MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 1

Total Repeats: 104427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008390	TCA	2	6	352465	352470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350366
10002	NC_008390	CCGT	2	8	352481	352488	0 %	25 %	25 %	50 %	115350366
10003	NC_008390	AACTCG	2	12	352522	352533	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115350366
10004	NC_008390	GC	3	6	352591	352596	0 %	0 %	50 %	50 %	115350367
10005	NC_008390	TCG	2	6	352664	352669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10006	NC_008390	ACG	2	6	352688	352693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10007	NC_008390	GC	3	6	352720	352725	0 %	0 %	50 %	50 %	115350367
10008	NC_008390	CGC	2	6	352734	352739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350367
10009	NC_008390	TGC	2	6	352764	352769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10010	NC_008390	CTG	2	6	352823	352828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10011	NC_008390	GC	3	6	352834	352839	0 %	0 %	50 %	50 %	115350367
10012	NC_008390	GAC	2	6	352849	352854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10013	NC_008390	TCG	2	6	352857	352862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10014	NC_008390	CGG	3	9	352867	352875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350367
10015	NC_008390	CGC	3	9	352900	352908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350367
10016	NC_008390	GCG	2	6	352920	352925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350367
10017	NC_008390	CGA	2	6	352944	352949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10018	NC_008390	GCT	2	6	352951	352956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10019	NC_008390	TCG	2	6	352970	352975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10020	NC_008390	CGG	2	6	352978	352983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350367
10021	NC_008390	ATCA	2	8	352994	353001	50 %	25 %	0 %	25 %	115350367
10022	NC_008390	GC	3	6	353064	353069	0 %	0 %	50 %	50 %	115350367
10023	NC_008390	GGC	2	6	353095	353100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350367
10024	NC_008390	TCA	2	6	353115	353120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350367
10025	NC_008390	TTC	2	6	353147	353152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350367
10026	NC_008390	CCG	2	6	353185	353190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350367
10027	NC_008390	GCCG	2	8	353194	353201	0 %	0 %	50 %	50 %	115350367
10028	NC_008390	CGA	2	6	353257	353262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10029	NC_008390	GGC	2	6	353270	353275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350367
10030	NC_008390	GC	3	6	353278	353283	0 %	0 %	50 %	50 %	115350367
10031	NC_008390	GGC	2	6	353383	353388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350367
10032	NC_008390	CCT	2	6	353410	353415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115350367
10033	NC_008390	GCC	2	6	353453	353458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350367
10034	NC_008390	GC	3	6	353495	353500	0 %	0 %	50 %	50 %	115350367
10035	NC_008390	AAG	2	6	353525	353530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350367
10036	NC_008390	CTG	2	6	353558	353563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10037	NC_008390	CGA	2	6	353599	353604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10038	NC_008390	GAC	2	6	353629	353634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350367
10039	NC_008390	CAG	2	6	353697	353702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350368
10040	NC_008390	GCC	2	6	353748	353753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350368
10041	NC_008390	GGC	2	6	353760	353765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350368
10042	NC_008390	CG	3	6	353810	353815	0 %	0 %	50 %	50 %	115350368
10043	NC_008390	GCC	3	9	353816	353824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350368
10044	NC_008390	CGC	2	6	353834	353839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350368
10045	NC_008390	CGG	2	6	353840	353845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350368
10046	NC_008390	GCGACC	2	12	353864	353875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115350368
10047	NC_008390	CG	3	6	353991	353996	0 %	0 %	50 %	50 %	115350368
10048	NC_008390	CG	3	6	354003	354008	0 %	0 %	50 %	50 %	115350368
10049	NC_008390	TCG	2	6	354032	354037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350368
10050	NC_008390	TCGC	2	8	354046	354053	0 %	25 %	25 %	50 %	115350368
10051	NC_008390	ATGC	3	12	354104	354115	25 %	25 %	25 %	25 %	115350368
10052	NC_008390	CGG	2	6	354123	354128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350368
10053	NC_008390	CGT	2	6	354156	354161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350368
10054	NC_008390	CGA	2	6	354162	354167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350368
10055	NC_008390	GAG	2	6	354172	354177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115350368
10056	NC_008390	CG	3	6	354218	354223	0 %	0 %	50 %	50 %	115350368
10057	NC_008390	CG	3	6	354245	354250	0 %	0 %	50 %	50 %	115350368
10058	NC_008390	GC	3	6	354256	354261	0 %	0 %	50 %	50 %	115350368
10059	NC_008390	GC	3	6	354269	354274	0 %	0 %	50 %	50 %	115350368
10060	NC_008390	ACA	2	6	354350	354355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115350368
10061	NC_008390	CGA	2	6	354366	354371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350368
10062	NC_008390	TCA	2	6	354389	354394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350368
10063	NC_008390	CGC	2	6	354475	354480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350368
10064	NC_008390	CAT	2	6	354504	354509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350368
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10066	NC_008390	CGA	2	6	354534	354539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350368
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10069	NC_008390	GCC	2	6	354597	354602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350368
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10071	NC_008390	CGC	2	6	354627	354632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350368
10072	NC_008390	GCC	3	9	354637	354645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350368
10073	NC_008390	CGT	2	6	354717	354722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350368
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10079	NC_008390	GACC	2	8	354834	354841	25 %	0 %	25 %	50 %	115350368
10080	NC_008390	TCG	2	6	354872	354877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350368
10081	NC_008390	ACTG	2	8	354887	354894	25 %	25 %	25 %	25 %	115350368
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10084	NC_008390	GC	3	6	355029	355034	0 %	0 %	50 %	50 %	115350369
10085	NC_008390	GCA	2	6	355048	355053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350369
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10087	NC_008390	CGC	2	6	355063	355068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350369
10088	NC_008390	GGCA	2	8	355207	355214	25 %	0 %	50 %	25 %	115350369
10089	NC_008390	CGC	2	6	355216	355221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350369
10090	NC_008390	TCC	2	6	355248	355253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115350369
10091	NC_008390	CGA	2	6	355275	355280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350369
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10103	NC_008390	GCA	2	6	355684	355689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350369
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10105	NC_008390	GCG	2	6	355782	355787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350369
10106	NC_008390	GAC	2	6	355801	355806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350369
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10108	NC_008390	ATG	2	6	355865	355870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350369
10109	NC_008390	ACG	2	6	355875	355880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350369
10110	NC_008390	ATC	2	6	355910	355915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350369
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10112	NC_008390	CCTCG	2	10	355990	355999	0 %	20 %	20 %	60 %	115350369
10113	NC_008390	CCG	2	6	356000	356005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350369
10114	NC_008390	CGC	2	6	356008	356013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350369
10115	NC_008390	ACG	2	6	356048	356053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350369
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10118	NC_008390	CCG	2	6	356138	356143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350369
10119	NC_008390	GTC	2	6	356195	356200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350369
10120	NC_008390	AGA	2	6	356229	356234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350369
10121	NC_008390	GCC	2	6	356261	356266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350369
10122	NC_008390	CG	3	6	356268	356273	0 %	0 %	50 %	50 %	115350369
10123	NC_008390	CGA	2	6	356275	356280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350369
10124	NC_008390	GCT	2	6	356281	356286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350369
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10127	NC_008390	GCC	3	9	356339	356347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10128	NC_008390	GC	3	6	356356	356361	0 %	0 %	50 %	50 %	115350370
10129	NC_008390	CGG	2	6	356366	356371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350370
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10131	NC_008390	CTG	2	6	356441	356446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
10132	NC_008390	CTG	2	6	356453	356458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
10133	NC_008390	CGC	2	6	356463	356468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350370
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10137	NC_008390	TCG	2	6	356565	356570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
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10139	NC_008390	TCG	2	6	356667	356672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
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10143	NC_008390	GCT	2	6	356734	356739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
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10146	NC_008390	GGC	2	6	356837	356842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350370
10147	NC_008390	TCG	2	6	356886	356891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
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10150	NC_008390	GGC	3	9	356977	356985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350370
10151	NC_008390	GCCGG	2	10	356996	357005	0 %	0 %	60 %	40 %	115350370
10152	NC_008390	GCG	2	6	357007	357012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350370
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10154	NC_008390	TGC	2	6	357027	357032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
10155	NC_008390	GCT	2	6	357034	357039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
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10162	NC_008390	GTCG	2	8	357214	357221	0 %	25 %	50 %	25 %	115350370
10163	NC_008390	TGA	2	6	357225	357230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350370
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10165	NC_008390	TCG	2	6	357267	357272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350370
10166	NC_008390	CGT	2	6	357348	357353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350371
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10194	NC_008390	TCG	2	6	358118	358123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350371
10195	NC_008390	ACGG	2	8	358140	358147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10196	NC_008390	ACG	2	6	358206	358211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350372
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10199	NC_008390	TCG	2	6	358263	358268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350372
10200	NC_008390	GCT	2	6	358303	358308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350372
10201	NC_008390	GAT	2	6	358312	358317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350372
10202	NC_008390	GACG	2	8	358336	358343	25 %	0 %	50 %	25 %	115350372
10203	NC_008390	GC	3	6	358489	358494	0 %	0 %	50 %	50 %	115350372
10204	NC_008390	GGCCGC	2	12	358513	358524	0 %	0 %	50 %	50 %	115350372
10205	NC_008390	GCT	2	6	358546	358551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350372
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10213	NC_008390	TCG	2	6	358857	358862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350372
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10219	NC_008390	CG	4	8	359170	359177	0 %	0 %	50 %	50 %	115350372
10220	NC_008390	GCG	2	6	359192	359197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350372
10221	NC_008390	TTC	2	6	359219	359224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350372
10222	NC_008390	GC	3	6	359242	359247	0 %	0 %	50 %	50 %	115350372
10223	NC_008390	CTG	2	6	359266	359271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10224	NC_008390	CG	3	6	359311	359316	0 %	0 %	50 %	50 %	115350373
10225	NC_008390	CGG	3	9	359330	359338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350373
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10227	NC_008390	CGA	2	6	359372	359377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350373
10228	NC_008390	GC	3	6	359380	359385	0 %	0 %	50 %	50 %	115350373
10229	NC_008390	CCG	2	6	359425	359430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350373
10230	NC_008390	ACG	2	6	359431	359436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350373
10231	NC_008390	CTG	2	6	359445	359450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350373
10232	NC_008390	ACG	2	6	359452	359457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350373
10233	NC_008390	CGG	3	9	359491	359499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350373
10234	NC_008390	CG	3	6	359549	359554	0 %	0 %	50 %	50 %	115350373
10235	NC_008390	GCG	4	12	359586	359597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350373
10236	NC_008390	TGC	2	6	359598	359603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350373
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10356	NC_008390	GGC	2	6	363935	363940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350376
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10390	NC_008390	TCG	3	9	365637	365645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350376
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10408	NC_008390	CGGC	2	8	366165	366172	0 %	0 %	50 %	50 %	115350376
10409	NC_008390	TCG	2	6	366216	366221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350376
10410	NC_008390	CGGG	2	8	366255	366262	0 %	0 %	75 %	25 %	115350376
10411	NC_008390	ATC	3	9	366266	366274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350376
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10432	NC_008390	GC	4	8	366790	366797	0 %	0 %	50 %	50 %	115350376
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10435	NC_008390	GAAG	2	8	366826	366833	50 %	0 %	50 %	0 %	115350376
10436	NC_008390	GCC	2	6	366839	366844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350376
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10438	NC_008390	CG	4	8	366871	366878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10439	NC_008390	CG	3	6	366888	366893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10440	NC_008390	AGA	2	6	366920	366925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10441	NC_008390	GGCAA	2	10	366936	366945	40 %	0 %	40 %	20 %	162389967
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10443	NC_008390	CG	3	6	366997	367002	0 %	0 %	50 %	50 %	162389967
10444	NC_008390	TCG	2	6	367021	367026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10445	NC_008390	GACGCG	2	12	367038	367049	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	162389967
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10447	NC_008390	CAA	2	6	367094	367099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162389967
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10451	NC_008390	CAA	2	6	367190	367195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162389967
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10458	NC_008390	GCA	2	6	367409	367414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10459	NC_008390	CG	3	6	367418	367423	0 %	0 %	50 %	50 %	162389967
10460	NC_008390	ACG	2	6	367432	367437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162389967
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10462	NC_008390	CGG	2	6	367466	367471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162389967
10463	NC_008390	CTG	2	6	367473	367478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162389967
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10465	NC_008390	AGC	2	6	367639	367644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162389967
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10467	NC_008390	CGC	2	6	367690	367695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162389967
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10470	NC_008390	TCG	2	6	367789	367794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10471	NC_008390	GCT	2	6	367799	367804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10472	NC_008390	CGTGAT	2	12	367820	367831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	162389967
10473	NC_008390	CGG	3	9	367832	367840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162389967
10474	NC_008390	GCT	2	6	367907	367912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10475	NC_008390	GCC	2	6	367919	367924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162389967
10476	NC_008390	CGT	3	9	367978	367986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10477	NC_008390	GAA	2	6	367992	367997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162389967
10478	NC_008390	CGA	2	6	368023	368028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10479	NC_008390	TGC	2	6	368146	368151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10480	NC_008390	GC	3	6	368214	368219	0 %	0 %	50 %	50 %	162389967
10481	NC_008390	CG	3	6	368225	368230	0 %	0 %	50 %	50 %	162389967
10482	NC_008390	TAC	2	6	368256	368261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162389967
10483	NC_008390	GTCG	2	8	368264	368271	0 %	25 %	50 %	25 %	162389967
10484	NC_008390	CGGC	2	8	368284	368291	0 %	0 %	50 %	50 %	162389967
10485	NC_008390	TCG	2	6	368314	368319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162389967
10486	NC_008390	GCC	2	6	368338	368343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162389967
10487	NC_008390	GC	4	8	368347	368354	0 %	0 %	50 %	50 %	162389967
10488	NC_008390	AGC	2	6	368424	368429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10489	NC_008390	T	7	7	368453	368459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10490	NC_008390	GCGTCG	2	12	368530	368541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115350378
10491	NC_008390	ATCG	2	8	368597	368604	25 %	25 %	25 %	25 %	115350378
10492	NC_008390	TCCG	2	8	368618	368625	0 %	25 %	25 %	50 %	115350378
10493	NC_008390	ACCA	2	8	368647	368654	50 %	0 %	0 %	50 %	115350378
10494	NC_008390	CGT	2	6	368695	368700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350378
10495	NC_008390	CGT	2	6	368779	368784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350378
10496	NC_008390	CGG	2	6	368836	368841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350378
10497	NC_008390	TACGA	2	10	368861	368870	40 %	20 %	20 %	20 %	115350378
10498	NC_008390	AGC	2	6	368882	368887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350378
10499	NC_008390	CCT	2	6	369055	369060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115350379
10500	NC_008390	TC	3	6	369114	369119	0 %	50 %	0 %	50 %	115350379

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