MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 128175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004663	TAC	2	6	36	41	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004663	TTC	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004663	GGT	2	6	69	74	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004663	ACG	2	6	112	117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345411
5	NC_004663	ACG	2	6	229	234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345411
6	NC_004663	TCAC	2	8	259	266	25 %	25 %	0 %	50 %	29345411
7	NC_004663	TG	3	6	427	432	0 %	50 %	50 %	0 %	29345411
8	NC_004663	TGT	2	6	464	469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345411
9	NC_004663	TAC	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345411
10	NC_004663	CTG	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345411
11	NC_004663	ACT	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345411
12	NC_004663	TGG	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345411
13	NC_004663	TTG	2	6	711	716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004663	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004663	CCTC	2	8	749	756	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_004663	T	6	6	769	774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004663	GAA	2	6	775	780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004663	ATG	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345412
19	NC_004663	TCA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345412
20	NC_004663	ACA	2	6	902	907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345412
21	NC_004663	AAG	2	6	914	919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345412
22	NC_004663	A	6	6	946	951	100 %	0 %	0 %	0 %	29345412
23	NC_004663	ATA	2	6	1054	1059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345412
24	NC_004663	TTC	2	6	1106	1111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345412
25	NC_004663	GGA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345412
26	NC_004663	ACA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345412
27	NC_004663	TA	3	6	1174	1179	50 %	50 %	0 %	0 %	29345412
28	NC_004663	AAT	2	6	1191	1196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345412
29	NC_004663	TA	3	6	1224	1229	50 %	50 %	0 %	0 %	29345412
30	NC_004663	TAT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345412
31	NC_004663	CTT	2	6	1355	1360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345412
32	NC_004663	AT	3	6	1363	1368	50 %	50 %	0 %	0 %	29345412
33	NC_004663	GAA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345412
34	NC_004663	CTG	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345412
35	NC_004663	CAA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345412
36	NC_004663	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345412
37	NC_004663	GTA	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345412
38	NC_004663	TAA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345412
39	NC_004663	ATA	2	6	1684	1689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345412
40	NC_004663	TGCAA	2	10	1741	1750	40 %	20 %	20 %	20 %	29345412
41	NC_004663	TATCT	2	10	1754	1763	20 %	60 %	0 %	20 %	29345412
42	NC_004663	ATTA	2	8	1808	1815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004663	TTAA	2	8	1849	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004663	AC	3	6	1877	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	29345413
45	NC_004663	ACA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345413
46	NC_004663	AAG	2	6	1927	1932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345413
47	NC_004663	GGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345413
48	NC_004663	GAA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345413
49	NC_004663	AGA	2	6	2000	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345413
50	NC_004663	GAA	2	6	2019	2024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345413
51	NC_004663	GT	3	6	2056	2061	0 %	50 %	50 %	0 %	29345413
52	NC_004663	GTG	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345413
53	NC_004663	TAG	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345413
54	NC_004663	CGG	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345413
55	NC_004663	A	7	7	2158	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	29345413
56	NC_004663	GA	3	6	2242	2247	50 %	0 %	50 %	0 %	29345413
57	NC_004663	TA	3	6	2262	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	29345413
58	NC_004663	GCC	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345413
59	NC_004663	ACGG	2	8	2298	2305	25 %	0 %	50 %	25 %	29345413
60	NC_004663	CCG	2	6	2314	2319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345413
61	NC_004663	GGTA	2	8	2375	2382	25 %	25 %	50 %	0 %	29345413
62	NC_004663	CTGA	2	8	2388	2395	25 %	25 %	25 %	25 %	29345413
63	NC_004663	TGG	2	6	2434	2439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345413
64	NC_004663	AAC	2	6	2442	2447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345413
65	NC_004663	ACGG	2	8	2484	2491	25 %	0 %	50 %	25 %	29345413
66	NC_004663	GTA	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345413
67	NC_004663	GTG	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345413
68	NC_004663	CTTT	2	8	2748	2755	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004663	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004663	ATA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004663	ATGA	2	8	2834	2841	50 %	25 %	25 %	0 %	29345414
72	NC_004663	GAAT	2	8	2859	2866	50 %	25 %	25 %	0 %	29345414
73	NC_004663	TGC	2	6	2889	2894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345414
74	NC_004663	TGT	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345414
75	NC_004663	AGAA	2	8	3240	3247	75 %	0 %	25 %	0 %	29345414
76	NC_004663	CAA	2	6	3263	3268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345414
77	NC_004663	AAT	2	6	3277	3282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345414
78	NC_004663	CAT	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345414
79	NC_004663	ATC	2	6	3398	3403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345414
80	NC_004663	GAA	2	6	3475	3480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345415
81	NC_004663	TCT	2	6	3522	3527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345415
82	NC_004663	CAAA	2	8	3615	3622	75 %	0 %	0 %	25 %	29345415
83	NC_004663	TGA	2	6	3656	3661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345415
84	NC_004663	GTGCC	2	10	3703	3712	0 %	20 %	40 %	40 %	29345415
85	NC_004663	GGA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345415
86	NC_004663	TGTAG	2	10	3910	3919	20 %	40 %	40 %	0 %	29345415
87	NC_004663	TGCT	2	8	3929	3936	0 %	50 %	25 %	25 %	29345415
88	NC_004663	A	7	7	4003	4009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004663	AT	3	6	4037	4042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004663	CTG	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345416
91	NC_004663	CTTG	2	8	4115	4122	0 %	50 %	25 %	25 %	29345416
92	NC_004663	GAT	2	6	4142	4147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345416
93	NC_004663	AGAA	2	8	4173	4180	75 %	0 %	25 %	0 %	29345416
94	NC_004663	TA	3	6	4300	4305	50 %	50 %	0 %	0 %	29345416
95	NC_004663	ATA	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345416
96	NC_004663	AAG	2	6	4412	4417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345416
97	NC_004663	AAT	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345417
98	NC_004663	AT	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	29345417
99	NC_004663	AAG	2	6	4595	4600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345417
100	NC_004663	T	6	6	4620	4625	0 %	100 %	0 %	0 %	29345417
101	NC_004663	AGG	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345417
102	NC_004663	AAT	2	6	4797	4802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345417
103	NC_004663	GGA	2	6	4839	4844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345417
104	NC_004663	CAT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_004663	AGA	2	6	4947	4952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004663	AAAT	2	8	4965	4972	75 %	25 %	0 %	0 %	29345418
107	NC_004663	GA	3	6	5009	5014	50 %	0 %	50 %	0 %	29345418
108	NC_004663	TAT	2	6	5056	5061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345418
109	NC_004663	GAAT	2	8	5062	5069	50 %	25 %	25 %	0 %	29345418
110	NC_004663	TGCT	2	8	5091	5098	0 %	50 %	25 %	25 %	29345418
111	NC_004663	GTTA	2	8	5099	5106	25 %	50 %	25 %	0 %	29345418
112	NC_004663	A	6	6	5213	5218	100 %	0 %	0 %	0 %	29345418
113	NC_004663	CAG	2	6	5253	5258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345418
114	NC_004663	GCA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345418
115	NC_004663	TTA	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345418
116	NC_004663	GAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345418
117	NC_004663	T	6	6	5425	5430	0 %	100 %	0 %	0 %	29345418
118	NC_004663	TGA	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345418
119	NC_004663	TTA	2	6	5471	5476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345418
120	NC_004663	TAT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345418
121	NC_004663	ATG	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345418
122	NC_004663	AAT	2	6	5616	5621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004663	CAA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345419
124	NC_004663	GCA	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345419
125	NC_004663	TTTA	2	8	5718	5725	25 %	75 %	0 %	0 %	29345419
126	NC_004663	GAG	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345419
127	NC_004663	CCG	3	9	5789	5797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345419
128	NC_004663	GAA	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345419
129	NC_004663	GAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345419
130	NC_004663	ATG	2	6	6110	6115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345419
131	NC_004663	GCAA	2	8	6140	6147	50 %	0 %	25 %	25 %	29345419
132	NC_004663	GGTA	2	8	6324	6331	25 %	25 %	50 %	0 %	29345419
133	NC_004663	CAGC	2	8	6371	6378	25 %	0 %	25 %	50 %	29345419
134	NC_004663	GGT	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345419
135	NC_004663	GAA	2	6	6586	6591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345419
136	NC_004663	GCT	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345419
137	NC_004663	AGG	2	6	6704	6709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345419
138	NC_004663	ACG	2	6	6716	6721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345419
139	NC_004663	AGG	2	6	6767	6772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004663	AAAG	2	8	6812	6819	75 %	0 %	25 %	0 %	29345420
141	NC_004663	AGAAC	2	10	6873	6882	60 %	0 %	20 %	20 %	29345420
142	NC_004663	GAT	2	6	6928	6933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345420
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145	NC_004663	GCT	2	6	7069	7074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345420
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155	NC_004663	GAAAC	2	10	7874	7883	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_004663	AAG	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_004663	GAA	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_004663	GAA	2	6	7986	7991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_004663	CTG	2	6	8000	8005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_004663	AATGG	2	10	8074	8083	40 %	20 %	40 %	0 %	29345421
161	NC_004663	AGCA	2	8	8105	8112	50 %	0 %	25 %	25 %	29345421
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164	NC_004663	TGTTTT	2	12	8224	8235	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	29345421
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166	NC_004663	TCC	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345421
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172	NC_004663	GGC	2	6	8631	8636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345421
173	NC_004663	AGGAAA	2	12	8640	8651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345421
174	NC_004663	GAA	2	6	8723	8728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345421
175	NC_004663	GAA	2	6	8735	8740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345421
176	NC_004663	GAA	2	6	8795	8800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345421
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199	NC_004663	TGA	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345422
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201	NC_004663	ATT	2	6	10165	10170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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212	NC_004663	ATT	2	6	10917	10922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345424
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251	NC_004663	GGA	2	6	12350	12355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345424
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254	NC_004663	GGCG	2	8	12462	12469	0 %	0 %	75 %	25 %	29345424
255	NC_004663	ACGGG	2	10	12490	12499	20 %	0 %	60 %	20 %	29345424
256	NC_004663	GGA	2	6	12548	12553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345424
257	NC_004663	GGA	2	6	12572	12577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345424
258	NC_004663	GGAA	2	8	12587	12594	50 %	0 %	50 %	0 %	29345424
259	NC_004663	GAT	2	6	12612	12617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345424
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268	NC_004663	TGG	2	6	12943	12948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345424
269	NC_004663	GAA	2	6	12959	12964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345424
270	NC_004663	AG	3	6	13043	13048	50 %	0 %	50 %	0 %	29345424
271	NC_004663	GATAC	2	10	13089	13098	40 %	20 %	20 %	20 %	29345424
272	NC_004663	TGC	2	6	13105	13110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345424
273	NC_004663	AC	4	8	13179	13186	50 %	0 %	0 %	50 %	29345424
274	NC_004663	GGC	2	6	13187	13192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345424
275	NC_004663	TG	3	6	13193	13198	0 %	50 %	50 %	0 %	29345424
276	NC_004663	GGA	2	6	13199	13204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345424
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278	NC_004663	GC	3	6	13396	13401	0 %	0 %	50 %	50 %	29345425
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282	NC_004663	AGG	2	6	13637	13642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345425
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284	NC_004663	G	6	6	13748	13753	0 %	0 %	100 %	0 %	29345425
285	NC_004663	GGAA	2	8	13766	13773	50 %	0 %	50 %	0 %	29345425
286	NC_004663	GGC	2	6	13860	13865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345425
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289	NC_004663	TGG	2	6	14075	14080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345425
290	NC_004663	ATTT	2	8	14135	14142	25 %	75 %	0 %	0 %	29345425
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303	NC_004663	TAC	2	6	14696	14701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_004663	TCTT	2	8	14724	14731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
305	NC_004663	ATT	2	6	14765	14770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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320	NC_004663	T	7	7	15484	15490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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369	NC_004663	GA	3	6	18257	18262	50 %	0 %	50 %	0 %	29345431
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381	NC_004663	ATGG	2	8	19044	19051	25 %	25 %	50 %	0 %	29345432
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390	NC_004663	GAA	2	6	19409	19414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
391	NC_004663	GCA	2	6	19419	19424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_004663	CGA	2	6	19587	19592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_004663	GTT	2	6	19639	19644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345433
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396	NC_004663	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	29345433
397	NC_004663	GAT	2	6	19780	19785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345433
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400	NC_004663	A	7	7	19925	19931	100 %	0 %	0 %	0 %	29345433
401	NC_004663	TTAT	2	8	19947	19954	25 %	75 %	0 %	0 %	29345433
402	NC_004663	TAC	2	6	20006	20011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345434
403	NC_004663	CCTT	2	8	20226	20233	0 %	50 %	0 %	50 %	29345434
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405	NC_004663	CAT	2	6	20332	20337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345434
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450	NC_004663	TAA	2	6	22476	22481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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