MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 1620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006129	AGC	2	6	51379	51384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038695
1502	NC_006129	T	6	6	51408	51413	0 %	100 %	0 %	0 %	51038695
1503	NC_006129	T	8	8	51416	51423	0 %	100 %	0 %	0 %	51038695
1504	NC_006129	T	8	8	51455	51462	0 %	100 %	0 %	0 %	51038695
1505	NC_006129	T	7	7	51494	51500	0 %	100 %	0 %	0 %	51038695
1506	NC_006129	ATT	2	6	51551	51556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038695
1507	NC_006129	ACA	2	6	51557	51562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038695
1508	NC_006129	TTTAG	2	10	51581	51590	20 %	60 %	20 %	0 %	51038695
1509	NC_006129	TTA	2	6	51611	51616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_006129	TTA	2	6	51631	51636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_006129	ATA	3	9	51650	51658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_006129	TTTTG	2	10	51737	51746	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_006129	TAA	2	6	51774	51779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_006129	TAAA	2	8	51784	51791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_006129	TTG	2	6	51803	51808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_006129	A	10	10	51838	51847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_006129	GAA	2	6	51850	51855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_006129	A	8	8	51869	51876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_006129	T	8	8	51893	51900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_006129	TTA	2	6	51905	51910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_006129	AT	3	6	51953	51958	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
1522	NC_006129	GTT	2	6	51970	51975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038696
1523	NC_006129	TGT	2	6	51991	51996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038696
1524	NC_006129	T	7	7	52034	52040	0 %	100 %	0 %	0 %	51038696
1525	NC_006129	T	6	6	52066	52071	0 %	100 %	0 %	0 %	51038696
1526	NC_006129	AAC	2	6	52141	52146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038696
1527	NC_006129	A	6	6	52166	52171	100 %	0 %	0 %	0 %	51038696
1528	NC_006129	AT	3	6	52190	52195	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
1529	NC_006129	AT	3	6	52224	52229	50 %	50 %	0 %	0 %	51038696
1530	NC_006129	TATT	2	8	52261	52268	25 %	75 %	0 %	0 %	51038696
1531	NC_006129	T	6	6	52267	52272	0 %	100 %	0 %	0 %	51038696
1532	NC_006129	GT	3	6	52273	52278	0 %	50 %	50 %	0 %	51038696
1533	NC_006129	ATT	2	6	52299	52304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038696
1534	NC_006129	T	8	8	52303	52310	0 %	100 %	0 %	0 %	51038696
1535	NC_006129	T	6	6	52318	52323	0 %	100 %	0 %	0 %	51038696
1536	NC_006129	GCA	3	9	52383	52391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51038696
1537	NC_006129	T	8	8	52415	52422	0 %	100 %	0 %	0 %	51038696
1538	NC_006129	CTT	2	6	52436	52441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038696
1539	NC_006129	TCT	2	6	52470	52475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038696
1540	NC_006129	TTTGA	2	10	52489	52498	20 %	60 %	20 %	0 %	51038696
1541	NC_006129	GATT	2	8	52515	52522	25 %	50 %	25 %	0 %	51038696
1542	NC_006129	GTT	2	6	52535	52540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038696
1543	NC_006129	CAA	2	6	52585	52590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51038696
1544	NC_006129	TTG	2	6	52621	52626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038696
1545	NC_006129	T	7	7	52719	52725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_006129	AT	3	6	52726	52731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_006129	AGA	2	6	52761	52766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_006129	T	8	8	52789	52796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_006129	ATAC	2	8	52819	52826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_006129	TAG	2	6	52836	52841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038697
1551	NC_006129	TAG	2	6	52865	52870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038697
1552	NC_006129	TCT	2	6	52879	52884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038697
1553	NC_006129	ATT	2	6	52953	52958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038697
1554	NC_006129	TAA	2	6	52999	53004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038697
1555	NC_006129	CTT	2	6	53005	53010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038697
1556	NC_006129	A	7	7	53176	53182	100 %	0 %	0 %	0 %	51038697
1557	NC_006129	AAT	2	6	53189	53194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038697
1558	NC_006129	T	6	6	53246	53251	0 %	100 %	0 %	0 %	51038697
1559	NC_006129	ATTTT	2	10	53253	53262	20 %	80 %	0 %	0 %	51038697
1560	NC_006129	CAT	2	6	53263	53268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51038697
1561	NC_006129	AATAA	2	10	53281	53290	80 %	20 %	0 %	0 %	51038697
1562	NC_006129	TCT	2	6	53291	53296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038697
1563	NC_006129	T	6	6	53307	53312	0 %	100 %	0 %	0 %	51038697
1564	NC_006129	TATT	2	8	53362	53369	25 %	75 %	0 %	0 %	51038697
1565	NC_006129	T	6	6	53392	53397	0 %	100 %	0 %	0 %	51038697
1566	NC_006129	T	6	6	53413	53418	0 %	100 %	0 %	0 %	51038697
1567	NC_006129	AATT	2	8	53453	53460	50 %	50 %	0 %	0 %	51038697
1568	NC_006129	TTCATT	2	12	53462	53473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51038697
1569	NC_006129	T	6	6	53489	53494	0 %	100 %	0 %	0 %	51038697
1570	NC_006129	TCCTT	2	10	53500	53509	0 %	60 %	0 %	40 %	51038697
1571	NC_006129	TGT	2	6	53532	53537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038697
1572	NC_006129	TTA	2	6	53559	53564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038697
1573	NC_006129	CTT	2	6	53611	53616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51038697
1574	NC_006129	A	6	6	53718	53723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_006129	AATATA	2	12	53759	53770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_006129	GTTT	2	8	53776	53783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_006129	TAAAA	2	10	53810	53819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_006129	T	9	9	53845	53853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_006129	A	7	7	53854	53860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_006129	GCAA	2	8	53901	53908	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_006129	TTG	2	6	53922	53927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_006129	A	6	6	53952	53957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_006129	TTA	2	6	53963	53968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_006129	T	6	6	53975	53980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_006129	TGA	2	6	53983	53988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_006129	TAA	3	9	54018	54026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_006129	TAT	2	6	54034	54039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_006129	TTAAA	2	10	54121	54130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_006129	ATT	2	6	54138	54143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_006129	AT	4	8	54157	54164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_006129	TAA	2	6	54252	54257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038698
1592	NC_006129	ATT	2	6	54265	54270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51038698
1593	NC_006129	TGT	2	6	54340	54345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038698
1594	NC_006129	TAA	2	6	54442	54447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038698
1595	NC_006129	ATG	2	6	54492	54497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038698
1596	NC_006129	TGT	2	6	54559	54564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038698
1597	NC_006129	GTT	2	6	54629	54634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038698
1598	NC_006129	AAT	2	6	54715	54720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038698
1599	NC_006129	AAAT	2	8	54724	54731	75 %	25 %	0 %	0 %	51038698
1600	NC_006129	ATA	2	6	54738	54743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51038698
1601	NC_006129	GGAATT	2	12	54745	54756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038698
1602	NC_006129	AGA	2	6	54763	54768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51038698
1603	NC_006129	TAG	2	6	54897	54902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51038698
1604	NC_006129	A	7	7	54904	54910	100 %	0 %	0 %	0 %	51038698
1605	NC_006129	GTT	2	6	54935	54940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51038698
1606	NC_006129	TA	3	6	54990	54995	50 %	50 %	0 %	0 %	51038698
1607	NC_006129	TA	3	6	55010	55015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_006129	T	6	6	55078	55083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_006129	ATA	2	6	55142	55147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_006129	TAA	2	6	55166	55171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_006129	T	6	6	55232	55237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_006129	GAT	2	6	55260	55265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_006129	TGC	2	6	55280	55285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_006129	GAG	2	6	55300	55305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_006129	TAA	2	6	55345	55350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_006129	GGT	2	6	55379	55384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_006129	AGA	3	9	55508	55516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_006129	CAA	2	6	55535	55540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_006129	AACC	2	8	55542	55549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_006129	AG	3	6	55554	55559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.