	CGC	2	6	590033	590038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337704
15484	NC_009445	CGC	2	6	590051	590056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337704
15485	NC_009445	GC	3	6	590080	590085	0 %	0 %	50 %	50 %	146337704
15486	NC_009445	GCG	2	6	590098	590103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337704
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15490	NC_009445	GGA	2	6	590171	590176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337704
15491	NC_009445	CGGC	2	8	590240	590247	0 %	0 %	50 %	50 %	146337704
15492	NC_009445	ATC	2	6	590290	590295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337704
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15495	NC_009445	GC	3	6	590398	590403	0 %	0 %	50 %	50 %	146337704
15496	NC_009445	AGGA	2	8	590419	590426	50 %	0 %	50 %	0 %	146337704
15497	NC_009445	CGA	2	6	590516	590521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337704
15498	NC_009445	GCA	2	6	590618	590623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337704
15499	NC_009445	CAC	2	6	590667	590672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337704
15500	NC_009445	GC	3	6	590801	590806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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