MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008542	CGA	2	6	478054	478059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688451
13002	NC_008542	GAC	2	6	478084	478089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_008542	GAC	2	6	478096	478101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_008542	CGGCG	2	10	478112	478121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13005	NC_008542	GCT	2	6	478160	478165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688452
13006	NC_008542	GCA	2	6	478217	478222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688452
13007	NC_008542	GACG	2	8	478223	478230	25 %	0 %	50 %	25 %	116688452
13008	NC_008542	GCG	3	9	478235	478243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688452
13009	NC_008542	TCGGTG	2	12	478260	478271	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116688452
13010	NC_008542	TGA	2	6	478279	478284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688452
13011	NC_008542	GCT	2	6	478295	478300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688452
13012	NC_008542	GCA	2	6	478304	478309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688452
13013	NC_008542	ATC	2	6	478311	478316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688452
13014	NC_008542	CTT	2	6	478319	478324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688452
13015	NC_008542	TCGG	2	8	478332	478339	0 %	25 %	50 %	25 %	116688452
13016	NC_008542	GCG	2	6	478354	478359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688452
13017	NC_008542	ATC	2	6	478362	478367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688452
13018	NC_008542	TGC	2	6	478369	478374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688452
13019	NC_008542	GGA	2	6	478427	478432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688452
13020	NC_008542	ACA	2	6	478456	478461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688452
13021	NC_008542	GCT	2	6	478487	478492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688452
13022	NC_008542	ATC	2	6	478521	478526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688452
13023	NC_008542	GCG	2	6	478530	478535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688452
13024	NC_008542	CGGGC	2	10	478557	478566	0 %	0 %	60 %	40 %	116688452
13025	NC_008542	TCG	2	6	478603	478608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688452
13026	NC_008542	GCCGA	2	10	478620	478629	20 %	0 %	40 %	40 %	116688452
13027	NC_008542	CTGC	2	8	478737	478744	0 %	25 %	25 %	50 %	116688452
13028	NC_008542	CGATTG	2	12	478761	478772	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116688453
13029	NC_008542	ATGGG	2	10	478779	478788	20 %	20 %	60 %	0 %	116688453
13030	NC_008542	AAG	2	6	478817	478822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688453
13031	NC_008542	GCC	2	6	478832	478837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688453
13032	NC_008542	TCG	2	6	478848	478853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688453
13033	NC_008542	GCCG	2	8	478858	478865	0 %	0 %	50 %	50 %	116688453
13034	NC_008542	CG	3	6	478871	478876	0 %	0 %	50 %	50 %	116688453
13035	NC_008542	CGT	2	6	478885	478890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688453
13036	NC_008542	AGG	2	6	478950	478955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688453
13037	NC_008542	GCT	2	6	478984	478989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688453
13038	NC_008542	GAC	2	6	479105	479110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688453
13039	NC_008542	GC	3	6	479274	479279	0 %	0 %	50 %	50 %	116688453
13040	NC_008542	CG	3	6	479296	479301	0 %	0 %	50 %	50 %	116688453
13041	NC_008542	GTG	2	6	479395	479400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_008542	GC	3	6	479419	479424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_008542	TTCTT	2	10	479522	479531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13044	NC_008542	ACG	2	6	479537	479542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_008542	GT	3	6	479594	479599	0 %	50 %	50 %	0 %	116688454
13046	NC_008542	T	6	6	479635	479640	0 %	100 %	0 %	0 %	116688454
13047	NC_008542	CGG	2	6	479650	479655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688454
13048	NC_008542	CGG	2	6	479688	479693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688454
13049	NC_008542	TCG	2	6	479701	479706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688454
13050	NC_008542	GAA	2	6	479735	479740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688454
13051	NC_008542	CGA	2	6	479765	479770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688454
13052	NC_008542	CGA	2	6	479777	479782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688454
13053	NC_008542	CGG	3	9	479798	479806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688454
13054	NC_008542	ATC	2	6	479862	479867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688454
13055	NC_008542	CCG	3	9	479872	479880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688454
13056	NC_008542	GAA	2	6	479882	479887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688454
13057	NC_008542	GCA	2	6	479926	479931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688454
13058	NC_008542	TCG	2	6	479935	479940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688454
13059	NC_008542	CGAC	2	8	479968	479975	25 %	0 %	25 %	50 %	116688454
13060	NC_008542	GATC	2	8	480005	480012	25 %	25 %	25 %	25 %	116688454
13061	NC_008542	GAA	2	6	480017	480022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688454
13062	NC_008542	ATCG	2	8	480044	480051	25 %	25 %	25 %	25 %	116688454
13063	NC_008542	TGC	2	6	480079	480084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688454
13064	NC_008542	GCG	2	6	480148	480153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688454
13065	NC_008542	GC	3	6	480272	480277	0 %	0 %	50 %	50 %	116688454
13066	NC_008542	GTC	2	6	480317	480322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_008542	GGC	2	6	480345	480350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_008542	CG	3	6	480366	480371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_008542	CAT	2	6	480414	480419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688455
13070	NC_008542	CAT	2	6	480435	480440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688455
13071	NC_008542	CCTG	2	8	480443	480450	0 %	25 %	25 %	50 %	116688455
13072	NC_008542	CCG	2	6	480458	480463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688455
13073	NC_008542	GTC	2	6	480469	480474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688455
13074	NC_008542	TCG	2	6	480488	480493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688455
13075	NC_008542	CGCC	2	8	480525	480532	0 %	0 %	25 %	75 %	116688455
13076	NC_008542	ACG	2	6	480536	480541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688455
13077	NC_008542	CGA	2	6	480552	480557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688455
13078	NC_008542	ATC	2	6	480613	480618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688455
13079	NC_008542	CGTCG	2	10	480624	480633	0 %	20 %	40 %	40 %	116688455
13080	NC_008542	CGG	3	9	480657	480665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688455
13081	NC_008542	GC	3	6	480669	480674	0 %	0 %	50 %	50 %	116688455
13082	NC_008542	GCG	2	6	480687	480692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688455
13083	NC_008542	CTG	2	6	480694	480699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688455
13084	NC_008542	TCG	2	6	480730	480735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688455
13085	NC_008542	TCG	3	9	480794	480802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688455
13086	NC_008542	CGC	2	6	480839	480844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688455
13087	NC_008542	CACG	2	8	480858	480865	25 %	0 %	25 %	50 %	116688455
13088	NC_008542	GC	3	6	480904	480909	0 %	0 %	50 %	50 %	116688455
13089	NC_008542	CG	3	6	480995	481000	0 %	0 %	50 %	50 %	116688455
13090	NC_008542	CGGTGC	2	12	481013	481024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116688455
13091	NC_008542	GCG	2	6	481040	481045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688455
13092	NC_008542	GCA	2	6	481056	481061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688455
13093	NC_008542	GCC	2	6	481105	481110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688455
13094	NC_008542	GGCGA	2	10	481141	481150	20 %	0 %	60 %	20 %	116688455
13095	NC_008542	TGA	2	6	481189	481194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688455
13096	NC_008542	CGAAA	2	10	481199	481208	60 %	0 %	20 %	20 %	116688456
13097	NC_008542	GAC	2	6	481242	481247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688456
13098	NC_008542	CGA	2	6	481282	481287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688456
13099	NC_008542	ACG	2	6	481288	481293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688456
13100	NC_008542	GC	3	6	481349	481354	0 %	0 %	50 %	50 %	116688456
13101	NC_008542	CTA	2	6	481358	481363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688456
13102	NC_008542	TTCGCG	2	12	481364	481375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688456
13103	NC_008542	GAG	2	6	481398	481403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688456
13104	NC_008542	GCA	2	6	481415	481420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688456
13105	NC_008542	CGA	2	6	481445	481450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688456
13106	NC_008542	CGT	2	6	481454	481459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688456
13107	NC_008542	GCT	2	6	481460	481465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688456
13108	NC_008542	CCGG	2	8	481501	481508	0 %	0 %	50 %	50 %	116688456
13109	NC_008542	CTT	2	6	481517	481522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688456
13110	NC_008542	CGG	2	6	481547	481552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688456
13111	NC_008542	GCT	2	6	481627	481632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688457
13112	NC_008542	GCG	2	6	481665	481670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688457
13113	NC_008542	CGTA	2	8	481683	481690	25 %	25 %	25 %	25 %	116688457
13114	NC_008542	CGA	2	6	481711	481716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688457
13115	NC_008542	GAA	2	6	481726	481731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688457
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13117	NC_008542	GC	3	6	481797	481802	0 %	0 %	50 %	50 %	116688457
13118	NC_008542	CGCGAG	2	12	481943	481954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116688457
13119	NC_008542	CGG	2	6	481960	481965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688457
13120	NC_008542	CGC	2	6	481981	481986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13121	NC_008542	CAT	2	6	482036	482041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688458
13122	NC_008542	CGG	2	6	482071	482076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688458
13123	NC_008542	GCG	2	6	482167	482172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688458
13124	NC_008542	CAT	2	6	482180	482185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688458
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13133	NC_008542	GAC	2	6	482536	482541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688459
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13148	NC_008542	TCA	2	6	482918	482923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688460
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13230	NC_008542	GC	3	6	485237	485242	0 %	0 %	50 %	50 %	116688463
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13233	NC_008542	TGA	2	6	485330	485335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688463
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13236	NC_008542	TCG	2	6	485429	485434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688463
13237	NC_008542	ACG	2	6	485554	485559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688463
13238	NC_008542	GGC	2	6	485616	485621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688463
13239	NC_008542	CTG	2	6	485631	485636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688463
13240	NC_008542	GAA	2	6	485658	485663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688463
13241	NC_008542	CG	4	8	485685	485692	0 %	0 %	50 %	50 %	116688463
13242	NC_008542	GGC	2	6	485698	485703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688463
13243	NC_008542	GAC	2	6	485733	485738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688463
13244	NC_008542	ACG	2	6	485771	485776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688463
13245	NC_008542	GCC	2	6	485790	485795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688463
13246	NC_008542	CGA	2	6	485822	485827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688463
13247	NC_008542	GCT	2	6	485840	485845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688463
13248	NC_008542	ACG	2	6	485890	485895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688463
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13252	NC_008542	CGC	2	6	486075	486080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688464
13253	NC_008542	GTCG	2	8	486113	486120	0 %	25 %	50 %	25 %	116688464
13254	NC_008542	G	6	6	486145	486150	0 %	0 %	100 %	0 %	116688464
13255	NC_008542	CCA	2	6	486167	486172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688464
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13258	NC_008542	TCG	2	6	486412	486417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688464
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13260	NC_008542	CACG	2	8	486581	486588	25 %	0 %	25 %	50 %	116688464
13261	NC_008542	CGG	3	9	486589	486597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688464
13262	NC_008542	CGTT	2	8	486610	486617	0 %	50 %	25 %	25 %	116688464
13263	NC_008542	GAA	2	6	486678	486683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688464
13264	NC_008542	GCG	3	9	486740	486748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13265	NC_008542	GAC	2	6	486871	486876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13266	NC_008542	GCG	2	6	486894	486899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13267	NC_008542	GCC	2	6	486981	486986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688465
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13269	NC_008542	GGTCGA	2	12	487099	487110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116688465
13270	NC_008542	CCGTG	2	10	487143	487152	0 %	20 %	40 %	40 %	116688465
13271	NC_008542	TCG	2	6	487320	487325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688465
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13273	NC_008542	GAC	2	6	487400	487405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688465
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13275	NC_008542	CGA	2	6	487524	487529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688465
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13280	NC_008542	TAC	2	6	487666	487671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688466
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13284	NC_008542	TCGCGT	2	12	487787	487798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688466
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13290	NC_008542	TTC	2	6	487993	487998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688466
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13293	NC_008542	TCG	2	6	488075	488080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688466
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13349	NC_008542	CGC	2	6	489783	489788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13350	NC_008542	T	6	6	489804	489809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13351	NC_008542	ATG	2	6	489824	489829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688468
13352	NC_008542	CAA	2	6	489928	489933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688468
13353	NC_008542	TGA	2	6	489951	489956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688468
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13355	NC_008542	CGA	2	6	490033	490038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688468
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13357	NC_008542	GC	3	6	490081	490086	0 %	0 %	50 %	50 %	116688468
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13480	NC_008542	GTT	2	6	495489	495494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688474
13481	NC_008542	CGC	2	6	495515	495520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688474
13482	NC_008542	GTG	2	6	495541	495546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688474
13483	NC_008542	GCT	2	6	495576	495581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688474
13484	NC_008542	CAA	2	6	495593	495598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688474
13485	NC_008542	TGG	2	6	495652	495657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688474
13486	NC_008542	CGT	2	6	495750	495755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688474
13487	NC_008542	CGC	2	6	495783	495788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13488	NC_008542	GCG	2	6	495795	495800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13489	NC_008542	CG	3	6	495814	495819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13490	NC_008542	TCGT	2	8	495861	495868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13491	NC_008542	CGA	2	6	495894	495899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13492	NC_008542	A	6	6	495899	495904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13493	NC_008542	C	6	6	495949	495954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13494	NC_008542	GCA	2	6	496014	496019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13499	NC_008542	TAG	2	6	496585	496590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688475
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