MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_008542	CGA	2	6	662403	662408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688614
18002	NC_008542	GCA	2	6	662409	662414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688614
18003	NC_008542	CGG	2	6	662445	662450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688614
18004	NC_008542	GAA	2	6	662491	662496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688614
18005	NC_008542	CTT	3	9	662578	662586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688614
18006	NC_008542	GCA	2	6	662598	662603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688614
18007	NC_008542	GGCC	2	8	662649	662656	0 %	0 %	50 %	50 %	116688614
18008	NC_008542	CGG	2	6	662667	662672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688614
18009	NC_008542	GCG	2	6	662673	662678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688614
18010	NC_008542	CGG	2	6	662697	662702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688614
18011	NC_008542	CGC	2	6	662718	662723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688614
18012	NC_008542	CGG	2	6	662730	662735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688614
18013	NC_008542	CGA	2	6	662757	662762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688614
18014	NC_008542	GCT	2	6	662782	662787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688614
18015	NC_008542	CTT	2	6	662793	662798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688614
18016	NC_008542	GAC	2	6	662839	662844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688614
18017	NC_008542	CAG	2	6	662866	662871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688614
18018	NC_008542	CGC	2	6	662928	662933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688614
18019	NC_008542	GAC	2	6	662944	662949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688614
18020	NC_008542	GC	3	6	662950	662955	0 %	0 %	50 %	50 %	116688614
18021	NC_008542	TGAG	2	8	662963	662970	25 %	25 %	50 %	0 %	116688614
18022	NC_008542	GCG	2	6	663013	663018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_008542	CGG	2	6	663111	663116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688615
18024	NC_008542	TCG	2	6	663164	663169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18025	NC_008542	GCCG	2	8	663177	663184	0 %	0 %	50 %	50 %	116688615
18026	NC_008542	CCG	2	6	663200	663205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688615
18027	NC_008542	GCCG	2	8	663223	663230	0 %	0 %	50 %	50 %	116688615
18028	NC_008542	CG	3	6	663229	663234	0 %	0 %	50 %	50 %	116688615
18029	NC_008542	CTG	2	6	663235	663240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18030	NC_008542	CGC	2	6	663243	663248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688615
18031	NC_008542	GCT	2	6	663249	663254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18032	NC_008542	TGC	2	6	663266	663271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18033	NC_008542	ACG	2	6	663293	663298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18034	NC_008542	TTCGCG	2	12	663313	663324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18035	NC_008542	TTC	2	6	663376	663381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688615
18036	NC_008542	GCCTGC	2	12	663392	663403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116688615
18037	NC_008542	TGC	2	6	663407	663412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18038	NC_008542	GCG	2	6	663422	663427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688615
18039	NC_008542	GCT	2	6	663432	663437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18040	NC_008542	CGG	2	6	663450	663455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688615
18041	NC_008542	TGC	2	6	663464	663469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18042	NC_008542	CGC	2	6	663540	663545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688615
18043	NC_008542	CTGATG	2	12	663559	663570	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116688615
18044	NC_008542	GCG	2	6	663576	663581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688615
18045	NC_008542	GCG	2	6	663599	663604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688615
18046	NC_008542	GCC	2	6	663651	663656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688615
18047	NC_008542	GCT	2	6	663657	663662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18048	NC_008542	GCT	2	6	663675	663680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18049	NC_008542	TGC	2	6	663707	663712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18050	NC_008542	GC	5	10	663760	663769	0 %	0 %	50 %	50 %	116688615
18051	NC_008542	CGG	2	6	663819	663824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688615
18052	NC_008542	CTG	2	6	663826	663831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18053	NC_008542	GGCGCG	2	12	663854	663865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688615
18054	NC_008542	CG	3	6	663870	663875	0 %	0 %	50 %	50 %	116688615
18055	NC_008542	CGC	2	6	663894	663899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688615
18056	NC_008542	GCT	3	9	663900	663908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18057	NC_008542	GTTT	2	8	663927	663934	0 %	75 %	25 %	0 %	116688615
18058	NC_008542	TGC	3	9	663941	663949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688615
18059	NC_008542	TTC	2	6	663990	663995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688616
18060	NC_008542	TTC	2	6	664002	664007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688616
18061	NC_008542	TCT	2	6	664008	664013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688616
18062	NC_008542	CG	3	6	664030	664035	0 %	0 %	50 %	50 %	116688616
18063	NC_008542	CAGGCG	2	12	664058	664069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116688616
18064	NC_008542	ACG	2	6	664092	664097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688616
18065	NC_008542	CG	3	6	664129	664134	0 %	0 %	50 %	50 %	116688616
18066	NC_008542	CG	3	6	664147	664152	0 %	0 %	50 %	50 %	116688616
18067	NC_008542	TGCGC	2	10	664173	664182	0 %	20 %	40 %	40 %	116688616
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18069	NC_008542	GCG	2	6	664227	664232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688616
18070	NC_008542	CGC	2	6	664267	664272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688616
18071	NC_008542	GC	3	6	664271	664276	0 %	0 %	50 %	50 %	116688616
18072	NC_008542	CGG	2	6	664307	664312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688617
18073	NC_008542	TGT	2	6	664313	664318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688617
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18077	NC_008542	CGG	2	6	664560	664565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688617
18078	NC_008542	TCGTG	2	10	664580	664589	0 %	40 %	40 %	20 %	116688617
18079	NC_008542	CGA	2	6	664590	664595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688617
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18082	NC_008542	CG	4	8	664633	664640	0 %	0 %	50 %	50 %	116688617
18083	NC_008542	GAC	2	6	664681	664686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688617
18084	NC_008542	CGA	2	6	664695	664700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688617
18085	NC_008542	CGC	2	6	664719	664724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688617
18086	NC_008542	CG	3	6	664732	664737	0 %	0 %	50 %	50 %	116688617
18087	NC_008542	CGC	2	6	664740	664745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688617
18088	NC_008542	GC	3	6	664744	664749	0 %	0 %	50 %	50 %	116688617
18089	NC_008542	GACC	2	8	664800	664807	25 %	0 %	25 %	50 %	116688617
18090	NC_008542	CCG	2	6	664856	664861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688617
18091	NC_008542	CTTTC	2	10	664866	664875	0 %	60 %	0 %	40 %	116688617
18092	NC_008542	T	6	6	664896	664901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_008542	T	6	6	664914	664919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_008542	TCC	2	6	664993	664998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18095	NC_008542	AGT	2	6	665027	665032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_008542	GT	4	8	665048	665055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_008542	CCGG	2	8	665079	665086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18098	NC_008542	CGG	2	6	665097	665102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18099	NC_008542	GCG	2	6	665117	665122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18100	NC_008542	CAGCG	2	10	665153	665162	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18101	NC_008542	TCGC	2	8	665247	665254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18102	NC_008542	CGTT	2	8	665285	665292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18103	NC_008542	TC	3	6	665305	665310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18104	NC_008542	ACC	2	6	665346	665351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688618
18105	NC_008542	CGG	2	6	665396	665401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688618
18106	NC_008542	CGC	2	6	665428	665433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688618
18107	NC_008542	CCG	2	6	665462	665467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688618
18108	NC_008542	GTG	2	6	665478	665483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688618
18109	NC_008542	GATCGC	2	12	665501	665512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116688618
18110	NC_008542	GC	3	6	665562	665567	0 %	0 %	50 %	50 %	116688618
18111	NC_008542	CGT	2	6	665600	665605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688618
18112	NC_008542	CG	3	6	665607	665612	0 %	0 %	50 %	50 %	116688618
18113	NC_008542	GCC	2	6	665623	665628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688618
18114	NC_008542	CGG	2	6	665633	665638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688618
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18116	NC_008542	CG	3	6	665708	665713	0 %	0 %	50 %	50 %	116688618
18117	NC_008542	GCG	2	6	665772	665777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688618
18118	NC_008542	GCGG	2	8	665781	665788	0 %	0 %	75 %	25 %	116688618
18119	NC_008542	GC	4	8	665855	665862	0 %	0 %	50 %	50 %	116688618
18120	NC_008542	TCG	2	6	665914	665919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688618
18121	NC_008542	GAA	2	6	665930	665935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688618
18122	NC_008542	ACG	2	6	665941	665946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688618
18123	NC_008542	GC	3	6	665988	665993	0 %	0 %	50 %	50 %	116688618
18124	NC_008542	GAT	2	6	665996	666001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688618
18125	NC_008542	CTG	2	6	666042	666047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688618
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18128	NC_008542	GCT	2	6	666170	666175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688618
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18131	NC_008542	CGACGC	2	12	666415	666426	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116688618
18132	NC_008542	GCAC	2	8	666439	666446	25 %	0 %	25 %	50 %	116688618
18133	NC_008542	GTC	2	6	666458	666463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688618
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18138	NC_008542	GC	3	6	666575	666580	0 %	0 %	50 %	50 %	116688618
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18149	NC_008542	TCG	2	6	667095	667100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688618
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18175	NC_008542	GCAG	2	8	668157	668164	25 %	0 %	50 %	25 %	116688618
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18187	NC_008542	GCG	2	6	668378	668383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18188	NC_008542	ACG	2	6	668387	668392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18190	NC_008542	CGA	2	6	668497	668502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18192	NC_008542	ACG	2	6	668580	668585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18193	NC_008542	A	6	6	668629	668634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18194	NC_008542	GAGCG	2	10	668752	668761	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18195	NC_008542	CCG	2	6	668784	668789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688619
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18225	NC_008542	ATG	2	6	669945	669950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18230	NC_008542	CG	3	6	670199	670204	0 %	0 %	50 %	50 %	116688620
18231	NC_008542	GC	3	6	670228	670233	0 %	0 %	50 %	50 %	116688620
18232	NC_008542	AAC	2	6	670354	670359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18233	NC_008542	AAG	2	6	670372	670377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688621
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18359	NC_008542	GGTC	2	8	673602	673609	0 %	25 %	50 %	25 %	116688625
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18361	NC_008542	GCG	3	9	673638	673646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688625
18362	NC_008542	GCG	2	6	673662	673667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688625
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18482	NC_008542	GC	4	8	678010	678017	0 %	0 %	50 %	50 %	116688629
18483	NC_008542	GATC	2	8	678029	678036	25 %	25 %	25 %	25 %	116688629
18484	NC_008542	GCA	2	6	678104	678109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688629
18485	NC_008542	GCG	2	6	678267	678272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18486	NC_008542	CGC	2	6	678287	678292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18487	NC_008542	TCG	2	6	678396	678401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688630
18488	NC_008542	GAC	2	6	678404	678409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688630
18489	NC_008542	GC	3	6	678421	678426	0 %	0 %	50 %	50 %	116688630
18490	NC_008542	CGG	2	6	678427	678432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688630
18491	NC_008542	TGA	2	6	678475	678480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688630
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