MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_008542	TCG	2	6	555276	555281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688520
15003	NC_008542	CGAC	2	8	555282	555289	25 %	0 %	25 %	50 %	116688520
15004	NC_008542	CG	4	8	555297	555304	0 %	0 %	50 %	50 %	116688520
15005	NC_008542	GC	3	6	555314	555319	0 %	0 %	50 %	50 %	116688520
15006	NC_008542	CG	3	6	555328	555333	0 %	0 %	50 %	50 %	116688520
15007	NC_008542	TCG	2	6	555360	555365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688520
15008	NC_008542	CCGG	3	12	555380	555391	0 %	0 %	50 %	50 %	116688520
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15010	NC_008542	CCGGC	2	10	555425	555434	0 %	0 %	40 %	60 %	116688520
15011	NC_008542	GC	3	6	555438	555443	0 %	0 %	50 %	50 %	116688520
15012	NC_008542	TGC	2	6	555480	555485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688520
15013	NC_008542	GGCT	2	8	555533	555540	0 %	25 %	50 %	25 %	116688520
15014	NC_008542	CG	3	6	555579	555584	0 %	0 %	50 %	50 %	116688520
15015	NC_008542	CTG	2	6	555590	555595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688520
15016	NC_008542	CGA	2	6	555604	555609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688520
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15018	NC_008542	CGA	2	6	555634	555639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688520
15019	NC_008542	GACG	2	8	555664	555671	25 %	0 %	50 %	25 %	116688520
15020	NC_008542	CGA	2	6	555673	555678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688520
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15024	NC_008542	CGAC	2	8	555802	555809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15025	NC_008542	CGG	2	6	555817	555822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_008542	GCT	2	6	555876	555881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688521
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15033	NC_008542	CG	3	6	556136	556141	0 %	0 %	50 %	50 %	116688521
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15040	NC_008542	TGC	2	6	556379	556384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688521
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15044	NC_008542	TGC	2	6	556478	556483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688521
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15053	NC_008542	CG	3	6	556749	556754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15056	NC_008542	GGC	2	6	556815	556820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688522
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15108	NC_008542	CGT	2	6	558614	558619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688524
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15121	NC_008542	TTC	2	6	558978	558983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688524
15122	NC_008542	CTT	2	6	558986	558991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688524
15123	NC_008542	GCG	2	6	558997	559002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688524
15124	NC_008542	GCAC	2	8	559024	559031	25 %	0 %	25 %	50 %	116688524
15125	NC_008542	GCT	2	6	559082	559087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688524
15126	NC_008542	TGC	2	6	559162	559167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688524
15127	NC_008542	ATCT	2	8	559203	559210	25 %	50 %	0 %	25 %	116688524
15128	NC_008542	CTT	2	6	559232	559237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688524
15129	NC_008542	GCC	2	6	559289	559294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688524
15130	NC_008542	CGAC	2	8	559309	559316	25 %	0 %	25 %	50 %	116688524
15131	NC_008542	GGCC	2	8	559361	559368	0 %	0 %	50 %	50 %	116688524
15132	NC_008542	GCT	2	6	559406	559411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688524
15133	NC_008542	GC	3	6	559412	559417	0 %	0 %	50 %	50 %	116688524
15134	NC_008542	GAT	2	6	559445	559450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688524
15135	NC_008542	CGGG	2	8	559453	559460	0 %	0 %	75 %	25 %	116688524
15136	NC_008542	CAT	2	6	559466	559471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688524
15137	NC_008542	TGC	2	6	559486	559491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688524
15138	NC_008542	CG	4	8	559510	559517	0 %	0 %	50 %	50 %	116688524
15139	NC_008542	GCG	3	9	559515	559523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688524
15140	NC_008542	GCC	2	6	559554	559559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15141	NC_008542	CGGC	2	8	559567	559574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15142	NC_008542	GCAC	2	8	559579	559586	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15143	NC_008542	GC	3	6	559615	559620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15144	NC_008542	TGTC	2	8	559694	559701	0 %	50 %	25 %	25 %	116688525
15145	NC_008542	CAC	2	6	559713	559718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688525
15146	NC_008542	CG	4	8	559757	559764	0 %	0 %	50 %	50 %	116688525
15147	NC_008542	CG	3	6	559900	559905	0 %	0 %	50 %	50 %	116688525
15148	NC_008542	ACG	2	6	560018	560023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688525
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15150	NC_008542	TGC	2	6	560048	560053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688525
15151	NC_008542	CGC	2	6	560073	560078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688525
15152	NC_008542	CGG	2	6	560132	560137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688525
15153	NC_008542	ATC	2	6	560155	560160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688525
15154	NC_008542	TGC	2	6	560201	560206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688525
15155	NC_008542	GTC	2	6	560251	560256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688525
15156	NC_008542	CGC	2	6	560357	560362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15157	NC_008542	GC	3	6	560361	560366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15158	NC_008542	CGC	2	6	560375	560380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15159	NC_008542	CGT	2	6	560382	560387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15160	NC_008542	GGCC	2	8	560436	560443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15161	NC_008542	CG	3	6	560455	560460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15162	NC_008542	CTG	2	6	560505	560510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15163	NC_008542	CGAT	2	8	560536	560543	25 %	25 %	25 %	25 %	116688526
15164	NC_008542	CCG	2	6	560560	560565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688526
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15168	NC_008542	CGA	2	6	560651	560656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688526
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15171	NC_008542	CGC	2	6	560749	560754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688526
15172	NC_008542	ACC	2	6	560766	560771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688526
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15176	NC_008542	CG	3	6	560859	560864	0 %	0 %	50 %	50 %	116688526
15177	NC_008542	CG	3	6	560874	560879	0 %	0 %	50 %	50 %	116688526
15178	NC_008542	CGGC	2	8	560885	560892	0 %	0 %	50 %	50 %	116688526
15179	NC_008542	TTC	2	6	560898	560903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688526
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15182	NC_008542	GGC	2	6	560951	560956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688526
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15184	NC_008542	TCGG	2	8	560964	560971	0 %	25 %	50 %	25 %	116688526
15185	NC_008542	CGC	3	9	561005	561013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688526
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15187	NC_008542	TCG	2	6	561055	561060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688526
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15202	NC_008542	TCGTC	2	10	561527	561536	0 %	40 %	20 %	40 %	116688526
15203	NC_008542	CGCA	2	8	561557	561564	25 %	0 %	25 %	50 %	116688526
15204	NC_008542	TCG	2	6	561565	561570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688526
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15206	NC_008542	CG	3	6	561610	561615	0 %	0 %	50 %	50 %	116688526
15207	NC_008542	CGG	2	6	561638	561643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688526
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15209	NC_008542	GGCG	2	8	561776	561783	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15210	NC_008542	GTC	2	6	561792	561797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15211	NC_008542	GAC	2	6	561808	561813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15212	NC_008542	CAAAAA	2	12	561821	561832	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15213	NC_008542	CCG	2	6	561836	561841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15214	NC_008542	T	6	6	561851	561856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15215	NC_008542	CGGA	2	8	561883	561890	25 %	0 %	50 %	25 %	116688527
15216	NC_008542	TCG	2	6	562004	562009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688527
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15218	NC_008542	TGA	2	6	562026	562031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688527
15219	NC_008542	AAGG	2	8	562137	562144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15220	NC_008542	T	6	6	562322	562327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15221	NC_008542	CGAT	2	8	562336	562343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15222	NC_008542	CGC	2	6	562381	562386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15223	NC_008542	C	6	6	562417	562422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15224	NC_008542	TGCG	2	8	562428	562435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15225	NC_008542	GCTG	2	8	562576	562583	0 %	25 %	50 %	25 %	116688528
15226	NC_008542	CGG	2	6	562618	562623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688528
15227	NC_008542	ATC	2	6	562638	562643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688528
15228	NC_008542	CGT	2	6	562649	562654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688528
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15230	NC_008542	CG	3	6	562727	562732	0 %	0 %	50 %	50 %	116688528
15231	NC_008542	TGG	2	6	562750	562755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688528
15232	NC_008542	TCA	2	6	562759	562764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688528
15233	NC_008542	GTT	2	6	562865	562870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688528
15234	NC_008542	CTG	3	9	562899	562907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688528
15235	NC_008542	GTC	3	9	562920	562928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688528
15236	NC_008542	ACT	2	6	562942	562947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688528
15237	NC_008542	CG	3	6	562964	562969	0 %	0 %	50 %	50 %	116688528
15238	NC_008542	CGA	2	6	563122	563127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688528
15239	NC_008542	GC	3	6	563184	563189	0 %	0 %	50 %	50 %	116688528
15240	NC_008542	CTG	2	6	563232	563237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688528
15241	NC_008542	TGC	3	9	563254	563262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688528
15242	NC_008542	TCGGT	2	10	563275	563284	0 %	40 %	40 %	20 %	116688528
15243	NC_008542	TCG	2	6	563328	563333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688528
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15485	NC_008542	TTC	2	6	571685	571690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15486	NC_008542	GATG	2	8	571776	571783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15487	NC_008542	GCTG	2	8	571902	571909	0 %	25 %	50 %	25 %	116688537
15488	NC_008542	GCG	2	6	571918	571923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688537
15489	NC_008542	GTG	2	6	571939	571944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688537
15490	NC_008542	TCG	2	6	571956	571961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688537
15491	NC_008542	GCC	3	9	571976	571984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688537
15492	NC_008542	TC	3	6	571999	572004	0 %	50 %	0 %	50 %	116688537
15493	NC_008542	CCG	2	6	572223	572228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688538
15494	NC_008542	GC	3	6	572267	572272	0 %	0 %	50 %	50 %	116688538
15495	NC_008542	GCTG	2	8	572274	572281	0 %	25 %	50 %	25 %	116688538
15496	NC_008542	TCGG	2	8	572297	572304	0 %	25 %	50 %	25 %	116688538
15497	NC_008542	TGA	2	6	572400	572405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688538
15498	NC_008542	CGGG	2	8	572412	572419	0 %	0 %	75 %	25 %	116688538
15499	NC_008542	CAG	2	6	572420	572425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688538
15500	NC_008542	GGC	2	6	572461	572466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688538

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