MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 195449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_009445	TAT	2	6	516976	516981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146337645
13503	NC_009445	GCA	2	6	516996	517001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337645
13504	NC_009445	CGG	2	6	517025	517030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337645
13505	NC_009445	GC	3	6	517032	517037	0 %	0 %	50 %	50 %	146337645
13506	NC_009445	CGC	2	6	517122	517127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337645
13507	NC_009445	GCC	2	6	517170	517175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337645
13508	NC_009445	ATC	2	6	517186	517191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337645
13509	NC_009445	CCG	2	6	517202	517207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337645
13510	NC_009445	GC	3	6	517242	517247	0 %	0 %	50 %	50 %	146337645
13511	NC_009445	CGA	2	6	517254	517259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337645
13512	NC_009445	TGA	2	6	517310	517315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337645
13513	NC_009445	CGG	2	6	517335	517340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337645
13514	NC_009445	GCT	2	6	517365	517370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337645
13515	NC_009445	CG	4	8	517386	517393	0 %	0 %	50 %	50 %	146337645
13516	NC_009445	CAT	2	6	517404	517409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337645
13517	NC_009445	GCTGC	2	10	517423	517432	0 %	20 %	40 %	40 %	146337645
13518	NC_009445	CGGC	2	8	517433	517440	0 %	0 %	50 %	50 %	146337645
13519	NC_009445	CG	3	6	517478	517483	0 %	0 %	50 %	50 %	146337645
13520	NC_009445	GGC	2	6	517518	517523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337645
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13524	NC_009445	GC	3	6	517688	517693	0 %	0 %	50 %	50 %	146337645
13525	NC_009445	GCCAC	2	10	517712	517721	20 %	0 %	20 %	60 %	146337645
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13533	NC_009445	CGA	2	6	517944	517949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337645
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13535	NC_009445	TTG	2	6	518102	518107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_009445	CGG	3	9	518110	518118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_009445	GTC	2	6	518134	518139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_009445	AGGC	2	8	518181	518188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13539	NC_009445	GTC	2	6	518201	518206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_009445	ACG	2	6	518212	518217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_009445	GAC	2	6	518250	518255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_009445	GAG	2	6	518265	518270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_009445	CG	3	6	518333	518338	0 %	0 %	50 %	50 %	146337646
13544	NC_009445	CCG	2	6	518369	518374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337646
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13551	NC_009445	TTG	2	6	518577	518582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146337646
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13593	NC_009445	GAGC	2	8	520265	520272	25 %	0 %	50 %	25 %	146337647
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13602	NC_009445	CGA	2	6	520685	520690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13605	NC_009445	CGA	2	6	520875	520880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13740	NC_009445	GCC	2	6	525530	525535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337653
13741	NC_009445	TCCGC	2	10	525564	525573	0 %	20 %	20 %	60 %	146337653
13742	NC_009445	GCT	2	6	525588	525593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337653
13743	NC_009445	CTG	2	6	525628	525633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337653
13744	NC_009445	CG	3	6	525693	525698	0 %	0 %	50 %	50 %	146337653
13745	NC_009445	CGA	2	6	525732	525737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337653
13746	NC_009445	TGC	2	6	525761	525766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337653
13747	NC_009445	CGG	2	6	525809	525814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337653
13748	NC_009445	TGGG	2	8	525887	525894	0 %	25 %	75 %	0 %	146337653
13749	NC_009445	TCA	2	6	525974	525979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337653
13750	NC_009445	TCA	2	6	526049	526054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337653
13751	NC_009445	GGCGAC	2	12	526114	526125	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146337653
13752	NC_009445	ACG	2	6	526151	526156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337653
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13754	NC_009445	TGA	2	6	526298	526303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146337653
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13757	NC_009445	ATC	2	6	526382	526387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337653
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13760	NC_009445	TGC	2	6	526521	526526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337653
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13762	NC_009445	CTT	2	6	526641	526646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13763	NC_009445	TCTGAA	2	12	526657	526668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13764	NC_009445	CCG	2	6	526716	526721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13765	NC_009445	GGC	2	6	526773	526778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13766	NC_009445	C	6	6	526808	526813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13767	NC_009445	CG	3	6	526835	526840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13768	NC_009445	CGG	2	6	526850	526855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13769	NC_009445	CCG	2	6	526857	526862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13770	NC_009445	TCT	2	6	526873	526878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13771	NC_009445	CGT	2	6	526925	526930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13772	NC_009445	GCC	2	6	526987	526992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337654
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13776	NC_009445	GCG	2	6	527181	527186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337654
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13780	NC_009445	GGC	2	6	527278	527283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337654
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13788	NC_009445	CAC	2	6	527633	527638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13789	NC_009445	CG	3	6	527687	527692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13790	NC_009445	CCT	2	6	527712	527717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13791	NC_009445	GGA	2	6	527729	527734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13792	NC_009445	CGC	2	6	527761	527766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13793	NC_009445	ACG	2	6	527771	527776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13796	NC_009445	CAA	2	6	528014	528019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146337655
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13800	NC_009445	CGG	2	6	528127	528132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337655
13801	NC_009445	CG	4	8	528158	528165	0 %	0 %	50 %	50 %	146337655
13802	NC_009445	CCG	2	6	528250	528255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337655
13803	NC_009445	GC	4	8	528269	528276	0 %	0 %	50 %	50 %	146337655
13804	NC_009445	TGC	2	6	528283	528288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337655
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13808	NC_009445	CGT	2	6	528365	528370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337655
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13820	NC_009445	GTC	2	6	528707	528712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337655
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13832	NC_009445	AGG	2	6	529162	529167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337655
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13836	NC_009445	GCC	2	6	529344	529349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337655
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13840	NC_009445	TGC	2	6	529447	529452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337655
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13843	NC_009445	CCG	2	6	529498	529503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337655
13844	NC_009445	CGGGC	2	10	529641	529650	0 %	0 %	60 %	40 %	146337655
13845	NC_009445	GC	3	6	529649	529654	0 %	0 %	50 %	50 %	146337655
13846	NC_009445	CTT	2	6	529664	529669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146337655
13847	NC_009445	GC	3	6	529815	529820	0 %	0 %	50 %	50 %	146337655
13848	NC_009445	CGCC	2	8	529849	529856	0 %	0 %	25 %	75 %	146337655
13849	NC_009445	GGA	2	6	529874	529879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146337655
13850	NC_009445	CAG	2	6	529929	529934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337655
13851	NC_009445	CGT	2	6	529939	529944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337655
13852	NC_009445	CG	3	6	529950	529955	0 %	0 %	50 %	50 %	146337655
13853	NC_009445	CGT	2	6	530024	530029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337655
13854	NC_009445	CGC	2	6	530042	530047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146337655
13855	NC_009445	ATGCTG	2	12	530067	530078	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146337655
13856	NC_009445	GC	3	6	530108	530113	0 %	0 %	50 %	50 %	146337655
13857	NC_009445	GAGC	2	8	530132	530139	25 %	0 %	50 %	25 %	146337655
13858	NC_009445	GATC	2	8	530234	530241	25 %	25 %	25 %	25 %	146337655
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13860	NC_009445	GGT	2	6	530330	530335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146337655
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13981	NC_009445	ATC	2	6	534413	534418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337659
13982	NC_009445	CGA	2	6	534432	534437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337659
13983	NC_009445	TGC	2	6	534438	534443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337659
13984	NC_009445	CGG	2	6	534446	534451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337659
13985	NC_009445	GGC	2	6	534460	534465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337659
13986	NC_009445	GC	3	6	534476	534481	0 %	0 %	50 %	50 %	146337659
13987	NC_009445	GAC	2	6	534501	534506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337659
13988	NC_009445	CAC	2	6	534508	534513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13989	NC_009445	GCT	2	6	534624	534629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337660
13990	NC_009445	GC	3	6	534689	534694	0 %	0 %	50 %	50 %	146337660
13991	NC_009445	CTG	2	6	534697	534702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337660
13992	NC_009445	CGG	2	6	534756	534761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337660
13993	NC_009445	CA	3	6	534820	534825	50 %	0 %	0 %	50 %	146337660
13994	NC_009445	CTG	2	6	534862	534867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146337660
13995	NC_009445	GGCG	2	8	534870	534877	0 %	0 %	75 %	25 %	146337660
13996	NC_009445	CGG	2	6	534933	534938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337660
13997	NC_009445	CAT	2	6	534960	534965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146337660
13998	NC_009445	CGG	2	6	535082	535087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146337660
13999	NC_009445	AGC	2	6	535127	535132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337660
14000	NC_009445	CAG	2	6	535149	535154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146337660

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