MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 128175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_004663	CAAT	2	8	542241	542248	50 %	25 %	0 %	25 %	29345856
11003	NC_004663	TAA	2	6	542266	542271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345856
11004	NC_004663	AAT	2	6	542317	542322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345856
11005	NC_004663	CAG	2	6	542338	542343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345856
11006	NC_004663	TCCAT	2	10	542406	542415	20 %	40 %	0 %	40 %	29345856
11007	NC_004663	TGC	2	6	542433	542438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345856
11008	NC_004663	CAG	2	6	542560	542565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345856
11009	NC_004663	TAA	2	6	542644	542649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345856
11010	NC_004663	AAT	2	6	542653	542658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345856
11011	NC_004663	TTC	2	6	542685	542690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345856
11012	NC_004663	AAG	2	6	542700	542705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345856
11013	NC_004663	CAT	2	6	542713	542718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345856
11014	NC_004663	GCAAA	2	10	542813	542822	60 %	0 %	20 %	20 %	29345856
11015	NC_004663	TGAA	2	8	542885	542892	50 %	25 %	25 %	0 %	29345856
11016	NC_004663	AAAG	2	8	542899	542906	75 %	0 %	25 %	0 %	29345856
11017	NC_004663	GCT	2	6	542996	543001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345856
11018	NC_004663	GAA	2	6	543016	543021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345856
11019	NC_004663	AAG	2	6	543057	543062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345856
11020	NC_004663	AT	3	6	543069	543074	50 %	50 %	0 %	0 %	29345856
11021	NC_004663	GGC	2	6	543083	543088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345856
11022	NC_004663	TAA	2	6	543153	543158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345856
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11024	NC_004663	TTCC	2	8	543224	543231	0 %	50 %	0 %	50 %	29345857
11025	NC_004663	CTT	2	6	543236	543241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345857
11026	NC_004663	TCCG	2	8	543288	543295	0 %	25 %	25 %	50 %	29345857
11027	NC_004663	CCA	2	6	543356	543361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345857
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11029	NC_004663	TAA	2	6	543517	543522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345857
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11031	NC_004663	GAAA	2	8	543678	543685	75 %	0 %	25 %	0 %	29345857
11032	NC_004663	CTT	2	6	543707	543712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345857
11033	NC_004663	T	6	6	543852	543857	0 %	100 %	0 %	0 %	29345857
11034	NC_004663	TTC	2	6	543867	543872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345857
11035	NC_004663	CTT	2	6	543876	543881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345857
11036	NC_004663	GAA	2	6	543892	543897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345857
11037	NC_004663	CTT	2	6	543971	543976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345857
11038	NC_004663	TTC	2	6	544005	544010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345857
11039	NC_004663	TA	3	6	544115	544120	50 %	50 %	0 %	0 %	29345857
11040	NC_004663	T	6	6	544200	544205	0 %	100 %	0 %	0 %	29345857
11041	NC_004663	TA	3	6	544283	544288	50 %	50 %	0 %	0 %	29345857
11042	NC_004663	GATTT	2	10	544342	544351	20 %	60 %	20 %	0 %	29345857
11043	NC_004663	T	6	6	544349	544354	0 %	100 %	0 %	0 %	29345857
11044	NC_004663	TAA	2	6	544360	544365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345857
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11048	NC_004663	AGTC	2	8	544656	544663	25 %	25 %	25 %	25 %	29345857
11049	NC_004663	CTGC	2	8	544834	544841	0 %	25 %	25 %	50 %	29345857
11050	NC_004663	GGT	2	6	544848	544853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345857
11051	NC_004663	CTTC	2	8	544874	544881	0 %	50 %	0 %	50 %	29345857
11052	NC_004663	ATA	2	6	544962	544967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345857
11053	NC_004663	GAAA	2	8	544988	544995	75 %	0 %	25 %	0 %	29345857
11054	NC_004663	GA	3	6	545006	545011	50 %	0 %	50 %	0 %	29345857
11055	NC_004663	TCCA	2	8	545218	545225	25 %	25 %	0 %	50 %	29345857
11056	NC_004663	TTG	2	6	545286	545291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345857
11057	NC_004663	GAA	2	6	545304	545309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345857
11058	NC_004663	CTT	2	6	545336	545341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345857
11059	NC_004663	CTT	3	9	545375	545383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345857
11060	NC_004663	T	6	6	545554	545559	0 %	100 %	0 %	0 %	29345857
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11062	NC_004663	GAT	2	6	545672	545677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345857
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11066	NC_004663	GTCA	2	8	545909	545916	25 %	25 %	25 %	25 %	29345858
11067	NC_004663	GAG	2	6	545947	545952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345858
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11071	NC_004663	CCA	2	6	546296	546301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345858
11072	NC_004663	CA	3	6	546307	546312	50 %	0 %	0 %	50 %	29345858
11073	NC_004663	CTG	2	6	546313	546318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345858
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11076	NC_004663	TA	3	6	546415	546420	50 %	50 %	0 %	0 %	29345858
11077	NC_004663	TAT	2	6	546457	546462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345858
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11084	NC_004663	GTCAT	2	10	546723	546732	20 %	40 %	20 %	20 %	29345858
11085	NC_004663	CAAT	2	8	546828	546835	50 %	25 %	0 %	25 %	29345858
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11091	NC_004663	GAG	2	6	547114	547119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345858
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11093	NC_004663	TCCG	2	8	547163	547170	0 %	25 %	25 %	50 %	29345858
11094	NC_004663	ACT	2	6	547176	547181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345858
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11099	NC_004663	CATTAA	2	12	547336	547347	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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11102	NC_004663	AT	3	6	547741	547746	50 %	50 %	0 %	0 %	29345859
11103	NC_004663	GAT	2	6	547753	547758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345859
11104	NC_004663	CTG	2	6	547783	547788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345859
11105	NC_004663	TAG	2	6	547803	547808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345859
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11107	NC_004663	TACA	2	8	547877	547884	50 %	25 %	0 %	25 %	29345859
11108	NC_004663	AGGC	2	8	547987	547994	25 %	0 %	50 %	25 %	29345859
11109	NC_004663	ATT	2	6	548145	548150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345859
11110	NC_004663	CAT	2	6	548206	548211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345859
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11112	NC_004663	CTT	2	6	548315	548320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345859
11113	NC_004663	TCA	2	6	548325	548330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345859
11114	NC_004663	ACC	2	6	548375	548380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345859
11115	NC_004663	TGAC	2	8	548392	548399	25 %	25 %	25 %	25 %	29345859
11116	NC_004663	ATA	2	6	548474	548479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345859
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11118	NC_004663	AGT	2	6	548531	548536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345859
11119	NC_004663	CAA	2	6	548572	548577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345859
11120	NC_004663	T	6	6	548598	548603	0 %	100 %	0 %	0 %	29345859
11121	NC_004663	TTA	2	6	548634	548639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345859
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11352	NC_004663	TAT	2	6	562673	562678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345867
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11354	NC_004663	TTCC	2	8	562881	562888	0 %	50 %	0 %	50 %	29345867
11355	NC_004663	GTG	2	6	562902	562907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345867
11356	NC_004663	ATG	2	6	563007	563012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345867
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11359	NC_004663	TGGC	2	8	563101	563108	0 %	25 %	50 %	25 %	29345867
11360	NC_004663	CTGC	2	8	563147	563154	0 %	25 %	25 %	50 %	29345867
11361	NC_004663	A	6	6	563222	563227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11362	NC_004663	GTA	2	6	563324	563329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345868
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11366	NC_004663	CCT	2	6	563543	563548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345868
11367	NC_004663	CTG	2	6	563644	563649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345868
11368	NC_004663	ATA	2	6	563657	563662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345868
11369	NC_004663	TA	3	6	563720	563725	50 %	50 %	0 %	0 %	29345868
11370	NC_004663	CGG	2	6	563789	563794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345868
11371	NC_004663	ATC	2	6	563801	563806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345868
11372	NC_004663	GT	3	6	563822	563827	0 %	50 %	50 %	0 %	29345868
11373	NC_004663	GTG	2	6	563885	563890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345868
11374	NC_004663	ACT	2	6	563939	563944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345868
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11377	NC_004663	CTG	2	6	564128	564133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345868
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11381	NC_004663	CTG	2	6	564367	564372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345868
11382	NC_004663	TAC	2	6	564381	564386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345868
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11385	NC_004663	GTG	2	6	564452	564457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345868
11386	NC_004663	AAT	2	6	564469	564474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345868
11387	NC_004663	ATCC	2	8	564545	564552	25 %	25 %	0 %	50 %	29345868
11388	NC_004663	TCG	2	6	564600	564605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345868
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11394	NC_004663	TGC	2	6	564975	564980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345868
11395	NC_004663	TGA	2	6	565010	565015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345868
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11397	NC_004663	GTA	2	6	565031	565036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345868
11398	NC_004663	GTA	2	6	565222	565227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345868
11399	NC_004663	ATT	2	6	565244	565249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345868
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11404	NC_004663	CTT	2	6	565530	565535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345868
11405	NC_004663	T	6	6	565587	565592	0 %	100 %	0 %	0 %	29345868
11406	NC_004663	TCC	2	6	565617	565622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345868
11407	NC_004663	CT	3	6	565673	565678	0 %	50 %	0 %	50 %	29345868
11408	NC_004663	TCA	2	6	565681	565686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345868
11409	NC_004663	CTT	2	6	565746	565751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345868
11410	NC_004663	AAG	2	6	565804	565809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345868
11411	NC_004663	GAA	2	6	565813	565818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345868
11412	NC_004663	TAAA	2	8	565854	565861	75 %	25 %	0 %	0 %	29345868
11413	NC_004663	ACT	2	6	565874	565879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11415	NC_004663	AAC	2	6	565903	565908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345869
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11417	NC_004663	TGA	2	6	565945	565950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345869
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11420	NC_004663	CTG	2	6	566344	566349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345869
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11423	NC_004663	GTC	2	6	566404	566409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345869
11424	NC_004663	TTC	2	6	566412	566417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345869
11425	NC_004663	TGA	2	6	566423	566428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345869
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11428	NC_004663	GCTG	2	8	566708	566715	0 %	25 %	50 %	25 %	29345869
11429	NC_004663	GAT	2	6	566787	566792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345869
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11431	NC_004663	GGT	2	6	566886	566891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345869
11432	NC_004663	GAA	2	6	566985	566990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345869
11433	NC_004663	ATCA	2	8	567009	567016	50 %	25 %	0 %	25 %	29345869
11434	NC_004663	TGGCG	2	10	567111	567120	0 %	20 %	60 %	20 %	29345869
11435	NC_004663	ATG	2	6	567154	567159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345869
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11440	NC_004663	TC	3	6	567361	567366	0 %	50 %	0 %	50 %	29345869
11441	NC_004663	AT	3	6	567374	567379	50 %	50 %	0 %	0 %	29345869
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11448	NC_004663	GTCGT	2	10	567718	567727	0 %	40 %	40 %	20 %	29345869
11449	NC_004663	TTG	2	6	567769	567774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345869
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11456	NC_004663	T	6	6	568354	568359	0 %	100 %	0 %	0 %	29345870
11457	NC_004663	CT	3	6	568361	568366	0 %	50 %	0 %	50 %	29345870
11458	NC_004663	A	6	6	568368	568373	100 %	0 %	0 %	0 %	29345870
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11463	NC_004663	TGTCT	2	10	568483	568492	0 %	60 %	20 %	20 %	29345870
11464	NC_004663	TA	3	6	568538	568543	50 %	50 %	0 %	0 %	29345870
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11470	NC_004663	TAAAC	2	10	568777	568786	60 %	20 %	0 %	20 %	29345870
11471	NC_004663	TTTGCA	2	12	568789	568800	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29345870
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11482	NC_004663	GCT	2	6	569057	569062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345870
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11484	NC_004663	AT	3	6	569185	569190	50 %	50 %	0 %	0 %	29345870
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11490	NC_004663	TGC	2	6	569428	569433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345870
11491	NC_004663	TCA	2	6	569446	569451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345870
11492	NC_004663	GGA	2	6	569528	569533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345870
11493	NC_004663	AT	3	6	569638	569643	50 %	50 %	0 %	0 %	29345870
11494	NC_004663	AT	3	6	569665	569670	50 %	50 %	0 %	0 %	29345870
11495	NC_004663	AT	3	6	569672	569677	50 %	50 %	0 %	0 %	29345870
11496	NC_004663	TGA	2	6	569767	569772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345870
11497	NC_004663	GTC	2	6	569823	569828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345870
11498	NC_004663	CTG	2	6	570030	570035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345870
11499	NC_004663	CTG	2	6	570048	570053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345870
11500	NC_004663	TGA	2	6	570115	570120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345870

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