MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 35965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_008392	CAT	2	6	1192529	1192534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361247
33502	NC_008392	GC	3	6	1192647	1192652	0 %	0 %	50 %	50 %	115361247
33503	NC_008392	GGC	2	6	1192666	1192671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33504	NC_008392	GCC	2	6	1192684	1192689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33505	NC_008392	CCT	2	6	1192713	1192718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115361248
33506	NC_008392	TGT	2	6	1192719	1192724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115361248
33507	NC_008392	TCT	2	6	1192758	1192763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115361248
33508	NC_008392	TGA	2	6	1192773	1192778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361248
33509	NC_008392	ATG	2	6	1192856	1192861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361248
33510	NC_008392	CG	3	6	1192919	1192924	0 %	0 %	50 %	50 %	115361248
33511	NC_008392	TGC	2	6	1192971	1192976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361248
33512	NC_008392	CGG	2	6	1192980	1192985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361248
33513	NC_008392	CGT	2	6	1193049	1193054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361248
33514	NC_008392	CAG	2	6	1193062	1193067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361248
33515	NC_008392	GCG	2	6	1193169	1193174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361248
33516	NC_008392	GCC	2	6	1193278	1193283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361248
33517	NC_008392	CCA	2	6	1193317	1193322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361248
33518	NC_008392	GACC	2	8	1193344	1193351	25 %	0 %	25 %	50 %	115361248
33519	NC_008392	CGA	2	6	1193361	1193366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361248
33520	NC_008392	GTC	2	6	1193593	1193598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33521	NC_008392	CCG	2	6	1193647	1193652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33522	NC_008392	AAATT	2	10	1193678	1193687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33523	NC_008392	CTG	2	6	1193693	1193698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33524	NC_008392	CGA	2	6	1193747	1193752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361249
33525	NC_008392	CA	4	8	1193762	1193769	50 %	0 %	0 %	50 %	115361249
33526	NC_008392	CGT	2	6	1193780	1193785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
33527	NC_008392	TCA	2	6	1193833	1193838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361249
33528	NC_008392	CAA	2	6	1193871	1193876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361249
33529	NC_008392	GA	3	6	1193911	1193916	50 %	0 %	50 %	0 %	115361249
33530	NC_008392	CGG	2	6	1193930	1193935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361249
33531	NC_008392	TGC	2	6	1194079	1194084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
33532	NC_008392	CGT	2	6	1194095	1194100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
33533	NC_008392	ATCA	2	8	1194135	1194142	50 %	25 %	0 %	25 %	115361249
33534	NC_008392	TTG	2	6	1194147	1194152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115361249
33535	NC_008392	CGG	2	6	1194178	1194183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361249
33536	NC_008392	CTG	2	6	1194186	1194191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
33537	NC_008392	CG	3	6	1194203	1194208	0 %	0 %	50 %	50 %	115361249
33538	NC_008392	GCT	2	6	1194212	1194217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
33539	NC_008392	T	6	6	1194217	1194222	0 %	100 %	0 %	0 %	115361249
33540	NC_008392	CG	4	8	1194281	1194288	0 %	0 %	50 %	50 %	115361249
33541	NC_008392	CGC	2	6	1194353	1194358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361249
33542	NC_008392	ACG	2	6	1194394	1194399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361249
33543	NC_008392	GCT	2	6	1194404	1194409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
33544	NC_008392	CAA	2	6	1194488	1194493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361249
33545	NC_008392	GC	3	6	1194542	1194547	0 %	0 %	50 %	50 %	115361250
33546	NC_008392	GGC	2	6	1194565	1194570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361250
33547	NC_008392	TCA	2	6	1194597	1194602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361250
33548	NC_008392	GCG	2	6	1194609	1194614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361250
33549	NC_008392	AGC	2	6	1194621	1194626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361250
33550	NC_008392	CGA	2	6	1194720	1194725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361250
33551	NC_008392	CAC	2	6	1194746	1194751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361250
33552	NC_008392	ATC	2	6	1194954	1194959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361250
33553	NC_008392	CGG	2	6	1195000	1195005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361250
33554	NC_008392	CCTC	2	8	1195047	1195054	0 %	25 %	0 %	75 %	115361250
33555	NC_008392	GAC	2	6	1195120	1195125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361250
33556	NC_008392	GGAA	2	8	1195146	1195153	50 %	0 %	50 %	0 %	115361250
33557	NC_008392	GGCGT	2	10	1195154	1195163	0 %	20 %	60 %	20 %	115361250
33558	NC_008392	GCCT	2	8	1195223	1195230	0 %	25 %	25 %	50 %	115361250
33559	NC_008392	TCG	2	6	1195274	1195279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361250
33560	NC_008392	GGC	2	6	1195299	1195304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33561	NC_008392	A	6	6	1195349	1195354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33562	NC_008392	TGC	2	6	1195355	1195360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33563	NC_008392	CG	4	8	1195530	1195537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33564	NC_008392	GAAAA	2	10	1195567	1195576	80 %	0 %	20 %	0 %	115361251
33565	NC_008392	AGC	2	6	1195709	1195714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361251
33566	NC_008392	ATCA	2	8	1195828	1195835	50 %	25 %	0 %	25 %	115361251
33567	NC_008392	GGC	2	6	1195860	1195865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361251
33568	NC_008392	GC	3	6	1195908	1195913	0 %	0 %	50 %	50 %	115361251
33569	NC_008392	ACG	2	6	1195918	1195923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361251
33570	NC_008392	GC	3	6	1195932	1195937	0 %	0 %	50 %	50 %	115361251
33571	NC_008392	TAC	2	6	1196038	1196043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361251
33572	NC_008392	GCC	2	6	1196049	1196054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361251
33573	NC_008392	GCC	2	6	1196107	1196112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361251
33574	NC_008392	TGA	2	6	1196159	1196164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361251
33575	NC_008392	CTG	2	6	1196203	1196208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361251
33576	NC_008392	GACCG	2	10	1196241	1196250	20 %	0 %	40 %	40 %	115361251
33577	NC_008392	GACC	2	8	1196298	1196305	25 %	0 %	25 %	50 %	115361251
33578	NC_008392	CG	3	6	1196329	1196334	0 %	0 %	50 %	50 %	115361251
33579	NC_008392	CG	3	6	1196346	1196351	0 %	0 %	50 %	50 %	115361251
33580	NC_008392	CGAC	2	8	1196357	1196364	25 %	0 %	25 %	50 %	115361251
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33583	NC_008392	CGA	2	6	1196541	1196546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361251
33584	NC_008392	TGC	3	9	1196549	1196557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361251
33585	NC_008392	TGG	2	6	1196603	1196608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361251
33586	NC_008392	CAA	2	6	1196640	1196645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361251
33587	NC_008392	CGAC	2	8	1196657	1196664	25 %	0 %	25 %	50 %	115361251
33588	NC_008392	GCA	2	6	1196712	1196717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361251
33589	NC_008392	TCC	2	6	1196784	1196789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115361252
33590	NC_008392	TCG	2	6	1196872	1196877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361252
33591	NC_008392	GCCG	2	8	1196922	1196929	0 %	0 %	50 %	50 %	115361252
33592	NC_008392	CGG	2	6	1196942	1196947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361252
33593	NC_008392	TCGA	2	8	1196958	1196965	25 %	25 %	25 %	25 %	115361252
33594	NC_008392	CG	3	6	1196989	1196994	0 %	0 %	50 %	50 %	115361252
33595	NC_008392	TCGAGG	2	12	1197022	1197033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115361252
33596	NC_008392	GGC	2	6	1197044	1197049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361252
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33598	NC_008392	CTT	2	6	1197192	1197197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115361252
33599	NC_008392	TGA	2	6	1197226	1197231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361252
33600	NC_008392	GAT	2	6	1197272	1197277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361252
33601	NC_008392	CAA	2	6	1197278	1197283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361252
33602	NC_008392	GCT	2	6	1197302	1197307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361252
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33604	NC_008392	CG	3	6	1197349	1197354	0 %	0 %	50 %	50 %	115361252
33605	NC_008392	CAA	2	6	1197383	1197388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361252
33606	NC_008392	TCA	2	6	1197391	1197396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361252
33607	NC_008392	TCGC	2	8	1197426	1197433	0 %	25 %	25 %	50 %	115361252
33608	NC_008392	ACC	3	9	1197563	1197571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361253
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33613	NC_008392	GGC	2	6	1197709	1197714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361253
33614	NC_008392	CAT	2	6	1197742	1197747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361253
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33737	NC_008392	CAT	2	6	1202557	1202562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361255
33738	NC_008392	CCGG	2	8	1202579	1202586	0 %	0 %	50 %	50 %	115361255
33739	NC_008392	GCG	2	6	1202609	1202614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361255
33740	NC_008392	CGT	2	6	1202647	1202652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361255
33741	NC_008392	GCC	2	6	1202686	1202691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361255
33742	NC_008392	GCA	2	6	1202749	1202754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361255
33743	NC_008392	GTC	2	6	1202801	1202806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361255
33744	NC_008392	CGAT	2	8	1202841	1202848	25 %	25 %	25 %	25 %	115361255
33745	NC_008392	GC	4	8	1203138	1203145	0 %	0 %	50 %	50 %	115361256
33746	NC_008392	GCC	2	6	1203167	1203172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361256
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33748	NC_008392	GCT	3	9	1203204	1203212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361256
33749	NC_008392	GCGG	2	8	1203216	1203223	0 %	0 %	75 %	25 %	115361256
33750	NC_008392	CGG	2	6	1203230	1203235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361256
33751	NC_008392	CGG	2	6	1203249	1203254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361256
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33753	NC_008392	ACGATG	2	12	1203429	1203440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115361257
33754	NC_008392	GAC	2	6	1203524	1203529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361257
33755	NC_008392	GCC	2	6	1203633	1203638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361257
33756	NC_008392	ATC	2	6	1203654	1203659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361257
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33780	NC_008392	AACC	2	8	1204928	1204935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33781	NC_008392	GTA	2	6	1204999	1205004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33842	NC_008392	CGA	2	6	1207827	1207832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361260
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33851	NC_008392	CGC	2	6	1208356	1208361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361261
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33853	NC_008392	ACG	2	6	1208424	1208429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361261
33854	NC_008392	CGC	2	6	1208443	1208448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361261
33855	NC_008392	T	7	7	1208522	1208528	0 %	100 %	0 %	0 %	115361262
33856	NC_008392	CGC	2	6	1208543	1208548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361262
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33861	NC_008392	ACC	2	6	1208827	1208832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361262
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33864	NC_008392	CAT	2	6	1208990	1208995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33865	NC_008392	GCA	2	6	1209015	1209020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33882	NC_008392	GTC	2	6	1209673	1209678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33951	NC_008392	ACACG	2	10	1212314	1212323	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33952	NC_008392	CGC	2	6	1212382	1212387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361266
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33960	NC_008392	GCACC	2	10	1212822	1212831	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33961	NC_008392	GC	3	6	1212843	1212848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33962	NC_008392	CGT	2	6	1212883	1212888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33965	NC_008392	CCGTC	2	10	1213002	1213011	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33966	NC_008392	GAA	2	6	1213138	1213143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115361267
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33968	NC_008392	CGG	2	6	1213284	1213289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361267
33969	NC_008392	CAT	2	6	1213309	1213314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361267
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33971	NC_008392	AGGAAG	2	12	1213338	1213349	50 %	0 %	50 %	0 %	115361267
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