MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_009445	GCT	2	6	553419	553424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337673
14502	NC_009445	ACG	2	6	553442	553447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337673
14503	NC_009445	CCGA	2	8	553456	553463	25 %	0 %	25 %	50 %	146337673
14504	NC_009445	CTCG	2	8	553488	553495	0 %	25 %	25 %	50 %	146337673
14505	NC_009445	GCG	2	6	553573	553578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_009445	CGA	2	6	553646	553651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_009445	GTC	2	6	553726	553731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_009445	ACC	2	6	553754	553759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14509	NC_009445	TG	3	6	553766	553771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_009445	GCCT	2	8	553795	553802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14511	NC_009445	TCG	2	6	553937	553942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_009445	AGGC	2	8	553984	553991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14513	NC_009445	CGA	2	6	554011	554016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_009445	ACG	2	6	554017	554022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_009445	GCG	2	6	554114	554119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_009445	GGA	2	6	554122	554127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_009445	CCGCCC	2	12	554132	554143	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
14518	NC_009445	GC	3	6	554183	554188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14519	NC_009445	AGA	2	6	554221	554226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_009445	TCACG	2	10	554263	554272	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14521	NC_009445	CGC	2	6	554292	554297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14522	NC_009445	ACT	2	6	554353	554358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337674
14523	NC_009445	CGGC	2	8	554374	554381	0 %	0 %	50 %	50 %	146337674
14524	NC_009445	CTG	2	6	554387	554392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14525	NC_009445	ATC	2	6	554418	554423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337674
14526	NC_009445	AGCG	2	8	554426	554433	25 %	0 %	50 %	25 %	146337674
14527	NC_009445	TCA	2	6	554455	554460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337674
14528	NC_009445	ACCATG	2	12	554502	554513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146337674
14529	NC_009445	CG	3	6	554525	554530	0 %	0 %	50 %	50 %	146337674
14530	NC_009445	CAG	2	6	554552	554557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14531	NC_009445	CCG	2	6	554627	554632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337674
14532	NC_009445	TTCC	2	8	554635	554642	0 %	50 %	0 %	50 %	146337674
14533	NC_009445	GC	3	6	554728	554733	0 %	0 %	50 %	50 %	146337674
14534	NC_009445	GCCGAA	2	12	554780	554791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14535	NC_009445	ATG	2	6	554799	554804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337674
14536	NC_009445	GGTC	2	8	554836	554843	0 %	25 %	50 %	25 %	146337674
14537	NC_009445	ACAGCG	2	12	554860	554871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14538	NC_009445	CGA	2	6	554887	554892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14539	NC_009445	GCGT	2	8	554899	554906	0 %	25 %	50 %	25 %	146337674
14540	NC_009445	GCC	2	6	554926	554931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337674
14541	NC_009445	CAT	2	6	554939	554944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337674
14542	NC_009445	CAG	2	6	554975	554980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14543	NC_009445	CGG	2	6	554986	554991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337674
14544	NC_009445	TGA	2	6	554992	554997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337674
14545	NC_009445	GCC	2	6	555086	555091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337674
14546	NC_009445	TGG	2	6	555139	555144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337674
14547	NC_009445	AGT	2	6	555163	555168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337674
14548	NC_009445	CGC	2	6	555179	555184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337674
14549	NC_009445	GAT	3	9	555197	555205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337674
14550	NC_009445	AGCC	2	8	555219	555226	25 %	0 %	25 %	50 %	146337674
14551	NC_009445	CGC	2	6	555235	555240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337674
14552	NC_009445	GCCGAT	2	12	555263	555274	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14553	NC_009445	TCC	2	6	555330	555335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337674
14554	NC_009445	GAA	2	6	555386	555391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337674
14555	NC_009445	ATCGCC	2	12	555477	555488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146337674
14556	NC_009445	GCA	2	6	555568	555573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14557	NC_009445	CCG	2	6	555640	555645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337674
14558	NC_009445	GAT	2	6	555650	555655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337674
14559	NC_009445	CGC	2	6	555713	555718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337674
14560	NC_009445	GGTC	2	8	555754	555761	0 %	25 %	50 %	25 %	146337674
14561	NC_009445	AGGGC	2	10	555787	555796	20 %	0 %	60 %	20 %	146337674
14562	NC_009445	TGG	2	6	555808	555813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337674
14563	NC_009445	TCG	2	6	555832	555837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337674
14564	NC_009445	GCG	2	6	555866	555871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_009445	TGA	2	6	555887	555892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_009445	GCCG	2	8	555927	555934	0 %	0 %	50 %	50 %	146337675
14567	NC_009445	TCGA	2	8	555982	555989	25 %	25 %	25 %	25 %	146337675
14568	NC_009445	CGA	2	6	556022	556027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14569	NC_009445	CAC	2	6	556071	556076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337675
14570	NC_009445	GCG	2	6	556103	556108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337675
14571	NC_009445	GC	3	6	556124	556129	0 %	0 %	50 %	50 %	146337675
14572	NC_009445	GGT	2	6	556169	556174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337675
14573	NC_009445	CGTCGA	2	12	556184	556195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14574	NC_009445	CGA	2	6	556304	556309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14575	NC_009445	GC	4	8	556358	556365	0 %	0 %	50 %	50 %	146337675
14576	NC_009445	CGT	2	6	556368	556373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14577	NC_009445	CTTGGC	2	12	556404	556415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14578	NC_009445	CTC	2	6	556434	556439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337675
14579	NC_009445	AGC	2	6	556462	556467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14580	NC_009445	GCT	3	9	556487	556495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14581	NC_009445	TGA	2	6	556496	556501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337675
14582	NC_009445	GCCG	2	8	556515	556522	0 %	0 %	50 %	50 %	146337675
14583	NC_009445	GGC	2	6	556536	556541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337675
14584	NC_009445	GC	3	6	556692	556697	0 %	0 %	50 %	50 %	146337675
14585	NC_009445	GCC	2	6	556708	556713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337675
14586	NC_009445	TCG	2	6	556765	556770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14587	NC_009445	CTG	2	6	556782	556787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14588	NC_009445	CCT	2	6	556790	556795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337675
14589	NC_009445	TGA	2	6	556808	556813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337675
14590	NC_009445	TGA	2	6	556835	556840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337675
14591	NC_009445	GC	3	6	556850	556855	0 %	0 %	50 %	50 %	146337675
14592	NC_009445	CGT	2	6	556865	556870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14593	NC_009445	GGT	2	6	556872	556877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337675
14594	NC_009445	GCC	2	6	556887	556892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337675
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14596	NC_009445	CGA	2	6	556925	556930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14597	NC_009445	CAC	2	6	556938	556943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146337675
14598	NC_009445	AGC	3	9	556945	556953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337675
14599	NC_009445	GCG	2	6	556956	556961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337675
14600	NC_009445	GCG	2	6	556996	557001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337675
14601	NC_009445	GCC	2	6	557005	557010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337675
14602	NC_009445	GGC	2	6	557011	557016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337675
14603	NC_009445	GGGC	2	8	557057	557064	0 %	0 %	75 %	25 %	146337675
14604	NC_009445	GCT	2	6	557076	557081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337676
14605	NC_009445	GCT	2	6	557088	557093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337676
14606	NC_009445	CA	3	6	557097	557102	50 %	0 %	0 %	50 %	146337676
14607	NC_009445	TCA	2	6	557151	557156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337676
14608	NC_009445	CTCGGC	2	12	557161	557172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146337676
14609	NC_009445	CGC	2	6	557208	557213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337676
14610	NC_009445	GCA	2	6	557214	557219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337676
14611	NC_009445	AGC	2	6	557234	557239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337676
14612	NC_009445	GC	3	6	557242	557247	0 %	0 %	50 %	50 %	146337676
14613	NC_009445	TTC	2	6	557252	557257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337676
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14617	NC_009445	GC	3	6	557452	557457	0 %	0 %	50 %	50 %	146337676
14618	NC_009445	CCT	2	6	557460	557465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337676
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14620	NC_009445	GGA	2	6	557565	557570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14865	NC_009445	CGA	2	6	567614	567619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337684
14866	NC_009445	GCG	2	6	567638	567643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337684
14867	NC_009445	TGA	2	6	567662	567667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337684
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14985	NC_009445	GCG	2	6	572472	572477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337688
14986	NC_009445	GCCCAG	2	12	572503	572514	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146337688
14987	NC_009445	CTG	2	6	572526	572531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337688
14988	NC_009445	AGA	2	6	572730	572735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337689
14989	NC_009445	CGC	2	6	572751	572756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337689
14990	NC_009445	AAG	2	6	572784	572789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337689
14991	NC_009445	CGT	2	6	572826	572831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337689
14992	NC_009445	GCC	2	6	572869	572874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337689
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14994	NC_009445	CG	3	6	572964	572969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14995	NC_009445	TCG	2	6	573024	573029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14996	NC_009445	CGC	2	6	573047	573052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14997	NC_009445	GCT	3	9	573103	573111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
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14999	NC_009445	CTG	2	6	573176	573181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690
15000	NC_009445	TGC	2	6	573249	573254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337690

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