MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009445	GGCGAT	2	12	535175	535186	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14002	NC_009445	GTC	2	6	535203	535208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_009445	CGC	2	6	535333	535338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337661
14004	NC_009445	GAT	2	6	535351	535356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337661
14005	NC_009445	CAT	2	6	535393	535398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337661
14006	NC_009445	TTG	2	6	535409	535414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337661
14007	NC_009445	GTCG	2	8	535423	535430	0 %	25 %	50 %	25 %	146337661
14008	NC_009445	TCG	2	6	535523	535528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337661
14009	NC_009445	CAG	2	6	535552	535557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337661
14010	NC_009445	TGA	2	6	535701	535706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337661
14011	NC_009445	GGCC	2	8	535725	535732	0 %	0 %	50 %	50 %	146337661
14012	NC_009445	CTT	2	6	535807	535812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337661
14013	NC_009445	GGA	2	6	535867	535872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337661
14014	NC_009445	GGTCG	2	10	535900	535909	0 %	20 %	60 %	20 %	146337661
14015	NC_009445	ATC	2	6	535937	535942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337661
14016	NC_009445	ATC	2	6	535999	536004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337661
14017	NC_009445	GGT	2	6	536037	536042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337661
14018	NC_009445	CTT	2	6	536170	536175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337661
14019	NC_009445	CGG	2	6	536196	536201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337661
14020	NC_009445	GAT	2	6	536218	536223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337661
14021	NC_009445	TCG	2	6	536243	536248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337661
14022	NC_009445	GCG	2	6	536286	536291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337661
14023	NC_009445	GCC	2	6	536338	536343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337661
14024	NC_009445	TCT	2	6	536472	536477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337661
14025	NC_009445	GCAG	2	8	536495	536502	25 %	0 %	50 %	25 %	146337661
14026	NC_009445	AGCG	2	8	536521	536528	25 %	0 %	50 %	25 %	146337661
14027	NC_009445	CGA	2	6	536550	536555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337661
14028	NC_009445	TCC	2	6	536583	536588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14029	NC_009445	TGTC	2	8	536598	536605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14030	NC_009445	TTC	2	6	536611	536616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_009445	GGA	2	6	536652	536657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_009445	TTG	2	6	536679	536684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_009445	CGA	2	6	536688	536693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_009445	CTC	2	6	536766	536771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14035	NC_009445	GGCG	2	8	536792	536799	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14036	NC_009445	CGC	2	6	536843	536848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14037	NC_009445	TTG	2	6	536853	536858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_009445	GCG	2	6	536884	536889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_009445	CTC	2	6	536890	536895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14040	NC_009445	G	6	6	536901	536906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_009445	CCG	2	6	536950	536955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337662
14042	NC_009445	TCC	2	6	536964	536969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337662
14043	NC_009445	TCA	2	6	537010	537015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337662
14044	NC_009445	GCT	2	6	537022	537027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14045	NC_009445	GTCG	2	8	537041	537048	0 %	25 %	50 %	25 %	146337662
14046	NC_009445	CGA	2	6	537088	537093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14047	NC_009445	CGC	2	6	537107	537112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337662
14048	NC_009445	CGC	2	6	537145	537150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337662
14049	NC_009445	AGC	2	6	537171	537176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14050	NC_009445	GCCGTA	2	12	537185	537196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14051	NC_009445	CGG	2	6	537346	537351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337662
14052	NC_009445	GACG	2	8	537368	537375	25 %	0 %	50 %	25 %	146337662
14053	NC_009445	CGA	2	6	537388	537393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14054	NC_009445	CTT	2	6	537425	537430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337662
14055	NC_009445	GCCG	2	8	537482	537489	0 %	0 %	50 %	50 %	146337662
14056	NC_009445	AGC	2	6	537501	537506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14057	NC_009445	TCG	2	6	537517	537522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14058	NC_009445	CGA	2	6	537550	537555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14059	NC_009445	TCG	2	6	537615	537620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14060	NC_009445	AGT	2	6	537697	537702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337662
14061	NC_009445	TGG	2	6	537751	537756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337662
14062	NC_009445	CGC	2	6	537764	537769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337662
14063	NC_009445	CTT	2	6	537785	537790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337662
14064	NC_009445	GAT	2	6	537833	537838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337662
14065	NC_009445	CAG	2	6	537848	537853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14066	NC_009445	TCG	2	6	537858	537863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14067	NC_009445	GCG	2	6	537901	537906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337662
14068	NC_009445	CGT	2	6	537913	537918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337662
14069	NC_009445	GCC	2	6	537953	537958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337662
14070	NC_009445	GGC	2	6	537983	537988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337662
14071	NC_009445	TCT	2	6	538087	538092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337662
14072	NC_009445	TGACG	2	10	538103	538112	20 %	20 %	40 %	20 %	146337662
14073	NC_009445	GGC	2	6	538121	538126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337662
14074	NC_009445	TCC	2	6	538180	538185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14075	NC_009445	TGGG	2	8	538227	538234	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_009445	GGA	2	6	538240	538245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_009445	GCG	2	6	538283	538288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_009445	CG	3	6	538298	538303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14079	NC_009445	GAT	2	6	538321	538326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_009445	GTC	2	6	538373	538378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14081	NC_009445	GT	3	6	538445	538450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_009445	GAC	2	6	538551	538556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_009445	CGC	4	12	538570	538581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14084	NC_009445	GCA	2	6	538621	538626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14085	NC_009445	GT	3	6	538665	538670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_009445	GAC	2	6	538770	538775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_009445	CGA	2	6	538845	538850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_009445	GT	3	6	538886	538891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_009445	TGC	2	6	538925	538930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_009445	GAC	2	6	538991	538996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_009445	GCC	3	9	539015	539023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14092	NC_009445	CGG	2	6	539069	539074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_009445	GAC	2	6	539213	539218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14094	NC_009445	GTG	2	6	539220	539225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_009445	CACCAG	2	12	539259	539270	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146337663
14096	NC_009445	CGA	2	6	539342	539347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337663
14097	NC_009445	GAA	2	6	539361	539366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146337663
14098	NC_009445	GAACGC	2	12	539379	539390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337663
14099	NC_009445	TGGG	2	8	539397	539404	0 %	25 %	75 %	0 %	146337663
14100	NC_009445	CGG	2	6	539423	539428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337663
14101	NC_009445	GTT	2	6	539496	539501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337663
14102	NC_009445	GCCG	2	8	539514	539521	0 %	0 %	50 %	50 %	146337663
14103	NC_009445	GCA	2	6	539564	539569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337663
14104	NC_009445	CGA	3	9	539582	539590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337663
14105	NC_009445	CAAT	2	8	539597	539604	50 %	25 %	0 %	25 %	146337663
14106	NC_009445	TCAA	2	8	539659	539666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14107	NC_009445	GAG	2	6	539675	539680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_009445	CGC	2	6	539731	539736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337664
14109	NC_009445	CTCG	2	8	539755	539762	0 %	25 %	25 %	50 %	146337664
14110	NC_009445	GCA	2	6	539772	539777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337664
14111	NC_009445	GC	3	6	539820	539825	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14112	NC_009445	AGG	2	6	539828	539833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337664
14113	NC_009445	GC	3	6	539858	539863	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14114	NC_009445	GTTCAG	2	12	539896	539907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146337664
14115	NC_009445	CGT	2	6	539920	539925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337664
14116	NC_009445	ACA	2	6	539934	539939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337664
14117	NC_009445	ATTG	2	8	539991	539998	25 %	50 %	25 %	0 %	146337664
14118	NC_009445	TGC	2	6	540035	540040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337664
14119	NC_009445	CG	3	6	540045	540050	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14120	NC_009445	CGTC	2	8	540052	540059	0 %	25 %	25 %	50 %	146337664
14121	NC_009445	CG	3	6	540127	540132	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14122	NC_009445	CTCGTC	2	12	540139	540150	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146337664
14123	NC_009445	GC	3	6	540186	540191	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14124	NC_009445	GGT	3	9	540199	540207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337664
14125	NC_009445	CGA	2	6	540222	540227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337664
14126	NC_009445	GCCG	2	8	540235	540242	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14127	NC_009445	AGGCGC	2	12	540243	540254	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146337664
14128	NC_009445	GAT	2	6	540259	540264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337664
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14131	NC_009445	GC	3	6	540316	540321	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14132	NC_009445	CTCG	2	8	540364	540371	0 %	25 %	25 %	50 %	146337664
14133	NC_009445	GCCG	2	8	540438	540445	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14134	NC_009445	TCC	2	6	540464	540469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146337664
14135	NC_009445	GCC	2	6	540544	540549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337664
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14147	NC_009445	CG	3	6	540830	540835	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
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14150	NC_009445	CGT	2	6	540882	540887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337664
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14153	NC_009445	TCG	2	6	541022	541027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337664
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14160	NC_009445	CG	3	6	541231	541236	0 %	0 %	50 %	50 %	146337664
14161	NC_009445	GTT	2	6	541261	541266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337664
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14201	NC_009445	ATG	2	6	542689	542694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14228	NC_009445	A	6	6	543796	543801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14229	NC_009445	GGCG	2	8	543842	543849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14230	NC_009445	TCGCC	2	10	543904	543913	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14231	NC_009445	ACG	2	6	543914	543919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14232	NC_009445	GAC	2	6	543953	543958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14233	NC_009445	TG	3	6	543965	543970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_009445	CGC	2	6	544074	544079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337666
14235	NC_009445	GGC	2	6	544080	544085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337666
14236	NC_009445	CGC	2	6	544088	544093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337666
14237	NC_009445	CAGC	2	8	544101	544108	25 %	0 %	25 %	50 %	146337666
14238	NC_009445	GCT	2	6	544134	544139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337666
14239	NC_009445	GCT	2	6	544143	544148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337666
14240	NC_009445	CCCTGG	2	12	544160	544171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146337666
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14242	NC_009445	CGGC	2	8	544206	544213	0 %	0 %	50 %	50 %	146337666
14243	NC_009445	GCC	3	9	544218	544226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337666
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14349	NC_009445	CT	3	6	547953	547958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14350	NC_009445	GCG	2	6	547978	547983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14351	NC_009445	CG	3	6	548106	548111	0 %	0 %	50 %	50 %	146337671
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14355	NC_009445	CG	3	6	548237	548242	0 %	0 %	50 %	50 %	146337671
14356	NC_009445	CGG	2	6	548256	548261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337671
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14358	NC_009445	CGG	2	6	548352	548357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337671
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14363	NC_009445	GC	4	8	548589	548596	0 %	0 %	50 %	50 %	146337671
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14479	NC_009445	GCGTCG	2	12	552499	552510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146337672
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14481	NC_009445	CG	4	8	552590	552597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14482	NC_009445	TCG	2	6	552613	552618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14483	NC_009445	CTC	2	6	552624	552629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14484	NC_009445	ACGTC	2	10	552683	552692	20 %	20 %	20 %	40 %	146337673
14485	NC_009445	GGC	2	6	552816	552821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337673
14486	NC_009445	GCTC	2	8	552887	552894	0 %	25 %	25 %	50 %	146337673
14487	NC_009445	CGC	2	6	552902	552907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337673
14488	NC_009445	CTGC	2	8	552912	552919	0 %	25 %	25 %	50 %	146337673
14489	NC_009445	CAA	2	6	552921	552926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337673
14490	NC_009445	CGG	2	6	552933	552938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337673
14491	NC_009445	GCT	2	6	552960	552965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337673
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