MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 35965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_008392	GCG	2	6	1153004	1153009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361220
32502	NC_008392	GCC	2	6	1153068	1153073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361220
32503	NC_008392	CAG	2	6	1153101	1153106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361220
32504	NC_008392	C	6	6	1153139	1153144	0 %	0 %	0 %	100 %	115361220
32505	NC_008392	CG	3	6	1153182	1153187	0 %	0 %	50 %	50 %	115361220
32506	NC_008392	CAG	2	6	1153206	1153211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361220
32507	NC_008392	AGC	2	6	1153234	1153239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361220
32508	NC_008392	CGC	2	6	1153328	1153333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32509	NC_008392	GCG	2	6	1153418	1153423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361221
32510	NC_008392	GCC	2	6	1153452	1153457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361221
32511	NC_008392	GCAG	2	8	1153481	1153488	25 %	0 %	50 %	25 %	115361221
32512	NC_008392	TGC	2	6	1153512	1153517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32513	NC_008392	TCGG	2	8	1153519	1153526	0 %	25 %	50 %	25 %	115361221
32514	NC_008392	GAC	2	6	1153554	1153559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32515	NC_008392	ATC	2	6	1153570	1153575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361221
32516	NC_008392	GGCCGC	2	12	1153577	1153588	0 %	0 %	50 %	50 %	115361221
32517	NC_008392	CAG	2	6	1153641	1153646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32518	NC_008392	CGA	2	6	1153688	1153693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32519	NC_008392	CCA	2	6	1153715	1153720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361221
32520	NC_008392	GC	3	6	1153754	1153759	0 %	0 %	50 %	50 %	115361221
32521	NC_008392	GGC	2	6	1153762	1153767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361221
32522	NC_008392	ACC	3	9	1153792	1153800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361221
32523	NC_008392	GCC	3	9	1153812	1153820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361221
32524	NC_008392	ACA	2	6	1153832	1153837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361221
32525	NC_008392	CCGG	2	8	1153847	1153854	0 %	0 %	50 %	50 %	115361221
32526	NC_008392	TCG	2	6	1153912	1153917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32527	NC_008392	CGA	2	6	1154015	1154020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32528	NC_008392	GCC	2	6	1154026	1154031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361221
32529	NC_008392	GCC	2	6	1154172	1154177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361221
32530	NC_008392	GCG	2	6	1154206	1154211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361221
32531	NC_008392	GCCG	2	8	1154217	1154224	0 %	0 %	50 %	50 %	115361221
32532	NC_008392	TCG	2	6	1154258	1154263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32533	NC_008392	CGC	2	6	1154315	1154320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361221
32534	NC_008392	CGA	2	6	1154387	1154392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32535	NC_008392	CTG	2	6	1154427	1154432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32536	NC_008392	GAC	2	6	1154443	1154448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32537	NC_008392	CGAGCG	2	12	1154492	1154503	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115361221
32538	NC_008392	GACA	2	8	1154515	1154522	50 %	0 %	25 %	25 %	115361221
32539	NC_008392	CGCGTA	2	12	1154549	1154560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115361221
32540	NC_008392	TTCGA	2	10	1154614	1154623	20 %	40 %	20 %	20 %	115361221
32541	NC_008392	TCC	2	6	1154739	1154744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32542	NC_008392	CCG	2	6	1154881	1154886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361222
32543	NC_008392	ATC	2	6	1154968	1154973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361222
32544	NC_008392	CGGA	2	8	1154983	1154990	25 %	0 %	50 %	25 %	115361222
32545	NC_008392	CAT	2	6	1155106	1155111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361222
32546	NC_008392	GTC	2	6	1155133	1155138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361222
32547	NC_008392	CGC	2	6	1155192	1155197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361222
32548	NC_008392	ATGC	2	8	1155244	1155251	25 %	25 %	25 %	25 %	115361222
32549	NC_008392	ACC	2	6	1155278	1155283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361222
32550	NC_008392	GAA	2	6	1155316	1155321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115361222
32551	NC_008392	TCG	2	6	1155347	1155352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361222
32552	NC_008392	GC	3	6	1155359	1155364	0 %	0 %	50 %	50 %	115361222
32553	NC_008392	TCG	2	6	1155438	1155443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361222
32554	NC_008392	GCA	2	6	1155450	1155455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361222
32555	NC_008392	TGCG	2	8	1155464	1155471	0 %	25 %	50 %	25 %	115361222
32556	NC_008392	TGG	2	6	1155516	1155521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361222
32557	NC_008392	CGT	2	6	1155612	1155617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361222
32558	NC_008392	CGT	2	6	1155702	1155707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361222
32559	NC_008392	CG	3	6	1155813	1155818	0 %	0 %	50 %	50 %	115361222
32560	NC_008392	CG	3	6	1155886	1155891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32561	NC_008392	CGA	2	6	1155904	1155909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32562	NC_008392	CCGG	2	8	1155918	1155925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32563	NC_008392	GAT	2	6	1156005	1156010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361223
32564	NC_008392	GTC	2	6	1156084	1156089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361223
32565	NC_008392	CG	3	6	1156134	1156139	0 %	0 %	50 %	50 %	115361223
32566	NC_008392	CGCA	2	8	1156215	1156222	25 %	0 %	25 %	50 %	115361223
32567	NC_008392	CAG	2	6	1156233	1156238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361223
32568	NC_008392	TGT	2	6	1156253	1156258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115361223
32569	NC_008392	GCC	2	6	1156278	1156283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361223
32570	NC_008392	GTGCA	2	10	1156290	1156299	20 %	20 %	40 %	20 %	115361223
32571	NC_008392	CGA	2	6	1156301	1156306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361223
32572	NC_008392	GTC	2	6	1156314	1156319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361223
32573	NC_008392	GCG	2	6	1156360	1156365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361223
32574	NC_008392	CGGG	2	8	1156405	1156412	0 %	0 %	75 %	25 %	115361223
32575	NC_008392	CG	3	6	1156534	1156539	0 %	0 %	50 %	50 %	115361223
32576	NC_008392	GGC	2	6	1156553	1156558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361223
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32578	NC_008392	CGG	2	6	1156628	1156633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361223
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32580	NC_008392	TGC	2	6	1156697	1156702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361223
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32582	NC_008392	TTG	2	6	1156771	1156776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115361223
32583	NC_008392	TTC	2	6	1156796	1156801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115361223
32584	NC_008392	GA	3	6	1156807	1156812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32585	NC_008392	GC	4	8	1156831	1156838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32586	NC_008392	ACG	2	6	1156893	1156898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32587	NC_008392	GC	3	6	1156941	1156946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32588	NC_008392	ATGT	2	8	1157007	1157014	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32589	NC_008392	CG	3	6	1157030	1157035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32590	NC_008392	CACAT	2	10	1157068	1157077	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32591	NC_008392	ATCC	2	8	1157091	1157098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32592	NC_008392	GC	4	8	1157253	1157260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32593	NC_008392	CGGG	2	8	1157271	1157278	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32594	NC_008392	CCGT	2	8	1157436	1157443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32595	NC_008392	CGC	2	6	1157457	1157462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32596	NC_008392	CG	4	8	1157470	1157477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32597	NC_008392	TCCGG	2	10	1157490	1157499	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32598	NC_008392	GC	3	6	1157573	1157578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32599	NC_008392	TGC	2	6	1157816	1157821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32600	NC_008392	GCT	2	6	1157906	1157911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361224
32601	NC_008392	GCC	2	6	1157924	1157929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361224
32602	NC_008392	GGC	2	6	1157932	1157937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361224
32603	NC_008392	CGT	2	6	1157943	1157948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361224
32604	NC_008392	ACC	2	6	1158044	1158049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361224
32605	NC_008392	CG	4	8	1158069	1158076	0 %	0 %	50 %	50 %	115361224
32606	NC_008392	CGG	2	6	1158097	1158102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361224
32607	NC_008392	CGG	2	6	1158138	1158143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361224
32608	NC_008392	CGC	2	6	1158187	1158192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361224
32609	NC_008392	CCA	2	6	1158210	1158215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361224
32610	NC_008392	GCCCG	2	10	1158233	1158242	0 %	0 %	40 %	60 %	115361224
32611	NC_008392	TCG	2	6	1158279	1158284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361224
32612	NC_008392	ATC	2	6	1158291	1158296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361224
32613	NC_008392	GCC	2	6	1158310	1158315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361224
32614	NC_008392	CGA	2	6	1158318	1158323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361224
32615	NC_008392	CGGCGC	2	12	1158325	1158336	0 %	0 %	50 %	50 %	115361224
32616	NC_008392	GTC	2	6	1158359	1158364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361224
32617	NC_008392	GC	3	6	1158449	1158454	0 %	0 %	50 %	50 %	115361224
32618	NC_008392	CTG	2	6	1158458	1158463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361224
32619	NC_008392	TCGC	2	8	1158474	1158481	0 %	25 %	25 %	50 %	115361224
32620	NC_008392	GCA	2	6	1158525	1158530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361224
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32643	NC_008392	CCATC	2	10	1159204	1159213	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32644	NC_008392	TGT	2	6	1159219	1159224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32646	NC_008392	CGC	2	6	1159306	1159311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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32648	NC_008392	CTT	2	6	1159364	1159369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32650	NC_008392	TCGA	2	8	1159443	1159450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32651	NC_008392	CGCA	2	8	1159537	1159544	25 %	0 %	25 %	50 %	115361225
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32673	NC_008392	GC	3	6	1160327	1160332	0 %	0 %	50 %	50 %	115361225
32674	NC_008392	TGG	2	6	1160338	1160343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361225
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32682	NC_008392	CCGCC	2	10	1160562	1160571	0 %	0 %	20 %	80 %	115361225
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32685	NC_008392	A	7	7	1160689	1160695	100 %	0 %	0 %	0 %	115361225
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32708	NC_008392	TGTGC	2	10	1161450	1161459	0 %	40 %	40 %	20 %	115361226
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32713	NC_008392	GAAA	2	8	1161732	1161739	75 %	0 %	25 %	0 %	115361226
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32715	NC_008392	GAC	2	6	1161795	1161800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361226
32716	NC_008392	CGC	2	6	1161882	1161887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361226
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32718	NC_008392	CTC	2	6	1161967	1161972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115361226
32719	NC_008392	CGA	2	6	1161977	1161982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361226
32720	NC_008392	GCGA	2	8	1161983	1161990	25 %	0 %	50 %	25 %	115361226
32721	NC_008392	CGA	2	6	1162080	1162085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32722	NC_008392	GA	4	8	1162108	1162115	50 %	0 %	50 %	0 %	115361227
32723	NC_008392	TG	3	6	1162127	1162132	0 %	50 %	50 %	0 %	115361227
32724	NC_008392	CACCT	2	10	1162232	1162241	20 %	20 %	0 %	60 %	115361227
32725	NC_008392	ACGC	2	8	1162275	1162282	25 %	0 %	25 %	50 %	115361227
32726	NC_008392	CG	4	8	1162305	1162312	0 %	0 %	50 %	50 %	115361227
32727	NC_008392	GAC	2	6	1162325	1162330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361227
32728	NC_008392	CTG	2	6	1162352	1162357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361227
32729	NC_008392	TCA	2	6	1162365	1162370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361227
32730	NC_008392	CGA	2	6	1162386	1162391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361227
32731	NC_008392	GCCG	2	8	1162416	1162423	0 %	0 %	50 %	50 %	115361227
32732	NC_008392	TGG	2	6	1162433	1162438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361227
32733	NC_008392	CGC	2	6	1162447	1162452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361227
32734	NC_008392	CGA	3	9	1162540	1162548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361227
32735	NC_008392	GCG	2	6	1162641	1162646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361227
32736	NC_008392	ATC	2	6	1162667	1162672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361227
32737	NC_008392	CTG	2	6	1162763	1162768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361227
32738	NC_008392	GGC	2	6	1162771	1162776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361227
32739	NC_008392	GC	3	6	1162788	1162793	0 %	0 %	50 %	50 %	115361227
32740	NC_008392	CAT	3	9	1162849	1162857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361227
32741	NC_008392	CGA	2	6	1162858	1162863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361227
32742	NC_008392	GGT	2	6	1162878	1162883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361227
32743	NC_008392	CCG	2	6	1162907	1162912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361227
32744	NC_008392	GCG	2	6	1162935	1162940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361227
32745	NC_008392	GC	4	8	1162997	1163004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32746	NC_008392	GCCG	2	8	1163046	1163053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32747	NC_008392	ACGA	2	8	1163078	1163085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32748	NC_008392	CGAT	2	8	1163169	1163176	25 %	25 %	25 %	25 %	115361228
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32751	NC_008392	ACA	2	6	1163232	1163237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361228
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32755	NC_008392	CCG	2	6	1163316	1163321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361228
32756	NC_008392	TCGA	3	12	1163337	1163348	25 %	25 %	25 %	25 %	115361228
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32764	NC_008392	CTGG	2	8	1163578	1163585	0 %	25 %	50 %	25 %	115361228
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32774	NC_008392	AGG	2	6	1164066	1164071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115361228
32775	NC_008392	CGA	2	6	1164099	1164104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361228
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32789	NC_008392	GCG	2	6	1164595	1164600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361228
32790	NC_008392	GAA	2	6	1164638	1164643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115361228
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32814	NC_008392	CGA	2	6	1165456	1165461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361228
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32835	NC_008392	TCG	2	6	1166618	1166623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361229
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32837	NC_008392	GTCGT	2	10	1166707	1166716	0 %	40 %	40 %	20 %	115361229
32838	NC_008392	TGC	2	6	1166717	1166722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361229
32839	NC_008392	GCG	2	6	1166736	1166741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361229
32840	NC_008392	CG	3	6	1166740	1166745	0 %	0 %	50 %	50 %	115361229
32841	NC_008392	GCA	2	6	1166752	1166757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361229
32842	NC_008392	CG	3	6	1166777	1166782	0 %	0 %	50 %	50 %	115361229
32843	NC_008392	GCG	2	6	1166800	1166805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361229
32844	NC_008392	ACG	2	6	1166808	1166813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361229
32845	NC_008392	GGCACG	2	12	1166824	1166835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115361229
32846	NC_008392	GTC	2	6	1166840	1166845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361229
32847	NC_008392	CCG	2	6	1166892	1166897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361230
32848	NC_008392	GAC	2	6	1166904	1166909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361230
32849	NC_008392	CCG	2	6	1167027	1167032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361230
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32970	NC_008392	GCC	2	6	1171826	1171831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361233
32971	NC_008392	CCG	2	6	1171873	1171878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361233
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