MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brucella abortus bv. 1 str. 9-941 chromosome I

Total Repeats: 43685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_006932	T	6	6	2114849	2114854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43502	NC_006932	CAT	2	6	2114953	2114958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291011
43503	NC_006932	ACT	2	6	2114965	2114970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291011
43504	NC_006932	GAAG	2	8	2115076	2115083	50 %	0 %	50 %	0 %	62291011
43505	NC_006932	ATCGAG	2	12	2115101	2115112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	62291011
43506	NC_006932	GC	3	6	2115162	2115167	0 %	0 %	50 %	50 %	62291011
43507	NC_006932	CCA	2	6	2115318	2115323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62291011
43508	NC_006932	CGACC	2	10	2115337	2115346	20 %	0 %	20 %	60 %	62291011
43509	NC_006932	CGG	2	6	2115426	2115431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291011
43510	NC_006932	GAA	2	6	2115448	2115453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62291011
43511	NC_006932	TGG	2	6	2115612	2115617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62291011
43512	NC_006932	CGA	2	6	2115676	2115681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291011
43513	NC_006932	ATC	2	6	2115737	2115742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43514	NC_006932	A	6	6	2115743	2115748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_006932	GTCA	2	8	2115780	2115787	25 %	25 %	25 %	25 %	62291012
43516	NC_006932	C	6	6	2115807	2115812	0 %	0 %	0 %	100 %	62291012
43517	NC_006932	CGC	2	6	2115843	2115848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291012
43518	NC_006932	CAC	2	6	2115863	2115868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62291012
43519	NC_006932	CGA	2	6	2115894	2115899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291012
43520	NC_006932	CGCC	2	8	2115924	2115931	0 %	0 %	25 %	75 %	62291012
43521	NC_006932	GCC	2	6	2115938	2115943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291012
43522	NC_006932	AAG	2	6	2116018	2116023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62291012
43523	NC_006932	GCC	2	6	2116068	2116073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291012
43524	NC_006932	GCCT	2	8	2116108	2116115	0 %	25 %	25 %	50 %	62291012
43525	NC_006932	CGG	2	6	2116233	2116238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291012
43526	NC_006932	TTTC	2	8	2116437	2116444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43527	NC_006932	TCTTTG	2	12	2116456	2116467	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43528	NC_006932	CGC	2	6	2116471	2116476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43529	NC_006932	AGG	2	6	2116530	2116535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43530	NC_006932	GGC	2	6	2116638	2116643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43531	NC_006932	AAG	3	9	2116686	2116694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62291013
43532	NC_006932	AGCC	2	8	2116791	2116798	25 %	0 %	25 %	50 %	62291013
43533	NC_006932	ATC	2	6	2116803	2116808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291013
43534	NC_006932	GAAG	2	8	2116817	2116824	50 %	0 %	50 %	0 %	62291013
43535	NC_006932	CAGG	2	8	2116878	2116885	25 %	0 %	50 %	25 %	62291013
43536	NC_006932	ATA	2	6	2116927	2116932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	62291013
43537	NC_006932	GCC	3	9	2116944	2116952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291013
43538	NC_006932	GCT	2	6	2117021	2117026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62291013
43539	NC_006932	GCCGC	2	10	2117036	2117045	0 %	0 %	40 %	60 %	62291013
43540	NC_006932	TCA	2	6	2117065	2117070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291013
43541	NC_006932	CGC	2	6	2117121	2117126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291013
43542	NC_006932	CGG	2	6	2117173	2117178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291013
43543	NC_006932	CGC	2	6	2117184	2117189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291013
43544	NC_006932	CAT	2	6	2117309	2117314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291013
43545	NC_006932	CCGC	2	8	2117359	2117366	0 %	0 %	25 %	75 %	62291013
43546	NC_006932	GC	3	6	2117409	2117414	0 %	0 %	50 %	50 %	62291013
43547	NC_006932	ATC	2	6	2117421	2117426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291013
43548	NC_006932	AGCC	2	8	2117500	2117507	25 %	0 %	25 %	50 %	62291013
43549	NC_006932	CTG	2	6	2117520	2117525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62291013
43550	NC_006932	GGT	2	6	2117546	2117551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62291013
43551	NC_006932	TCA	3	9	2117611	2117619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291013
43552	NC_006932	TGC	2	6	2117662	2117667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62291013
43553	NC_006932	GCA	2	6	2117714	2117719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291014
43554	NC_006932	ACG	2	6	2117731	2117736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291014
43555	NC_006932	GCC	2	6	2117779	2117784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291014
43556	NC_006932	TCG	2	6	2117791	2117796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62291014
43557	NC_006932	GTTC	2	8	2117807	2117814	0 %	50 %	25 %	25 %	62291014
43558	NC_006932	CG	4	8	2117883	2117890	0 %	0 %	50 %	50 %	62291014
43559	NC_006932	CCA	2	6	2117995	2118000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62291014
43560	NC_006932	AGC	2	6	2118046	2118051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291014
43561	NC_006932	ATC	2	6	2118060	2118065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291014
43562	NC_006932	TCG	2	6	2118091	2118096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62291014
43563	NC_006932	CGA	2	6	2118131	2118136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291014
43564	NC_006932	ATG	2	6	2118144	2118149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62291014
43565	NC_006932	GCC	2	6	2118198	2118203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291014
43566	NC_006932	CAG	2	6	2118210	2118215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291014
43567	NC_006932	CGG	2	6	2118219	2118224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291014
43568	NC_006932	GGC	2	6	2118276	2118281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291014
43569	NC_006932	CCG	2	6	2118326	2118331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291014
43570	NC_006932	GAA	2	6	2118336	2118341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62291014
43571	NC_006932	GCA	2	6	2118343	2118348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291014
43572	NC_006932	GGCTT	2	10	2118397	2118406	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43573	NC_006932	AGA	2	6	2118566	2118571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	62291015
43574	NC_006932	CGC	2	6	2118578	2118583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291015
43575	NC_006932	CTG	2	6	2118636	2118641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62291015
43576	NC_006932	GCC	2	6	2118729	2118734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291015
43577	NC_006932	TGGC	2	8	2118811	2118818	0 %	25 %	50 %	25 %	62291015
43578	NC_006932	CGC	2	6	2118830	2118835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291015
43579	NC_006932	TG	3	6	2118915	2118920	0 %	50 %	50 %	0 %	62291015
43580	NC_006932	ACG	2	6	2118964	2118969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291015
43581	NC_006932	GCC	2	6	2119009	2119014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291015
43582	NC_006932	ATC	2	6	2119102	2119107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291015
43583	NC_006932	GC	3	6	2119141	2119146	0 %	0 %	50 %	50 %	62291015
43584	NC_006932	CGA	2	6	2119151	2119156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291015
43585	NC_006932	GGC	2	6	2119256	2119261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291015
43586	NC_006932	ATC	2	6	2119314	2119319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291016
43587	NC_006932	TTA	2	6	2119366	2119371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	62291016
43588	NC_006932	TCA	2	6	2119392	2119397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	62291016
43589	NC_006932	GC	3	6	2119438	2119443	0 %	0 %	50 %	50 %	62291016
43590	NC_006932	GCG	2	6	2119498	2119503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291016
43591	NC_006932	AGAT	2	8	2119512	2119519	50 %	25 %	25 %	0 %	62291016
43592	NC_006932	CAG	2	6	2119523	2119528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291016
43593	NC_006932	CTGC	2	8	2119534	2119541	0 %	25 %	25 %	50 %	62291016
43594	NC_006932	GTG	2	6	2119545	2119550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62291016
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43596	NC_006932	AGGC	2	8	2119785	2119792	25 %	0 %	50 %	25 %	62291017
43597	NC_006932	CCGT	2	8	2119895	2119902	0 %	25 %	25 %	50 %	62291017
43598	NC_006932	TTG	2	6	2119910	2119915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62291017
43599	NC_006932	CG	3	6	2119926	2119931	0 %	0 %	50 %	50 %	62291017
43600	NC_006932	CGG	2	6	2119983	2119988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291017
43601	NC_006932	TC	3	6	2119989	2119994	0 %	50 %	0 %	50 %	62291017
43602	NC_006932	GTC	2	6	2120026	2120031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62291017
43603	NC_006932	CTT	2	6	2120118	2120123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62291017
43604	NC_006932	ATG	2	6	2120303	2120308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62291017
43605	NC_006932	GCCGC	2	10	2120333	2120342	0 %	0 %	40 %	60 %	62291017
43606	NC_006932	CTT	2	6	2120350	2120355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	62291017
43607	NC_006932	CAG	2	6	2120359	2120364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291017
43608	NC_006932	CG	3	6	2120561	2120566	0 %	0 %	50 %	50 %	62291017
43609	NC_006932	GCC	2	6	2120576	2120581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62291017
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43611	NC_006932	CGT	2	6	2120619	2120624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62291017
43612	NC_006932	GT	3	6	2120631	2120636	0 %	50 %	50 %	0 %	62291017
43613	NC_006932	TGA	2	6	2120637	2120642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	62291017
43614	NC_006932	GCA	2	6	2120937	2120942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62291017
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43616	NC_006932	GGC	2	6	2121010	2121015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62291017
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43619	NC_006932	TC	3	6	2121100	2121105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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43685	NC_006932	CATG	2	8	2124213	2124220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.